Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Barrow (2013)
Title HIV-1 drug resistance in treatment-naive chronically infected patients in Jamaica.
Citation Antivir Ther
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 75
NumPts 75
Subtype B

 

Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
1 1 None    I15V, L19Q, R41K, Q61H, K70R  
10 10 None    K14KR, I15V, L19Q, K20M, E35D, M36I, R41K, L63HQ, K70R, I72IV, L89I  
102 102 None    K14M, I15V, L19Q, E35ED, N37NS, R41K, D60E, I62V, I64V, E65D, K70R  
103 103 None    T12TA, I13V, K14KR, I15IV, R41K, L63P  
104 104 None    I15V, R41K, K70R  
110 110 None    I15V, L19Q, E35D, M36I, R57RK, I62V, L63ST, K70KR, I72V  
111 111 None    L19Q, N37NS, R41K, L63P, I72V, I93L  
117 117 None    K14R, E35D, P39S, R41K, D60E, L63P, I64V  
119 119 None    N37NS, R41K, L63LP, V77I, I93L  
120 120 None    I15V, L19Q, E35D, N37S, R41K, D60E, L63P  
123 123 None    T12Q, I15V, L19Q, M36I, K43KR, L63PS  
124 124 None    G16E, L19T, N37NS, P39S, L63P, K70R, I72IV, V77I  
127 127 None    T12S, I15V, L19Q, N37H, R41K, R57K, L63P  
128 128 None    I15V, L19Q, R41RK, D60DE, K70KR  
129 129 None    I15V, L19Q, M36I, R41K, L63P, K70R  
13 13 None    L19Q, R41K, L63P, E65ED, K70R  
131 131 None    T12S, I15V, L19Q, N37NS, R41K, K70R  
132 132 None    I15V, G16E, L19Q, M36I, R41K, K43R, K70R, I72V  
133 133 None    L19Q, R41K, D60DE, L63LP, A71AT, I93L  
134 134 None    L63A, H69Q  
138 138 None    I15V, L19Q, E35D, M36I, R41K, Q61H, L63S, I64V, E65D, K70R, I72V  
140 140 None    T4TI, I13IV, G16GE, L19LI, E35D, M36I, N37NI, R41K, I62V, L63S, H69Q, T91TI  
143 143 None    I15V, L19Q, P39PS, R41K, I62V, L63P, H69Y, K70R, V77I  
145 145 None    E35D, R41K, L63P, E65D  
154 154 None    I13V, P39S, R41K, D60E, I62IV, L63P, I64V, V77I  
156 156 None    L10V, I15V, L19Q, E35D, M36I, R41K, K70R, L89M  
157 157 None    T12A, E35D, N37S, R41K, R57K, I62IV, L63P, H69Y, I72V, V77I  
158 158 None    I13V, K14KR, I15V, M36MI, R57K, L63S, I64V, E65D, V77I  
164 164 None    I15V, L19Q, E35D, N37S, R41K, L63P, E65ED, K70R  
166 166 None    T12K, L19I, N37S, R41K, K70R, V77I  
167 167 None    I15V, L19Q, N37C, P39S, R41RK, Q61H, L63P, I64IV, K70R, V77VIM  
168 168 None    I13V, K14T, I15V, L19Q, N37C, I62V, I64V, T91TI  
169 169 None   L10LF I15V, E35D, R41K, L63P, K70R  
17 17 None    L19Q, N37S, L63P, K70R, L89I  
170 170 None    R41K, L63P, I64L, K70KR, V77I  
171 171 None    K14T, I15V, L19Q, M36I, R41K, R57K, D60E, I62V, I64V, E65D, K70R  
174 174 None    I15V, L19Q, R41K, K70R, V77I  
18 18 None    I15IV, L19Q, N37NS, R41RK, L63X, E65ED, K70R, L89LIM  
182 182 None    I13V, K20M, E35D, M36I, R41RK, L63PS, A71T  
186 186 None    I15V, L19Q, E35D, M36I, R41K, L63P, E65D, K70R, I72V  
187 187 None    I15V, L19Q, M36MI, N37NS, R41K, K70R, V77VI  
19 19 None    I15V, L19Q, N37S, R41K, L63P  
192 192 None    I15IV, L19LF, M36I, I62V, L63X, V82I  
195 195 None    L63P  
196 196 None    I13IV, K14KT, L19Q, L63P, I72V, V77I  
197 197 None    I15V, E35D, N37E, K43KR, L63P, E65D, I66V, I72V  
198 198 None    I15IV, L19Q, N37S, R41K, D60E, I64V, K70R  
205 205 None    I15V, M36I, R41K, I62V, L63A  
207 207 None    R41K, L63P, I64M  
217 217 None    L10I, I15V, Q18H, L63P, I72E, V77I  
219 219 None    I13IV, L63P, V77I  
221 221 None    L19T, L63P, K70R, V77I  
223 223 None    K14M, I15V, L19Q, N37S, R41K, R57K, D60E, I62V, L63P, I64V, K70KR  
23 23 None    K14KR, I15IV, R41K, Q61QE, L63P, E65D, K70KR, V77I  
24 24 None    I13V, K14R, N37S, R41K, L63P, I64L, K70KR, I72V, V77I, L89LM  
27 27 None    I15V, L19Q, M36I, R41K, D60E, I62V, I64IV  
28 28 None    L10I, N37T, I62IV, L63A, I72M, V77I, I93L  
43 43 None    I15V, E35D, M36I, R41K, L63A  
44 44 None    I15V, L19Q, K20M, M36I, N37S, R41K, R57K, Q61H, L63P, I64M, K70R, I72T  
48 48 None    K14M, I15V, L19Q, M36I, R41K, D60E, I64V, K70R  
49 49 None    E35D, M36MI, N37NS, R41K, R57K, D60E, I62IV, L63P, I72T, V77VI  
56 56 None    T12P, L19Q, E35D, M36I, R41K, D60E, L63P, I72V, I93L  
57 57 None    I13V, I15V, E35D, L63P, H69HQ, K70KR, I72IV, V77I  
58 58 None    K14KR, I15V, L19I, E35D, M36I, R41K, L63P, E65D, K70R, I72V  
59 59 None    I15V, G17E, L19I, E35D, N37K, R41K, I62V, L63A, A71T  
60 60 None    I15V, G17E, L19I, E35D, N37K, R41K, I62V, L63A, A71T  
61 61 None    I15V, E35D, M36I, R41K, L63P, E65D, K70R  
65 65 None    T12TP, I15V, L19Q, E35D, M36I, R41K, L63P, K70R, I72V  
68 68 None    I13V, L33I, L63P, I64L  
75 75 None    T12S, K14MT, L19Q, N37S, R41K, D60E, L63V, I64V, E65D, V77I  
77 77 None    I13V, M36MI, N37ND, R41RK, R57K, L63P, I64M, H69K  
78 78 None    I15V, M36I, R41K  
8 8 None    E35D, N37D, R41RK, D60E  
80 80 None    T12N, L19I, E35D, M36I, K45R, R57RK, I62V, L63X, I64IL, H69Q  
81 81 None    I13V, R41K, K43R, R57K, L63P, H69Y  

Database

Resources

Team