Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ndase (2012)
Title Outside sexual partnerships and risk of HIV acquisition for HIV uninfected partners in African HIV serodiscordant partnerships.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 294
NumPts 294
Subtype A, D, C, B, G, J

 
  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 294 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
50000512 50000512 None None   K11Q, V35T, T39TA, K49KR, V60VI, D123NS, I135T, I142V, K173AS, Q174R, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
50006862 50006862 None None   V21I, V35T, E36D, T39A, S48T, V60I, D121Y, K122E, T165I, D177E, Q207E  
50007042 50007042 None None   K11T, V35T, T39K, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, S162C, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
50014392 50014392 None None   K49R, V60I, R83RG, K122E, D123N, I135V, A158S, S162Q, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, L210M, R211S  
50024652 50024652 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, K173AS, Q174K, D177E, I178M, T200V, Q207E, R211K  
50037832 50037832 None None   E6X, K20KR, V35T, T39M, V60I, V118I, K122E, I135R, K166KT, K173S, Q174KR, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L  
50041482 50041482 None None   V35T, T39M, K43R, V60I, D121H, K122E, I135V, I142K, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211S  
50041982 50041982 None None   V35T, V60I, E79EK, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179IT, T200A, I202V, Q207N, R211S, F214L  
50047102 50047102 None None  K103N I5V, K20R, V21I, V35T, E36A, T39D, K122E, D123N, A158S, T165TI, K173S, T200A, I202V, E203D, Q207A, R211K  
50088632 50088632 None None   E6D, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, I135IV, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200TA, Q207A, R211S  
50098222 50098222 None None   V35T, T39N, V60I, K122E, D123G, D177E, I178M, Q207A, R211S  
50119402 50119402 None None   E29D, V35T, E40D, K49R, K122E, D123S, I142V, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
50125002 50125002 None None   E6Q, K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123S, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A  
50132142 50132142 None None M41L  E6N, E28A, V35T, T39A, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, K166T, K173A, Q174K, Q207E, R211S  
50164762 50164762 None None   K11T, E29D, V35T, K49R, T69TA, K122E, D123S, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
50167952 50167952 None None   V21I, V35T, K43R, V60I, D121H, K122E, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
50176322 50176322 None None   K11T, E29D, V35T, K49R, K122E, D123S, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, K201R, Q207A, R211S  
51004362 51004362 None None   E6X, V35T, T39X, E40ED, K49R, K122E, D177E, Q207G, R211K  
51018492 51018492 None None   E28A, V35T, K49R, I50IV, V60I, D121X, K122E, I135T, S162C, D177DE, Q207A, R211S  
51042032 51042032 None None   V21I, V35T, E36G, T39A, E40D, V60I, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
51052442 51052442 None None  V179E P4T, V21I, V35T, V60I, K102Q, D177DN, I202IV, Q207E, R211K M230D 
51072032 51072032 None None   E6A, V35T, T39X, V60I, D121H, K122E, I135K, K173IT, Q174K, D177E, V179I, Q207QK, R211S  
51088752 51088752 None None   K20R, V35T, K49R, V60I, D121H, K122E, E169G, D177E, I178M, I195IM, Q207K  
51090980 51090980 None None   K11T, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, T165I, D177E, I178M, Q207E, R211K  
52041312 52041312 None None   P4H, I5IV, K11T, K20R, V21I, E28K, K32E, V35T, T39K, K122E, D123G, K173S, D177E, V179I, I202IV, Q207A, R211S  
52046162 52046162 None None   K11T, K20KR, V21I, V35T, T39KR, V60VI, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177E, I178IV, V179I, I202V, Q207A, R211N  
52050792 52050792 None None   V35T, T39M, V60I, K122E, D123S, I135T, S163T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
52085512 52085512 None None  E138A V35T, T39A, E40D, V60I, V111VI, K122E, D123S, I132V, I159IV, T200I, Q207E, R211K  
52104562 52104562 None None   K11T, V21I, V35T, T39K, V60I, K102Q, K122E, D123N, I142IT, A158S, T165I, K173S, D177G, V179VI, T200A, I202V, Q207A, R211K  
52126300 52126300 None None   E6ED, K11T, K20KR, V21I, V35T, T39R, K122KE, D123S, I135T, I142IL, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S  
52135070 52135070 None None  E138A V35T, T39A, E40D, V60I, K82R, T107S, V111I, K122E, D123S, K126R, I132V, I159V, T200I, Q207E  
52135090 52135090 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
52153152 52153152 None None  E138EK E6R, V35T, K49R, V60I, K122E, D177E, E194A, T200I, Q207E, R211K  
53004382 53004382 None None   P4H, V35T, V60I, K122E, D123N, I135T, S162H, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
53010042 53010042 None None   P4H, V21I, V35T, E36D, V60VI, D121H, K122E, I135T, T165TI, K173LS, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
53016892 53016892 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, E36D, T39R, D123N, T165TI, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, I202V, Q207A, R211S  
53020532 53020532 None None   E6K, V35T, V60I, K122E, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207D, R211K  
53039642 53039642 None None   V35T, T39TIM, E40ED, V60I, K122E, D123G, I135T, S162H, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
53046182 53046182 None None   K32Q, V35T, K49KR, V60I, D123S, I135T, S162H, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A  
53066452 53066452 None None   E6NS, K11A, E28A, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179VI, T200TA, Q207A, R211N  
53091372 53091372 None None   E6S, K11A, E28A, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211N  
53098922 53098922 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
54005840 54005840 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, K43R, K122E, D123S, I135IT, K173T, Q174K, D177E, T200A  
54007872 54007872 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123S, K173N, Q174K, D177E, I178M, T200R, Q207E, R211K K43L 
54008352 54008352 None None  V106I E6D, V35T, E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178L, V179I, V189I, I202V, Q207A, R211S, F214L  
54017022 54017022 None None  V106I V21I, V35T, T39S, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, V179I, Q207A, R211NS  
54023072 54023072 None None   K11T, K20R, V21I, K32R, V35T, T39R, V60I, K122E, D123N, I135V, I167IV, K173AS, Q174K, V179I, T200I, I202IV, Q207A, R211S K43G, Y115Y* 
54044732 54044732 None None   V35T, T39A, E40D, K122E, D123N, I142V, K173T, Q174K, G196E, T200E, Q207D, R211K  
54051102 54051102 None None  K103KN V35K, K49KR, V60I, D121Y, K122E, K173KR, D177E, I178M, T200IM, Q207G, R211K  
54079442 54079442 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, V90I, A98AS, K122E, D123S, A158S, S162HY, K173S, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211NS  
54108022 54108022 None None   V35T, T39M, K122E, D123S, D177E, D192N, G196E, T200R, Q207E, R211K  
54111232 54111232 None None   V35T, K49R, I50V, V60I, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S  
54155132 54155132 None None   E6X, K11X, V21I, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, V179I, Q207A, R211S  
54155642 54155642 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, K122E, D123N, T165I, K173L, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211G, F214L  
54160782 54160782 None None   E6K, K11R, V21I, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, V179I, S191T, T200A, Q207A, R211S  
54162492 54162492 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, E36D, T39M, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, I202V, E203Q, Q207D, R211K  
54164022 54164022 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, E36D, T39M, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, I202V, E203Q, Q207D, R211K  
55000362 55000362 None None   E6D, V35T, E40ED, K49KR, V60I, K122E, D123N, I135IT, S162A, K173S, Q174R, D177E, T200A, Q207A, R211N  
55001412 55001412 None None   V35T, T39L, K43KQ, V60I, I142IV, D177E, V179I, T200I, Q207E, R211K  
55010552 55010552 None None   E6EK, K11AT, K20R, V21I, V35T, T39A, K43KQ, K49KR, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S  
55011042 55011042 None None  V106VI V35T, E44ED, K49R, I50IV, V60I, K122E, I135IT, I142V, K173LS, D177E, Q207AD, R211RS, F214FL  
55011222 55011222 None None   V35T, E40A, K43E, K49R, V60I, S162X, T165TI, D177E, I178IM, T200V, Q207E, R211K  
55014982 55014982 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39G, K122KE, D123DG, T165IV, K173LS, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211RS, P225X  
55021222 55021222 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, E40D, V60I, K122E, D123N, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
55037882 55037882 None None   E28A, V35T, E40D, K49R, V60I, K104R, D121H, K122KE, I135T, T139A, K173S, Q174K, V179I, G196E, Q207A, R211S  
55045882 55045882 None None   E6D, K11R, V35T, E40D, K49R, K122E, D123G, I135IT, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
55058342 55058342 None None   V35T, K49R, V60I, K173A, D177E, I178IM, V179I, Q207A  
55120652 55120652 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, K122E, D123N, I135T, T139A, S162C, T165I, K173T, N175H, D177E, G196E, T200A, Q207E  
55127440 55127440 None None  M230I V35T, G51R, V60I, W88*, G99R, T107S, K122E, D123N, R172K, D177E, I178M, G190R, T200I, R206K, Q207G, R211K, W212* G213R 
55143382 55143382 None None  G190GA V35T, T39A, E40ED, V60I, K122E, D123DG, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179VI, T200A, Q207A, R211X  
56006882 56006882 None None   V35T, T39A, E40D, V60I, T107S, D121H, K122E, I142V, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
56009652 56009652 None None   V35T, T39R, K122AT, I142V, D177E, Q207E, R211K N81NK 
56015652 56015652 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K102R, K122E, I135T, S162C, D177DG, I178IM, T200A, Q207E, R211RK  
56021022 56021022 None None   K11T, K20R, V21VI, V35T, T39N, V60I, K122KE, D123N, K173S, D177EG, V179I, T200A, I202V, Q207A  
56030122 56030122 None None   V35T, V60I, S68G, K122E, I135R, K173S, T200I, Q207A, R211S  
56032432 56032432 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121C, K122E, D123S, T165I, K173T, I178L, T200A, Q207E, R211K  
56039372 56039372 None None   V35T, K49KR, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, T165I, K173A, Q174K, V179I, Q207A, R211S  
56053302 56053302 None None   V35T, K49R, V60I, K104KR, K122E, D123G, I135T, K166T, Q174K, D177E, I178V, V179I, Q207A, R211S E6M 
56076002 56076002 None None   P4PS, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
56147612 56147612 None None  Y188C V35T, K102Q, K122E, D123N, I135T, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
57001682 57001682 None None   V35T, V60I, K64R, D121H, K122E, I135IT, D177DE, I178L, T200I, Q207E, R211K  
57011062 57011062 None None   P4T, I5V, K11Q, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123DN, T139K, S162C, K173N, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
57013142 57013142 None None   P4T, V21I, V35T, T39A, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162N, K173A, Q174K, D177E, Q207T, R211K  
57042002 57042002 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123N, T165I, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
57053792 57053792 None None   K20R, V35T, K49R, V60I, K122X, D123DE, D177E, I178L, T200M, E204K, Q207E, R211Q  
57058542 57058542 None None  K103N E6ED, V35T, E40D, K49R, V60I, D177E, V179T, G196A, T200I, Q207G, R211K  
57075912 57075912 None None   K11KR, V35T, E36D, T39M, V60I, K64R, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, K201KR, Q207A, R211S  
57090042 57090042 None None   K20R, V35T, T39X, E40ED, K49R, D121DY, K122E, I135T, T139A, S162C, F171Y, K173A, Q174K, D177E, V179I, V189I, T200A, Q207A, R211S  
57095432 57095432 None None K65KE  E6D, V35T, E40D, K49R, V60I, D177E, V179T, G196A, T200I, Q207G, R211K  
57098712 57098712 None None   V35T, T39R, E40D, K49R, V60I, I135M, D177E, Q207E, R211K  
57104062 57104062 None None D67DN, K70KR Y188H E6N, V35T, T39K, V118I, K122E, I135T, I142T, K173S, Q174K, I202V, Q207N, R211S, F214L  
58000562 58000562 None None   E6D, T7P, K11T, V35T, E40D, K49R, V60I, D121H, K122KE, S134SC, D177E, I178IM, G196K, T200TI, Q207E, F214L, E224D  
58003662 58003662 None None   K20KR, V35T, V60I, K104R, K122E, E169ED, D177E, T200I, Q207E, R211K  
58014362 58014362 None None   V35T, T39G, V90I, K122E, S162SN, Q174L, I178M, Q207A, R211K, P226S, L228X  
58027512 58027512 None None   K20KR, E28EA, V35T, E40ED, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200TA, Q207A, R211S  
58039202 58039202 None None   E6N, V35T, V60I, K122E, I135T, K173S, Q174K, I202V, Q207D, F214L  
58065622 58065622 None None   E6D, V21I, V35T, E36A, T39E, K122E, D123DN, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178L, V179I, Q207A, R211RK  
58068082 58068082 None None   E6D, V21I, V35T, E36A, T39E, K122E, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178L, V179I, Q207A  
58068632 58068632 None None  Y188YH P4S, K11T, K20R, V21I, V35T, T39S, K104R, K122E, D123N, S162C, K173S, D177E, T200A, I202V, Q207A, R211K  
58075302 58075302 None None   E6D, V35T, E36D, T39KR, K43Q, K122E, D123N, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207K, R211S, F214L  

Database

Resources

Team