Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Guimaraes (2015)
Title Assessing the HIV-1 epidemic in Brazilian drug users: a molecular epidemiology approach.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 132
NumPts 132
Subtype B, C, F, D

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 132 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
RDSBA056 RDSBA056 None None   K49R, D121H, K122E, I135T, I142V, I178L, R199K, E203K, R211K, E224K, E233K, D237N, V245K, E248K, G262E, I293V, E297A, D320N D185N, V261M 
RDSBA086 RDSBA086 None None   V8I, V35T, E40D, K49R, V90I, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, Q207A, R211K, F214L, V245Q, A272P, V276I, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T  
RDSBA198 RDSBA198 None None   V35I, S48T, V60I, D123E, I142V, K166R, R211K, E248A, A272P, K277R, K281R, P294T, E297R, S322T  
RDSBA210 RDSBA210 None None  E138A V35T, I135V, I142V, S162C, F171Y, K173T, Q174K, V189I, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, I309V  
RDSBA265 RDSBA265 None None   D123E, R211K, F214L, V245K, E248D, D250E, I293V, E297A, R307G  
RDSBA336 RDSBA336 None None   I135T, D177N, K277R  
RDSBA353 RDSBA353 None None   E6D, V35A, K49R, S68G, D123E, I135T, E169N, K173E, Q174K, I178L, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, L283I, T286A, E291D, I293V, E297A, R307K  
RDSBA392 RDSBA392 None None   I135T, I142M, K173R, Q174E, V189I, R211K, I293V, E297A  
RDSBA393 RDSBA393 None None   R83K, K122E, D123E, I135R, K238R, V245E, K281R, P294T, E297K  
RDSBA427 RDSBA427 None None   K64R, I135T, I142M, K173R, Q174E, R211K, I293V, E297A  
RDSBA450 RDSBA450 None None   K11R, D121H, K122E, I135T, I178L, T200I, F214L, V245I, A272P, E308K, V317M I293F, R307V 
RDSDF056 RDSDF056 None None   V35I, R83K, D123E, A272P, K281R  
RDSDF090 RDSDF090 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, A62T, I135V, K173A, P176Q, D177E, T200A, I202V, R211T, V245Q, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
RDSDF112 RDSDF112 None None  K103N P4T, K20R, V60I, K122E, I135T, T200I, F214L, A272P, I293V, E297V  
RDSDF159 RDSDF159 None None   V35I, S48T, S162C, E169D, K173R, D177E, T200A, R211K, V245I, K277R, T286A, V292I, I293V, P294T, E297K, A304E  
RDSDF180 RDSDF180 None None   V35I, K104R, D123E, I135T, K173R, D177E, T200I, F214L, Q278E, V292I, I293V, E297R R307W 
RDSDF206 RDSDF206 None None   R83K, D123E, I135V, S162C, I178L, I180V, R211K, A272P, K277R, K281R, T286A, I293V, E297K  
RDSDF221 RDSDF221 None None   V35T, K122Q, I135V, S162C, K173T, Q174R, D177E, I178L, T200A, E204K, Q207D, R211K, L234P, V245L, A272P, K275R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297V  
RDSDF275 RDSDF275 None None   A98S, I135T, K166R, K173T, A272P, T286A, I293V  
RDSDF290 RDSDF290 None None  K103N V35I, R83K, K122I, I178L, R211K, V245M, D250E, L260I, I293V, E297R L187W 
RDSDF309 RDSDF309 None None   E6D, K101R, I135T, S162C, D177E, E203D, Q207D, R211K, V245T, E248D, D250E, S251C, A272P, K277R, L283I, I293V, P294S, T296S, E297R  
RDSMG013 RDSMG013 None None   E6D, K20R, V35T, T39L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, V276I, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V, P294S, E297V, E308K, V317A, S322T  
RDSMG014 RDSMG014 None None  V179D K20R, V35T, T39I, E40D, V60I, K102Q, V118I, K122E, I135C, S162H, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L, A272P, K277R, K281R, T286A, E297K  
RDSMG018 RDSMG018 None None   K122E, I135T, V245M, A272S, V276I, I293V, E297K  
RDSMG071 RDSMG071 None None   K122E, I135T, E169D, I178M, R211K, V245M, D250E, A272P, I293V, K311R  
RDSMG108 RDSMG108 None None   P4S, V35I, V60I, A98S, D123E, I135L, G196K, R211K, D250E, K277R, L283I, A288S, E297K, L301I  
RDSMG110 RDSMG110 None None   K102Q, K122E, I135T, S162C, T200E, I202V, A272P, V276I, L283I, I293V  
RDSMG136 RDSMG136 None None   R83K, K104N, R211K  
RDSMG208 RDSMG208 None None   K122E, I135T, I178M, T200I, A272P, K277R  
RDSMG325 RDSMG325 None None   P4S, V35I, K122E, D123N, I135T, S162C, V245S, E248D, T286A, V292I, I293V, E297A  
RDSMG326 RDSMG326 None None   V35T, D121Y, K122E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, L210M, R211K, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V, E297A, K311R  
RDSMS013 RDSMS013 None None   A98S, K122E, I135T, K173E, Q174R, I202V, R211K, F214L, A272P, K281R, T286P, E297K  
RDSMS022 RDSMS022 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121Y, K122E, A158S, K173A, D177G, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
RDSMS074 RDSMS074 None None   K49R, I50V, I135V, T165I, E169D, D177E, I202V, R211K, E248D, A272P, K277R, P294S  
RDSMS106 RDSMS106 None None   T200A, Q207E, R211K, I293V  
RDSMS109 RDSMS109 None None K219Q K103N T7A, V35I, V60I, S68G, T69N, D121Y, K122E, D123E, Q174S, D177E, I180V, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245K, D250E, T286A, A288S, I293V, L295F  
RDSMS226 RDSMS226 None None   V35I, K49R, V60I, R83K, D123E, T200I, S251I, A272S, K281R, I293V  
RDSMS273 RDSMS273 None None   V8I, V35L, S48E, K49R, I142L, Y144F, Q207T, R211K, A272P, A288S, I293V, E297K, E300Q, V317A  
RDSPE010 RDSPE010 None None   V118I, D123E, D177G, Q207R, R211Q, F214L, A272P, K277R, K281R, E297K, K311R  
RDSPE028 RDSPE028 None None   V118I, D123E, I180V, T200A, R211K, F214L, A272P, K281R, T286A, E297K, K311R  
RDSPE091 RDSPE091 None None   V35T, V60I, D123E, I135L, S162C, E169D, K173T, Q174K, I178M, T200I, Q207D, R211K, V245Q, E248K, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297P, P313S  
RDSPE098 RDSPE098 None None   V60I, S68G, I135T, T200A, Q207E, V245M, K277R, Q278E, A288S, I293V, E297A  
RDSPE100 RDSPE100 None None   K64R, D177E, R211K, F214L, V245I, A272P, I293V, K311R  
RDSPE103 RDSPE103 None None   K49R, D123E, I135T, S162A, K173Q, D177E, F214L, V245Q, A272P, K281R, V292I, I293V, E297K  
RDSPE199 RDSPE199 None None   K20R, K49R, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174R, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V, E297T  
RDSPE207 RDSPE207 None None   V35T, T39R, E40D, V118I, D121H, K122E, D123E, I135T, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, I293V, P294T, E297K  
RDSPE258 RDSPE258 None None   K20R, K49R, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174R, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D, K277R, T286A, E291D, I293V, E297T  
RDSPE313 RDSPE313 None None   K122E, I135T, S162C, R211G, V245Q, I293V  
RDSPE367 RDSPE367 None None   D121Y, K122E, I135T, S162C, D177E, V245N, K277R, Q278E, T286A, I293V, E297A  
RDSPE452 RDSPE452 None None   P4S, E6D, D123E, I135T, S162A, D177E, I178V, G196E, I202M, Q207E, R211K, F214L, V245K, A272P, K277R, I293V, E297R, K311R  
RDSPR018 RDSPR018 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E300D, E312D  
RDSPR030 RDSPR030 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, V317A  
RDSPR048 RDSPR048 None None  E138A V35T, E36A, T39D, S48T, K102Q, K122E, D123S, K173A, T200A, Q207D, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, V317A  
RDSPR089 RDSPR089 None None  K103N I135R, S162C, E169D, T200A, I202V, V245I, E248D, A272P, K277R, L283I, I293V, P294S  
RDSPR175 RDSPR175 None None   R72K, D123E, I135T, S162C, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, I293V  
RDSPR238 RDSPR238 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D123E, I142V, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, K277R, E291D, V292I, I293V, V317A  
RDSPR276 RDSPR276 None None   I135T, K173N, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, P294T  
RDSPR282 RDSPR282 None None   R211K  
RDSRJ048 RDSRJ048 None None   V60I, D123E, K166R, D177E, S191F, G196E, R211K, V245M, A272S, L283I, P294Q, E312K  
RDSRJ093 RDSRJ093 None None   K173N, T200A, Q207E, A272P, T286A, I293V, E297R  
RDSRJ123 RDSRJ123 None None   K122E, P243S, V245Q, E248D, A272P, K277R, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, V317A  
RDSRJ148 RDSRJ148 None None   K122E, I135V, I178M, T200A, A272S, I293V  
RDSRJ205 RDSRJ205 None None   V35T, D121H, K122E, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, V317A, S322T  
RDSRJ218 RDSRJ218 None None   K20R, A98S, K122E, I135T, V245M, A272S, I293V  
RDSRJ237 RDSRJ237 None None   K64R, D121Y, K122E, D177E, I178M, V245E, A272S, I293V, E312A  
RDSRJ263 RDSRJ263 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, K166R, K173T, Q174K, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250S, A272P, K277R, E297K, V317A  
RDSRJ289 RDSRJ289 None None   E36Q, S105A, I142V, S162A, R211K, K277R, A288S, E297K  
RDSRJ301 RDSRJ301 None None   I135T, K173Q, D177E, T200A, F214L, V245T, K249R, D250T, A272P, K277R, I293V, E297A  
RDSRJ378 RDSRJ378 None None   I135V, S162C, D177E, K238R, P247L, E248D, I257V, A272P, K277R, T286A, I293V, P294T, E297A  
RDSRJ407 RDSRJ407 None None   E169D, D177E, R211K, F214L, P243S, V245K, A272P, K277R, L283I, I293V, E297I, V317A  
RDSRJ411 RDSRJ411 None None   S48T, I50V, V118I, K122E, I135T, S162C, T165I, D177E, G196E, R211K, F214L, A272P, I293V, P294Q  
RDSRJ422 RDSRJ422 None None   K49R, I135T, T165I, I178M, R211K, A272P, K277R, I293V, E297T  
RDSRJ428 RDSRJ428 None None   V35T, K49R, K122E, I135T, S162C, F171Y, K173A, Q174K, P176S, T200A, Q207A, R211S, V245Q, E248D, A272P, E291D, I293V, E297A  
RDSRJ432 RDSRJ432 None None   V35T, D123E, T139K, S162C, T165I, R211K, V245M, K281R, R284K, A288S, I293V, E297A, V314L, Y319F  
RDSRJ454 RDSRJ454 None None   V35T, E40D, K49R, D123E, I135V, S162C, E169A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211Q, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T  
RDSRJ460 RDSRJ460 None None   K64R, K103E, I135T, K173E, T200E, I202V, R211K, T286A, E297K  
RDSRJ494 RDSRJ494 None None   A158S, S162C, R211K, K249R, P294Q D185G 
RDSRJ495 RDSRJ495 None None   V35T, T39L, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200R, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T  
RDSRJ534 RDSRJ534 None None   K122E, I135T, Q197K, T200E, I202V, F214L, K275Q, I293V, E297K  
RDSRJ548 RDSRJ548 None None   G45E, V60I, I135T, I178M, T200A, I202V, R211K, A272P, T286A, I293V  
RDSRJ609 RDSRJ609 None None   R83K, K122E, S162C, T200A, V245L, A272P, T286A, E297K  
RDSRJ675 RDSRJ675 None None   K122E, I135T, T200A, Q207E, F214L, V245E, D250E, K275R, Q278E, L283I, I293V  
RDSRJ679 RDSRJ679 None None   K20R, K32R, K102Q, K122E, S162A, V245K, A272S, A288S, I293V  
RDSSC002 RDSSC002 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I135K, K173A, D177E, E194D, T200A, E204D, Q207A, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
RDSSC003 RDSSC003 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122P, I135T, A158S, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, V292I, I293V, E297A  
RDSSC081 RDSSC081 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, I135V, I142M, A158S, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q, S251N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, S322L  
RDSSC086 RDSSC086 None None   R83K, D123E, R211K, V245K, D250E, A272P, T296S, E297K, V317A  
RDSSC100 RDSSC100 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, K173A, D177E, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
RDSSC105 RDSSC105 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123N, G141E, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294S, E297A, V317A  
RDSSC113 RDSSC113 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, A272P, K277R, A288T, E291D, V292I, I293V  
RDSSC114 RDSSC114 None None   K32R, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, A158S, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, E297A  
RDSSC141 RDSSC141 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K173A, D177E, I195L, Q197K, T200A, Q207A, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
RDSSC146 RDSSC146 None None   V35T, T39D, K43R, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, V317A  
RDSSC150 RDSSC150 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123N, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, V317A  
RDSSC211 RDSSC211 None None  V106M V60I, K122E, I135T, I142V, D177E, T200A, A272P, I293V, R307G  
RDSSC299 RDSSC299 None None   V35T, T39A, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
RDSSC301 RDSSC301 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135R, K173A, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, P294T, V317A  
RDSSC306 RDSSC306 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, I135T, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
RDSSC312 RDSSC312 None None   V35T, T39K, S48T, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
RDSSC317 RDSSC317 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V90I, I135T, S162Y, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  

Database

Resources

Team