Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Martin (2014)
Title Early immune adaptation in HIV-1 revealed by population-level approaches.
Citation Retrovirology
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 116
NumPts 116
Subtype B


  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 116 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
ACU1 ACU1 None None   V35T, I50V, T200A, K277R, T286A, I293V, E297K, L301I, G335D, R356K, M357S, I375V, A376T, T377M, K390R, A400S  
ACU100 ACU100 None None   K122P, D123E, I142V, S162A, Q174K, N175H, G196E, T200A, E204V, R211A, V245M, I293V, V317A, I326V, Q334L, K390R  
ACU101 ACU101 None None   I142T, R211K, A272P, K275KQ, K277KR, T286A, E297K, I329L, Q334G, G335D, V365I  
ACU102 ACU102 None None   K20R, K122T, I178L, E204G, R211K, F214L, V245E, V276I, Q278E, L283I, A288S, I293V, Q334L, G335S, R356K, V365I, I380V, T386I, K390R  
ACU103 ACU103 None None M41L, L210W, T215D  V35I, E44D, S48T, V60I, S68G, K122E, I135V, R172K, Q207H, K277R, I326V, K390R, K395R  
ACU104 ACU104 None None  E138A A98S, I142T, A158AS, T165TI, K173I, Q207T, R211K, K277R, T286A, I293V, E297K, S322T, D324E, A376T, T386I, E399D  
ACU105 ACU105 None None  K103KN D123E, K166KR, D177E, E203D, Q207E, R211K, Q278E, V292I, I293V, E297A, I329L, F346C, K390R  
ACU106 ACU106 None None   R83K, D121Y, K122E, I195IK, G196E, Q197K, T200E, E204D, E224A, V276VI, E297K, S322T, A360V, A376T, K390R  
ACU107 ACU107 None None   D123E, I178V, T200TA, Q207QR, R211EK, A272P, E291D, K311KR, Q334L, G335S, R356K, M357V, A376S, T377Q, T386I, K390R  
ACU108 ACU108 None None   I142V, S162C, R211S, K277R, V317A, S322L, I329V, Q334L  
ACU109 ACU109 None None   K20R, V35M, S68SG, K104R, K122KE, D123E, I135RT, S162A, D177E, T200A, Q207E, R211K, E248EV, A272P, K277R, T286A, E291D, E297K, Q334L, G335S, R356K, M357V, A360T, K366R, A376S, T377Q, T386I, K390R  
ACU11 ACU11 None None   S48T, T165I, T200A, V245T, A272P, K277R, I293V, T296S, E297K, A327S, Q334E, M357V, A376T, T386I, K390R  
ACU110 ACU110 None None  K103N K20KR, T27TA, D123E, P170S, D177E, Q197E, R211K, Q278E, V292I, I293V, E297A, I329L, F346C, V381I, K390R  
ACU111 ACU111 None None   K49R, V60I, R83K, I195L, T200A, Q207K, R211Q, K277R, T286A, A288S, E297K, I309L, D324E, I329L, G333E, M357T, V365I, A376T  
ACU112 ACU112 None None   K11Q, V35T, R211K, V245E, I293V, I326V, K390R  
ACU115 ACU115 None None   D123E, I178M, R211K, I244IV, A272P, E291D, Q334L, G335S, R356K, M357V, A371AT, A376S, T377Q, T386I, K390R  
ACU116 ACU116 None None   K20R, K103R, I142M, I178L, E203D, R211K, F214L, V245Q, V276I, Q278E, L283I, I293V, D324E, A327V, R356K, V365I, T386I, K390R  
ACU12 ACU12 None None   I135T, S162C, Q207A, T286A, A288S, I326V, I329L, A376T, S379SC, V381VI  
ACU13 ACU13 None None   D123E, Q174QK, D177E, F214L, A272AT, K277KR, I293V, I329V, G333E, G335C, R356K, A371V, K390R  
ACU14 ACU14 None None   K49R, V60VI, I135K, D177DE, G196E, Q207QH, R211RK, E248X, K277R, T286A, I293IV, E297EA, Q334QL, M357T, A360AT, I375IV, I382IL, K390R  
ACU15 ACU15 None None   V60I, S68G, K122E, D123N, I135T, T139A, P176T, D177E, I178M, Q207A, R211S, A288S, I293V, K311R, Q334S, A360T, T377Q, K385R, K390R  
ACU18 ACU18 None None   P4PH, K66KR, A98S, R211K, A272P, K277R, I293V, E297A, K323R, A376T, V381I  
ACU19 ACU19 None None M184V K101E, G190A D123E, D177E, T200A, Q207E, V245E, I329L, M357T, A376S  
ACU2 ACU2 None None   V35M, T39A, R83K, K122P, D177E, G196E, F214L, A272P, K277R, T286A, E297R, Q334L, A376T, K390R  
ACU20 ACU20 None None   K64R, K122E, I135T, S162C, T165I, E169D, D177E, I178L, V179I, G196E, I202V, V245T, D250E, A272P, I293V, K311R, R358K, T386I, K390R  
ACU21 ACU21 None None  K103N V35I, R83K, D177E, G196E, K249Q, A272P, K311R, D324E, G333D, K366R, S379G, K390R  
ACU23 ACU23 None None   K122E, S162C, R211Q, K275KQ, V276VI, K277KR, R284K, E312T, I329L, Q334N, M357V, V365I, A376S, V381I, K395R, E399D  
ACU24 ACU24 None None   V60I, K122P, I135V, K173R, I178L, F214L, V245M, A272P, L283I, A288T, V292I, I293V, R356K, M357T, A376S, I382V  
ACU25 ACU25 None None   I167V, G196E, V245M, A272P, E297K, E312V, I329V, K366R, A376S  
ACU26 ACU26 None None   K20R, K122KE, I178V, A272S, K277R, T286A, I293V, E297T, P313T, V317A, R358K, T377S  
ACU27 ACU27 None None   K122E, D123N, S162C, I178M, G196GR, T200I, R211S, V245M, E248D, A272P, K311R, T369A, E399D  
ACU28 ACU28 None None   Q207E, R211K, K277R, I293V, V317A, D324P, I329V, Q334L  
ACU3 ACU3 None None   E36D, A98S, D121DY, K122KE, S162C, I178IL, Q207E, R211K, V245E, V276VI, K277R, I293V, E297A, P321PS, D324EG, R356RK, A360AT, K390R  
ACU30 ACU30 None None M41L, T215D  E6D, E40K, S68G, K104R, K122P, K166I, I178L, V179I, T200I, R211K, K277R, I293V, E297V, V317A, I326V, A360V, V365I K73KE 
ACU31 ACU31 None None   I135V, S162C, E169D, Q207E, V245T, V276VI, I293V, K311R, I326V, Q334L, R356K, A360T, K390R  
ACU32 ACU32 None None M41L, T215E  K20R, V60I, A158S, V179I, R211K, A272P, K277R, G333E, Q334H, R358K  
ACU33 ACU33 None None   S68G, K122Q, S162N, E203Q, R211Q, V245E, K277R, I293V, S322SL, I326V, T338S, A360V, V365I  
ACU34 ACU34 None None   K122E, Q197K, Q207N, R211K, V245E, K311R, V317A, I326V, I329V, Q334L, M357I, K390R, E399D  
ACU35 ACU35 None None   V35I, D123N, D177E, A272S, K277R, T286A, I293V, E297T, P313T, V317T, R358K, T377TS, E396ED  
ACU38 ACU38 None None   D123E, I135T, S162A, D177E, G196E, K201KR, Q207E, F214L, A272P, K277R, P294T, E297K, Q334L, M357MT, S379G, T386I, K390R  
ACU39 ACU39 None None   V35I, D123E, K166R, T200A, I202V, R211A, K277R, P294Q, I329L, G333E, Q334H, T369A, Q373H, K390R  
ACU4 ACU4 None None   V35I, A98S, I135T, R211K, K275Q, V276T, K277R, T286A, A288S, E297K, I329L, M357T, V365I, K366R, T397TI  
ACU40 ACU40 None None   R83K, S162Y, D177E, R211K, A272P, K277R, E297A, K311Q, I329L, A376T, V381I, T386A  
ACU43 ACU43 None None   A98S, D123E, A158S, I180V, I202V, R211G, V245T, A272P, K277R, E297K, V317A, D324E, I329L, K366R, I380V  
ACU44 ACU44 None None   K49R, I50V, V60I, K122P, D123E, I142V, D177E, T200I, R211K, V245M, A272P, K277R, I293V, Y342F, K390R  
ACU45 ACU45 None None  K103N, V106I S68G, T69N, D123E, I135T, D177E, G196E, R211K, D237E, I244V, K277R, Q278E, V292I, I293V, E297R, K311R, G333E, G335C, R356K, M357V, A376T, S379C, T386I  
ACU46 ACU46 None None  K103N K20R, V118I, I135T, T165I, K173E, D177N, T200A, F214L, V245E, K277R, A288S, E291Q, I293V, P294A, Q334E, M357A, K374R, A376V, K390R A98P 
ACU47 ACU47 None None   V35I, R83K, D123E, I178L, R211K, A272P, K277R, I293V, E297D, E328D, E344D, K366R, T377Q, K390R  
ACU48 ACU48 None None   E6D, I135T, S162C, I202V, Q207K, R211G, A272P, E291D, V317A, G335S, R356K, M357T, G359S, K366R, K390R  
ACU49 ACU49 None None  V179D R83K, Q174R, G196E, R211G, A272P, V292I, E297A, K311R, I329L, G333E, M357S, K390R  
ACU5 ACU5 None None   P4T, A98S, K122E, T165I, R211K, A272P, K277R, M357E, A376T  
ACU50 ACU50 None None   S162C, R211K, F214L, T286A, I293V, S322T, Q334H, R358K, E370A, K374R, K390R  
ACU51 ACU51 None None   K20R, D123E, D177E, T200A, Q207R, R211K, V245M, D250E, A304E, I326V, Q334E, M357A, A360T, T369A, A376T, T386I  
ACU52 ACU52 None None   I135V, S162C, D177E, R211Q, I293V, I341L, Q367L  
ACU53 ACU53 None None   E6D, I135T, S162C, I202V, R211G, V245E, A272P, E291D, V317A, I329L, K366R  
ACU54 ACU54 None None F77L  V75L, V118I, K122A, I135T, T165I, Q207E, R211Q, F214L, V245E, A272P, K277R, V292I, Q334L, M357T, K390R  
ACU55 ACU55 None None   T39TI, K49R, I50V, K104KN, I142T, R211K, V245T, A272P, K277R, T286A, V292I, E297EA, P321S, D324E, I326V, Q334X, R356RK, M357MI, A360T, D364E, A376T, S379C, V381I, Q394QH, E399D  
ACU56 ACU56 None None  E138A I50V, R83K, K102Q, V118I, K122KE, D123DN, S162C, L210M, F214L, V245I, K277R, I293V, E312Q, A376S, I382V, K390R  
ACU57 ACU57 None None   V35I, I135T, I142V, S162A, V245M, A272P, I293V, K311R, D324E, I329V, Q334D, G335S, R356K, M357T, T369A, A376T, T377Q, K385R, K390R  
ACU58 ACU58 None None   K13KR, V35IMT, T39TK, I142V, S162C, R211AT, S251H, K277R, P294Q, E297K, V317A, I329L, G333E, Q334H, K347KR, M357I, K390R  
ACU59 ACU59 None None   D113DN, R172RK, D177E, K277R, T286A, E297A, A376T, K390R  
ACU6 ACU6 None None   V35M, E36D, T39A, R83K, A98S, K122P, D177E, G196E, A272P, K277R, T286A, E297R, Q334L, A376T, K390R  
ACU60 ACU60 None None   K122E, S162C, T200A, R211K, A272P, K277R, E297K, I326V, I329L, G333E, M357I, R358K, A376S, T377M, K390R, E399D  
ACU61 ACU61 None None   R83K, K122Q, S162Y, T200A, H208Y, R211K, A272P, K277R, I293V, E297A, I329L, G333E, A376S, T386A  
ACU62 ACU62 None None   S68G, K122P, I135T, D177E, T200A, R211K, K277R, T286A, V292I, I293V, I326V, Q334L, R358K, V365I, E370A, S379G, T386I  
ACU64 ACU64 None None   I142T, R172RK, D177DN, I178L, G196E, R211A, A272P, P294Q, K390R, K395R  
ACU65 ACU65 None None  E138A V60I, I142V, S162C, E169D, G196K, T200I, R211K, V245K, A272P, K277R, Q334L, M357T, K366R, T369A, A376S, T377S  
ACU66 ACU66 None None   S162C, D177E, I178M, G196E, A272P, K277R, E297Q, I326V  
ACU67 ACU67 None None   K102Q, S162C, E204G, R211K, V245E, V254I, I293V, K311R, S322A, R358K, I375V, K390R  
ACU68 ACU68 None None   V35T, K122Q, S162C, D177E, R211A, K277R, P294Q, E297K, I329L, G333E, Q334H, M357I, A360T, Q373H, K374R, K390R  
ACU69 ACU69 None None   V60I, A98S, I135T, R211K, F214L, V245M, A272P, K277R, V292I, I293V, V317A, I329L, V365I  
ACU7 ACU7 None None   R83K, D177E, I178L, R211K, V245N, D250E, T286A, I293V, D324E, I329L, V381I, K390R  
ACU70 ACU70 None None   E6D, K122E, D123S, S162C, D177E, V245L, A272P, K277R, V292I, I293V, G333E, Q334H, M357I, K366R, A376S, T386I, K390R  
ACU71 ACU71 None None   D123E, S162C, Q207QE, R211RK, I293V, K311KR, I329L, M357T, T377Q, K385R  
ACU73 ACU73 None None   V60I, R83K, I135T, S162Y, T200I, R211K, A272P, K277R, E297A, I329L, A376T, V381I, T386A  
ACU74 ACU74 None None  N348NI V35VI, V60VI, R83RK, V90I, S162Y, V179I, E204EK, R211K, V245VA, A272P, K277R, I293IV, E297A, I329L, G333GE, R356RK, A376S, S379SG, K385KR, T386V, A400AT  
ACU75 ACU75 None None F77L  S68N, T69A, V75L, V118I, K122E, I135T, T165I, Q207E, R211Q, F214L, V245E, A272P, K277R, V292I, Q334L, P345Q, M357T, K390R  
ACU76 ACU76 None None   I135T, T200I, V245K, A272P, V276I, Q278E, T286A, A288S, Q334R, V365I, S379G, K390R Q336I 
ACU78 ACU78 None None   V35I, R83K, G196E, R211K, K238R, K277R, I293IL, P294A, E297K, M357V, A360T, K390R  
ACU8 ACU8 None None   R83K, A98S, D123E, E169D, I178L, G196E, Q207E, A288S, I293V, R356K, M357T, K366R, Q394L  
ACU80 ACU80 None None   V35I, V60I, I135L, S162A, Q207K, R211K, V245M, A272P, K277R, I293V, E297A, V317A, I326V, I329V, Q334L, R358K, I382V, K390R  
ACU81 ACU81 None None   K20R, T200K, R211K, I293V, L301M, I329L, G333E, A360T  
ACU82 ACU82 None None   V35T, R83K, K122P, K166R, D177E, V245M, A272P, K277R, P294S, E297K, L301I, Q334L, R358K, A376T  
ACU83 ACU83 None None   S68G, K122E, I135V, S162C, I178L, T200A, Q207N, R211K, V245M, A272P, K275R, E297K, E312Q, I329V, G333E, G335C, M357T, A371V, S379G, T386I  
ACU84 ACU84 None None   I50V, S68G, K102Q, K122Q, I178M, R211S, A272P, K277R, T290S, I293V, P294T, I329L, Q334D, M357S, T377Q  
ACU85 ACU85 None None   V21I, V35I, D123E, I142T, I178L, T200I, R211K, F214L, E224G, V245M, A272P, K277R, I293V, E297P, I326V, A360T, A376T, T377L, K390R, E399D  
ACU86 ACU86 None None   V21VI, Q207E, V245T, I293V, R356K, M357MV, I375V, K390R  
ACU87 ACU87 None None   V60I, I142T, D177E, I178M, R211K, E248N, A272P, T286A, A288G, I326V, Q334G, G335D, R356K, K366R  
ACU88 ACU88 None None   S162C, I178M, T200A, R211K, V245Q, D250G, A272P, T286A, I293V, K311R, D324E, I329L, K390R  
ACU89 ACU89 None None  K103N, P225H E6EK, K102Q, V118I, K122E, T139A, Q207E, R211K, F214L, V245M, A272P, K277KR, T286A, I293V, V317A, D324E, I329L, M357T, R358K, K366R  
ACU9 ACU9 None None   V35T, K122A, K173Q, I178M, Q197P, T200AE, Q207DE, I293V, E297A, I329V, A376X, T386TA, E399D  
ACU90 ACU90 None None   K64R, D123E, I135T, Y144F, F214L, V245K, E248D, K277R, I293V, E297R, I329L, Y339F, T386I, K390R, K395R  
ACU91 ACU91 None None   K64R, K122E, I178M, R211S, F214FL, E248D, A272P, V276I, I293V, M357T, A400S  
ACU92 ACU92 None None D67DN, K219Q  K11KR, V60VI, T69TN, R83RK, A98AS, K101KQ, D177E, T200A, Q207N, A272P, K277R, A288S, V292I, I293V, E300A, V317A, I329V, Q334L, K350R, M357V, G359S, A371V, A376T, K390R  
ACU93 ACU93 None None   V60I, T69S, D121H, K122E, I135T, I142A, T286A, I293V, Q334E, P345Q, M357S, R358K, T377M, K388R, K390R, E399D  
ACU94 ACU94 None None   K32R, E36EG, R83K, K122P, S162SN, I178M, G196E, Q197K, Q207E, A272P, K277R, I326T, Q334L, A355G, G359S, A371V, A376V, T386A  
ACU96 ACU96 None None   V35I, K49R, V60I, R83K, I135T, T165I, G196E, A272P, V292I, K311R, S322T, Y339F, M357T, K390R  
ACU97 ACU97 None None   V35T, K102R, S162A, G196E, R211A, F214L, K277R, T286A, I293V, E297K, L301I, I326V, Q334L, P345Q, A360T, V365I, K390R  
ACU98 ACU98 None None   V35I, V60I, K102Q, I135L, S162A, Q207E, R211K, V245M, A272P, K277R, I293V, E297A, V317A, I329V, Q334L, R358K, T377L, K390R  
ACU99 ACU99 None None   K20R, T39A, R83K, E169D, G196E, R211G, V245K, A272P, K277R, P294T, I329L, Q334N, M357V, A360T, V365I, K390R, E396D, A400S