Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Grgic (2013)
Title The prevalence of transmitted drug resistance in newly diagnosed HIV-infected individuals in Croatia: the role of transmission clusters of men who have sex with men carrying the T215S surveillance drug resistance mutation.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 119
NumPts 119
Subtype B, A, C, CRF02_AG, CRF01_AE

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 119 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
cro328 cro328 None None T215S  S68G, K122E, I135R, S162A, T200TA, L210LM, R211K  
cro360 cro360 None None   I135T, S162C, K173KN, Q174QE, Q207H, R211K  
cro456 cro456 None None   D123E, I135T, S162C, D177E, Q207H, R211K  
cro457 cro457 None None   D123E, I135T, S162C, D177E, Q207H, R211K  
cro462 cro462 None None   E40D, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, D177E, I178M, T200TA, E204K, Q207QE, R211KQ  
cro463 cro463 None None   E40D, K49KR, V60VI, D121H, K122E, I135IT, K173L, Q174K, D177E, T200TA, Q207E, R211K  
cro464 cro464 None None   K49Q, R83K, K122P, I180V, G196E  
cro465 cro465 None None   V90I, I135T, S162D  
cro466 cro466 None None   I135T, G196E, Q207E, R211RK  
cro467 cro467 None None   A98S, K101KQ, K122E, I135R, G196GE, L210LF  
cro468 cro468 None None   P55PS, A98S, I135V, K166R, R211KQ  
cro469 cro469 None None   S68G, D123E, I135T, D177E, I178M, R211K, L228S  
cro475 cro475 None None   D123E, D177DE, I178IM, T200TA, R211K  
cro476 cro476 None None   K102R, I135L, S162C, R211K  
cro477 cro477 None None   V60I, K122E, D123S, I135T, K173IV, Q174K, D177E, I180V, T200A, Q207A, R211S  
cro478 cro478 None None   K46KE, I47IN, S48SL, W88C, I135IK, G155GR, K166R, K173E, R211K T39FI 
cro479 cro479 None None   E40D, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, I178IM, V179I, T200A, Q207A, R211S  
cro481 cro481 None None M184V  I135L, F171Y, D177E, T200I  
cro482 cro482 None None   I135R, I142V, I178L, Q197L  
cro483 cro483 None None T215S  S68G, K122E, I135R, I142V, S162A, R211K  
cro484 cro484 None None   A98S, K122E, K166KR, D177G, Q207QE, L210LF, R211K  
cro486 cro486 None None   R83K, D123E, K166R, K173Q, D177E, G196E, Q197K, T200S, R211K  
cro487 cro487 None None   K122X, I135T, K173S, Q174K, D177E, G196E, I202V, Q207A, R211S  
cro488 cro488 None None T215S  S68SG, K122E, I135R, I142V, S162A, R211K, F214L  
cro492 cro492 None None   A98S, K122E, I135IV, I142IV, Q151QK, S191T, G196GR, L210F, R211S P150PHQ, G152GDE, W153W*G 
cro493 cro493 None None   A98S, K122KE, S191T, G196GR, L210F, R211S  
cro494 cro494 None None T215S  S68G, K122E, I135R, S162A, R211K  
cro495 cro495 None None T215S  D121X, K122E, I142V, S162A, D177E, R211K  
cro502 cro502 None None   K122E, I135T, I142IMT, I178L, V189VI, Q197L, R211RK  
cro503 cro503 None None T215NS  S68G, D121DA, K122E, I135T, I142IV, S162A, D177E, R211KN  
cro504 cro504 None None   R83K, K103R, K173N, Q197E  
cro506 cro506 None None   K49R, V60I, S68G, K122Q, I135T, D177E, T200A, Q207H  
cro507 cro507 None None   K122KE, I135K, I178L, I202IL, R211K  
cro508 cro508 None None   V60I, S68G, K122P, I135T, D177E, T200A, R211K  
cro510 cro510 None None   I135R, I142V, I178L, Q197L  
cro511 cro511 None None   V60I, K122E, I135T, T200I, I202V, F214L  
cro512 cro512 None None   R83K, V90I, I135KT, S162A, I178M  
cro513 cro513 None None   K49R, I135R, I142M, I178L, Q197L  
cro514 cro514 None None   F171Y, D177E, T200TI, Q207QE, R211K  
cro515 cro515 None None   A98S, K122KE, D177E, G196E, T200A, R211Q, F214FL  
cro516 cro516 None None   V60I, K122E, I142T, G196E, T200I, E224D  
cro517 cro517 None None   S48T, V60I, K122E, D123G, I135T, S162C, K173T, T200A, Q207E, R211K  
cro519 cro519 None None   T69N, R83K, D123E, I142IT, K173DE, Q174R, G196E, Q197K, T200S, I202V, R211K  
cro520 cro520 None None   R83K, K122KE, D123E, E169D, Q174K, I178L, G196E, Q197K, T200S, I202V, R211E  
cro522 cro522 None None   K122P, I142T, E169D, D177E, I178M, T200I  
cro524 cro524 None None   S68G, D121DH, K122E, D123X, I135V, I142IV, R172K, K173IR, Q174K, D177E, E203ED, Q207A, R211N  
cro525 cro525 None None T215S, K219KR  S68G, K122E, I135R, S162A, T200A, R211K  
cro532 cro532 None None   D123E, I135T, S162C, I178IM, G196E, T200A K82K* 
cro533 cro533 None None T215S  S68G, K122E, I135R, S162A, Q207QH, R211K  
cro534 cro534 None None   R83K, V90I, K122KE, S162A, D177DE, Q207E  
cro535 cro535 None None   D86E, I178L, Q197L  
cro536 cro536 None None   A98S, D177E, I178V, G196E, T200R  
cro537 cro537 None None   Q174QR, T200TA, Q207E, R211K, F214L  
cro538 cro538 None None   D123E, I178ILM, R211K  
cro540 cro540 None None   V60I, S68G, K122KQ, I135T, K166R, D177DE, Q197E, T200A, Q207HN, R211K  
cro541 cro541 None None   D86E, I178L, Q197L  
cro542 cro542 None None   K49KR, I135R, I142M, I178L, Q197L  
cro543 cro543 None None   S48ST, S68SG, W88WC, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E  
cro545 cro545 None None   A98S, I135RT, K166R, L210LF, R211K  
cro547 cro547 None None  E138A V60I, K64R, K122E, D123N, I135T, I142T, K173S, Q174K, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L  
cro552 cro552 None None   D123E, I135T, S162C, P176S, G196E, T200A, R211X  
cro553 cro553 None None   D123E, I135T, S162C  
cro554 cro554 None None   E40ED, I135R, I142V, I178L, Q197L  
cro557 cro557 None None F77FL  K126R, I135R, G196E  
cro558 cro558 None None   R83K, V90I, I135T, S162D  
cro562 cro562 None None   K101R, I135IV, K173E, T200A, I202V, Q207E  
cro564 cro564 None None   R83K, V90I, S162D  
cro565 cro565 None None T215S  S68G, K122E, I135R, S162A, T200A, R211K  
cro566 cro566 None None   E53EK, K64R, R83K, D123N, T165I, D177E, I195L  
cro568 cro568 None None L210W, T215S  S68G, K122E, I135R, I142V, S162A, K173N, Q174QK, R211K, F214L  
cro569 cro569 None None L210W, T215S  S68G, K122E, I135R, I142V, S162A, R211K, F214L  
cro570 cro570 None None   V60I, K122E, I135T, Q174QL, D177HQ, T200I, I202V, F214L  
cro571 cro571 None None   W88C, I178L, Q197L L100L* 
cro572 cro572 None None   K49R, D123DE, I135K, I142M, I178L, Q197L  
cro575 cro575 None None   V111I, I178IL, F214L  
cro576 cro576 None None   I135R, I178L, Q197L  
cro577 cro577 None None   K166R, T200I  
cro578 cro578 None None   K166KR, D177E, T200M, R211RK  
cro579 cro579 None None   V60I, K122E, I135T, T200I, I202V, E204ED, R211RK, F214L  
cro580 cro580 None None   I135R, I142V, I178L, Q197L  
cro581 cro581 None None   K49R, I50V, I135R, I142M, I178L, Q197L  
cro582 cro582 None None   G112GA, D123DH, K166R, F171Y, D177E, T200E, Q207E K46KT, A114AP 
cro583 cro583 None None   I135IR, I142V, I178L, Q197L  
cro584 cro584 None None   I135RT, D177E, T200I, R211K  
cro585 cro585 None None   A98S, K101R, D123E, I142IM, K166KR, D177E, I178LV, V189VI, I202V, Q207AE, R211K, F214FL  
cro586 cro586 None None   S48T, K122E, D123G, I135T, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E  
cro588 cro588 None None D67G, K219E  V60I, S68G, V90I, A98S, K122E, I135V, K166R, I178M, G196E, I202V, E204Q, R211G N147NI 
cro590 cro590 None None   S68SG, I178L  
cro591 cro591 None None M41L, L210W, T215D  K122P, I142V, S162C, Q207E  
cro592 cro592 None None   D123E, I135V, T200I, Q207D, L210F, R211K  
cro594 cro594 None None   D123E, I135IV, S162A, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, I202V, Q207E  
cro595 cro595 None None  H221Y D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, I202V, E203X, Q207E  
cro598 cro598 None None   I135R, I142M, I178L, Q197L  
cro599 cro599 None None   A98S, K101R, D123E, K166R, D177E, I178L, I202V, E204G, Q207E, R211K, F214L  
cro600 cro600 None None   K43Q, E44G, I50V, V60I, K122E, D123N, I135T, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K  
cro601 cro601 None None   A98S, K101R, D123E, K166R, D177E, I178L, I202V, Q207E, R211K, F214L  
cro602 cro602 None None T215S  I135R, I142V, S162A, R211K, F214L  
cro603 cro603 None None   D123E, D177E, I178IM, R211K  
cro604 cro604 None None T215D  R83K, K102Q, D123E, I135T, S162C, D177E, I178M, Q207E, R211K  
cro606 cro606 None None   E40D, V60I, D121H, K122E, D123S, S162C, K173A, D177E, I178L, T200A, E204K, Q207D, R211K  

Database

Resources

Team