Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ramkissoon (2015)
Title Analysis of reverse transcriptase and protease genes of HIV for antiretroviral drug resistance in treatment-exposed Jamaican pediatrics.
Citation AIDS Res Hum Retroviruses
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 40
NumPts 40
Subtype B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
4UH0001 4UH0001 AZT, 3TC NVP M184V K103N A98S, D123E, I135T, S162Y, D177E, I178M, E204Q, Q207A, R211Q, V245Q, E248D, D250E  
4UH0002 4UH0002 AZT, 3TC NVP L210LW, T215Y Y188L V35I, L109I, D177E, G196E, H208HY, R211RK, P243T, V245E  
4UH0003 4UH0003 AZT, 3TC NVP M184V K103N V35M, T39A, R83K, D123E, I135L, S162HY, E169D, I178M, R211K, V245X D250DV 
4UH0004 4UH0004 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, T215V, K219Q K103N T69N, K102R, K122P, I135T, S162CY, D177E, Q207A, R211K, L228H, V245Q, E248D  
4UH0005 4UH0005 AZT, 3TC NVP K70R, M184V K103N V8VI, V35T, V90I, D123E, I135V, T139R, G196Q, I202V, E204Q, Q207A, R211K, D237E, V245M, E248D, D250E  
4UH0006 4UH0006 AZT, 3TC NVP M184V, T215Y H221Y T27S, V60I, S68G, A98S, K122E, I135T, S162Y, D177E, V179I, Y188W, V245K  
4UH0007 4UH0007 AZT, 3TC NVP M41L, M184V, L210L*W, T215FY A98G, Y181C, G190A T39TA, K49R, A158AS, T165L, E169D, D177E, I178L, G196GE, T200K, F214L, T216TP, E248D  
4UH0008 4UH0008 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, T215F, K219E K101E, Y181C, G190A I5L, A62T, K104R, K122E, T139R, D177E, V245M, D250E  
4UH0009 4UH0009 AZT, 3TC NVP M184V Y181C, H221Y S68G, K101R, D123E, T139K, K166R, D177E, V179I, T200I, E204Q, Q207A, R211K, V245E, D250E  
4UH0010 4UH0010 AZT, 3TC NVP M41L, T69D, L74I, M184V, L210W, T215Y, K219R K103N P4S, K32N, V35T, T39A, E40F, K43E, A98S, V111I, V118I, K122E, I135K, I142T, V179VI, T200K, H208Y, R211K, L228V, Q242K, V245VE, E248ED  
4UH0011 4UH0011 AZT, 3TC NVP M41ML, D67N, M184V, T215F, K219E V108I, Y181C I50V, V90I, L109I, D123E, D177E, G196E, E204Q, R211K, D218E, L228H  
4UH0012 4UH0012 AZT, 3TC NVP T215Y K103N K11KR, A98S, K122E, D123N, I135IT, S162T, D177E, I178M, T200A, E204Q, Q207E, R211K, D250N  
4UH0013 4UH0013 AZT, 3TC NVP M184MV A98G, V179D, Y181YC V60I, S68G, K102E, K103KR, K122X, I142IV, S162SC, D177DE, I178L, T200E, E204Q, Q207A, R211K, V245E, E248ED W212W*, W229W* 
4UH0014 4UH0014 AZT, 3TC NVP M41L, D67N, L74V, M184V, T215F, K219E G190A P4S, V35L, S68G, A98S, K101A, K102KR, K104KR, K122E, S162CY, D177E, V179I, R211K  
4UH0015 4UH0015 AZT, 3TC NVP T215Y K103N, V179F, Y181C, H221Y T39A, K102R, K122E, I135V, S162C, R211Q, L228R, P243S  
4UH0016 4UH0016 AZT, 3TC NVP M41L, V75I, M184V, T215Y V108VI, Y181C I31L, E36D, E44ED, K101KQ, D123E, I132L, Q207A, R211K, L228R, V245I, D250E  
4UH0017 4UH0017 AZT, 3TC NVP D67DN, M184V, L210LW, T215Y K103N S48T, K122E, D123E, I135IKM D218DH 
5BCH0023 5BCH0023 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, T215F, K219E K103S, G190A V35M, V60I, T69N, K102Q, V118I, K122Q, Q174D, D177E, F214L  
5BCH0024 5BCH0024 AZT, 3TC NVP M184V V106A, P225H P4S, S68G, I178L, T200A, E204Q, Q207A, R211K, F214L, V245M, E248D  
5BCH0026 5BCH0026 AZT, 3TC NVP M41L, V75M, M184V, L210W, T215Y A98G, Y181C K11R, V35I, K43Q, K49R, N54I, S162C, T165L, D177E, V179I, T200A, E204Q, Q207A, R211K, L228H, E248D  
5BCH0043 5BCH0043 AZT, 3TC NVP T69D, K70R, M184V G190A, M230L K104R, D123E, D177E, V179I, F214L, K219G, L228H, K238R, E248D  
5BCH0044 5BCH0044 AZT, 3TC NVP M184V, T215F K103S, G190A E44D, K49R, I135M, S162C, Q174N, T200A, Q207E, R211K, E248D  
5BCH0046 5BCH0046 AZT, 3TC NVP M41L, A62V, M184V, T215F V106A, F227L K11R, K122E, S162Y, T200A, Q207A, R211K, E248D  
5BCH0047 5BCH0047 AZT, 3TC NVP M184MV Y181YC, G190GA D123E, E169D, Q174K, D177E, G196E, I202V, L210X, R211Q, F214L, K238R, V241I, V245EK, E248ED  
5BCH0062 5BCH0062 AZT, 3TC NVP M184V K101E, G190A E28EA, S48T, A98AS, D121H, K122E, V179I, G196R, Q197E, V245M, D250E  
5BCH0063 5BCH0063 AZT, 3TC NVP   V35M, R83K, I135T, I159IV, S162A, T165TI, I178M, K201R, R211*  
5BCH0065 5BCH0065 AZT, 3TC NVP M184MV K103N V35M, K49R, D123E, I135T, S162C, G196E, E204Q, Q207AE, R211K, E248D, D250E  
5CHC0027 5CHC0027 AZT, 3TC NVP M184V K103N E28A, V35T, K101Q, E169A, K173E, D177E, I178L, Q207A, R211K, V241I, I244V, V245M, D250E E248W 
5CHC0029 5CHC0029 AZT, 3TC NVP M41L, L74I, M184V, L210W, T215Y K103N, V106I, Y181C S3C, K43E, E44A, K49R, K122E, I135T, T139K, D177E, T200A, E204Q, Q207E, H208Y, R211K, H221C, L228R, V245M, E248D  
5UH0018 5UH0018 AZT, 3TC NVP M184V, T215Y K101H, Y181C, H221Y V35T, K122E, I135V, S162C, E204Q, Q207A, R211K, V245K  
5UH0019 5UH0019 AZT, 3TC NVP M184V G190A I135M, S162C, I178F, T200A, E204Q, Q207E, R211K  
5UH0020 5UH0020 AZT, 3TC NVP M184V, T215Y K103N V35M, E204Q, Q207A, R211K, V241I, V245T  
5UH0021 5UH0021 AZT, 3TC NVP K70R, T215F, K219KQR A98G, Y181C V35M, K46Q, K64KR, T69N, D123E, I135V, S162C, K173N, T200A, E204Q, Q207AE, R211K, L228R, E248D  
5UH0022 5UH0022 AZT, 3TC NVP  K101E, E138A, G190A V35T, K49R, V60I, R83RK, V90I, A98S, K122E, K173Q, D177G, V179I, T200A, I202V, D237DE, E248D  
5UH0031 5UH0031 AZT, 3TC NVP M184V, T215Y K103N, V108I S68SG, I135T, I178M, T200A, Q207E, L210F, R211K, V245EK  
5UH0038 5UH0038 AZT, 3TC NVP T215Y Y181C V35T, S68G, V90I, K101R, D123E, I135V, T139R, S162C, R172RK, I178L, R199RK, Q207E, P243S, V245T P217A 
5UH0057 5UH0057 AZT, 3TC NVP M41L, M184V, T215F K101E, E138A, G190A P4PS, K20R, S162C, V179I, T200A, Q207A, R211K, E248D  
5UH0059 5UH0059 AZT, 3TC NVP M41L, M184V, L210LW, T215F A98G, Y181C, G190A K43KQ, K49R, F87L, S162SG, T165L, E169D, D177E, I178L, G196GE, T200K, R211RK, F214FL, E248D  
5UH0070 5UH0070 AZT, 3TC NVP M184V K103N, Y181C, H221Y K20R, K122E, D123N, I135T, D177E, T200A, Q207E, V245E  
BCH0025 BCH0025 AZT, 3TC NVP D67DG, K219KE K103KN, V179VF, Y181YC T69TN, K101KR, K122E, I135T, S162A, T165TI, G196GE, I202V, R211K, T215X, L228LR, Y232YH, V245VE  

Database

Resources

Team