Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Darcissac (2016)
Title HIV-1 pol gene polymorphism and antiretroviral resistance mutations in treatment-naive adult patients in French Guiana between 2006 and 2012.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 304
NumPts 304
Subtype B, F, CRF12_BF, CRF02_AG, A, C, CRF18_cpx, CRF06_cpx

 
  Page 1 of 4    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 304 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
Q13ZSPL Q13ZSPL None None   E6A, K49R, Q207E  
Q17LRTH Q17LRTH None None   I135V, Q207E, V245M  
Q18HMIG Q18HMIG None None   A98S, T107S, K122E, D123E, I135T, S162Y, D177E, G196K, Q197H, T200TA, Q207E, V245M, E248D  
Q18PJFI Q18PJFI None None   D121Y, K122E, S162A, D177E, Q207R, R211E, F214L  
Q47YSQB Q47YSQB None None   K20R, A98S, D121H, K122E, S162A, Q174H, D177E, R211RK  
Q48JTQL Q48JTQL None None   V35VI, S48T, V60I, K122E, D123E, K173Q, D177E, T200A, Q207E, V245N  
Q68DCVN Q68DCVN None None   A98S, K122E, D123N, I135V, D177E, I178M, T200A, Q207EG, R211RK, V245Q, E248N  
R06HZYL R06HZYL None None  E138A V35T, V60I, A98S, I135L, I142V, S162A, K166R, V189I, G196E, T200A, I202V  
R12EKRO R12EKRO None None   V35X, A158AS, S162H, T200A, I202IV, Q207E, R211RK  
R14CMSA R14CMSA None None   K32KR, V35T, I142V, S162C, I178L, V179I, T200A, Q207KN, R211KQ, E248N  
R14ICOG R14ICOG None None   V35I, V60I, V118I, I135T, F214L, V245K  
R16AQHF R16AQHF None None   P1PS, K20R, K49R, V60VI, K122A, I135T, K173Q, F214L  
R16BKRI R16BKRI None None   V118I, D123E, T165I, D177E, G196E, Q207E, R211K, F214L, P243S, V245K, E248D  
R18GVPB R18GVPB None None   V35I, E40D, K122E, K173R, D177E, I202V, Q207E, R211K, F214L  
R21AJVN R21AJVN None None  V179DE E6D, D121Y, K122E, D123E  
R22JFEG R22JFEG None None   P4S, V35T, D123E, A158S, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
R28UPCH R28UPCH None None   S162C, E169D, T200A, Q207EG, R211K  
R32NDTI R32NDTI None None   I142V, E169D, Q197QE, T200IM, Q207E, V245E, E248D  
R32OCEL R32OCEL None None   E6Q, K122E, D123N, I142V, K166T, Q174R, G196E, T200S, V245M  
R58OTEF R58OTEF None None   K64R, K122E, D123E, I135T, S162C, T200A, Q207E, F214L  
R58XBFI R58XBFI None None   D121Y, K122E, K173T, I178M, T200A  
R63BFKA R63BFKA None None   K102Q, K122E, S162C, T200A, R211K, V245M, E248D, D250E  
R86ECBF R86ECBF None None   V35M, E40ED, S162C, D177E, I178M, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
R91XBZE R91XBZE None None   V35I, E40D, K49R, I135T, F171Y, Q207E, R211K, F214L F61FY 
R92CTCP R92CTCP None None   V35T, K49R, I50V, V60I, I135T, T165I, R211K, F214L, V245VM  
R92TEIN R92TEIN None None   K49R, I135V, E169D, G196E, Q207E, V245K, D250E  
S01BNFP S01BNFP None None   V35T, D121DY, K122E, S162C, I178L, V179I, T200TA, Q207E, R211K, E248KN  
S06BJNH S06BJNH None None   V35I, E40D, I135T, Q207E, R211K, F214L, L228Q, V245M  
S13XKFC S13XKFC None None   K20R, V21I, K32R, S162C, I178L, V179I, T200A, Q207E, R211K  
S17BBGN S17BBGN None None   D123S, K166R, D177E, G196S, R211K, V245K  
S19GFGC S19GFGC None None   V35T, E36D, K102KR, K122KE, D123NS, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, K201KR, Q207E, V245Q  
S28CBVP S28CBVP None None   S48T, K49KR, T69TA, K122E, D123E, S162C, E169A, G196E, T200A, Q207EK, R211KQ  
S28QKLR S28QKLR None None   K122E, D177E, Q197P, T200A, Q207E, R211K, V245M  
S32EXJC S32EXJC None None   V35I, V60I, V118I, I135T, E169D, R211RK, F214L, V245K  
S33BPXH S33BPXH None None   S68G, K122E, I135T, G196E, T200A, Q207E, D250N  
S33FZFA S33FZFA None None   S162C, E169D, T200A, Q207K  
S33VZAB S33VZAB None None   D121H, K122E, S162A, Q174H, D177E, R211K, F214L  
S34UGMD S34UGMD None None  K101E K20R, K102Q, K103R, T165I, Q207E, R211K, F214L  
S40TUGM S40TUGM None None   E6D, V35I, E40D, I135T, Q197QP, I202V, Q207E, R211K, F214L  
S61JLZJ S61JLZJ None None   K11T, V35T, E53D, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, I142V, S162Y, K173S, Q174QR, D177E, T200A, Q207A, R211RK, F214L, V245K  
S63XTHL S63XTHL None None D67N, T69D, K219Q  V60I, K104N, K122KE, S162H, I167IV, G196E, Q207G, F214L  
S70CCFF S70CCFF None None   V118I, D123E, T165I, D177E, G196E, T200I, Q207G, R211K, F214L, V245I, E248N  
S73UTND S73UTND None None   S68G, I135T, T165I, D177E, T200A, V245M  
S86UCAI S86UCAI None None   K11Q, S162Y, Q174E, T200A, Q207E, R211K  
S90HREJ S90HREJ None None   V60I, K122E, I135T, I142T, T200TA, P243T  
T05EIHB T05EIHB None None   K20R, A98S, S162A, T200E, R211RK E233EV 
T07FKXP T07FKXP None None   V35T, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207R, R211A  
T17CLMI T17CLMI None None  V106I K122E, S162C, T200A, Q207R  
T22SESP T22SESP None None   V35IT, K64R, D121H, K122E, K166R, P176PS, D177DE, I178M, T200A, Q207G, R211K  
T23CFCB T23CFCB None None   K32R, V35E, T39A, K43R, I142V, S162C, I178L, T200A, Q207K, R211T  
T26NNJH T26NNJH None None   V118I, D123E, D177E, G196E, T200A, Q207EK, R211K, F214L, E224K, P236PH  
T51UGBN T51UGBN None None   K64R, K122E, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211K  
T69DQGR T69DQGR None None   V35I, E40D, K49R, K102Q, D123DE, I135V, S162C, E169D, T200A, E204EK, Q207E, R211RK, F214L  
T69PCGQ T69PCGQ None None   D123S, K166R, D177E, G196S, R211K  
T76YDGG T76YDGG None None   E6K, V35VA, V90I, A98S, K122P, I142V, D177E, I195L, Q207E, E233EG G18R, E89EG, K154KQ, K220I, Q222QL 
T77PDUI T77PDUI None None   P4PL, V60I, I135T, S162A, E169D, G196E, Q207K, R211K  
T78QAIR T78QAIR None None M184MI K103N, V108VI, Y188YH E6EK, K122E, S162C, I178IM, Q207A, L228LH, P236PH  
T82FBZI T82FBZI None None   K20R, K122E, S162A, T200A, F214L, P236PH  
T92XQUE T92XQUE None None   V35I, E40D, K49R, K102Q, D123E, S162C, E169D, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L  
U00DCKQ U00DCKQ None None   V21I, W24R, V35I, E40D, R125RK, I135T, Q207E, R211K, F214L, M230MR K20KI, L26S, C38CR, W229CG, E233V 
U01TVMQ U01TVMQ None None   V35I, S48T, V118I, K122E, D123E, I135T, K166R, T200A, R211K, F214L, E233EG  
U02TXAK U02TXAK None None   V35T, V60I, K166R, I178M, R211Q, E248D  
U20VIQI U20VIQI None None   V35I, E40D, K49R, D123E, I135V, S162C, E169D, D177E, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245R, D250E  
U31BPON U31BPON None None   I135V, I178M, G196E, D250E  
U32XDSB U32XDSB None None   D121DY, K122E, T139TA, S162C, M164MI, Q207E, R211K, F214L, V245T, K249Q  
U35JNXK U35JNXK None None   D121Y, K122E, K173T, D177DE, I178M, T200A, P243S, V245E  
U39UROD U39UROD None None  V106I I135T, D177E, F214L  
U44NXHG U44NXHG None None   V35I, E40D, K64R, D192N, Q207E, R211K, F214L, I244IV, K249Q  
U47PVPQ U47PVPQ None None   T69TP, D123E, E169K, T200A, Q207EG  
U48YAKH U48YAKH None None   K20R, A98S, S162A, T200E, R211K, P243PR  
U52EUDA U52EUDA None None   A98S, K122E, T200A  
U58HFCB U58HFCB None None   K20R, V60VI, K122E, I135R, F214L  
U86QDYL U86QDYL None None   K11KE, V21L, K22N, V118I, T165I, I178L, T200I, Q207E, R211K, F214L, E233EG D123R 
U91XTLD U91XTLD None None   V35I, V60I, F87L, K101Q, V118I, I135T, K173R, F214L, V245K  
V03HHTP V03HHTP None None   D123E, I135X, S162C, K173E, D177E, T200TA, E204Q, Q207A, R211K, V245E, E248N  
V04BQDJ V04BQDJ None None   K11KT, K20R, I142X, S162A, Q174X, G196E, Q207E, R211K  
V08SNIE V08SNIE None None   V35I, E40D, S48ST, K49R, I135IV, S162C, E169D, T200A, Q207E, V245M, D250E  
V09KMJO V09KMJO None None   K20R, V35I, E40D, V60I, I135T, T200A, I202V, F214L  
V12MODE V12MODE None None  V106I S68G, K166R, D177E, T200A, R211G, V245M  
V15DNVE V15DNVE None None   P1PS, D123N, I142V, E169D, I178L, T200IV, Q207E  
V25PENN V25PENN None None M184MI K103N, M230MI M16MI, K20KE, M41MI, G51R, G93R, K102Q, S162Y, D177E, I178IM, G190R, G196R, T200A, D237A P19A, W71W*, G99E, M164MT, W212W*, G213GR, W229W* 
V38YCKG V38YCKG None None   V35I, E40D, K122Q, I135T, D177E, Q207E, R211K, F214L, V245K  
V45IYHK V45IYHK None None   D123E, I135T, S162C, D177E, Q207E  
V45KCNJ V45KCNJ None None   K122E, I135IV, S162F, T200A, Q207E, R211RK, V245I  
V45PLDR V45PLDR None None   S162C, I178L, V179I, G196E, Q207G, R211K, E248ED  
V56ZBPC V56ZBPC None None   K122E, D123NST, D177E, I178M, G196S, T200A, P243T, V245E, E248D, D250E  
V62QRYL V62QRYL None None   K20R, V35I, K122A, I135T, S162C, D177E, T200A, Q207G  
V67QVTO V67QVTO None None   K20R, S48T, V60I, V118I, K122E, I135T, K173E, I178L, R211K, F214L, P243T, V245E  
V67TZBQ V67TZBQ None None   V21I, K32R, V35T, V60I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211K, V245Q, E248N  
V72XNSM V72XNSM None None   I135V, Q174L, I202V, Q207E  
V93UVIF V93UVIF None None   V118I, K122N, D123E, D177E, T200I, Q207E, R211K, F214L, V245M  
W03BCBM W03BCBM None None   V8I, I142V, T200A, E204Q, Q207A, R211K, V245N, E248D  
W23JEXB W23JEXB None None  V106I V35K, K49R, E79D, D121Y, K122E, I135T, S162C, E169D, K173T, Q174K, I178L, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248N  
W29VMMD W29VMMD None None   V35I, I135T, A158S, R211RK, F214L, V245T  
W38YVDJ W38YVDJ None None   K22KR, E53ED, I142IT, K173KE, Q197QR, Q207EG, R211K, V245T I63IM 
W52LMQC W52LMQC None None  K103N K122E, I178M, V179I, V245Q  
W79FEOR W79FEOR None None   S48T, K49R, V60I, D123E, E169D, D177E, T200A, E204X, Q207E  
W79LRMQ W79LRMQ None None   S48T, K122E, K173R, T200A, Q207E, R211RK, V245M  
W85QNUK W85QNUK None None   K122P, E169D, I178L, V179I, Q207R, R211E, F214L, V245M  
W93BFZJ W93BFZJ None None   K122E, D123S, Q197P, R211K, I244V, D250E  

Database

Resources

Team