Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Lima (2016)
Title HIV-1 infection and pregnancy in young women in Brazil: socioeconomic and drug resistance profiles in a cross-sectional study.
Citation BMJ Open
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 87
NumPts 87
Subtype B, F, C, CRF12_BF

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
BRGO4000 BRGO4000 None None   V60I, V90I, D123E, I135T, I142V, R211K  
BRGO4001 BRGO4001 NRTI NNRTI   V35I, R83K, D123E, I135T, S162C, F214L  
BRGO4002 BRGO4002 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, I178V, T200A, E204K, Q207E  
BRGO4003 BRGO4003 AZT, 3TC None   V35I, S68N, K82R, T200A, I202V L210G 
BRGO4004 BRGO4004 NRTI NNRTI M184V  K49R, I135T, K166R, E169K, K173E, F214L, W229G  
BRGO4005 BRGO4005 AZT, 3TC None   V35M, I135T, K166R, D177N, T200I, F214L  
BRGO4006 BRGO4006 None None   K102R, D123E, I135T, D177E  
BRGO4013 BRGO4013 NRTI NNRTI A62V, M184V K103N, P225H K122E, S162C, T200A, Q207E, L228R  
BRGO4017 BRGO4017 NRTI NNRTI   S162C, E169D, D177N, T200A, Q207E, R211K  
BRGO4018 BRGO4018 NRTI NNRTI   D123E, I142V, D177E, T200I, F214L  
BRGO4024 BRGO4024 NRTI NNRTI   E6EK, K13KR, V35X, K122E, D123E, S162C, V189VI, T200A, R211RK  
BRGO4027 BRGO4027 TDF, AZT, 3TC None   E6ED, V35T, E40D, K49R, V60I, K122KE, I135T, S162C, E169D, F171Y, K173A, Q174K, R199K, T200TA, I202V, R211RG, F214L  
BRGO4028 BRGO4028 NRTI NNRTI M184V, T215Y K103N, P225H E28K, D123E, I135T, S162C, T200A, Q207E  
BRGO4029 BRGO4029 NRTI NNRTI   K122E, I135T, I202V  
BRGO4031 BRGO4031 NRTI NNRTI   V35T, E36A, T39D, S48T, D123E, I142V, K173AT, D177E, T200A, Q207E, R211K  
BRGO4032 BRGO4032 NRTI NNRTI   K49R, K122E, D123NS, I135IT, S162C, D177E, I178IL, T200TI, Q207E, R211K  
BRGO4034 BRGO4034 NRTI NNRTI   K122E, I135T, T165I, D177E, G196GD, T200A, Q207E, F214L  
BRGO4035 BRGO4035 NRTI NNRTI   K20R, V35T, T39L, E40D, T165I, D186N  
BRGO4036 BRGO4036 NRTI NNRTI   V35E, I135R, S162C, Q207E  
BRGO4037 BRGO4037 AZT, 3TC None   K20R, V60I, D123E, I135T, D177E, T200A, R211K  
BRGO4038 BRGO4038 NRTI NNRTI   K20R, D121H, K122E, I135T, T165I, I178L, G196E, T200I, F214L  
BRGO4042 BRGO4042 NRTI NNRTI   K20R, K49R, V60VI, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178L, Q207E, R211K  
BRGO4043 BRGO4043 NRTI NNRTI D67N, K70KR, M184V, T215Y, K219DE L100I, H221Y V35T, S68G, K122E, D123E, I135T, V179I, I202V  
BRGO4046 BRGO4046 NRTI NNRTI M184V K103N T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, I142T, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K  
BRGO4048 BRGO4048 AZT, 3TC None   K104R, V118I, D123E, I135T, S162C, T165I, T200A, R211K, F214L G45K 
BRGO4049 BRGO4049 NRTI NNRTI   E6D, K32R, K122E, D123E, K173E  
BRGO4050 BRGO4050 AZT, 3TC None   V35T, S68G, D121DH, K122KE, I135T, I142L, T165TI, D177E, G196E, T200A, R211K  
BRGO4054 BRGO4054 NRTI NNRTI   K64R, K122E, I135M, S162C, D177E, I178L, V179I, E194K  
BRGO4055 BRGO4055 NRTI NNRTI   V35T, E36A, T39E, S48T, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
BRGO4056 BRGO4056 NRTI NNRTI   D123E, S162C, Q207E, R211M  
BRGO4057 BRGO4057 None None  V106I D123E, I142V, E204D  
BRGO4058 BRGO4058 NRTI NNRTI   S68G, K122E, D123E, I135T, P176Q, G196E, Q207A  
BRGO4059 BRGO4059 None None   P4S, V8I, V21I, V35I, V60I, I135T, P176S, T200A, I202V, R211K  
BRGO4060 BRGO4060 NRTI NNRTI   K20R, V35T, E36D, T39R, I142V, A158S, G196E, T200V, Q207K, R211G  
BRGO4062 BRGO4062 NRTI NNRTI   K11KR, K20KR, V35I, K103R, A158S, T165I, T200N, Q207QR, R211K, F214L  
BRGO4063 BRGO4063 NRTI NNRTI  E138A K20R, V35T, K49R, V60I, K122E, S162C, E169D, F171Y, K173A, Q174K, T200I, Q207A, R211K  
BRGO4064 BRGO4064 NRTI NNRTI   K20R, V35VI, K64R, K122E, I135IT, R211K  
BRGO4065 BRGO4065 NRTI NNRTI   A98S, I135T, D177E, I195R, G196E, T200M, I202V, R211K, E224D  
BRGO4066 BRGO4066 AZT, 3TC None   V35T, E36D, T39D, K43R, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, T200A, E204K, Q207E, R211K  
BRGO4067 BRGO4067 NRTI NNRTI   E6EK, E42K, K49KR, K122E, D123N, I135T, D177E, Q207E, R211K W71W* 
BRGO4068 BRGO4068 NRTI NNRTI   V35T, E40D, V60I, D123E, I135V, D177E, R211K  
BRGO4075 BRGO4075 NRTI NNRTI   E6D, V35T, T39A, E40D, K49R, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207E, R211K  
BRGO4109 BRGO4109 None None   K102Q, I135T, S162C, R211K  
BRGO4112 BRGO4112 NRTI NNRTI   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, K173A, D177E, I178M, I180V, T200A, Q207G, R211K  
BRGO4118 BRGO4118 None None  E138A V35T, T39L, A98S, K122E, D123N, I135T, S162C  
BRGO4126 BRGO4126 NRTI NNRTI  V106I V21I, K122E, S162C, T200A, Q207E, R211K  
BRGO4151 BRGO4151 AZT, 3TC None   P4S, A98S, A158S, I178L, G196E, Q197K, R211G  
BRGO4153 BRGO4153 None None   I135T, S162C, E169D  
BRGO4155 BRGO4155 None None   K20R, V35T, I135V, Q207E, R211K  
BRGO4160 BRGO4160 None None   K49R, A98S, K122E, S162D, Q207E  
BRGO4170 BRGO4170 None None   S48T, K122E, I135T, Q145QH, D177E  
BRGO4172 BRGO4172 AZT, 3TC None   D123E, I135M, K166R, Q174H, D177E, R211K  
BRGO4181 BRGO4181 NRTI NNRTI   V35I, S68G, K102R, K122E, I135T, V189I, I195L, G196V  
BRGO4183 BRGO4183 None None   E6N, K11H, V35T, T39L, V60I, D123X, I135L, T139TK, I142IT, S162Y, K173A, Q174K, I178M, V179I, T200TI, R211K  
BRGO4184 BRGO4184 None None   E6D, K20KR, V60I, D123E, I135L, K166R, D177E, T200A, I202V, L210S, R211Q  
BRGO4186 BRGO4186 None None   V21I, K102E, I135T, S162Y, K173KE, Q174K, T200A  
BRGO4187 BRGO4187 NRTI NNRTI   A98S, K122E, I135T, D177E  
BRGO4188 BRGO4188 NRTI NNRTI M184V E138A K20R, V35I, S48T, A98S, I135L, E194EQ, T200TA, Q207E, R211K  
BRGO6000 BRGO6000 None None   K20R, V35T, T39S, I135V, G196E, T200S, Q207E, R211K  
BRGO6001 BRGO6001 None None   K49R, K122E, I135T, E169D, K173E, D177E, T200A, I202V, Q207E  
BRGO6002 BRGO6002 None None   E36ED, S48T, I50IV, V60I, D123E, F171Y, Q174QR, D177E, V179VI, I195L, T200E, R211K  
BRGO6003 BRGO6003 None None  V179E K20R, A98S, D121H, K122E, D123DG, I135K, S162A, T200A, I202V  
BRGO6004 BRGO6004 None None   V35M, S68G, I135T, A158S, S162A, T165I, R211Q  
BRGO6005 BRGO6005 None None   V35T, K104Q, K122E, I202V  
BRGO6006 BRGO6006 None None   V21I, I135T, I142IV, S162Y, R211AT  
BRGO6007 BRGO6007 None None   I50V, D121Y, K122E, I135T, T139I, S162C, I178L  
BRGO6008 BRGO6008 None None   V35T, S48T, V60I, I135V, Q174K, I178M, R211K  
BRGO6009 BRGO6009 None None   R83K, K122P, T165I, G196E  
BRGO6011 BRGO6011 None None   K20R, K122A, I135T, T165I, R211K, F214L  
BRGO6012 BRGO6012 None None   E36EK, K49R, K102Q, K122E, I135T, S162C, D177E, I178M, G196E  
BRGO6016 BRGO6016 None None  E138A V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, T69S, L149LP, S162C, K173T, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207E, R211K  
BRGO6018 BRGO6018 None None   V35L, S68G, D123E, G196E, Q207A, R211A  
BRGO6019 BRGO6019 None None  V106I V35T, T39K, E40D, K43Q, K49R, V118I, S162Q, E169D, K173A, Q174K, D177E, D192N, T200A, Q207E, F214L  
BRGO6020 BRGO6020 None None   V21I, K49R, K104N, D123E, I135T, T139A, S162C, D177E, I178M, T200A, R211K F61FL 
BRGO6021 BRGO6021 None None   V35M, V60I, R83K  
BRGO6022 BRGO6022 None None   A98S, K102Q, K122E, D123G, I135T  
BRGO6024 BRGO6024 AZT, 3TC None   E6D, K20R, V21I, R78RK, D123E, I135T, T139I, E169D, K173R, F214L L210A 
BRGO6026 BRGO6026 None None   K122E, S162C, Q174K, Q197P, F214L  
BRGO6027 BRGO6027 AZT, 3TC None   K11T, V35T, E36A, T39D, S48T, D121Y, K122KE, I135L, K166R, K173T, D177G, I178V, T200A, Q207G, H208Y, R211K  
BRGO6028 BRGO6028 None None T215S  S68G, D123E, D177E, I178M, T200A, R211K P52PH 
BRGO6031 BRGO6031 None None M41L, T215D  V35R, K122E, D123N, I135T, T165I, Q174QR, P176PT, I178IM, Q197K, I202IV, R211K  
BRGO6032 BRGO6032 None None M41L, T215C  V35R, K122E, D123N, Q197K, R211K D192DY 
BRGO6033 BRGO6033 None None   K49R, K122E, Q174R, D177E, I178M, Q207E, R211K  
BRGO6034 BRGO6034 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K166R, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L  
BRGO6035 BRGO6035 None None  V106I V35T, T39R, K49R, A98S, D123E, Q145E, E169D, Q174K, R211K, F214L, E224D  
BRGO6036 BRGO6036 None None   E28EK, E29EK, E44EK, I142V, T165I, T200A, R211A  
BRGO6037 BRGO6037 None None   K20R, V35K, K49R, V60I, D123E, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207N, R211K  

Database

Resources

Team