Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Laga (2015)
Title HIV type 1 subtype A1 dominates in Armenia.
Citation Curr HIV Res
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 77
NumPts 77
Subtype A, B, A + CRF02_AG, CRF02_AG

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
AM003 AM003 None None   K11T, K20R, V35T, E36D, T39K, E53D, W88C, D123N, S162Y, K173L, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM004 AM004 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K64R, V90I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211S, I244V, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM005 AM005 None None   K11T, V35T, E36D, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, D250E, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P321Q, S322T, I326V  
AM007 AM007 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, K49R, I50V, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, V245K, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, I326V  
AM008 AM008 None None   E6A, K11T, V35T, E36D, T39D, K122E, D123S, I135T, I142T, K166R, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286V, E291D, V292I, I293V, P294T, K311R, I326V  
AM009 AM009 None None   P4S, K11T, V35T, E36D, T39D, K43Q, K122E, D123S, I142T, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286V, E291D, V292I, I293V, P294T, K311R, I326V  
AM012 AM012 None None A62V  K11T, V35T, T39N, K82R, K122E, D123N, A158S, K173S, Q174K, D177G, G196E, T200A, Q207A, R211S, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM013 AM013 None None A62V  P4K, K11T, V35I, E36D, T39E, K82R, K122E, D123N, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D, Q343R  
AM014 AM014 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, K122E, D123N, A158S, K173L, Q174K, D177E, T200I, E203D, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM015 AM015 None None A62V  E6G, K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123N, I135T, S162C, K173E, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, I329V, G335D  
AM016 AM016 None None   K11T, V35T, T39D, K122E, D123N, I135T, S162C, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM017 AM017 None None   K11T, V35I, T39N, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E302K, I326V, G335D  
AM018 AM018 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, K101R, D121H, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, I180V, Q207A, R211S, V245T, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM019 AM019 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, D121H, K122E, D123S, I142V, A158S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM021 AM021 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V118I, D123N, A158S, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM023 AM023 Unknown NVP, Unknown   V35T, T39N, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248H, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM025 AM025 None None  E138A S3T, V35T, E36D, T39D, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, Q207A, R211S, A272P, T286A, E291D, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM026 AM026 None None   S3T, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, G335D  
AM029 AM029 None None   V35I, K49R, S68G, V90I, K104N, K122Q, S162C, Q197E, K277R, T286A, E297Q, I326V  
AM030 AM030 None None   K11T, K20R, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I142T, A158S, K166R, K173L, Q174K, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
AM031 AM031 None None A62V E138A K11T, V35I, E36D, T39K, V60I, K122E, D123N, K173L, Q174K, D177G, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM032 AM032 None None   P4S, K11T, V35T, E36D, T39N, K101R, D121Y, K122E, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, E328D, G335D S3K, D17T 
AM033 AM033 None None   K11T, V35I, E36D, K122E, D123N, A158S, K173L, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211S, V245M, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM034 AM034 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, W88S, V118I, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM035 AM035 None None   S3R, K11T, V35T, E36D, T39K, S68G, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, G335D  
AM036 AM036 None None   K11T, V35T, E36D, T39M, K122E, D123N, A158S, K173S, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245M, E248D, D250E, A272P, T286A, A288G, E291D, V292I, I293V, P294T, D324E, I326V, G335D, Q343R  
AM047 AM047 None None   K11T, V35T, E36D, K122E, D123S, I142F, Q145H Q23L, W24V, Y146I 
AM048 AM048 AZT, 3TC NVP A62V E138K K11T, K32N, V35I, E36D, T39K, V90I, K101R, K122E, D123S, A158S, K166R, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S Y188D, V189G, L205V, L209P 
AM052 AM052 3TC, D4T EFV  K103N K11T, K20R, V35T, T39L, K122E, D123N  
AM059 AM059 None None   K11T, V35I, E53D, K101R, K122Q, D177E, Q207E  
AM062 AM062 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, V118I, D121H, K122E, D123N, A158S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, F214L  
AM064 AM064 AZT, 3TC NVP A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, D123N, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
AM074 AM074 None None A62V  K11T, V35T, E36D, T39K, K43R, D123N, A158S, K173S, Q174K, D177E, I178L, V179I, Q207A, R211S H208Q 
AM075 AM075 None None   K11T, E28A, V35T, T39M, V60I, D121H, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
AM077 AM077 AZT, 3TC NVP A62V  K11T, V35M, T39K, K122E, D123N, A158S, K173L, Q174K R172T, D177Y 
AM078 AM078 None None   K11T, T27S, V35T, T39M, K122E, D123S, A158S, S162C, E169D, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
AM079 AM079 None None   V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135T, A158S, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
AM080 AM080 None None   K11KT, V35T, E36D, T39M, K49R, I50V, K122E, D123S, I142T, A158S, K173A, Q174K, Q207A, R211S  
AM081 AM081 None None   V35T, E36D, T39K, V60I, V118I, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L  
AM084 AM084 AZT, 3TC NVP   K11T, V35T, E36D, T39K, K43Q, K122E, D123S, A158S, K173V, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
AM085 AM085 None None   E6D, V35T, E36D, T39Q, K122E, D123S, K173L, Q174K  
AM086 AM086 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L  
AM087 AM087 None None  E138A V35T, E36D, T39M, K49R, K122E, D123T, I142V, A158S, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
AM092 AM092 None None   K11T, V35T, E36D, T39M, D121H, K122E, D123S  
AM098 AM098 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, D121H, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, E194K, T200I, R206K, Q207A, R211S  
AM099 AM099 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39E, D123N  
AM100 AM100 None None A62V  P14S, V35I, E36D, T39K, K122E, D123N  
ARM037 ARM037 None None  E138A V35T, E36D, T39N, V60I, K122E, D123N, K173S, Q174K, N175Y, Q207A, R211S  
ARM038 ARM038 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V90I, K122E, D123S, A158S, S162C, K173S, Q174N, D177E, Q207A, R211S  
ARM039 ARM039 None None   K11T, V35T, E36D, T39R, K122E, D123G, A158S, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
ARM040 ARM040 None None A62V  K11T, V21I, V35T, E36D, T39K, K49R, V90I, K122E, D123S, I135T, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
ARM041 ARM041 None None   K11T, V35I, E36D, T39N, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
ARM042 ARM042 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K101R, K122E, D123N, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
ARM043 ARM043 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, D121H, K122E, D123S, I142V, K166R, K173Q, D177E, T200A, Q207E  
ARM044 ARM044 None None   K11T, V35I, E36D, T39K, S68G, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L  
ARM045 ARM045 None None   K11T, V35I, E36D, T39N, E53D, K64R, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
ARM046 ARM046 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, D121H, K122E, S162C, K173S, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207A, D237E  
ARM049 ARM049 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, V60I, K122E, D123S, I135M, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
ARM050 ARM050 None None   K11T, V35T, E36D, K101R, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E E194*Q 
ARM051 ARM051 None None   E6EK, K20KR, V35T, E36D, T39M, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E  
ARM053 ARM053 None None   K11T, V21I, V35T, E36D, T39KN, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E  
ARM054 ARM054 3TC, D4T EFV D67N, K70R K101E, G190S K11T, V35T, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, M184L, Q207A, R211S  
ARM055 ARM055 None None   K11A, D17G, V35T, E36D, T39E, K122E, D123S  
ARM056 ARM056 None None   K20R, V60I, K122P, K166R, D177E, I178IM, E194EQ, I195L, R211K  
ARM057 ARM057 None None   E6ED, K11T, V35T, T39E, A98S, K101R, K122E, D123NS, I135T, K166KR, K173IM, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
ARM058 ARM058 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, E40G, K43E, K49R, K122E, D123N, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
ARM060 ARM060 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K43KE, K49R, V90I, K102Q, K122E, D123N, G141R, A158S, K166R  
ARM061 ARM061 None None   V35T, E36D, T39M, K122E, D123S, I135T  
ARM063 ARM063 None None   V35T, E36D, T39L, Q145QH, A158P T131S 
ARM065 ARM065 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, D110DN, V118I, K122E, D123S T131S 
ARM066 ARM066 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135T, A158AT, S162C M41K, L168F 
ARM068 ARM068 AZT, 3TC NVP   K20R, V35I, V60I, K122P, I135K, Q145H M41K 
ARM089 ARM089 None None K219Q  K11T, V35T, E36D, T39N, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
ARM091 ARM091 None None   V8VI, K11T, V35T, E36D, T39E, K49R, I50V, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
ARM094 ARM094 AZT, 3TC NVP   K11T, V35T, T39N, D123S, K173V, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
ARM095 ARM095 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K43E, V90I, K122E, D123S  
ARM102 ARM102 AZT, 3TC, ABC, DDI EFV A62V, D67T, K70R, M184V K101E, E138K, G190S K11T, V35M, T39E, T69S, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211S K49T 

Database

Resources

Team