Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Lima (2016)
Title Epidemiological, clinical and antiretroviral susceptibility characterization of human immunodeficiency virus subtypes B and non-B in Pernambuco, northeast Brazil.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 167
NumPts 167
Subtype B, F, C, G

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 167 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
02PE003 02PE003 None None   S48T, T200A, R211K  
02PE005 02PE005 None None   K49R, K122E, S162A, E169K, K173E, D177E, I178M, V245K  
02PE008 02PE008 None None   T39S, S68G, D121H, K122E, I135T, D177E, G196E, R211G  
02PE011 02PE011 None None   K104R, I142T, V245M  
02PE016 02PE016 None None   E44D, E53D, K64R, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200I, Q207E, R211K, V245Q  
02PE017 02PE017 None None   V118I, K122E, T165I, F214L  
02PE023 02PE023 None None   T39K, E40D, K49R, D123E, I135T, S162C, E169D, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245K  
02PE024 02PE024 None None   S162A, D177E, I178L, V245M  
02PE025 02PE025 None None   D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178L, Q207E, R211K, V245Q  
02PE026 02PE026 None None   V60I, W88S, V118I, G196E, I202V, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245M D186H 
02PE027 02PE027 None None   S68G, D123E  
02PE032 02PE032 None None   T200A  
02PE033 02PE033 None None   I135T, S162T, D177E, G196E, V245E  
02PE035 02PE035 None None   I135T, V245M D110G 
02PE036 02PE036 None None   K49R, R72G, D123G, S162Y, E169D, K173T, Q174K, T200A, Q207D, R211K, V245Q V111E, I135N, N136K, P140Q 
02PE038 02PE038 None None   K122E, I135T, V245E  
02PE039 02PE039 None None  V179D T39L, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207D, R211K, V245Q  
02PE042 02PE042 None None   D177E, R211K, V245K  
02PE046 02PE046 None None  E138A S162T, T200A, R211K, V245Q  
02PE050 02PE050 None None   A98S, K122E, D123E  
02PE051 02PE051 None None   D177E, V245K  
02PE055 02PE055 None None   S48T, K122E, I135T, K173E, D177E  
02PE061 02PE061 None None   E79D, V118I, S162A, D177E, I178L, F214L  
02PE065 02PE065 None None   V60I, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
02PE066 02PE066 None None   K122E, I135T, S162A, K173N, Q207E, R211K  
02PE071 02PE071 None None   K122E, D123S, R211K  
02PE072 02PE072 None None   I135M, T165I, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245E  
02PE074 02PE074 None None   K122E, I135T, S162A, D177E, G196E, F214L, V245K  
02PE076 02PE076 None None   E79D, I135T, K173R, I202V, R211K, V245E  
02PE078 02PE078 None None   I135M, S162A, I178M, T200A, D237A, V245K  
02PE079 02PE079 None None   I135T, D177E, G196E, F214L  
02PE080 02PE080 None None   K102Q, K122E, I142V, Q174H, D177E, V245M  
03PE082 03PE082 None None   K49R, S105L, V106L, I135L, S162Y, E169D, K173T, Q174K, T200I, Q207D, R211K, V245Q  
03PE083 03PE083 None None   S48T, I50V, T69N, K122E, G196E, V245T  
03PE084 03PE084 None None   S68G, K122E, I135T, T165I, D177E, V245E  
03PE085 03PE085 None None   K122A, I142V, D177E, V245M  
03PE097 03PE097 None None   K49R, D123E, S162C, D177E, G196E, R211K, V245M  
03PE098 03PE098 None None   K122P, I135T, D177E, G196E, F214L  
03PE099 03PE099 None None   I50F, D123E, Q174R, R211K, V245E R172S 
03PE105 03PE105 None None   K122E, D123N, I135V, A158S, I159V, R211K, V245E  
07PE043 07PE043 None None   K49R, I135C, S162C, E169D, K173A, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
07PE045 07PE045 None None   R83K, S162A, K173R, D177E, T200V G45A 
07PE046 07PE046 None None   K46Q, V60I, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211K, V245Q H96Q 
08PE047 08PE047 None None   K49R, K122Q, I135L, S162Y, E169D, K173T, Q174K, D177E, V179I, G196E, T200A, Q207K, R211A, V245Q  
08PE048 08PE048 None None   T39M, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245H  
08PE055 08PE055 None None  G190A D123E, I142K, K173T, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, F214L  
08PE056 08PE056 None None   V60I, K122E, D123S, A158S, K166R, F171Y, K173A, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
08PE058 08PE058 None None   S68G, D123E, K166R, I178L, Q207E, P225T  
08PE059 08PE059 None None   Q174R, G196E, T200A, K201T, V245K  
08PE063 08PE063 None None   V118I, I135T, K166R, F214L, V245M  
08PE064 08PE064 None None   K49R, D123E, F171Y, D177E, I202V, R211K, V245L Q197N 
08PE066 08PE066 None None   K49R, D123E, I135T, S162C, E169D, K173I, Q174K, D177E, Q207E, R211K, V245Q  
08PE067 08PE067 None None   D123E, I135T, I178M, R211K, V245E  
08PE071 08PE071 None None  F227I G196E, T200I, R211K, V245M  
08PE072 08PE072 None None   K49R, K122E, D123S, I135T, S162C, G196E, R211K  
08PE073 08PE073 None None   K122E, D123N, K166R, D177H, T200I, I202V, V245K  
08PE074 08PE074 None None   K122E, D123E, I135T, D177E, R211K, F214L  
08PE075 08PE075 None None   E42K, D123E, S162C, K173R, Q174K, T200V, Q207D, R211K, V245Q  
08PE076 08PE076 None None  V179D I135T, S162C, G196E, I202V, R211Q, F214L, V245M  
08PE080 08PE080 None None   S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207E, R211A, V245Q  
08PE082 08PE082 None None F77L, M184V K101E, G190S V75L, K122E, D123N, E169D, D177E, G196E, T200A, V245K  
08PE087 08PE087 None None   K49R, I135T, S162C, E169D, K173T, Q174K, Q207E, R211K, V245Q  
08PE088 08PE088 None None   V60I, R83K, Q207A, E224D, L228F  
08PE089 08PE089 None None   T39D, K43R, S48T, K122E, K173A, D177G, T200A, R211K, V245K  
08PE091 08PE091 None None   D123E, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K, P243S, V245Q  
08PE092 08PE092 None None   D123E, I135T, E169D, K173A, Q174K, G196E, I202V, Q207E, V245Q  
08PE094 08PE094 None None   T39M, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207E, V245Q  
08PE098 08PE098 None None  V108I S162C, E169D, K173T, Q174K, I178L, V189I, Q207E, R211K, V245Q  
08PE100 08PE100 None None   A98S, K122E, I135T, A158S, I202V, V245E  
08PE103 08PE103 None None   D123E, I135T, T165I, G196E, I202V, R211K, V245T  
08PE109 08PE109 None None   K122E, D123N, Q174N, T200I, E203D, V245M  
08PE111 08PE111 None None   R83K, V90I, T200I, R211K  
08PE112 08PE112 None None   K49R, V60I, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, Q207A, H208L, R211K, V245Q  
08PE113 08PE113 None None   K49R, V60I, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, V245Q  
08PE114 08PE114 None None   K122E, D123N, I135T, I142V, S162A, Q174R, D177E, G196E, R211K, V245E  
08PE115 08PE115 None None   K49R, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, E204G, Q207E, R211K, T240S, V245Q N81D, T84A, T131I, L209P 
08PE117 08PE117 None None   K122E, I135T, S162A, K173Q, D177E, R211K, F214L, V245K  
08PE121 08PE121 None None   V118I, I135T, T139A, E169D, K173R, G196E, F214L, V245K  
08PE124 08PE124 None None  E138A T39E, S48T, D123E, I135T, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, P243A, V245Q  
08PE131 08PE131 None None   R83K, S162A, K173R, D177E, T200A, Q207E, V245E  
08PE133 08PE133 None None  E138A I135V, I142T, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207A, R211K, V245Q  
08PE139 08PE139 None None   K46E, T200A, I202V  
08PE143 08PE143 None None   V60I, K122P, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207K, R211A, V245Q  
08PE144 08PE144 None None   D123E, I135R, I180V, G196E, Q207A, V245K  
08PE150 08PE150 None None   D123E, S162A, D177E, G196E, V245T  
08PE151 08PE151 None None   K49R, D123E, I135T, S162C, K173A, Q174K, Q207N, R211K, V245Q  
08PE153 08PE153 None None   E169D, K173Q, V245E  
08PE154 08PE154 None None   I135T, S162A, D177E, I178V, V245T  
08PE159 08PE159 None None   K49R, I135V, S162C, E169N, K173A, Q174K, Q197E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
09PE171 09PE171 None None   T39L, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207A, R211K, V245Q  
09PE173 09PE173 None None   V111I, D123E, S162A, D177E, G196E, V245T  
09PE184 09PE184 None None   T39A, K49R, K102Q, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
09PE185 09PE185 None None   T39S, S48T, V118I, K122E, D123E, I135T, T165I, D177E, T200A, R211S, F214L, V245M  
09PE187 09PE187 None None   V60I, I135K, D177E, Q207K, R211K, V245K  
09PE188 09PE188 None None   T200A, R211K, P243T  
09PE194 09PE194 None None   K102Q, K122E, I135T, S162Y, K173E, Q174H, D177E, V245E  
09PE208 09PE208 None None   K49R, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
09PE211 09PE211 None None   E40D, K49R, V60I, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
09PE213 09PE213 None None   T39I, E40D, K49R, V60I, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
09PE214 09PE214 None None   K103R, V118I, K122E, K173A, I202V, R211G, F214L V245Y 

Database

Resources

Team