Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Kinloch (2016)
Title Population-level immune-mediated adaptation in HIV-1 polymerase during the North American epidemic.
Citation J Virol
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 321
NumPts 321
Subtype B

 
  Page 1 of 4    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 321 Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
PRRT_105 PRRT_105 None    T4A  
PRRT_106 PRRT_106 None    L10I, I13V, I15V, Q18L, E35D, R41K, I64V, H69Y  
PRRT_11 PRRT_11 None    K14R, I15V, R41RK  
PRRT_111 PRRT_111 None     I84IT 
PRRT_114 PRRT_114 None    I15IV, E35ED, N37CS, L63A, H69Y, I72V, V77I  
PRRT_115 PRRT_115 None    I15IV, N37D, P39PS, D60DE, L63LP, I64IM  
PRRT_116 PRRT_116 None    I93L  
PRRT_118 PRRT_118 None    I13IV, K14KR, I15IV, L19I, L63A  
PRRT_119 PRRT_119 None    L10LV, K14R, L63A, I72IV  
PRRT_12 PRRT_12 None    R41RK, R57RK, I62IV  
PRRT_124 PRRT_124 None    E35ED, N37NS  
PRRT_129 PRRT_129 None    I13V, E35D, N37NH, R41RK, L63P  
PRRT_134 PRRT_134 None    L10I, R41K, I93L  
PRRT_138 PRRT_138 None    H69Y, N98S  
PRRT_139 PRRT_139 None    T12S, N37S, I62IM  
PRRT_140 PRRT_140 None    E35D, M36I, L63P, I93L  
PRRT_148 PRRT_148 None    R41K, K45R, D60DE, L63T, V77VI  
PRRT_150 PRRT_150 None    N37S, R41K, V77I  
PRRT_152 PRRT_152 None    E35D  
PRRT_158 PRRT_158 None    E35ED, M36MI, N37NS, I62V, I93L  
PRRT_159 PRRT_159 None      
PRRT_16 PRRT_16 None    L63PS, I93L  
PRRT_161 PRRT_161 None    K14KR, N37ND, I64IV  
PRRT_165 PRRT_165 None      
PRRT_166 PRRT_166 None    G49E  
PRRT_17 PRRT_17 None      
PRRT_171 PRRT_171 None    E35D, N37S, L63P, I64IV  
PRRT_172 PRRT_172 None     V75VA 
PRRT_176 PRRT_176 None      
PRRT_177 PRRT_177 None    N37D, K45KR, L63PS, V77VI, I93L  
PRRT_183 PRRT_183 None    I64V  
PRRT_187 PRRT_187 None    E35ED, N37NS, L63LP  
PRRT_190 PRRT_190 None  M46I  E35D, I93L  
PRRT_191 PRRT_191 None    G16GE, N37T  
PRRT_197 PRRT_197 None    M36MI, N37S, I62M, L63P, A71T, I93L  
PRRT_20 PRRT_20 None    R41K, I93L  
PRRT_203 PRRT_203 None    R41K, I93L  
PRRT_204 PRRT_204 None    R41K, L63P, I93L  
PRRT_206 PRRT_206 None      
PRRT_207 PRRT_207 None    N37S, R41K  
PRRT_208 PRRT_208 None    R41K, I62IV, L63LP, I93L  
PRRT_214 PRRT_214 None    N37S  
PRRT_219 PRRT_219 None    N37ST, R41RK, I64IV  
PRRT_220 PRRT_220 None    N37S, I64IV  
PRRT_225 PRRT_225 None    E35D, I62V, L63P, H69Q, A71AT, V77I  
PRRT_229 PRRT_229 None    L10I, T12S, I93L  
PRRT_23 PRRT_23 None    D25DN, E35D Q2QHL 
PRRT_231 PRRT_231 None      
PRRT_238 PRRT_238 None    K14KR, N37S, R41RK  
PRRT_239 PRRT_239 None    I64V, I93IL  
PRRT_243 PRRT_243 None    R57RK, G68E, A71V, I93L  
PRRT_248 PRRT_248 None    L63P, I93L  
PRRT_25 PRRT_25 None    E35D, N37D  
PRRT_250 PRRT_250 None      
PRRT_258 PRRT_258 None    L19I, I93L  
PRRT_263 PRRT_263 None      
PRRT_27 PRRT_27 None    I15IL, L33V, Q61E, L63P, K70T  
PRRT_271 PRRT_271 None    K14R  
PRRT_274 PRRT_274 None    V11VI, N37NS  
PRRT_276 PRRT_276 None    I13V, I64V  
PRRT_279 PRRT_279 None      
PRRT_280 PRRT_280 None    N37S, R41K, I93L  
PRRT_281 PRRT_281 None    V77VI  
PRRT_283 PRRT_283 None    E35ED, H69Y  
PRRT_287 PRRT_287 None      
PRRT_289 PRRT_289 None      
PRRT_291 PRRT_291 None    I15V, F99FL  
PRRT_294 PRRT_294 None    K14R, E35D, N37A, R41K, I64V  
PRRT_295 PRRT_295 None    L10LI, I13V, M36I, L63LP, I64IV, H69HY  
PRRT_30 PRRT_30 None    L10I, N37NS, I93L  
PRRT_301 PRRT_301 None    I13V, N37S, R41K, K43R, I62IV, I64V  
PRRT_303 PRRT_303 None    C67CY, R87RK  
PRRT_309 PRRT_309 None    N37H, R41K, I93L  
PRRT_31 PRRT_31 None      
PRRT_311 PRRT_311 None    N37S  
PRRT_321 PRRT_321 None    R57RK, L63PS, I93L  
PRRT_323 PRRT_323 None    L10I, E35D, I93L  
PRRT_36 PRRT_36 None    L10LI, N37NS, I62V, L63P  
PRRT_38 PRRT_38 None    K14KR, I15IV, R41K, I64IV, I93L  
PRRT_40 PRRT_40 None    N37S, L38LM, R41RK, I62V, I64V  
PRRT_42 PRRT_42 None    E35D, N37X, R41RK P9PL 
PRRT_43 PRRT_43 None    E35D, L63P  
PRRT_45 PRRT_45 None    L63P, I72IM  
PRRT_47 PRRT_47 None    L33LV, R41RK, R57RK, L63P, I93L  
PRRT_5 PRRT_5 None    R41RK, K45KR, R57RK, L63P, V77I, I93L  
PRRT_51 PRRT_51 None    T12X, K14KQ, I15ILV, L19LI, E35D, R41K, R57K, L63P, E65D Q2QR 
PRRT_56 PRRT_56 None    N37X, R41RK, V77I, I93IL  
PRRT_59 PRRT_59 None    T12TP, K14KR, L63LP, V77VI, I93IL  
PRRT_6 PRRT_6 None    N37S, V77I, I93L  
PRRT_60 PRRT_60 None    R57K, I62V, A71X, V77VI, I93L  
PRRT_64 PRRT_64 None    N37C, R41K, I62V, H69HY, V77I, I93L  
PRRT_66 PRRT_66 None    R41K, L63LP, A71AV, I93L  
PRRT_70 PRRT_70 None    E35D, R41K, L63P, E65D, I72V  
PRRT_71 PRRT_71 None    T12S, M36I, I62IV, L63P, V77I, L89LM, I93L  
PRRT_76 PRRT_76 None    L10I, I13V, M36MI, L63ST, I64IV  
PRRT_78 PRRT_78 None    V77I  
PRRT_82 PRRT_82 None    L63Q, I64V, H69Y, I72T, V77I  
PRRT_89 PRRT_89 None    N37NS  
PRRT_91 PRRT_91 None      
PRRT_92 PRRT_92 None   L10LF K14KR  

Database

Resources

Team