Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Faria (2012)
Title Phylogeographical footprint of colonial history in the global dispersal of human immunodeficiency virus type 2 group A.
Citation J Gen Virol
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV2
SelectedType Clinical
NumIsolates 84
NumPts 84
Host Human

 

Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
05-1019652 05-1019652 None    N68D, K70R Y14H, N41D, K57R 
06-1022838 06-1022838 None   S43T, I46V G17D, E65K, K70R N40D 
06-1048808 06-1048808 None    K60N, K70R Y14H, N40S, N68G 
06-1048809 06-1048809 None    F3L, K70R, V71I, T91S K7Q, G17N, N41D, E65R, L93I 
07-1005732 07-1005732 None    E65K N40S, S43D 
08-1009179 08-1009179 None   I89V K70R N40S 
08-1013611 08-1013611 None   A73AG, I89V K70R Y14H, N40S, N41D, N68G 
08-1017348 08-1017348 None    E65K Y14H, N40S, S43D 
09-1012576 09-1012576 None   I46V T77TI V20VA, G35GE, N40CS, K57KR, N68G, L99LF 
09-1017295 09-1017295 None    K7KR, E21X, E63ED, R72K, T91A, A92T Y14YH, E16EG, N40C, N41ND, K60KR, N68G 
09-1019599 09-1019599 None   S43T G17D, K70R, V71I, A92L N40D, K60R, E65R 
09-1020943 09-1020943 None   S43T, I46V, I89V G17D, E65K, K70R N40D, K57R, V62I 
09-1022492 09-1022492 None    W6L, K7KR, K70R N40S, N41D, E65R 
116505 116505 None   S43T K70R, T91TA, L93M Y14H, S96ST 
131732 131732 None    G17E, N61D, E65K, V71I, R72RK, D79N N40S, N41D, T77V 
132232 132232 None    I36V Y14H, N40S, N68G, A92V 
137566 137566 None   I89V K70R Y14H, N40S, N41D, N68G 
138487 138487 None    E65K Y14L, N40S, N41D, S43K 
138768 138768 None    K70R, T91TA, A92AT Y14H, N40S 
139329 139329 None    K70R Y14H, N40S, N68G 
139637 139637 None     Y14H, N40S 
140874 140874 None    I15V, K70KR N40S, N41D, N68G 
141361 141361 None   I89V G39E W6Q, Y14H, G27E, N40S, G52R, N68G 
142831 142831 None   S43T, I46V V20L K7N, Y14H, N40S 
143877 143877 None    I36V, N61D, E65K, K70R N41D 
143991 143991 None    V20VI, K70R Y14H, N40S, N68G 
144035 144035 None    W6R, Y14R, V20L, E21D, E37D, K70R, R72K, T77TI K7N, N40C, N41ND, I46T, N68G 
144251 144251 None   I89V P19S, K70R Y14H, N40S, N41D, N68G 
147873 147873 None   I46V W6R, E63EK, K70KR, T91TA K7Q, N40S, A92IS 
148686 148686 None    I15V, G17D, V33VI, I36V, N61D, E65K, K70R, V71I, D79N N40S, T77V 
149807 149807 None   I89V K70R, R72RK N40S 
150281 150281 None   I89V E65K, K70R, R72RK Y14YH, N40S, N41D 
150965 150965 None    N61D, A92X W6W*R, N40S, K60R, N68G 
151533 151533 None    G17D, N40E, E65K, K70KR  
151833 151833 None    K70KR N40S, N41D, K60RT 
152792 152792 None  I46IT I89V E21EK, E37ED, E65EK, K70R Y14H, N40NS, N41ND, N68G 
153658 153658 None   I89V E63R Y14H, N40C, N41D, N68G, I75L 
153776 153776 None    T12TP, E37D, K70R Y14H, N40S, N55IT, A73G 
154427 154427 None   I89V K70R Y14H, N40S, K60R, N68G, I75IV 
156209 156209 None    K70R Y14H, N40S, I46T, K57R, N68G, I75V 
156260 156260 None   I46V I36V, K70R Y14H, N40S, D79E 
156294 156294 None   I89V E65K, K70R Y14YH, N40S, N41D, T56TI 
156529 156529 None    S43SN, N61ND, K70KR Y14H, N40S, N68G 
156927 156927 None    F3L, G17GD, E65K, V71I N40S, N41ND, L93I 
157554 157554 None    K70R, L93M Y14H, N40S, E65E*Q, N68G 
157780 157780 None    E65K, R72K N41D 
158425 158425 None    I15V, E21D, K70R, T91A, A92T Y14H, N40S, N68G, I75L 
160439 160439 None    Y14R, E37ED, K70KR N40C, N41ND, I46T, K57R, N68G 
160664 160664 None   I89V K70R N40S, K60R 
160930 160930 None   I89V V20L, E37D, E65K, K70T Y14H 
161360 161360 None   I89IV W6R, K7R, V20L, K70T Y14H, N40S, E65KR 
161453 161453 None    F3L, S43N, K70R, V71I Y14H, N41D, E65R, L93I 
161735 161735 None   I89V K70R Y14H, N40S, N41D 
161738 161738 None   I89V K70R Y14H, N40S, N41Y, N68G, S96T 
161798 161798 None    E21K, E37D, E65K, K70KR, T91A, A92T K7N, N40S, N41D 
162071 162071 None   I89V K70R K7Q, G17GS, V20VA, N40C, N68G 
162136 162136 None    N61D, E65K N40S 
162648 162648 None     N40C, K60KR, N68G 
163290 163290 None    K7R, N61D, E65K, L97LI Y14H, N40S, T56TP 
163556 163556 None    I15V N40S, N41D 
164339 164339 None   I89IV S4P, K7E, K60N, E65K, K70R P1A, N40S, N68G 
164788 164788 None  I46IV S43ST I36IV, K70R, T77TI, T91TA Y14H, N40CS, D79DE 
165389 165389 None  I54IL  I15IV, K70R N40S, N68G 
165434 165434 None    F3L, I15V, G17D, K70R N40S, E65R, L93I, L99F 
34306 34306 None   I89V K70R Y14H, I32L, N40S, N68G 
34399 34399 None    E65K Y14H, N40S 
39601 39601 None    K70R Y14H, N40S, K57R, N68G, D79E 
39604 39604 None    I15IV, G48GE, K70R Y14H, N40S, N68G 
42449 42449 None   I89IV K70KR Y14H, N40NS, N41D, K57KR, N68G 
43021 43021 None   I89V E21D, N61D, E63ED, E65K, K70KR Y14H, N40S, N68G 
60042 60042 None    K70KR N40S 
67157 67157 None   I89IV K70R Y14H, N40S, N41D, N68G 
68752 68752 None    E65K, K70R, T91A K7N, Y14H, N40S, N41D 
83695 83695 None    K70R, T91A N40S, E65R, A92N 
A/BO/BRESC A/BO/BRESC None    E65K, K70R, T77I Y14H, N40S, N41D, G94D 
A/DM/BRESC A/DM/BRESC None   I89V T12R, K70R, R72K N40S, I46T, K57R, N68G 
A/KA/BRESC A/KA/BRESC None    K70R N40S, K60R, N68G 
BM10767 BM10767 None   I46V, I89IV K70R Y14H, N40C, D79E 
BM11874 BM11874 None    F3L, G17D, E65K, V71I N40S, L93I 
BM13272 BM13272 None   I46V, I89V K70R, R72RK, A92AT W6W*, Y14H, N40S, N68G 
BM13370 BM13370 None   S43ST K7R, E37ED, N61ND, K70R, T91A, A92T Y14YH, N40S 
BM16229 BM16229 None   I89V K70KR N40NS, I75IV 
BM16582 BM16582 None    S4P, K7E, K70R Y14YH, K60R, N68G 
BM17066 BM17066 None    W6R, T12TI, Y14R, E37D, K70R, R72K K7N, N40C, N41ND, I46T, N68G 

Database

Resources

Team