Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Seu (2015)
Title Characterization of HIV drug resistance mutations among patients failing first-line antiretroviral therapy from a tertiary referral center in Lusaka, Zambia.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 68
NumPts 68
Subtype C, CRF49_cpx

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
ZM.HIVDRM.1 ZM.HIVDRM.1 3TC, D4T NVP D67N, T69D, K70R, V75M, M184V, K219Q K103N K20R, V35M, T39E, K49R, V60I, V90VI, D121Y, K122E, D123DE, S134R, I135V, K173A, T200A, E203EK, Q207E, R211K, L228H, K238Q, V245Q, E248N, A272P, E291D, V292VI, I293V  
ZM.HIVDRM.10 ZM.HIVDRM.10 ABC, 3TC NVP A62AV, K65R, Y115F, M184V V106M, Y181C, H221Y V35T, T39A, S48T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, T200A, E203D, R211K, V245Q, E248D, D250E, A272P, L283I, R284K, E291D, V292I, I293V, V314VA  
ZM.HIVDRM.11 ZM.HIVDRM.11 TDF, FTC EFV K65R, M184V L100I, K103N V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, T139A, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L, P243T, V245Q, S251C, A272P  
ZM.HIVDRM.12 ZM.HIVDRM.12 TDF, FTC NVP A62V, K65KR, M184V A98G, Y181C, G190A V35T, E36EA, T39E, S48T, K101Q, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, L228LR, V245Q, E248D, D250E, A272P, I274IV, K275KR, Q278HN, K281KR, E291D, V292I, I293V, K311R  
ZM.HIVDRM.13 ZM.HIVDRM.13 TDF, 3TC EFV D67N, K70R, M184V, K219E K103N, Y188L P4T, V35T, T39E, S48ST, V60VI, V90VI, S105T, K122E, D123S, I135V, T139A, S162Y, K173T, D177EG, T200A, I202V, Q207E, R211K, L228LM, V245Q, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.14 ZM.HIVDRM.14 TDF, FTC EFV A62AV, K65R, Y115F, M184V K101E, V106M, Y181C, G190GA E28EK, V35T, T39D, S48T, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, E203EK, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
ZM.HIVDRM.15 ZM.HIVDRM.15 TDF, FTC EFV A62V, K65R, M184V V108I, Y181C V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, L228Q D123P 
ZM.HIVDRM.16 ZM.HIVDRM.16 3TC, D4T NVP A62V, D67N, M184V V106A, E138A, F227L T27TS, V35T, T39E, S48T, K101R, K122E, D123Q, K166R, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207K, R211Q, L228F, V245E, D250E, S251N, A272P, K277R, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.17 ZM.HIVDRM.17 AZT, 3TC NVP M41L, D67T, K70R, T215F, K219E A98G, K103H, Y181C, G190A V35M, T39A, K66R, V75L, V118I, K122E, D123N, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, D218E, L228R  
ZM.HIVDRM.18 ZM.HIVDRM.18 AZT, 3TC NVP M184V K101E, G190A E28K, V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K  
ZM.HIVDRM.19 ZM.HIVDRM.19 TDF, FTC NVP K65R, K70T, M184V G190Q, H221Y P4S, E6D, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, S68G, I94L, K122E, D123G, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178L, V179T, V189I, T200A, Q207E, R211RK  
ZM.HIVDRM.2 ZM.HIVDRM.2 3TC, D4T NVP A62V, K65R, K70T, M184V V106M, V108I, Y181C, H221Y V35T, E36A, T39E, S48T, S68N, K122E, D123S, T131TP, T139I, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.20 ZM.HIVDRM.20 3TC, D4T NVP M184V K103N, V108I V35T, T39E, S48T, D123E, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K  
ZM.HIVDRM.21 ZM.HIVDRM.21 AZT, 3TC NVP M184V, T215Y K103N, G190A V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, T139K, I142V, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, L210S, R211K, V245Q, A272P, K281R, T286A, E291D, V292I  
ZM.HIVDRM.22 ZM.HIVDRM.22 3TC, D4T EFV  K103KN V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, Q174R, T200A, I202V, Q207E, R211K  
ZM.HIVDRM.23 ZM.HIVDRM.23 AZT, 3TC NVP  E138A K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211V, F214L  
ZM.HIVDRM.24 ZM.HIVDRM.24 3TC, D4T NVP M184V Y181C K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135R, T139TI, K173T, T200A, Q207E, R211K, F214FL, V245Q, E248D, A272P, K277R  
ZM.HIVDRM.25 ZM.HIVDRM.25 AZT, 3TC NVP  K103N V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, Q174K, T200A, Q207N, R211K, V245M  
ZM.HIVDRM.26 ZM.HIVDRM.26 3TC, D4T NVP A62V, K65R, V75I, F77L, F116Y, Q151M, M184V V106VM, Y188L, G190A V35T, T39E, S68G, T69I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, G196MT, T200A, I202V, E204Q, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
ZM.HIVDRM.27 ZM.HIVDRM.27 3TC, D4T NVP M184V, T215F V108I, Y181C, H221Y V35T, T39D, S48T, S68G, A98S, K122E, D123N, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248D, A272PS, K277R, Q278X, T286A, E291D, V292VI, I293V L279MV 
ZM.HIVDRM.28 ZM.HIVDRM.28 TDF, FTC NVP M41L, M184V, T215Y A98G, K103N, V108I K20R, V35IT, T39A, E40D, S48T, V75L, K122E, D123N, I135L, K173A, Q174K, D177E, I178M, I195L, G196E, T200A, Q207E, R211K  
ZM.HIVDRM.29 ZM.HIVDRM.29 3TC, D4T NVP K70R, M184V, K219E V108I, Y181C E6D, K32R, V35T, E36A, T39D, S48T, I142V, K166R, K173A, Q174QR, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, L228R, V245K, D250E  
ZM.HIVDRM.3 ZM.HIVDRM.3 3TC, D4T NVP  E138A V35T, E36EA, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I142V, K173KT, Q174QK, D177E, I178IL, Q197QP, T200E, Q207A, R211K  
ZM.HIVDRM.30 ZM.HIVDRM.30 TDF, FTC NVP A62V, K65R, M184V V108I, Y181C V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K173A, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
ZM.HIVDRM.31 ZM.HIVDRM.31 AZT, 3TC NVP D67N, M184V, T215Y K101E, V106M, E138A, G190A K20R, V35T, T39E, S48T, W88C, K122E, D123S, S162C, K173A, I178L, G196K, T200A, E203D, E204D, Q207D, R211K, V245Q, D250E, A272AP, K277R, T286A, E291D, I293V  
ZM.HIVDRM.32 ZM.HIVDRM.32 AZT, 3TC NVP K70KR, M184V K103N, H221HY K20R, V35T, K49R, V60VI, K122A, D123S, I135T, S162C, I178L, T200A, Q207E, R211K, L228LR, P243T, V245Q, D250E, A272P, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.33 ZM.HIVDRM.33 TDF, FTC NVP D67N, K70R, V75M, M184V, K219Q V106M, E138A, V179E, H221Y, F227L K20R, V35T, T39E, S48T, V60I, K64Y, D121C, K122E, K173T, Q174K, T200A, I202V, E203K, Q207E, R211K, F214L, L228H, D250E, A272P, K277R, T286TA, E291D, V292I  
ZM.HIVDRM.34 ZM.HIVDRM.34 TDF, FTC EFV K65R, Y115F, M184V Y181C, G190S E6K, V8I, E28X, V35T, T39E, S48T, K101N, K122E, K173T, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, R211Q, V245Q  
ZM.HIVDRM.35 ZM.HIVDRM.35 TDF, 3TC NVP M184V Y181V, H221Y E6D, V8I, V35T, T39E, S48T, W88C, K122E, D123N, I135T, K173T, D177E, T200A, E203EK, Q207E, V245E, E248D, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.36 ZM.HIVDRM.36 AZT, 3TC NVP M41L, K65R, L74I, M184V G190A K20R, V35K, T39E, E40D, S48T, V60I, A98S, K122E, D123N, K173AE, Q174QK, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245E, S251D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, G335D K101G 
ZM.HIVDRM.37 ZM.HIVDRM.37 AZT, 3TC NVP M184V K103N E28K, E29EK, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, I135T, K173A, D177E, V179I, Q197K, T200A, E203EQ, Q207E, D218E  
ZM.HIVDRM.38 ZM.HIVDRM.38 TDF, FTC EFV A62AV, K65R, D67N, L74I, M184V, K219E G190E K20R, K32E, V35T, E36A, T39K, K102R, K122E, D123N, I135R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RK, F214L, V245E, A272P, K275R, E291D, V292I, I293V E28V 
ZM.HIVDRM.39 ZM.HIVDRM.39 3TC, D4T NVP K65KR, M184V, T215FI E138A K20R, V35T, E36EA, T39D, K49Q, S68G, K122E, D123S, S134N, I135V, T139V, I142T, A158S, S162A, T165K, E169D, K173KR, Q174K, N175Y, T200A, Q207E, R211K, F214L, Y232H, V245Q, E248D, A272P, R284K, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.4 ZM.HIVDRM.4 AZT, 3TC EFV   V35T, E36A, T39D, K122E, D123N, I142V, K173A, Q174K, D177E, I178IL, G196E, T200A, E204Q, Q207D, R211K, W229G  
ZM.HIVDRM.40 ZM.HIVDRM.40 AZT, 3TC NVP M184V, T215F K103N, Y181C D17E, V35T, E36A, T39D, S68G, K122E, D123S, I135T, K166R, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K  
ZM.HIVDRM.41 ZM.HIVDRM.41 AZT, 3TC NVP M184V K101E, G190A P4S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, A98S, K122E, D123S, K173A, Q174R, D177E, I178IL, G196M, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245EKQ, D250E, A272P, T286V, E291D, I293V  
ZM.HIVDRM.42 ZM.HIVDRM.42 3TC, D4T NVP M184V V108I, Y181C V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, E53D, T69N, K122E, D123G, I135R, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
ZM.HIVDRM.43 ZM.HIVDRM.43 TDF, FTC NVP A62AV, K65R, M184V A98G, K101E, V108VI, Y181C K20KR, E28EK, V35T, E36A, T39E, S48T, S68N, K122E, K173I, Q174K, D177E, T200A, I202IV, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, V317A G152GR 
ZM.HIVDRM.44 ZM.HIVDRM.44 TDF, 3TC NVP M184V V106M, G190A V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, D177E, T200A, E203EK, Q207T, R211K, F214L, D237N, V245Q, D250E  
ZM.HIVDRM.45 ZM.HIVDRM.45 TDF, 3TC NVP K65R, V75M, M184V K103N, Y181C D17E, K20KR, V35T, T39E, I135M, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, K277R, T286A, I293V, P294Q  
ZM.HIVDRM.46 ZM.HIVDRM.46 TDF, FTC NVP A62V, K65R, M184V Y181C, G190A V8VI, V35T, T39N, K46KQ, S48T, S68N, V90I, K122E, K173I, Q174K, D177DE, T200A, I202IV, R211Q, P243T, V245E, A272P, E291D, V292I, I293V, E297A  
ZM.HIVDRM.47 ZM.HIVDRM.47 3TC, D4T NVP M184V K103N, Y181C T27S, V35T, T39E, S48T, K122P, I135T, I142IV, E169A, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207D, R211K, L228H, V245Q, E248D, A272P, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.48 ZM.HIVDRM.48 3TC, D4T NVP M184V, T215Y Y181C, G190A V35T, T39D, S48T, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245L  
ZM.HIVDRM.49 ZM.HIVDRM.49 AZT, 3TC NVP A62AV, K65R, Y115F, M184V E138G, V179D, Y181I, Y188L K20KR, V35T, T39E, S48T, K103R, K122E, D123N, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245K  
ZM.HIVDRM.5 ZM.HIVDRM.5 3TC, D4T EFV D67G, K70R, M184V, T215I, K219E E138A, G190E K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, T69N, I94IL, K102R, K122E, D123G, I135V, T165TI, K173T, Q174R, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, L295M, E297K, D324E, Q334HN, G335D  
ZM.HIVDRM.50 ZM.HIVDRM.50 TDF, 3TC NVP A62AV, K65R, Y115F, M184V E138G, V179D, Y181I, Y188L K20KR, V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, T131TP, K173T, Q174K, T200A, E203ED, Q207E, R211K, V245K, I257L, K281R, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.51 ZM.HIVDRM.51 AZT, 3TC NVP M184V K103N E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, I135T, K173A, D177E, V179I, Q197K, T200A, E203EQ, Q207E, D218E, P243PS, V245Q, D250E, S251D, A272P, I274V, T286A, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.52 ZM.HIVDRM.52 AZT, 3TC NVP M41L, L74LI, V75I, M184V, L210W, T215Y K103N, V108VI V8I, V35K, T39D, E44D, V60I, A98S, K122E, D123S, I132L, I135T, I142V, K173T, Q174K, N175Y, D177E, T200A, K201I, Q207E, R211RK, L228R  
ZM.HIVDRM.53 ZM.HIVDRM.53 TDF, FTC EFV K70N, M184V, K219R K103N, V108I, E138A, P225H, K238N K11Q, V35T, T39D, S48T, V75L, V118I, K122V, D123N, I142V, K173A, D177E, I178L, V189I, T200A, K201R, E204K, Q207E, L210LS, R211K, F214L, P243T, V245Q, A272P, K275R, Q278N, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.54 ZM.HIVDRM.54 AZT, 3TC NVP M41L, M184V, T215Y A98G, Y181C, H221Y V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, D123E, S162N, K173T, D177E, I178L, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A, E291D, I293V  
ZM.HIVDRM.55 ZM.HIVDRM.55 AZT, 3TC NVP M41L, D67N, L74I, M184V, L210W, T215Y A98G, K103N K20R, E28GR, K32KE, V35T, T39E, E44D, S48T, V60I, V111I, V118VI, D121C, K122E, D123E, I132L, I142T, K173A, D177E, G196GE, T200A, E203K, Q207E, H208Y, R211K, K223E, V245Q, E248D, D250E, S251D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.56 ZM.HIVDRM.56 3TC, D4T EFV M184V K103N V8VI, V35T, E36A, T39DE, D123DN, T131TP, I135M, K173T, Q174K, N175NY, T200A, K201KR, Q207E, R211K, L228Q  
ZM.HIVDRM.57 ZM.HIVDRM.57 AZT, 3TC NVP M41L, M184V, T215F K103S, G190A K20R, V35T, E36A, T39E, E44D, I142IT, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, E203D, Q207D, H208Y, R211K, V245Q, A272P, G273GR, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.58 ZM.HIVDRM.58 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, K219Q K103N, E138Q K20R, V35T, T39E, S48T, K49R, V60I, K122E, D123S, E169K, K173A, D177E, G196E, Q197K, T200A, Q207N, R211K, V245Q, A272P, V292I, I293V, P294T  
ZM.HIVDRM.59 ZM.HIVDRM.59 3TC, D4T NVP D67N, K70R, M184V, T215V, K219E Y181C T27S, V35T, T39E, V60I, V90I, K122E, D123S, I135R, T139R, S162C, K173A, D177E, V179VI, T200A, I202V, Q207E, V245Q, D250E, A272P  
ZM.HIVDRM.6 ZM.HIVDRM.6 3TC, D4T NVP T69S_SA, L74I, M184V, T215C V108I, E138A, Y181C, G190A V8I, I31L, V35T, T39E, K101Q, K102R, K122E, D123S, K173T, Q174K, G196GE, T200A, Q207E, L210X, R211A, L228HR, V245Q, A272P, Q278H, K281R, E291D, V292I, I293V, D324E, Q334N, G335D  
ZM.HIVDRM.60 ZM.HIVDRM.60 AZT, 3TC NVP M184V A98G, K103N P4PL, V35T, E36A, T39E, E40D, K49KR, K122E, D123N, I135L, S162SN, K173A, D177E, I178V, G196GE, T200A, K201M, E204K, Q207D, P243PA, V245KQ, E248D, A272P, K277R, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.61 ZM.HIVDRM.61 3TC, D4T NVP M184V K101E, G190A V35T, E36A, T39E, E40D, K49R, K122E, D123G, K173R, Q174R, T200A, E203EK, Q207E, R211K, V241I, V245Q, A272Q, K277R, T286A  
ZM.HIVDRM.62 ZM.HIVDRM.62 AZT, 3TC NVP A62V, M184V K101E, E138A, G190A, H221Y V35K, T39D, S48T, W88S, K103R, I135T, K173A, V179I, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, D250E, S251A, A272P, K277R, T286A P59PS 
ZM.HIVDRM.63 ZM.HIVDRM.63 AZT, 3TC NVP A62AV, K65R, Y115F, M184V E138G, V179D, Y181I, Y188L K20KR, V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, E169ED, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245K, I257IL, K281R, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.64 ZM.HIVDRM.64 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, K219Q A98G, K101E, G190A, P225H E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, E40D, V60I, K103R, K122E, D123S, I135T, K173A, T200A, Q207E, R211K, F214L, K238R  
ZM.HIVDRM.65 ZM.HIVDRM.65 AZT, 3TC NVP M184V V106A, F227L E6K, V35T, T39E, S48T, A98S, F116FS, K122E, D123S, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245K, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.66 ZM.HIVDRM.66 AZT, 3TC NVP M184V V106M K11KT, V21VI, V35M, T39E, S48T, T58S, V60I, K64R, D121H, K122E, D123S, I142IV, K173T, Q174R, D177E, I178L, Y188W, T200A, Q207QK, R211K, F214FL, A272P, K275R, T286A, E291D, V292I, I293V D86H 
ZM.HIVDRM.67 ZM.HIVDRM.67 AZT, 3TC NVP M184V A98G, V108I, Y181C E6D, K20R, V35T, T39E, S48T, T69N, K101Q, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A, I202V, E204K, Q207D, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.68 ZM.HIVDRM.68 AZT, 3TC NVP K65R K103N, Y181C V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, L228H  
ZM.HIVDRM.7 ZM.HIVDRM.7 3TC, D4T NVP K65R, M184V, K219E V106I, V179D, Y181C, G190A V35T, T39E, E40Q, S48T, V60I, S68G, T69I, K101N, K103R, K122E, D123N, I135R, T165I, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, L228LH, V245Q, E248N, K281R, L283I, T286A, A288S, E291D, V292I, I293V  
ZM.HIVDRM.8 ZM.HIVDRM.8 3TC, D4T NVP T215TI V106M, G190A V35IT, T39A, K122E, D123S, Q151QR, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178F, T200A, Q207E, R211K, W212WG  
ZM.HIVDRM.9 ZM.HIVDRM.9 TDF, FTC EFV M184V V106M, G190A V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, S134C, K173A, D177E, T200A, Q207T, R211K, F214L