Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Lin (2013)
Title Slow immunological progression in HIV-1 CRF07_BC-infected injecting drug users.
Citation Emerg Microbes Infect
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 122
NumPts 122
Subtype CRF07_BC, CRF01_AE

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 122 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
BC BC None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, K173R, E203G, R211K, V245E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311S, G335D, R356K, G359T, T377M, K390R, A400T, E404D, E432D, V435A, L452I, Q464K, D471E, Q480R, H483F, L484I, L491S, S519N, K530R, A534S, A554N, K558R  
BC1 BC1 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC10 BC10 None None   V8I, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, D121Y, K122E, I135T, E169D, V245Q  
BC103 BC103 None None   K11Q, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, S162SN, T165TI, E169D, V245Q  
BC107 BC107 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC108 BC108 None None   I2IV, V35T, E36EA, T39D, S48T, K49R, V60I, D121HY, K122E, E169D, K173KR, E203EG, R211RK, V245EQ  
BC11 BC11 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, D177N, R199K, V245Q, D256E Y188D 
BC110 BC110 None None   V35T, E36EA, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, A158AS, I159IV, E169D, V245Q  
BC113 BC113 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q H198HR 
BC114 BC114 None None   V8VI, V35T, E36EA, T39DE, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, K166R, E169D, V245Q  
BC115 BC115 None None   P1PS, P4PS, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, T58TN, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q P59PS 
BC116 BC116 None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, K173R, E203G, R211K, V245E  
BC12 BC12 None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, D121DY, K122E, E169D, V245Q H198HR 
BC120 BC120 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, T200TA, V245Q  
BC121 BC121 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, D121CY, K122E, D123E, I135T, K173L, Q174K, D177E, I180IV, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BC122 BC122 None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, R211RK, V245Q H198HR 
BC123 BC123 None None   V35T, E36A, T39D, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, R211RK, V245Q  
BC124 BC124 None None   K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135R, E169D, V245Q  
BC125 BC125 None None  K103N T27TS, V35T, E36EA, T39DN, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, D177DN, T200I, R211RK, V245Q  
BC129 BC129 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135R, E169D, V245Q  
BC136 BC136 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, E169D, V245Q  
BC14 BC14 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q H198HR 
BC140 BC140 None None   V35T, E36EA, T39D, S48T, K49R, V60I, D121HY, K122E, E169D, R211K, V245Q P59PS 
BC141 BC141 None None   V35T, E36EA, T39D, S48ST, K49R, V60I, D121HY, K122E, K166KR, E169D, T200TI, I202IV, V245Q  
BC142 BC142 None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, K173R, E203G, R211K, V245E E29EQ 
BC145 BC145 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, T200I, V245Q  
BC146 BC146 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, K166R, E169D, V245Q  
BC149 BC149 None None  K238T K11R, V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, K122E, E169D, T200I, V245Q, P247Q K13M, H198R, L264F, N265H 
BC15 BC15 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, T200TA, V245Q H198HR 
BC151 BC151 None None   V35T, E36A, T39N, S48T, K49KR, V60I, K102KR, D121Y, K122E, E169D, V245K, K249R  
BC155 BC155 None None   V35T, T39N, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, Q207QH, V245K K201N 
BC156 BC156 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135IR, E169D, V245Q  
BC158 BC158 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, D177DE, T200TI, Q207A, R211S, V245Q  
BC16 BC16 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, R211K, V245EQ  
BC161 BC161 None None  V106VM V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, E53D, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC163 BC163 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, V90VI, K122KE, E169D, I202V, R211K, V245Q  
BC166 BC166 None None   V35T, E36A, T39N, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245QR, S251SN L80LR 
BC168 BC168 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, S251I H198HR 
BC17 BC17 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, E169D, V245Q  
BC171 BC171 None None   T27A, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, E169D, R199RK, V245Q  
BC173 BC173 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K104KR, D121DY, K122E, D123DN, I135R, E169D, V245Q  
BC176 BC176 None None   V8I, K32KE, V35T, E36EA, T39D, E40EK, E42EK, S48T, K49R, V60I, D121DH, K122E, I135RT, K166R, E169D, V245Q  
BC178 BC178 None None   K32KE, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135R, E169D, T200TI, I202IV, R211K, V245Q  
BC18 BC18 None None   V35T, E36EA, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, E169D, V245Q, E248ED, T253S  
BC180 BC180 None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, V90I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC181 BC181 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC183 BC183 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, E53D, V60I, D121Y, K122E, E169D, T200A, V245Q  
BC186 BC186 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K122E, I135T, E169D, T200I, V245Q  
BC19 BC19 None None   V35M, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC191 BC191 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, R211K, V245Q H198HR 
BC193 BC193 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, R211K, V245Q  
BC194 BC194 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, V90VI, D121Y, K122E, E169D, R211RK, V245Q  
BC196 BC196 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, R211RK, V245Q  
BC197 BC197 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, V118I, D121C, K122E, D123E, R125G, I135T, K166R, K173A, Q174K, D177E, I195L, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BC198 BC198 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q Q258Q* 
BC199 BC199 None None   V35T, T39N, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, Q207QE, R211RK, V245H  
BC2 BC2 None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, D121DH, K122KE, I135R, E169D, V245Q  
BC20 BC20 None None   V35T, E36EA, T39D, S48T, K49R, V60I, D121HY, K122E, K166KR, E169D, T200TI, I202IV, V245Q  
BC202 BC202 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, R211RK, V245Q  
BC23 BC23 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC24 BC24 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, H208HY, R211RK, V245Q  
BC28 BC28 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, I202IV, V245Q  
BC29 BC29 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, E169D, V245Q  
BC30 BC30 None None   V35T, T39D, S48ST, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, P170L, K173R, E203G, R211K, V245E  
BC31 BC31 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC33 BC33 None None   E6D, K11T, M16K, V35T, T39R, K43E, Y56F, V60I, S68G, D121Y, K122E, D123E, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E G18R 
BC35 BC35 None None   K11N, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, T200I, V245Q  
BC42 BC42 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, T200I, D218DE, V245Q  
BC44 BC44 None None   Q23H, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K122E, E169D, D218DE, V245Q  
BC48 BC48 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K102KQ, D121Y, K122E, E169D, V245Q H198HR 
BC49 BC49 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q H198HR 
BC50 BC50 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121HY, K122E, E169D, V245Q  
BC52 BC52 None None   V35T, T39D, E40K, S48ST, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, E203EK, R211T, V245Q G231E 
BC53 BC53 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D123X, E169D, I178L, R211RK, I244IM, V245Q H198HR 
BC55 BC55 None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, K166KR, E169D, Q207QH, V245Q P97PT, H198HR 
BC56 BC56 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, V60I, S68G, D121H, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207AD, R211S, K238R, V245E  
BC57 BC57 None None   V35T, T39E, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245EK  
BC58 BC58 None None   P4S, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121H, K122E, E169D, V245Q  
BC64 BC64 None None  K103KN V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, R211S, V245Q  
BC65 BC65 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC67 BC67 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q H198HR 
BC69 BC69 None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q L264S 
BC7 BC7 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC70 BC70 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K103R, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC71 BC71 None None   V35T, E36A, T39N, S48T, K49R, V60I, K122E, E169D, Q207H, R211K, V245Q, E248A, N255ND Y144Y* 
BC74 BC74 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q N147NI 
BC75 BC75 None None   E6G, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC76 BC76 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121DY, K122E, E169ED, T200TI, F214FL, V245X  
BC77 BC77 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K122E, I135T, E169D, V245Q  
BC78 BC78 None None   V35T, E36A, T39D, K49R, V60I, V90VI, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC79 BC79 None None   V35T, T39N, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC82 BC82 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q K82KE 
BC84 BC84 None None   K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135R, E169D, V245Q  
BC86 BC86 None None   V35T, T39D, S48T, K49KR, V60I, D121Y, K122E, E169D, R211RK, V245Q K22KQ 
BC88 BC88 None None  K103KN V35T, E36EA, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, K173KR, E203EG, R211RK, V245EQ  
BC89 BC89 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q  
BC91 BC91 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, K166KR, E169D, Q207E, V245Q K22KQ 
BC93 BC93 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121HY, K122E, E169D, T200TA, Q207E, V245Q, K249KR  
BC94 BC94 None None   P4PS, V35T, T39N, S48T, K49R, V60I, V90VI, D121Y, K122E, E169D, Q207QE, R211RG, I244IM, V245H K22KQ 
BC99 BC99 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K101KQ, D121Y, K122E, G141GR, E169D, V245Q, T253S  

Database

Resources

Team