Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Abram (2016)
Title Pre-existing HIV-1 integrase polymorphisms do not impact treatment response to elvitegravir-containing fixed-dose combination regimens in treatment-naive patients.
Citation HIV Drug Therapy 2016 Glasgow
SelectedGene IN
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Lab
NumIsolates 52
Lab Parent Strain NL43

 

Lab IN Isolates : Susceptibility Data


IsolateINIMajorDRMsINIMinorDRMsMethodDrugFold Res.
A128T  A128T PhenoSense DTG 1.1 
     PhenoSense EVG 1.5 
     PhenoSense RAL 1.2 
E138A E138A  PhenoSense DTG 0.9 
     PhenoSense EVG 1.3 
     PhenoSense RAL 1.1 
E138K E138K  PhenoSense DTG 0.9 
     PhenoSense EVG 1.2 
     PhenoSense RAL 0.8 
E157K   PhenoSense DTG 1.6 
    PhenoSense EVG 1.4 
    PhenoSense RAL 1.4 
E157Q  E157Q PhenoSense DTG 1.1 
     PhenoSense EVG 1.8 
     PhenoSense RAL 1.3 
E170A   PhenoSense DTG 1.0 
    PhenoSense EVG 1.6 
    PhenoSense RAL 1.2 
E92G E92G  PhenoSense DTG 1.0 
     PhenoSense EVG 9.0 
     PhenoSense RAL 1.5 
E92Q E92Q  PhenoSense DTG 1.3 
     PhenoSense EVG 26 
     PhenoSense RAL 4.5 
F121Y F121Y  PhenoSense DTG 0.6 
     PhenoSense EVG 16 
     PhenoSense RAL 5.3 
G140A G140A  PhenoSense DTG 0.7 
     PhenoSense EVG 5.4 
     PhenoSense RAL 2.7 
G140C G140C  PhenoSense DTG 0.5 
     PhenoSense EVG 6.1 
     PhenoSense RAL 1.1 
G140S G140S  PhenoSense DTG 0.8 
     PhenoSense EVG 5.0 
     PhenoSense RAL 1.4 
G163K  G163K PhenoSense DTG 0.9 
     PhenoSense EVG 1.5 
     PhenoSense RAL 1.2 
G163R  G163R PhenoSense DTG 1.1 
     PhenoSense EVG 1.8 
     PhenoSense RAL 1.3 
H51Y  H51Y PhenoSense DTG 1.2 
     PhenoSense EVG 2.8 
     PhenoSense RAL 1.0 
L68I   PhenoSense DTG 0.7 
    PhenoSense EVG 1.9 
    PhenoSense RAL 0.9 
L68V   PhenoSense DTG 0.6 
    PhenoSense EVG 1.7 
    PhenoSense RAL 0.9 
L74M   PhenoSense DTG 0.7 
    PhenoSense EVG 1.7 
    PhenoSense RAL 1.2 
M50I   PhenoSense DTG 1.1 
    PhenoSense EVG 1.5 
    PhenoSense RAL 1.2 
N155H N155H  PhenoSense DTG 1.3 
     PhenoSense EVG 30 
     PhenoSense RAL 12 
P145S P145S  PhenoSense DTG 0.3 
     PhenoSense EVG 28 
     PhenoSense RAL 0.7 
Q146I   PhenoSense DTG 2.2 
    PhenoSense EVG >115 
    PhenoSense RAL 3.2 
Q146K   PhenoSense DTG 0.8 
    PhenoSense EVG 2.2 
    PhenoSense RAL 0.8 
Q146L   PhenoSense DTG 1.3 
    PhenoSense EVG 15 
    PhenoSense RAL 1.0 
Q146P Q146P  PhenoSense DTG 0.5 
     PhenoSense EVG 6.5 
     PhenoSense RAL 0.8 
Q146R   PhenoSense DTG 1.4 
    PhenoSense EVG 4.9 
    PhenoSense RAL 1.6 
Q148H Q148H  PhenoSense DTG 0.4 
     PhenoSense EVG 4.9 
     PhenoSense RAL 15 
Q148K Q148K  PhenoSense DTG 1.5 
     PhenoSense EVG 94 
     PhenoSense RAL 37 
Q148R Q148R  PhenoSense DTG 1.1 
     PhenoSense EVG 92 
     PhenoSense RAL 29 
Q95K  Q95K PhenoSense DTG 1.1 
     PhenoSense EVG 1.9 
     PhenoSense RAL 1.3 
Q95R   PhenoSense DTG 1.0 
    PhenoSense EVG 1.7 
    PhenoSense RAL 1.2 
R263K R263K  PhenoSense DTG 1.7 
     PhenoSense EVG 4.6 
     PhenoSense RAL 1.1 
S119G   PhenoSense DTG 0.9 
    PhenoSense EVG 1.5 
    PhenoSense RAL 1.1 
S119P   PhenoSense DTG 0.9 
    PhenoSense EVG 1.9 
    PhenoSense RAL 1.0 
S119R   PhenoSense DTG 1.1 
    PhenoSense EVG 2.1 
    PhenoSense RAL 1.3 
S119T   PhenoSense DTG 1.0 
    PhenoSense EVG 1.6 
    PhenoSense RAL 1.3 
S147G S147G  PhenoSense DTG 1.0 
     PhenoSense EVG 4.1 
     PhenoSense RAL 1.1 
S153A   PhenoSense DTG 1.0 
    PhenoSense EVG 1.9 
    PhenoSense RAL 0.9 
S153F  S153F PhenoSense DTG 1.9 
     PhenoSense EVG 2.7 
     PhenoSense RAL 1.2 
S153Y  S153Y PhenoSense DTG 2.1 
     PhenoSense EVG 3.0 
     PhenoSense RAL 1.2 
T66A T66A  PhenoSense DTG 0.3 
     PhenoSense EVG 7.6 
     PhenoSense RAL 0.9 
T66I T66I  PhenoSense DTG 0.3 
     PhenoSense EVG 9.7 
     PhenoSense RAL 0.9 
T66K T66K  PhenoSense DTG 1.7 
     PhenoSense EVG 40 
     PhenoSense RAL 8.0 
T97A  T97A PhenoSense DTG 0.6 
     PhenoSense EVG 2.9 
     PhenoSense RAL 1.4 
V151A V151A  PhenoSense DTG 0.8 
     PhenoSense EVG 2.7 
     PhenoSense RAL 1.4 
V151L V151L  PhenoSense DTG 1.6 
     PhenoSense EVG 20 
     PhenoSense RAL 15 
V72A   PhenoSense DTG 0.6 
    PhenoSense EVG 4.2 
    PhenoSense RAL 1.0 
V72N   PhenoSense DTG 0.6 
    PhenoSense EVG 6.1 
    PhenoSense RAL 1.1 
V72T   PhenoSense DTG 0.9 
    PhenoSense EVG 2.4 
    PhenoSense RAL 1.1 
Y143C Y143C  PhenoSense DTG 0.8 
     PhenoSense EVG 1.1 
     PhenoSense RAL 3.4 
Y143H Y143H  PhenoSense DTG 0.9 
     PhenoSense EVG 1.2 
     PhenoSense RAL 2.1 
Y143R Y143R  PhenoSense DTG 1.3 
     PhenoSense EVG 2.1 
     PhenoSense RAL 18 

Database

Resources

Team