Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Liegler (2014)
Title HIV-1 drug resistance in the iPrEx preexposure prophylaxis trial.
Citation J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 134
NumPts 134
Subtype B, CRF01_AE, CRF02_AG, C, F, CRF12_BF, A, CRF60_BC


  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 134 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
8730001 8730001 None None   V60I, R83K, K104R, I135V, I178IM  
8730088 8730088 None None M41L  T39A, K122E, D123S, I135T, G196E, T200A, V245M  
8730104 8730104 None None   K173R, Q197P, R211K, V245K  
8831678 8831678 None None   K122E, Q174K, D177E, G196E, T200I, I202V, Q207K, R211A, V245M  
8932007 8932007 None None   K49R, A98S, I178M, G196E, E204K, Q207E, R211S, V245M  
8932010 8932010 None None   K122E, I135T, G196E, T200I, I202V, V245M  
8944080 8944080 None None   K49R, V60I, K122E, I135T, E169D, R211K, F214L  
8944264 8944264 None None  V106I S48T, K101Q, K104N, D123E, E169D, I202V, R211K, E224D  
8944918 8944918 None None   K122E, D123N, I135T, K173E, P176S, T200A, V245I  
9010202 9010202 None None   K49KQR, K122E, D123E, I135T, R211K, V245R  
9010284 9010284 None None   I135T, I178M, T200I, Q207H, R211K  
9010398 9010398 None None   V60I, K102R, K104R, I135V, I142V, I178M, G196E, R211G  
9010488 9010488 None None   I135R, K166R, T200Q, I202V, E204G, Q207E, R211K, I244V, V245T  
9010609 9010609 None None   S48T, A98S, G196E, T200R, R211Q, V245M  
9010730 9010730 None None   K102Q, K103R, K122E, I135T, I178M, V179I, Q207E, R211K, V245T  
9010908 9010908 None None   T39A, V60I, S68G, K122E, D123N, I135T, I178L, I195L, T200A, R211K, F214L  
9010963 9010963 None None   T39E, I135V, K173M, Q174K, D177N, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
9014206 9014206 None None   S68G, V90I, K122E, I178M, I195L, G196A, V245K  
9014224 9014224 None None  K103N K102R, I178M, V179I, Q207E, R211K, V245M  
9014717 9014717 None None   F214L, P243PST  
9015339 9015339 None None   V60I, K101T, K102Q, K103R, K104R, I135V, I142V, I178M, G196E, R211G  
9015536 9015536 None None   K166R, T200A, V245N  
9015887 9015887 None None   I135T, I178M, T200I, Q207H, R211K  
9015957 9015957 None None   D123E, I178M, T200E, R211K  
9022123 9022123 None None   F87FL, S162SC, I202V, E204D, F214L, V245T  
9022416 9022416 None None   E40ED, K49KR, V60I, I135V, I142IV, V189VI, G196GE, T200A, V245K  
9022653 9022653 None None   K102R, K122E, I135T, I142V, K173Q, D177E, V189I, G196V, T200A, I202V, R211K  
9022677 9022677 None None   I135R, K173E, T200I, V245M  
9022999 9022999 None None   K103R, K104R, D123E, V179I, T200E, R211K  
9051738 9051738 None None   K102Q, K103R, I178M, V179I, Q207QEK, R211RK, V245T  
9111000 9111000 None None   V60I, K102R, I135V, I178IL, F214L  
9111124 9111124 None None   K122E, D123N, I142T, T200I, Q207D  
9111213 9111213 None None  V108I K101R, D123E, V179I, G196Q, Q197K, T200D, Q207K  
9111280 9111280 None None   K122E, I135T, I142T, G196E, F214L, V245T  
9111375 9111375 None None   V60I, K102Q, S105A, I135V, I142V, I178M, G196E, R211G  
9111417 9111417 None None   I135T, I142M, Q174K, V245K  
9111578 9111578 None None   D123E, G196E, R211K  
9111703 9111703 None None   V60I, D123S, E169D, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, E203D, Q207A, R211S, V245M  
9111848 9111848 None None   D123N, D177E, E204D, R211KT, F214L  
9116160 9116160 None None   K49R, A98S, K102R, V179I, R211K, V245M  
9116351 9116351 None None   K122E, I135IT, D177E, G196GE, Q197X, T200E  
9116390 9116390 None None   K122E, I135T, D177E, Q197P, T200E, F214FL  
9116413 9116413 None None   K122E, I135T, D177E, Q197P, T200E  
9116586 9116586 None None   S68G, K104N, K122P, D123E, I135T, T200I  
9117344 9117344 None None   K122Q, D123E, D177N, I178M, T200E, Q207R, F214L  
9117475 9117475 None None   V60I, K102R, I135V, Q174R, F214L  
9117660 9117660 None None   S68G, V90I, K122E, I178M, I195L, G196A, V245K  
9117849 9117849 None None   K49R, I50V, R83K, K102R, E169D, G196E, T200A, R211K, V245N  
9117989 9117989 None None   K122E, D123E, I135T, I142V, K173Q, Q174R, D177E, G196E, T200A  
9123030 9123030 None None   V60I, I135V, I142V, G196E, R211G  
9123602 9123602 None None  E138A V60VI, D123E, I135T, I142V, G196E, R211S, F214L, V245VE  
9150322 9150322 None None   T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
9150339 9150339 None None   V60I, K101T, K102Q, K103R, K104R, I135V, I142V, I178M, G196E, R211G  
9150490 9150490 None None  K103N K43Q, K102GR, I135L, E169D, Q174K, D177N, V179A, G196E, T200A, Q207D, R211K  
9212077 9212077 None None   K122Q, D123E, D177N, I178M, T200E, Q207R, F214L  
9212092 9212092 None None   T39A, K104N, D123E, S162C, R211K, F214L  
9218116 9218116 None None   K102Q, K103R, I135T, K173N, G196K, Q197E, T200E, I202V, R211K, F214L, V245I  
9218169 9218169 None None   V60I, D123E, I135T, K173N, Q174K, G196K, Q197E, T200I, R211K, V245M  
9218211 9218211 None None   E53D, I135V, I195T, G196K, Q197E, T200I, R211K, F214L, E224K, V245I  
9218406 9218406 None None   K122E, T200TI  
9218740 9218740 None None   K102Q, K103R, I135T, K173N, G196K, Q197E, T200E, I202V, E204G, R211K, F214L, V245I  
9218986 9218986 None None   K102Q, K103R, I135T, K173N, G196K, Q197E, T200E, I202V, E204G, R211K, F214L, V245I  
9219175 9219175 None None  V106I E44EK, V118VI, D123E, K173KN, E194ED, G196K, Q197E, T200V, K201KR, E204X, R211K, F214L, V245I  
9219392 9219392 None None   A98S, K102M, K122P, E169D, K173KR, Q174QK, N175H, I180V, G196E, T200A, K201T, R211RK, V245IK  
9219700 9219700 None None   V60I, K101R, I135M, K166R, R211K  
9252180 9252180 None None M184MV  R83K, D123E, D177E, T200A, I202V, E204G, Q207K, R211G, V245K  
9252420 9252420 None None   V60I, I135V, K173N, G196K, Q197E, T200I, R211K, F214L, V245M  
9252802 9252802 None None   G196R, T200A, E204D  
9313117 9313117 None None   T39L, K102Q, D123E, I135T, I142V, S162A, D177E, T200I, V245M  
9313352 9313352 None None  K101E K64R, D123E, Q174N, T200I, Q207G, R211K  
9313454 9313454 None None  V106I K49R, K122R, D123E, I135T, E169D, I178L, T200A, I202V, E204K, R211E, F214L, V245M  
9313612 9313612 None None   K103R, I135R, K173A, T200K, R211Q, F214L, V245M K73KR 
9313664 9313664 None None   I135T, S162C, Q174H, T200L, R211K  
9313697 9313697 None None   D123E, I135T, I142V, D177E, I180V, G196E, T200L, F214L  
9313739 9313739 None None   V60I, T165I, I195T, G196E  
9313920 9313920 None None   K64R, T200I L100LP 
9313956 9313956 None None   I50V, S68G, I135T, D177N, R211K, V245M  
9320086 9320086 None None   T39A, I135K, S162A, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, I202V, Q207K, F214L, V245Q  
9320666 9320666 None None   R83K, K122E, I135T, T200I  
9320802 9320802 None None   K64R, I135T, G196E, T200V, R211G  
9320851 9320851 None None   R83K, K103R, I135V, V179I, G196E, Q197K, T200A, E204D  
9320998 9320998 None None   V60I, R83K, D123E, I135T, D177E, G196E, T200V, H208HY, R211A, V245E  
9321108 9321108 None None   K122KE, I142V, G196D, E204EG, R211K, F214L, V245X  
9321117 9321117 None None   E40D, K104R, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, V179I, V189I, Q197E, T200A, I202V, E204K, Q207E, F214L, V245Q  
9321155 9321155 None None  V106I D123E, I142V, S162C, I178L, Q207E, L228F, V245T  
9321282 9321282 None None   K122E, I142V, G196D, R211K, F214L  
9321393 9321393 None None   I50V, S68G, Q174N, D177E, Q207A, R211K  
9321553 9321553 None None   K122E, I135T, D177E, R211K, F214L  
9321623 9321623 None None   E40D, A98S, K122E, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, V189I, Q197E, T200A, I202V, Q207K, V245Q  
9321891 9321891 None None   I50V, V60I, S68G, K104R, I135V, T200A, Q207E  
9433185 9433185 None None   K101R, D123E, I135T, I180V, T200E, V245L  
9433288 9433288 None None   K122A, E169D, K201R, F214L  
9534415 9534415 None None   T39M, K49R, K103R, I178L, V179I  
9635097 9635097 None None   T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, I135R, K173V, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
9635258 9635258 None None  E138A V60I, R83K, K122P, G196E, I202V  
9635826 9635826 None None   T39L, D123E, K166T, K173A, Q174K, D177E, I178M, Q207E, R211K, V245Q  
9736101 9736101 None None   T39K, K43E, K101KR, K102KQ, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238KR, V245E  
9736702 9736702 None None   T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, G196R, Q207A, R211S, K238R, I244V, V245E  
9736778 9736778 None None   T39K, K43E, K102KR, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
9736807 9736807 None None   T39K, K43E, K101R, K122E, D123N, I135L, T165I, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E