Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Barrow (2013)
Title HIV-1 drug resistance in treatment-naive chronically infected patients in Jamaica.
Citation Antivir Ther
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 75
NumPts 75
Subtype B


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
None None   R83K, I135IV, S162A, D177E, I178V, G196E, V245M  
10 10 None None   D123E, S162C, D177E, I178L, E204Q, Q207E, P243S, V245T  
102 102 None None   S162C, D177E, T200A, E204Q, Q207A, R211K  
103 103 None None   R83K, I135T, S162A, I195M, V245I  
104 104 None None   I135R, S162A, K173N, D177E, I202V, E204Q, Q207A, R211K, F214L, V245VE  
110 110 None None   S162C, G196E, T200A, E204Q, Q207A, R211K, V245E  
111 111 None None   K49R, V60I, D123E, D177E, T200TA, E204Q, Q207E, R211K  
117 117 None None   K64R, K122P, I135IT, K166R, I195IT, V245VM  
119 119 None None   I37F, K64KR, K122E, I135T, K173KQ, I178M, Q207E, R211K, V245T  
120 120 None None   K49KR, I135IV, S162C, E169D, I178M, T200A, E204Q, Q207A, R211K  
123 123 None None   D123E, Q174L, I178M, T200TI, Q207A, R211K  
124 124 None None T215S  D86E, K122E, D123A, I142V, S162A, D177E, I178M, T200TA, Q207E  
127 127 None None   S162C, D177E, E204Q, Q207A, R211K, V245E  
128 128 None None  K103KN D123N, S162C, D177DE, I178IL, V179VI, E204Q, Q207A, R211K  
129 129 None None   E79EK, S162C, T200TA, E204Q, Q207A, R211K, F214FL, K238KR  
13 13 None None   D123E, I142V, K173Q, D177DE, I178L, T200TA, E204Q, Q207A, R211K, F214L  
131 131 None None   K122E, I142IM, S162C, T200A, E204Q, Q207DE, R211K, V245VA  
132 132 None None  K103KN I135RT, S162C, E169D, G196E, E204Q, Q207E, R211K, I244V  
133 133 None None   I142V, T165I, K173R, Q174K, D177E, G196GE, T200TA, I202V, F214L  
134 134 None None   K102KQ, K122KE, D123E, D177E, R211K, V245EK  
138 138 None None   S162C, E204Q, Q207A, R211K, V245M  
140 140 None None  K103N, E138A V90I, S162Y, K173T, Q174K, D177G, V179I, G196E, R211K, I244V, V245M  
143 143 None None   E79D, D123E, I135T, I142T, S162A, Q174R, N175H, P176Q, I178M, Q197K, T200E, K201R, R211K  
145 145 None None   K49KR, R83K, V90I, D123E, S162A, G196E, I244IV  
154 154 None None   K49KR, D123E, D177E, G196E, R211K, V245K  
156 156 None None   K49KR, K104KR, D123N, I135V, S162C, D177DE, E204Q, Q207A, R211K, P243S, V245Q  
157 157 None None   K49KR, V60VI, K122KE, I135IT, Q207ADE, R211K, V245T  
158 158 None None   E53D, D123E, I142IV, S162A, D177E, R211K  
164 164 None None   S162C, G196E, E204Q, Q207A, R211K, V245T  
166 166 None None   V60I, I142V, S162A, I202IV, Q207H, R211K  
167 167 None None   I37L, K173KE, G196GE, E204Q, Q207E, R211K, F214L  
168 168 None None   I37L, K49R, I50V, V60I, D123E, I135T, S162C, D177E, I178M, G196E, E204Q, Q207A, R211K  
169 169 None None   K102KQ, K122KE, D123DN, D177E, I178IV, V179I, G196E, E204K, Q207E, F214FL  
17 17 None None   D123E, S162C, D177E, Q207A, R211RK, P243S, V245VE  
170 170 None None   K101Q, D123DE, S162C, G196E, T200TA, E204Q, Q207A, R211K, P243PS, V245MT, L246LIM  
171 171 None None   S48X, K49R, K122KR, D123E, S162C, D177E, I178L, E204Q, Q207A, R211K  
174 174 None None   S162C, G196E, E204Q, Q207A, R211K  
18 18 None None  K103KN D123DE, S162C, G196E, E204Q, Q207A, R211K, K238R  
182 182 None None   K49R, R83K, K104N, K122P, I135T, S162A, Q174QR, T200E, I202V  
186 186 None None   D123E, S162C, D177E, T200A, E204Q, Q207A, R211K  
187 187 None None   S162C, D177E, E204Q, Q207A, R211K, V245MR Q85H 
19 19 None None   T39TI, D123E, S162C, K173Q, I178L, E194D, E204EQ, Q207E, V245E  
192 192 None None   V60VI, A98AS, D123E, K166R, D177E, I178IM, T200A  
195 195 None None   R83K, S162A, I178IM  
196 196 None None   K122E, D123EG, S162C, K173T, Q174QR, D177E, I178IV, G196E, T200I, R211K  
197 197 None None   R83K, D123E, S162H, T200A, R211K, P243S  
198 198 None None   S162C, E204Q, Q207A, R211Q  
205 205 None None   R83K, D121DN, T139K, I142IN, A158S, S162F, I178L, I202V, R211G, V245E  
207 207 None None   I37F, K102Q, K173E, Q174QR, T200TIM, I202V, R211K, F214L  
217 217 None None   K49R, V60VI, E79EK, A98S, D123E, I135T, K166R, Q174H, G196V, R211RK, I244V, V245M  
219 219 None None   S68G, K122E, D123E, S162X, T165TI, D177E, I178M, G196E, V245E  
221 221 None None  K103N K122E, D123G, I142V, S162A, I178L, R211K  
223 223 None None   S162C, Q197E, E204Q, Q207A, R211K  
23 23 None None  V106VI K122KE, S162C, G196E, E204Q, Q207A, R211K, V245K  
24 24 None None  E138A K64KR, K122KE, I135T, S162C, V179I, G196E, E204Q, Q207A, R211K  
27 27 None None   S68G, K122E, D123N, S162C, D177E, I178L, V179I, E204Q, Q207AT, R211K, V245E  
28 28 None None   R83K, K122E, I135IV, S162A, K173KR, P176PS, D177E, I178M, T200TA, V245M  
43 43 None None   Q207T, R211K  
44 44 None None   A98S, K122E, S162H, T200I, Q207A, R211K, V245E  
48 48 None None   S162SC, K173KN, D177E, I178IM, E204Q, Q207E, R211K, F214FL  
49 49 None None   S162A, D177E, I178M, R211K, V245EQ  
56 56 None None   I135IT, S162C, G196E, E204Q, Q207A, R211K  
57 57 None None   A98S, I135T, S162SA, D177E, R211K, F214L  
58 58 None None   S162C, E204Q, Q207D, R211K  
59 59 None None   R83K, K122E, D123G, S162A, P176PS, T200TA, V245Q  
60 60 None None   R83K, K122E, D123G, I135T, G141GE, S162A, Q174QR, Q197QH, F214FL, V245Q  
61 61 None None   K49R, D123E, S162C, K173KQ, D177E, I178IV, T200TA, E204Q, Q207X, R211K, V245VL  
65 65 None None   G45GE, K49R, D123E, S162C, D177E, I178M, T200TA, E204Q, Q207A, R211K  
68 68 None None   K49R, V60I, R83K, D123E, I135T, S162A, E169D, V189I, I202V, R211K, P243H, V245E  
75 75 None None  K103N V60I, K122EQ, I135T, I142IV, S162C, D177E, T200A, Q207A, L210LF, R211K  
77 77 None None   K122E, I178M, V245VM  
78 78 None None   D123E, S162C, D177E, T200A, E204Q, Q207A, R211K, V245M  
None None V75VI  D76DN, K122Q, I135IL, K173D, Q174K, V179I, T200A, R211K, V245IM  
80 80 None None   R83RK, D123E, I142IT, K166R, D177E, Q207K, R211K  
81 81 None None   R83K, I135T, S162A, K173E, I178L, I195L, R211K, V245M