Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Chehadeh (2015)
Title Phylogenetic analysis of HIV-1 subtypes and drug resistance profile among treatment-naïve people in Kuwait.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 30
NumPts 30
Subtype B, CRF01_AE, C, A, CRF02_AG

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
10988 10988 None None   T39I, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245K  
12094 12094 None None   W88C, D123E, I135T, Q145C, P176Q, T200E, I202V  
1302 1302 None None A62V  T39K, V60I, D121H, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M  
1532 1532 None None   T39E, E40ED, S48T, V60VI, K122E, D123S, I135R, K166R, K173A, D177E, T200A, I202IV, Q207E, R211K, V245Q  
2178 2178 None None  E138A E40D, K122E, S162C, V179I, Q207A, R211S, V245K  
21831 21831 None None   A98S, Q197P, R211K  
21971 21971 None None  A98G T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135L, R172K, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
21972 21972 None None  A98G T39K, K43E, V60I, S68SR, K122E, D123S, I135L, R172K, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F227S, K238R, V241I, V245E  
22009 22009 None None   V60I, K122E, D123E, I135V, S162A, K173I, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q  
22111 22111 None None   D123E, I135T, S162A, K173T, Q174E, D177E, Q197L, T200A, I202V, Q207E, V245Q  
2577 2577 None None   E40D, V60I, K122E, I135T, S162A, K173A, Q174K, P176PQ, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245E  
30801 30801 None None   T39E, I47IF, S48T, V60I, K122E, K173A, I178M, T200A, E203D, E204K, Q207E, R211K, V245Q K73KN, L209LM 
3475 3475 None None   T39K, V60I, K122E, D123S, I135L, F171Y, R172K, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245E  
4276 4276 None None   T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, S162N, K166R, K173A, V179I, T200TA, Q207K, R211K, V245VE  
513 513 None None   D123E, I135L, P176Q, Q197E, T200A  
571 571 None None   T39E, E40D, K49R, I50V, V60I, K103R, K122E, D123S, I135T, K173T, Q174K, T200A, Q207E, F214L, V245Q  
5717 5717 None None   T39I, V60I, K122E, D123S, P176S, G196E, R211K, V245K  
5827 5827 None None   A98S, R211K  
6295 6295 None None   T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123N, I135T, I142V, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E  
6314 6314 None None T215N A98G T39K, K43E, V60I, L100F, K122E, D123S, I135L, K173I, Q174K, D177E, G196E, Q197E, Q207A, V245E G99E, L187W, R206I 
6920 6920 None None  V179D T39E, E40D, K122E, D123S, I135T, K173T, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
7490 7490 None None   D123E, I142V, K166R, D177E, I178M, R211Q, V245Q  
7532 7532 None None   T39E, S48T, D121Y, K122E, I135T, K173G, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
7750 7750 None None   D123E, I135T, I142V, P176Q, T200E  
8618 8618 None None   T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123DE, I135R, T165I, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
8830 8830 None None   A98S, Q197P, R211K  
9589 9589 None None   T39K, K43E, K122E, D123G, K173I, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245K  
972 972 None None   K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
9773 9773 None None   I50IV, A98S, Q197P, R211K W88W*, D185DE 
9820 9820 None None   T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  

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