Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Betancor (2012)
Title Clinical, virological and biochemical evidence supporting the association of HIV-1 reverse transcriptase polymorphism R284K and thymidine analogue resistance mutations M41L, L210W and T215Y in patients failing tenofovir/emtricitabine therapy.
Citation Retrovirology
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 216
NumPts 216
Subtype B, CRF02_AG, F, G, A, CRF06_cpx, C


  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 216 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
HCB-6060483035 HCB-6060483035 None None   K20KR, K122E, D123DG, S162C, E169D, K201KR, A272P, K275Q, V276I, K277R, Q278H, K281KR, I293V, P294Q  
HCB-6090515729 HCB-6090515729 None None   V60I, K102R, K122E, D123G, I142V, T165I, I178IM, T200A, Q207X, R211RK, A272P, K281R, T286A, I293V, E297R, I326V, I329V, Q334E  
HCB-6090515868 HCB-6090515868 None None   I135X, S162C, R211Q, K277R, I293V, E312A, I326V, Q334L  
HCB-6100518346 HCB-6100518346 None None   V35VI, A98S, K101KR, K102KQ, D123E, I135T, I142M, P176PS, D177DE, I178IV, I195L, T200A, R211K, A272S, K277R, T286A, V292VI, I293V, P294PS, E297Q, I326V, I329V  
HCB-6100521397 HCB-6100521397 None None  E138EA, V179L K122E, I135T, T200A, I202V, V245I, E248D, K275Q, V276T, K277R, Q278H, A288S, I293V, P294T, Q334L  
HCB-6100524440 HCB-6100524440 None None   V35M, I135V, I195L, G196K, T200A, I202V, R211K, V245M, K277R, T286A, I293V, I326V, Q334E  
HCB-6100525193 HCB-6100525193 None None   V35I, I47IL, I50V, R83K, K173R, R211S, A272P, K277R, T286A, E297K, A304E, I329L, Q334D  
HCB-6100525361 HCB-6100525361 None None  V179D V118I, D123E, F214L, A272P, K277R, T286A, I293V, E297A, S322T, D324DE  
HCB-6112004277 HCB-6112004277 None None   V60VI, D123E, I135V, S162X, D177DE, I178IL, T200TA, R211RK, V245M, A272P, K277R, T286A, I329IL, Q334QE S48*E 
HCB-6112004474 HCB-6112004474 None None   A98S, D123E, S162N, I178M, Q207E, R211RK, V245M, A272P, K277R, T286A, P294Q, K311R, I329L, Q334R, G335D  
HCB-6112008574 HCB-6112008574 None None   K49R, D123E, I135T, E169D, D177DE, I178V, Q207E, F214L, V245M, T286A, I329L, G335D  
HCB-6112011015 HCB-6112011015 None None   S48T, K49KR, D123E, E169D, I178L, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245M, A272P, K281R, I293V, I329L, Q334R, G335D  
HCB-6122017271 HCB-6122017271 None None   V60I, A98S, I135V, R211K, T286A, V292I, E297A, D324E, I326V, I329V D86A 
HCB-6122017601 HCB-6122017601 None None   E36D, V60I, A98S, Q207E, R211K, V245K, D250E, T286A, V317A, S322A  
HCB-70120030493 HCB-70120030493 None None   I135T, V189I, G196E, Q197P, T200A, Q207E, R211S, F214L, E248D, K277R, I329L  
HCB-7012029219 HCB-7012029219 None None   V35T, T39A, G45GE, K49R, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, R211K, V245M, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V, P294T, E297T, V317A, S322T  
HCB-7022039811 HCB-7022039811 None None   I135V, S162C, T200A, V245M, A272S, K275KR, L283I, T286V, E297EA, D324E, Q334R, G335D  
HCB-7022042525 HCB-7022042525 None None   V35T, T39A, R83K, D121H, K122E, I135R, S162C, D177E, G196E, V245M, T286A, I329L  
HCB-7022043920 HCB-7022043920 None None   V35I, K102KR, K104KR, K122E, I135T, D177E, I178M, R211K, E248D, E291D, I293V, E297AT  
HCB-7022044077 HCB-7022044077 None None   K20R, V35E, T39A, D123E, I135R, S162C, V245E, I293V  
HCB-7032049466 HCB-7032049466 None None   K11T, D121H, K122E, D123S, I135T, S162C, G196E, I202V, A272P, K277R, T286P, I293V, E297K, K311R, G335D  
HCB-7032052327 HCB-7032052327 None None   E6D, K20R, V60I, K64R, D123E, I135R, R211K, V245E, K277R, T286A, P294T, E297K, K311R, Q332H  
HCB-7032052659 HCB-7032052659 None None   V60I, S68G, K122E, D123N, T139K, I142V, S162A, Q207E, K277R, T286A, I293V  
HCB-7042063545 HCB-7042063545 None None   R83RK, Q207R, R211E, T286A, P313T, S322L, G333E, Q334HY  
HCB-7042067124 HCB-7042067124 None None M41L, L210W, T215S  V35E, V60I, K122E, I135T, G196E, R211N, R284K, I293V  
HCB-7042068387 HCB-7042068387 None None   V35M, R83K, T200A, Q207E, V245E, I257L, K277R, T286A, I293V, T296S, E297Q, I329L, Q334Y  
HCB-7042070107 HCB-7042070107 None None   K20KR, R83K, K102Q, K103KR, T139TM, S162X, R211RK, A272P, K277R  
HCB-7042070215 HCB-7042070215 None None   V35VI, I135R, S162C, Q207K, R211Q, I293V, K311R, I326V, Q334L  
HCB-7052072312 HCB-7052072312 None None   V35T, K49R, T200I, I202V, A288S  
HCB-7052073539 HCB-7052073539 None None   K49R, D123E, I135T, S162C, E169D, I178L, T200A, Q207E, F214L, V245M, K281R, I329L, G335D  
HCB-7052077495 HCB-7052077495 None None   K49R, D123E, T165I, E169D, D177E, I178L, Q207E, R211K, F214L, V245M, A272P, I293V, I329L  
HCB-7052077953 HCB-7052077953 None None   R83K, D121Y, K122E, I135IT, I142M, K166R, E169D, G196E, R211T, A272P, K277R, T286A, E297K, D324E, G333D, Q334H  
HCB-7052079620 HCB-7052079620 None None T215TA V179VD V35X, T39TA, K49KR, D113DN, D123E, I135IV, S162C, G196GE, T200TA, E203Q, Q207E, E224D, V245Q, A272P, K277R, R284K, T286A, I293V, E297K, E312T P313G 
HCB-7052081007 HCB-7052081007 None None  K103N I50V, V60VI, I142V, R211K, A272P, K277R, T286A, P294A, E297R, E312D, S322T  
HCB-7062086378 HCB-7062086378 None None   K49R, D123E, I135T, E169D, D177E, I178V, Q207E, F214L, V245M, K277R, T286A, I329L, G335D  
HCB-7062088110 HCB-7062088110 None None   V35IT, T39A, D123E, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207T, R211K, A272P, T286A, E291D, I293V, P294T, E297T, V317A, S322T  
HCB-7062088757 HCB-7062088757 None None   D123E, I135T, T200I, R211K, T286A, K311R  
HCB-7062090549 HCB-7062090549 None None   V35M, D123E, I135R, S162W, V179I, V245E, A272P, K277R, L283I, V292I, I293V, E297A, S322A  
HCB-7062090784 HCB-7062090784 None None   K20R, V35I, V60I, D121H, K122E, D123E, I135R, I142V, I178M, I202V, V245M, T286A, I293V, P294S, I329V  
HCB-7062092330 HCB-7062092330 None None   R83K, D121DHY, K122E, E169D, G196E, R211K, T286A, P294T, E297K  
HCB-7072102680 HCB-7072102680 None None   V35I, R83K, D177G, A272P, Q334HY  
HCB-7072104173 HCB-7072104173 None None   K20R, K104R, K122E, D123E, I135M, K166R, I178M, T200A, E204G, A272P, K277R, T286A, E297R, L301I, K323R  
HCB-7072106865 HCB-7072106865 None None   A98S, K122E, D123S, I135T, I142T, K173R, Q174K, D177E, D192DN, Q197QP, T200A, Q207K, R211S, K277R, T286TA, E297A, S322T, Q334L  
HCB-7072107858 HCB-7072107858 None None   V60I, I135M, Q207E, R211K, A272S, T286A, A288S, K311R, I326V  
HCB-7072108078 HCB-7072108078 None None   K122E, I142T, R211K, A272P, I293V  
HCB-7082117818 HCB-7082117818 None None  V106I E6D, I135T, S162Y, V179I, R211Q, E291D, E297A, I329L  
HCB-7092121902 HCB-7092121902 None None   K49R, R83K, K104N, D123E, E169ED, R172RK, I178IM, T200A, K277R, T286A, E297K  
HCB-7092124446 HCB-7092124446 None None   D86E, K104R, D177DE, T200A, I202V, F214L, S251I, K281R, I293V, P294Q, Q334Y, G335S  
HCB-7092127170 HCB-7092127170 None None   K20R, V60I, D121H, K122E, I135R, I142V, I178M, I202V, V245M, T286A, I293V, P294S, A304E  
HCB-7102128380 HCB-7102128380 None None   E6D, R83K, D86E, D121Y, K122E, I135X, A158S, S162A, R211K, K238R, I244IV, A272S, I293V, E312Q, Q334L  
HCB-7112143891 HCB-7112143891 None None   Q23H, D123E, I135T, Q174H, D177E, G196E, Q207E, R211K, F214L, A288S, I293V, E297K  
HCIII-00216871 HCIII-00216871 None None   V35I, E40D, T200R, E204D, K277R, T286A, E297K, K311R, V317A, G333E, Q334H M16Q 
HCIII-00266336 HCIII-00266336 None None   V35I, E40D, T200R, E204D, K277R, T286A, E297K, K311R, V317A, G333E, Q334H M16Q 
HCIII-00270581 HCIII-00270581 None None   V35T, V60I, D86E, A98S, K101KR, D121H, K122E, K166KR, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207K, R211S, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, L301M, D324E, I329V, Q334P, G335D  
HCIII-00270892 HCIII-00270892 None None   V35T, E36N, V90I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245KQ, E248D, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322T, G335D  
HCIII-00275182 HCIII-00275182 None None   K11R, K20R, V60I, D123E, I135T, I178M, R211RG, A272P, V276I, K277R, T286A, P294S, E297R, L301I, G333E  
HCIII-00277049 HCIII-00277049 None None   R83K, K102Q, I135T, S162C, K166KR, I195L, R211K, V245E, K263KE, A272P, I293V, E308EK, Q334Y E29EQ, P150PA, S268SR 
HCIII-00288782 HCIII-00288782 None None   K20KR, D123DE, I135IT, A158AS, R211K, K277R, R284RK, E291D, P294AS, E297EK, I329IL E29EQ, K66KQ, S268SR 
HCIII-00292894 HCIII-00292894 None None   K20R, V60I, I135T, K166R, T200I, R211K, K277R, T286A, I293V, P294A, E297K, I326V  
HCIII-00298905 HCIII-00298905 None None   K101R, K166R, I178L, I202V, R211RK, F214L, V245M, A272P, T286A, E297R, Q334ADE  
HCIII-00311801 HCIII-00311801 None None   V35T, T39M, D121HY, K122E, I135T, D177G, R211K, V245M, A272P, K277R, E297A, I329L  
HCIII-00321619 HCIII-00321619 None None K219Q  K20R, V35T, V60I, T69S, I135T, N175H, G196E, F214L, A272P, I293V, E297R, A327V, G333E, Q334H  
HCIII-00322971 HCIII-00322971 None None   K11T, T27S, V35T, T39K, K43E, K49R, D123S, I135M, S162A, K173S, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245Q, E248D, A272S, K281R, E291D, V292I, I293V, K311KR, E312NT, D324DE, K331N, G335D  
HCIII-00323135 HCIII-00323135 None None   I50V, D123E, I135L, I142IT, D177E, R211K, V245M, A272P, K281KR, P294S, E297T  
HCIII-00326485 HCIII-00326485 None None   K20KR, A98AS, K122E, I178IM, T200A, R211K, K277R, T286P, E297K, S322A, D324DE  
HCIII-00326517 HCIII-00326517 None None   V35I, I135M, S162C, R211K, A272S, K277R, T286A, V292VI, I293V  
HCIII-00328739 HCIII-00328739 None None  V106I K20R, D123E, S162X, P176AT, D177E, I178L, R211RK, F214L, V245I, A272P, K277Q, T286A, I293V, I326V, I329V, Q334R  
HCIII-00329446 HCIII-00329446 None None   K104R, S162C, R211K, T286A, I293V, D324E, Q334L  
HCIII-00334529 HCIII-00334529 None None   V35I, I142IV, D177E, R211K, A272G, Q334E  
HCIII-00334951 HCIII-00334951 None None   D121DA, D123E, S162C, D177DE, R211Q, K277R, L282LI, I293V, L301LI, I326V, Q334L  
HCIII-00341239 HCIII-00341239 None None   K22R, K32R, V35T, E36D, S68G, D121H, K122E, D123E, I135V, S162A, S163ST, E169A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, V245E, E248D, D250E, S251SN, Y271H, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, R307K, S322A, I326IV, G335D  
HCIII-00345190 HCIII-00345190 None None   K20KR, V60VI, V118VI, D123E, I135IR, I202IV, R211K, F214L, A272P, I293IV, K311R, I326IV  
HCIII-00345518 HCIII-00345518 None None   V35VI, K49KR, A98S, I135IT, I142M, I195L, T200A, R211K, A272S, K277R, T286A, I293V, E297Q, I326V  
HCIII-00345739 HCIII-00345739 None None   V21I, V35T, D86N, D123E, Q174H, D177E, Q197P, I202V, A272P, I293V, E297K, L301I, G333E, Q334L  
HCIII-00346150 HCIII-00346150 None None   K49R, K122KE, D123E, I135T, K166R, E169D, I202V, Q207E, F214L, V245K, A272P, K277R, I293V, D324E, L325I  
HCIII-00347517 HCIII-00347517 None None   V35M, K43KQ, K49KR, I50IV, V60I, R83K, K122E, D123N, A272P, K277R, I293V  
HCIII-00348913 HCIII-00348913 None None   V35T, T39L, K122E, D123N, G196E, T200TA, Q207E, P243S, V245E, E248D, I293V, E297K, Q334H  
HCIII-00350232 HCIII-00350232 None None   E6D, A98S, D123E, I135R, K173R, Q174N, G196E, A272P, K277R, I293V, T296S, E297K, L301I, K311R, D324E, I329L  
HCIII-00351157 HCIII-00351157 None None M41L, T215E  E6D, K20KR, E53ED, V60I, D121H, K122E, I135T, I142IT, R172K, Q174QK, D177E, I178M, R211K, V245VM, A272P, A288S, I293V, E297K, D324E  
HCIII-00353742 HCIII-00353742 None None   V21I, E28A, V35Q, T39A, V60I, K122E, I135T, I142IT, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, R211K, V245Q, E248D, K277R, T286A, A288AT, V292I, I293IV, E297A, I326V, I329L, G335D  
HCIII-00356841 HCIII-00356841 None None   K49KR, V60I, S68G, V90I, I135T, A158AT, V245E, K277R, T286A, E297A, I326V, I329IV, Q334H  
HCIII-00359803 HCIII-00359803 None None M41L, T215D K103N T27S, V35VI, S48E, V60I, I135R, K166R, Q174QR, Q207E, K223R, A272T, K277R, R284K, T286A, I293V, P294Q, Q334HY  
HCIII-00360767 HCIII-00360767 None None   K104KR, K122Q, I142V, S162A, D177E, R211T, F214L, A272P, P294T, E297A  
HCIII-00373976 HCIII-00373976 None None   V60I, I135T, R211K, D237E, V241VI, A272S, T286A, K311R, I326V, I329V, Q334D H208D 
HCIII-00375662 HCIII-00375662 None None  H221Y V60I, S68K, D123E, I135T, S162Q, I178L, D192DN, G196E, R211K, V245E, K277R, T286A, I293V  
HCIII-00375902 HCIII-00375902 None None   R83K, K122E, D177N, G196E, T200TA, R211K, V245E, A272P, K277R, V292I, I293V, E297R  
HCIII-00375981 HCIII-00375981 None None  E138A K64R, A98S, K104KR, K122E, D123N, I132IL, I135T, K173KE, V179VI, R211RK, F214L, V245M, A272AG, T286A, I293V, E297K T131N 
HCIII-00380491 HCIII-00380491 None None  V179D K11R, K20R, K122KE, D123X, S162C, I180IV, T200I, R211RK, A272P, K277R, T286A  
HCIII-00381462 HCIII-00381462 None None  V108VI, H221HY E6D, K11KR, V35IM, K46KQ, S68G, R83K, V90VI, D123E, K166R, D177E, I178L, I202V, Q207QK, R211K, V245E, K277R, A288S, E297A, K311R, I329L  
HCIII-00381583 HCIII-00381583 None None   V60I, S68G, K122E, I135T, L193F, G196D, T200A, R211K, T286P, I293V, E297K, S322A, I329L  
HCIII-00387599 HCIII-00387599 None None   V35T, D123E, I135V, S162C, K173A, Q174K, Q207E, R211RK, P243T, V245Q, D250T, A272P, K275R, Q278Y, T286A, E291D, I293V, E297A, P321S, D324E, K331N, Q334H, G335D  
HCIII-00389102 HCIII-00389102 None None   S3R, S68G, I135T, I178L, I244V, V245VM, A272AP, K277R, T286A, I326V, Q334L  
HCIII-00396546 HCIII-00396546 None None   K11T, K20R, V21I, K32R, V35I, T39N, V60I, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177G, V179I, I202V, Q207D, R211K, V245Q, E248N, V276I, T286A, E291D, I293V, P294T, E312D  
HCIII-00399759 HCIII-00399759 None None   D123E, I135T, S162C, R211K, A272P, K277R, I293V, G333E  
HCIII-00407676 HCIII-00407676 None None   R83K, T165I, E169D, T200A, A288G, V317A  
HCIII-00413041 HCIII-00413041 None None   E6D, V35T, E40D, K49R, I135L, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E, V245Q, L246I, K275Q, T286A, E291D, I293V, P294T, L295I, S322T, G335D  
HCIII-00414888 HCIII-00414888 None None   V8VI, T39A, S68G, T69TN, D123E, I135AT, V179VI, G196GE, R211K, F214FL, V245VM, T286A, A288AS, I293IV, E312K, I326V, Q334QH, G335D L168LF 
HCIII-00415440 HCIII-00415440 None None  E138A S162C, R211K, A272P, A288S, V292I, I293V, P294T, E297A, K311KR, Q334E  
HCIII-00415821 HCIII-00415821 None None   V35I, K103KR, K122E, D123E, I142V, D177E, G196E, T200I, F214L, K277R, T286A, I293V, E297K P97PS 
HCIII-00416350 HCIII-00416350 None None   S3R, V35T, E36D, V90I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322T, G335D