Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Budambula (2015)
Title HIV-1 protease inhibitor drug resistance in Kenyan antiretroviral treatment-naive and -experienced injection drug users and non-drug users.
Citation AIDS Res Ther
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 132
NumPts 132
Subtype A, C, D, B, CRF01_AE, CRF35_AD, CRF02_AG, G

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 132 Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
MK01 MK01 None    I15V, L19V, M36I, R41N, L63P  
MK03 MK03 None    I15V, L19T, M36I, N37K, R41N, I62V, L63P, H69K, L89M, I93L  
MK04 MK04 None    T12S, I15V, M36I, N37K, R41N, W42*, L63T, H69K, L89M, I93L G16K, G51R, G68R, G86R 
MK05 MK05 None    K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
MK06 MK06 None    W6C, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M R8W, P9H 
MK08 MK08 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, R57K, I64V, H69K, L89M  
MK09 MK09 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, R57K, L63P, I64V, H69K, L89M  
MK10 MK10 None    K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, R87K, L89M  
MK100 MK100 None    L10V, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, H69K, L89M  
MK101 MK101 None   L33F R41K, H69K, L89M  
MK102 MK102 None    T12S, I15V, L19T, M36I, N37K, R41N, L63P, H69K, L89M, I93L  
MK104 MK104 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, L63P, H69K, V77I, L89M  
MK105 MK105 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
MK106 MK106 None    L10V, I13V, K14R, K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, I62V, L63T, I64M, H69K, T74S, L89M  
MK107 MK107 None    I13V, L33I, R41K, H69K, A71T, I93M  
MK108 MK108 None    I13V, E35D, M36I, N37D, R57K, L63P, H69K, L89M  
MK109 MK109 None    I13V, K20R, M36I, R41K, H69K, L89M  
MK11 MK11 None    T12S, I15V, L19I, M36I, R41K, L63T, H69K, I93L  
MK111 MK111 None    I15V, M36I, R41K, L63T, E65D, H69K, V82I, L89M, I93L  
MK112 MK112 None    I13V, K20R, L33V, M36I, R41K, Q61H, H69K, L89M  
MK113 MK113 None    I13V, L63P  
MK115 MK115 None    G16E, E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, E65D, H69K, L89M  
MK116 MK116 None    I13V, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, H69K, L89M  
MK117 MK117 None    I13V, K20R, M36I, N37S, R41K, L63P, I64V  
MK118 MK118 None    L10I, I13V, G16E, K20R, E35D, M36I, R57K, I62V, L63A, H69K, L89M  
MK119 MK119 None    L10M, T12S, I15V, L19I, M36I, N37K, R41N, Q61E, L63T, H69K, I93L  
MK12 MK12 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, K70R, L89M  
MK120 MK120 None    I13V, K14R, L19I, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, L63V, H69K, L89M  
MK121 MK121 None    T12P, M36I, N37D, R41K, L63S, I64V, K70R  
MK122 MK122 None   L33F I13V, M36I, R41K, R57K, G68E, H69K, L89M  
MK123 MK123 None    I13V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
MK124 MK124 None    K14R, I15V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
MK125 MK125 None    L10V, V11I, I13V, G16E, E35D, M36I, R41K, K45R, L63S, H69K, L89M  
MK126 MK126 None    L10I, T12I, I13V, G16E, E35D, M36I, R41K, R57K, L63S, H69K, L89M  
MK127 MK127 None    I13V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
MK129 MK129 None    T12V, I13V, K14R, G17E, E35D, M36I, R41K, R57K, L63P, H69K, I72V, L89M  
MK131 MK131 None    K14R, I15V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
MK132 MK132 None    L10V, V11I, I13V, G16E, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, L63S, H69K, L89M  
MK15 MK15 None    I13V, L19V, L33V, M36I, G40E, R41K, W42*, G48R, R57K, D60K, Q61E, L63S, I64V, G78R G16K 
MK16 MK16 None    T12S, I15V, M36I, N37K, R41N, L63P, H69K, V82I, I93L L19A 
MK18 MK18 None    I13V, K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, Q61E, E65D, H69R, L89M  
MK19 MK19 None    W6*, T12S, I15V, L19T, M36I, R41K, W42*, G48E, G51E, L63T, H69K, G78R, L89M, I93L G40K, G68K, G86R, G94R 
MK20 MK20 None    I13V, K14R, L19V, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, Q61E, H69K, K70R, L89M  
MK22 MK22 None    T12S, K14R, I15V, L19Q, M36I, N37K, R41N, H69K, V82I, L89M, I93L  
MK23 MK23 None    L10I, I13V, G16A, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, Q61D, H69Q, I72V, L89M  
MK24 MK24 None    I13V, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, H69K, L89M  
MK25 MK25 None    I13V, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, H69K, L89M  
MK26 MK26 None    L10I, I13V, I15V, M36I, R41K, I62V, L63A, I64V, C67Y  
MK30 MK30 None    T12S, I15V, L19I, M36I, R41K, H69K, I93L G78A 
MK31 MK31 None    L10V, I13V, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, L63T, C67G, G68E, H69K, K70R, L89M, T91V, I93L  
MK32 MK32 None  L90M  K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, L63T, H69K, I72T, L89M  
MK33 MK33 None    I13V, E35D, M36I, N37I, R41K, R57K, D60E, I62V, H69K, L89M  
MK34 MK34 None    K14R, E35D, M36I, N37E, R41K, R57K, H69K, K70R, L89M  
MK36 MK36 None    I13V, L63Q, I64V, V77I  
MK38 MK38 None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, Q61H, I64M, H69K, I72E, V82I, L89M  
MK39 MK39 None    I13V, K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, L63S, H69K, K70R, L89M  
MK41 MK41 None    I13V, L19I, M36I, R57K, L63P, I64V, H69Y, I72V  
MK42 MK42 None    L10V, I13V, K14R, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, H69K, L89M  
MK43 MK43 None    I13V, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, L63A, H69K, L89M  
MK44 MK44 None    K14R, G16E, K20R, T31A, M36L, R41K, D60E, I64V  
MK45 MK45 None    G16A, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
MK46 MK46 None    T4I, I13V, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
MK47 MK47 None    K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, L63A, E65D, H69K, K70R, L89M  
MK49 MK49 None    I13V, K20R, E35D, M36I, R41K, W42*, E65K, H69K, L89M G68R, G86R 
MK50 MK50 None  D30N, M46I  I13V, K20I, D25N, E34K, E35K, M36I, G40E, R41K, G51E, D60N, Q61N, E65K, H69K, I72V, R87K, L89M C67K, G78E, G86K 
MK52 MK52 None    L5F, T12P, L19I, L23F, T31P, E34K, M36I, R41K, K43X, P44X, I64V, H69K, G78R, Q92H V32L 
MK53 MK53 None    I13V, K14R, G16A, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M  
MK55 MK55 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, D60E, H69K, K70R, L89M  
MK56 MK56 None    I13V, I15V, M36I, R41K, K45R, L63P, I64V, E65D  
MK57 MK57 None    I13V, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
MK58 MK58 None    L10I, I13V, E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, L89M  
MK60 MK60 None    I13V, M36I, R41K, I62V, H69K, V82I, L89M  
MK62 MK62 None    I13V, R41K, I64V, H69Y, V77I, T96P G94W 
MK63 MK63 None    L10V, I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, H69K, L89M  
MK64 MK64 None    L10I, I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, K70R, L89M  
MK65 MK65 None    L10V, G16E, E35D, M36I, N37D, R57K, H69K, L89M  
MK66 MK66 None    K14R, L19I, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, E65D, H69K, L89M  
MK67 MK67 None    T12S, I15V, M36I, N37K, R41N, L63P, H69K, V82I, I93L L19A 
MK68 MK68 None    T12S, I15V, L19I, K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, D60E, H69K, L89M, I93L  
MK69 MK69 None    K14R, R41K, D60E, L63Q, I64V, V77I  
MK72 MK72 None    T12S, I15V, L19I, M36I, N37S, R41K, L63P, H69K, L89M, I93L  
MK74 MK74 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
MK78 MK78 None    I13V, K14R, L19I, K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
MK80 MK80 None    L10V, I13V, K14R, E35D, M36I, R57K, I62V, L63T, H69K, T74S, L89M  
MK81 MK81 None    T12S, I15V, L19I, M36I, N37K, R41N, L63P, H69K, L89M, I93L  
MK82 MK82 None    I13V, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, I62V, E65D, H69K, L89M  
MK83 MK83 None    I13V, K14R, G16E, E35D, M36I, R41K, R57K, L63H, H69K, L89M  
MK84 MK84 None    T12S, I15V, L19I, M36I, N37S, R41K, H69K, L89M, I93L  
MK85 MK85 None    I15V, L19I, M36I, N37K, R41N, K45R, I66F, H69K, L89M, I93L  
MK86 MK86 None    L10V, I13V, K14S, G16E, K20R, E35D, M36I, N37D, R57K, D60E, Q61E, L63A, H69K, L89M  
MK87 MK87 None    L10I, T12I, I13V, G16E, E35D, M36I, R41K, R57K, L63S, H69K, L89M  
MK88 MK88 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, L63S, H69K, L89M  
MK89 MK89 None    L5P, T12P, I15V, M36I, R41K, L63P, H69K, L89M, I93L  
MK91 MK91 None    K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
MK93 MK93 None    I13V, K20I, M36I, R41K, C67S, H69K, V82I, L89M  
MK94 MK94 None    K20R, E35D, M36I, N37D, R57K, I62V, E65D, H69K, L89M  
MK95 MK95 None    T12V, I13V, G17E, E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, H69K, I72V, L89M  
MK96 MK96 None    T12S, I15V, L19V, M36I, N37K, R41N, L63V, H69K, I72V, L89M, I93L  
MK97 MK97 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
MK98 MK98 None    I13V, G16E, K20R, M36I, P39S, R41K, D60E, I62V, L63P, I72V  

Database

Resources

Team