Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Loubet (2014)
Title Prevalence of HIV-1 transmitted drug resistance in Liberia.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 102
NumPts 102
Subtype CRF02_AG, A, G, C, CRF06_cpx, CRF09_cpx, B, D

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 102 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
LILX011279 LILX011279 None None   K20R, V35K, T39TA, S68G, D86E, V90I, K122E, D123N, I159IV, S162A, Q174E, D177E, T200A, Q207N, V245Q, E248D  
LILX011280 LILX011280 None None   V35T, T39TA, E40D, V60VI, S68G, D123E, S162A, S163T, T165TI, Q174E, D177DE, T200A, E204D, Q207KNT, R211K, V245Q, E248DN  
LILX011282 LILX011282 None None   K20R, V35T, T39M, V60I, A98S, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, I178L, G196E, T200A, Q207N, V245Q, E248D, D250E  
LILX011283 LILX011283 None None   P1S, V35T, K102KQ, D121DY, K122X, A158S, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207DE, R211K, V245Q  
LILX011286 LILX011286 None None   V35T, T39L, V60I, K122E, D123N, I135T, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, I195L, T200A, Q207E, V245K, E248D, D250E  
LILX011287 LILX011287 None None   P1S, V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, D121Y, K122E, T139K, I142V, S162HY, K173S, D177E, V179I, G196GE, Q207N, R211K, V245D, E248D, D250E  
LILX011314 LILX011314 None None   V21I, V35T, E36D, V60I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174R, T200A, Q207E, P243S, V245Q  
LILX011315 LILX011315 None None   V21I, V35T, V60I, K64KR, W88C, D121Y, K122E, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207D, R211K, P243Q, V245Q, E248D, D250E  
LILX011316 LILX011316 None None  K103N, E138Q K11Q, V35T, T39TA, V60I, K122E, D123N, I135V, I142T, S162A, K173T, Q174S, T200A, Q207G, R211K, V245T  
LILX011317 LILX011317 None None   V35T, E36D, T39TIM, V90I, D123E, I135V, S162A, Q174E, D177E, I178V, T200AS, Q207X, R211RK, V245Q, E248D  
LILX011318 LILX011318 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, Q145C, S162A, E169Q, K173L, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, V245Q  
LILX011319 LILX011319 None None   V35T, E36D, T39K, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173AT, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245E, E248D  
LILX011320 LILX011320 None None   V21I, V35T, T39K, K43E, D123E, S162A, K173R, Q174K, D177E, Q197E, T200A, I202IV, Q207N, V245EK  
LILX011321 LILX011321 None None   V35T, V60I, D123DE, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178MV, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
LILX011322 LILX011322 None None   V35T, E36D, K122P, I135V, S162A, K173T, Q174K, P176PS, D177E, I178V, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214FL, V245Q, E248D  
LILX011323 LILX011323 None None   K20R, V35T, T39X, E40D, V60I, T69TI, K122E, I135IV, K166R, F171Y, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202IV, Q207E, R211RS, F214L, V245L, E248D D121CR 
LILX011324 LILX011324 None None   V35T, E40D, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, I178V, T200A, Q207A, R211K, V245X, E248N  
LILX011325 LILX011325 None None   V35T, K102E, I135V, I142V, S162A, F171Y, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207AV, R211K, V245Q, E248D  
LILX011326 LILX011326 None None   V35T, E36D, K122E, D123N, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211K, P243A, V245Q  
LILX011327 LILX011327 None None   V35T, K122E, A158S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207E, R211K, V245K  
LILX011328 LILX011328 None None   V35T, T39TA, V60I, I135L, S162A, K166R, K173A, Q174N, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
LILX011329 LILX011329 None None   K11T, V35T, D121H, K122E, I135T, I142V, S162C, K173A, Q174K, D177E, V179I, G196E, Q207A, V245Q  
LILX011330 LILX011330 None None   M16MT, V21VI, V35T, V60VI, K122E, D123N, I135T, K173AT, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207X, R211K, V245Q, E248N, D250E  
LILX011331 LILX011331 None None   V35T, E36D, V60I, I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, V245K, E248D  
LILX011332 LILX011332 None None   V21VI, V35T, E36ED, E40ED, D121DY, K122P, D123E, S162A, K173KT, Q174E, D177E, I178ILM, T200A, Q207E, V245E, E248D L209LP 
LILX011333 LILX011333 None None   E36D, W88C, K122E, D123E, I135V, A158AS, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245E  
LILX011334 LILX011334 None None   E6R, V35T, E36A, T39D, S48T, K104A, K122E, D123E, K166T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, D250E  
LILX011335 LILX011335 None None   K11RT, V35T, V60VI, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196GE, T200A, Q207A, R211K, D237N, V245Q, E248D  
LILX011337 LILX011337 None None   V35T, E36D, T39K, V60I, V111I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207D, R211K, F214L, P243T, V245Q  
LILX011363 LILX011363 None None   V35T, K122P, D123DE, E169ED, K173T, Q174K, D177E, I180V, T200A, Q207AD, R211K, E248NS  
LILX011364 LILX011364 None None   V21I, K32R, V35T, T39L, V60I, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, K238R, V245Q, E248D  
LILX011365 LILX011365 None None   E28G, V35I, S68G, D123DN, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, V245Q, D250E  
LILX011366 LILX011366 None None   V35T, T39TI, V60I, D121H, K122E, I135T, D177E, E194D, G196GE, T200TA, Q207E, V245VIM, E248D, D250DE  
LILX011367 LILX011367 None None   V35T, T39N, E40D, K49R, V60I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, Q197QR, T200A, Q207E, V245Q, D250E A158AV, I180IT 
LILX011369 LILX011369 None None   V35T, E36Q, V60I, K173T, Q174R, T200A, Q207D, R211K, V245Q, D250E  
LILX011370 LILX011370 None None  A98AG, K101KE, E138EG P1S, V35T, T39TA, D123E, I142IT, S162A, K173KE, Q174EK, D177E, I178MV, G196E, T200A, Q207D, V245Q, D250N  
LILX011371 LILX011371 None None   V35T, T39TK, D123E, I135V, A158AS, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207DG, R211K, F214L, V245Q, E248D  
LILX011373 LILX011373 None None   V35T, E36D, I135V, S162A, T165I, E169N, K173A, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245Q D121DG 
LILX011374 LILX011374 None None   V35T, E36D, D123DE, I135L, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211RK, P243H, V245E, E248D  
LILX011375 LILX011375 None None   V21I, K32R, V35T, V60I, K122A, Q174K, D177E, T200E, Q207E, R211Q, V245Q  
LILX011376 LILX011376 None None   V35T, T39M, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207D, P243S, V245Q, E248D  
LILX011377 LILX011377 None None   V35R, E36D, V60I, D86E, I135IV, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D  
LILX011378 LILX011378 None None   V35T, T39TA, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200V, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
LILX011379 LILX011379 None None   V35T, T39K, E40ED, V60I, T69TS, K104R, K122E, I142X, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, F214L  
LILX011380 LILX011380 None None   V35T, T39KR, S48T, V60I, K122E, D123G, S162A, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211E, V245Q, E248D  
LILX011381 LILX011381 None None   V35T, T39L, V60I, V90I, D123E, I135V, S162A, Q174DN, D177E, G196GE, Q207D, R211K, V245Q  
LILX011382 LILX011382 None None   V35T, E36D, T39N, V60I, D86E, D121Y, K122E, D123DE, I135V, I142V, S162A, K173A, Q174KR, D177E, T200A, E203ED, Q207E, R211K, V245Q  
LILX011383 LILX011383 None None   V35T, E36D, T39A, K49KR, D123E, I135V, S162A, F171FY, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LILX011384 LILX011384 None None   V35T, T39L, V60I, V90I, I135V, S162A, Q174NS, T200A, Q207D, R211K, V245X, E248D  
LILX011385 LILX011385 None None  E138A V35T, E36D, T39I, V60I, K122E, D123N, I135V, S162A, T165TI, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RK, F214L, V245Q, E248D  
LILX011386 LILX011386 None None   K20KR, V35T, T39K, E40D, D121DH, K122KE, D123DEG, I135IT, S162A, T165TI, F171FY, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, P243T, V245Q, E248ED  
LILX011399 LILX011399 None None   V35R, T39A, K64KR, I135T, I142V, S162A, K173T, Q174E, D177E, Q207KN, R211RK, V245Q  
LILX011400 LILX011400 None None   V35T, K49KR, K64KR, T69S, K122N, D123N, S162A, K173AT, Q174QEK, P176T, D177E, T200A, Q207E, F214L, V245Q  
LILX011401 LILX011401 None None   P1S, I31IT, V35T, E40D, K49R, V60I, K122KE, E169ED, D177E, I178IL, Q207E, R211K, V245K, D250E  
LILX011402 LILX011402 None None   V35T, V60I, K64R, K122E, I135R, S162A, K173AV, Q174K, D177E, I178M, T200IV, Q207AE, R211K, V245Q, E248ED  
LILX011403 LILX011403 None None   P1S, V35T, V60I, K122X, D123DEG, I135T, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, E248T  
LILX011404 LILX011404 None None   P1S, V35T, T39A, E40D, V60I, K122E, D123DN, I135L, S162A, K173AT, Q174K, D177E, I178MV, T200A, Q207D, R211RK, P243T, V245H, K249Q  
LILX011407 LILX011407 None None  K103KN P1S, V35T, E36D, T39A, K46KQ, K122E, D123E, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178IMV, T200A, Q207E, R211RK, V245HN  
LILX011408 LILX011408 None None   P1S, K11T, V35T, E36A, T39TK, E40ED, K43E, K49KR, V90VI, D121H, K122KE, D123NS, I135IT, I142V, K173S, Q174K, D177DE, I178IM, V179VI, G196GE, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
LILX011410 LILX011410 None None  E138EA V35T, E36D, T39TA, V60I, K122KE, I135IMV, S162SA, K173T, Q174R, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207N, R211K, V245K  
LILX011411 LILX011411 None None   P1S, V35T, E36D, T39TA, K49R, K122P, S162A, E169G, K173A, Q174E, D177E, T200A, Q207AT, V245Q  
LILX011413 LILX011413 None None   K22R, T27S, V35T, S68G, D123DE, I135T, S162A, E169D, K173T, Q174KR, D177E, G196E, T200V, E203D, Q207E, R211K, I244IV, V245KQ, E248D, D250DE  
LILX011414 LILX011414 None None   K20R, V35T, E40D, K49R, V60I, V90I, I135IT, K166KR, K173AT, Q174K, D177DG, I178LM, G196E, T200A, Q207N, R211K, V245K, D250E S162ADE 
LILX011415 LILX011415 None None   K20R, V21I, V35T, K49R, V60I, I135V, T165I, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D  
LILX011416 LILX011416 None None   P1S, I5IV, K11T, K20R, V35T, T39A, D121H, K122E, D123S, I135T, I142V, S162Y, K173S, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211K, F214L, P243A, V245Q  
LILX011417 LILX011417 None None   P1S, V35T, K49R, I50V, V60I, D123E, A158S, S162A, K166Q, E169G, K173A, Q174E, D177E, T200A, Q207A, R211RK, F214FL, V245E  
LILX011420 LILX011420 None None   V8I, K20R, V35T, E40D, V60VI, K122E, D123S, I135T, S162A, Q174E, I178IMV, T200A, Q207N, V245Q, E248D  
LILX011421 LILX011421 None None   T27S, V35T, T39L, V60I, K122P, I135V, T139TA, K173AT, Q174K, D177E, I178L, T200A, E204Q, Q207D, V245Q  
LILX011422 LILX011422 None None M41L, M184V, T215F A98AG, Y188L K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, E53ED, V60VI, D123N, I142V, S162Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, H208HY, R211K, F214FL, V245Q  
LILX011450 LILX011450 None None   K20R, V35I, S48T, K49KR, E79ED, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245LQ, E248ED  
LILX011451 LILX011451 None None   V35T, T39TI, K122KE, I135L, S162A, K173AT, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207N, R211RK, K223KR, V245Q, E248D  
LILX011452 LILX011452 None None   V35T, E36ED, V60I, V90I, K122Q, D123DN, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200V, Q207E, R211RK V245CW 
LILX011453 LILX011453 None None   M16MT, V35T, E40D, K122Q, D123S, S162A, K173T, Q174KR, D177E, T200A, Q207E, F214FL  
LILX011454 LILX011454 None None  K103KT V35T, E36D, K49R, V60I, K64R, K122KE, I135V, S162A, K173T, Q174A, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q  
LILX011455 LILX011455 None None   V35IT, E36ED, T39X, S48T, V60I, I135IV, S162A, K173T, Q174EK, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245X, E248D Q222Q* 
LILX011456 LILX011456 None None   V35T, D86E, I135V, S162A, K173IT, Q174K, D177DE, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  
LILX011457 LILX011457 None None   V35K, E36D, T39A, V60I, S68G, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211K, P243T, V245Q, E248D  
LILX011458 LILX011458 None None   V21I, V35A, T39A, V60VI, D123E, K173T, Q174K, D177E, I195IL, T200A, Q207G, R211K, V245Q, E248D, D250E  
LILX011459 LILX011459 None None   V21I, V35T, E36ED, E40ED, V60I, K122KE, I135IV, S162A, T165TI, K173T, Q174K, N175NY, T200A, Q207E, R211RK, V245Q T39*L 
LILX011460 LILX011460 None None   K20KR, V35T, V60I, K122E, D123DN, I142IV, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207E, F214FL, V245Q  
LILX011461 LILX011461 None None   T27S, T39S, S68G, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173N, Q174K, D177E, V179I, Q207A, V245Q  
LILX011462 LILX011462 None None   V8VI, K11T, V35T, T39L, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, I142V, S162X, K173AT, Q174K, D177DE, V179I, G196GE, Q207A, R211RK, V245Q  
LILX011463 LILX011463 None None   V35T, K122KE, I135V, S162A, T165I, K173AT, Q174K, D177E, T200A, E203ED, Q207DN, R211S, V245Q  
LILX011464 LILX011464 None None   V35T, K43KR, F130FL, I135V, S162A, K173T, D177E, I178M, T200E, E204K, Q207D, R211RS, V245Q, E248N, D250E V60VA 
LILX011465 LILX011465 None None   K11R, V35T, K43R, K102R, D123S, T139A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q, E248D, D250E F87FS 
LILX011466 LILX011466 None None   K11T, V35T, E36D, D121H, K122E, D123NS, I135IT, I142IV, S162Y, K173T, D177E, V179I, I202IV, Q207A, R211RK  
LILX011467 LILX011467 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123NS, E169D, K173A, Q174KN, D177E, T200A, Q207X, R211K, V245Q, E248D T240M, D250P 
LILX011469 LILX011469 None None   E28G, V35I, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245HQ, E248D, D250E  
LILX011470 LILX011470 None None   K11T, V35R, E36D, V60I, V90I, D121H, K122E, D123E, I135T, I142V, S162Y, K173S, D177E, V179I, Q207A, R211K, V245T, E248D  
LILX011471 LILX011471 None None   K32R, V35T, E36ED, T39M, V60I, S68G, K122E, D123N, I135T, S162A, K173IT, Q174K, D177E, I178IV, Q197EK, T200A, Q207D, V245E K70K* 
LILX011472 LILX011472 None None  V106VI V21I, V35T, T39A, I50IV, D86E, K122KE, I135IT, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E  
LILX011473 LILX011473 None None   V35T, E40D, K49R, V90VI, I135V, S162A, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207D, V245Q, E248D  
LILX011486 LILX011486 None None   E6G, V8G, P9A, P14A, V35T, I47IL, K122E, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, F214L, V245R  
LILX011487 LILX011487 None None   V35T, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173KT, Q174R, D177E, Q197QL, T200E, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
LILX011488 LILX011488 None None M41ML  K11T, V35T, E40D, V60I, K102Q, K104R, K122KE, D123NS, F124FL, I135T, I142IV, S162Y, K173A, D177E, V179I, Q207A, R211K, V245Q  
LILX011491 LILX011491 None None   V35T, W88WS, V90VI, D123E, S162A, F171Y, Q174DN, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LILX011492 LILX011492 None None  E138K V8I, K11Q, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211K, V245Q  
LILX011493 LILX011493 None None   P1S, V35T, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, E204K, Q207E, R211K, P243S, V245Q, E248D  
LILX011495 LILX011495 None None   V35T, T39A, E40D, V60I, I135V, S162C, K173AS, Q174R, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D, D250DE  
LILX011496 LILX011496 None None   V35T, V60I, K122KE, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  

Database

Resources

Team