Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Velasco-de-Castro (2014)
Title HIV-1 diversity and drug resistance mutations among people seeking HIV diagnosis in voluntary counseling and testing sites in Rio de Janeiro, Brazil.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 245
NumPts 245
Subtype B, F, CRF02_AG, CRF45_cpx, CRF40_BF, C

 
  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 245 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
05BRRJLTS02 05BRRJLTS02 None None   K122E, D123S, I202V, R211K  
05BRRJLTS03 05BRRJLTS03 None None   V35I, K122E, I135T, Q174QR, D177E, T200A, R211T  
05BRRJLTS04 05BRRJLTS04 None None   V35T, T39M, V60I, I135T, F171Y, D177E, F214L  
05BRRJLTS10 05BRRJLTS10 None None   P4S, K20R, V60I, I135T, T200A  
05BRRJLTS11 05BRRJLTS11 None None  V106I K11Q, D121H, K122E, I135T, K166R, D177DE, I178LV, V179I, G196E K223KN 
05BRRJLTS119 05BRRJLTS119 None None  E138A V35T, E36D, T39L, I135T, I142V, S162Y, K173I, Q174K, Q207G, R211K, F214L  
05BRRJLTS122 05BRRJLTS122 None None   S48T, D123E, I135T, I180V, Q197E  
05BRRJLTS138 05BRRJLTS138 None None   K11R, A98S, D123E, I178M, T200I  
05BRRJLTS142 05BRRJLTS142 None None   V35T, T39K, D123E, I135V, I142T, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178L, V179I, E203K, Q207E, R211K  
05BRRJLTS143 05BRRJLTS143 None None  V106I V35I, D123E, I135T, I202V, F214L  
05BRRJLTS146 05BRRJLTS146 None None   D123E, I135T, D177E, T200V, Q207K, F214L  
05BRRJLTS148 05BRRJLTS148 None None   E28K, K32E, V35T, T39K, I135L, T139A, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
05BRRJLTS150 05BRRJLTS150 None None   P4S, K49R, A98S, D123E, I135T, R211K  
05BRRJLTS157 05BRRJLTS157 None None   K104N, I135V, T139M, Q174R, Q207E, R211K  
05BRRJLTS182 05BRRJLTS182 None None   K20R, K104N, D123E, I135T, S162A, D177E  
05BRRJLTS183 05BRRJLTS183 None None   K20R, V35A, K49R, S162SC, E169DN, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
05BRRJLTS203 05BRRJLTS203 None None   K20R, S68G, K122E, I135T, K166R, D177E, G196E, R211G  
05BRRJLTS208 05BRRJLTS208 None None   K11R, V35I, D177E, I178M  
05BRRJLTS234 05BRRJLTS234 None None   K101R, I135T, K166KR, I180V, R211K  
05BRRJLTS236 05BRRJLTS236 None None   V35T, T39A, K49R, V60I, K122E, I132V, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, T200L, Q207E, R211K  
05BRRJLTS244 05BRRJLTS244 None None   V35T, K122E, I135V, S162C, E169N, K173A, Q174K, G196R, Q207E, R211K  
05BRRJLTS249 05BRRJLTS249 None None   K20R, K49R, I135T, S162A, I202V  
05BRRJLTS26 05BRRJLTS26 None None   K49R, I50V, K104KR, K122KE, I135T, T165I, T200TA, F214L  
05BRRJLTS261 05BRRJLTS261 None None   D121Y, K122E, I135T, V179I  
05BRRJLTS264 05BRRJLTS264 None None   V118I, D123E, Q145E, T165I, E169D, G196E, R211K, F214L  
05BRRJLTS265 05BRRJLTS265 None None   I135T, E169D, D177E, T200TA, R211K  
05BRRJLTS269 05BRRJLTS269 None None K70R K103N, P225H K122E, D123NS, E169D, D177E, T200A, F214L  
05BRRJLTS27 05BRRJLTS27 None None   V35T, K122E, I135V, A158AS, S162G, T165I, E169D, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
05BRRJLTS273 05BRRJLTS273 None None   S105A, V118I, K122E, E169G, T200TA, I202V, E204A, Q207E, R211K, F214L  
05BRRJLTS275 05BRRJLTS275 None None M184V K103N R83K, I135IL, I142T, K166R, R211Q  
05BRRJLTS277 05BRRJLTS277 None None   K20R, E44D, A98S, I135T, K173KQ, G196E, Q197K, F214L  
05BRRJLTS281 05BRRJLTS281 None None   K49R, I50V, I135T, T165I, E169D, T200I, R211K  
05BRRJLTS303 05BRRJLTS303 None None   I50V, K122E, I142V, I178M, Q207H, R211K  
05BRRJLTS304 05BRRJLTS304 None None  V106VI K64KR, T69TN, D121Y, K122E, I135T, S162C, D177E  
05BRRJLTS305 05BRRJLTS305 None None   K20R, D123E, I135T, I178L, R211K  
05BRRJLTS32 05BRRJLTS32 None None   K20R, K49R, K122E, I135T, Q145C, E169D, G196E, R211K  
05BRRJLTS33 05BRRJLTS33 None None   P4S, K20R, V60I, I135T, T200A  
05BRRJLTS44 05BRRJLTS44 None None M41L, D67N, M184V, T215Y Y188L E28K, K32KE, V35T, T39A, V60VI, D123E, I135T, S162Y, K166Q, E169A, K173AT, Q174K, N175NY, D177E, V189I, Q197E, T200TA, Q207E, H208Y, R211K  
05BRRJLTS52 05BRRJLTS52 None None   D17DN, K32R, I135T, D177DN, F214L  
05BRRJLTS92 05BRRJLTS92 None None   K122E, D123N, I135T, I178M, T200A  
05BRRJRS08 05BRRJRS08 None None   V60I, R83K, R125K, S162A, F171Y, K173S, Q174K, Q207E, R211K  
05BRRJRS09 05BRRJRS09 None None D67N, T69D, T215S, K219Q  T39A, S48T, K103R, V118I, K122E, D123E, I135T, T165I, D177E, T200A, F214L  
05BRRJRS19 05BRRJRS19 None None  E138K I50V, K122E, I142IT, S162A, D177E, I202V, R211K, F214L  
05BRRJRS22 05BRRJRS22 None None  Y188L T69A, D123E, T139I, I142V, R172K, D177E, R211K, E224D  
05BRRJRS24 05BRRJRS24 None None   V35T, T39M, V60I, K122V, I135L, S162H, K173T, Q174K, D177E, R211K, E224D  
05BRRJRS25 05BRRJRS25 None None   K122E, K173Q, T200A  
05BRRJRS26 05BRRJRS26 None None   E6K, V35T, V118I, K122E, S162G, E169D, K173A, Q174K, I178L, Q207E, R211K, F214L Y56Y* 
05BRRJRS27 05BRRJRS27 None None   V35I, K122E, D123S, I135R, D177E, I178M, T200A  
05BRRJRS29 05BRRJRS29 None None   K49R, E53D, A98S, K104R, K122A, D177E, I178L, G196E K70K* 
05BRRJRS30 05BRRJRS30 None None M41L, M184V, T215F  K32Q, I135T, F171Y  
05BRRJRS33 05BRRJRS33 None None   V35I, S68G, D123E, I135T, K173Q, D177E, I178M, R211K  
05BRRJRS35 05BRRJRS35 None None   K122E, I135T, D177E, G196E  
05BRRJRS36 05BRRJRS36 None None   D123E, I135T, K166KR, D177E, I178IM  
05BRRJRS38 05BRRJRS38 None None   K32R, K49R, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A  
05BRRJRS46 05BRRJRS46 None None   R211K  
05BRRJRS47 05BRRJRS47 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, K173A, D177K, T200A  
05BRRJRS52 05BRRJRS52 None None   K102Q, S162A, T200A, E224D  
05BRRJRS56 05BRRJRS56 None None   K49R, K122E, I135T, E169D, D177E, I178L, I202V, R211G, F214L  
05BRRJRS57 05BRRJRS57 None None D67G, K70R, M184V, K219Q  A33G, S68G, K122E, I135T, T165L, I202V, R211K  
05BRRJRS58 05BRRJRS58 None None   D121H, K122E, D177E, I178M  
05BRRJRS60 05BRRJRS60 None None   V35T, E36D, T39L, T69S, D123E, I135L, I142S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, F214L  
05BRRJRS61 05BRRJRS61 None None K70KR  E28EK, V35T, E44EK, G45GE, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178L, E194X, Q207E, R211K, K219X  
05BRRJRS62 05BRRJRS62 None None   S68G, T69N, I178L, R211K  
05BRRJRS63 05BRRJRS63 None None  V106I K11T, V35T, T39M, V60I, T69A, I135L, S162Y, K173T, Q174K, V179I, R211K  
05BRRJRS66 05BRRJRS66 None None   E6D, E42K, E53K, A98S, D177E, G196E, Q197K, R199K, T200I  
06BRRJRS07 06BRRJRS07 None None   K122E, G196E, T200A  
06BRRJRS106 06BRRJRS106 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, I135V, S162C, E169D, R172K, K173T, Q174K, I178L, T200A, Q207A, R211K  
06BRRJRS108 06BRRJRS108 None None   V35T, E40D, V60I, K102R, S162A, K173R, Q174K, D177E, Q207E, R211K, E224D  
06BRRJRS120 06BRRJRS120 None None   K20R, K122E, I135T, I178M, T200A, Q207E  
06BRRJRS124 06BRRJRS124 None None   K49R, K122E, I135T, E169D, I202V, F214L  
06BRRJRS129 06BRRJRS129 None None   K11Q, V35M, D113E, R211K, Q222X E42A, S48S* 
06BRRJRS133 06BRRJRS133 None None   V118I, K122E, D123N, I135V, I142V, T165I, R211G, F214L  
06BRRJRS137 06BRRJRS137 None None   I135T, S162C, Q207E  
06BRRJRS140 06BRRJRS140 None None  Y188C G15E, E42K, E53K, R72K, K122E, I178M, D186N, E194K, T200K, E204A, R211K, T215X, K219G H208R, L209M, T216S 
06BRRJRS142 06BRRJRS142 None None   V8I, D123E, I142V, I178L, G196E, E204G K64Q, N137D, H208R 
06BRRJRS148 06BRRJRS148 None None T215C K103N V60I, I135T, R211K Y188Y* 
06BRRJRS149 06BRRJRS149 None None K70KN  K20R, D121H, K122E, E169D, D177E  
06BRRJRS32 06BRRJRS32 None None   V35T, K122P, D123E, I135L, I142V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K  
06BRRJRS99 06BRRJRS99 None None   V35T, K122E, I135V, S162C, S163SR, E169D, K173A, Q174K, Q207E, R211T, E224D  
07BRRJRS04 07BRRJRS04 None None   V60I, R83K, K122E, I135M, I142V, S162Y, E169D, E194EQ, G196E, T200A, R211G  
07BRRJRS103 07BRRJRS103 None None   D123E, I135T, S162Y, D177E, Q207E, R211K  
07BRRJRS105 07BRRJRS105 None None   V35M, K49R, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178L, T200A, Q207A, L210M, R211K  
07BRRJRS111 07BRRJRS111 None None  E138A K166KR, T200A, I202V, R211S  
07BRRJRS115 07BRRJRS115 None None   K20R, A98S, I135T, S162D, T200I, I202V, R211K  
07BRRJRS126 07BRRJRS126 None None   I135T, S162H, I178L, V179I, T200I, I202V, R211K  
07BRRJRS17 07BRRJRS17 None None   K101R, K122E, D123E, I135T, D177E, V179I, T200AV, I202V  
07BRRJRS67 07BRRJRS67 None None  V106I K122E, I135T, S162A, K173E, D177G  
07BRRJRS70 07BRRJRS70 None None   V118I, D123E, I135T, I178L, R211K, F214L  
07BRRJRS71 07BRRJRS71 None None   T39A, A98S, D123E, I178M, T200A, Q207N  
07BRRJRS72 07BRRJRS72 None None   D121H, K122E, I135T, S162C, I178M, T200A, Q207E  
07BRRJRS73 07BRRJRS73 None None   V35T, E36D, T39MR, V60I, T69S, K122E, I135L, I142S, S162A, K173A, Q174K, D177DN, T200A, Q207E, R211K  
07BRRJRS75 07BRRJRS75 None None   S162N, D177E, G196E, K223R  
07BRRJRS78 07BRRJRS78 None None  K103N K49R, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
07BRRJRS80 07BRRJRS80 None None   K13R, K104Q H208Q 
07BRRJRS81 07BRRJRS81 None None   K64R, K122E, I135T, D177E, T200A W212W* 
07BRRJRS82 07BRRJRS82 None None   I5IM, K20R, K49R, V60I, D123N, I135T, T165I, D177E, R211K, F214L  
07BRRJRS88 07BRRJRS88 None None K219R  D121Y, K122E, I135T, E169D, D177E, I202V, R211K  
07BRRJRS89 07BRRJRS89 None None   V35T, E36ED, K49R, K122E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
07BRRJRS90 07BRRJRS90 None None   K122E, I135T, G196R, T200S, I202V, F214L  
BRRJJLTS204 BRRJJLTS204 None None   A98S, K122E, D123N, K166R, T200A, Q207E, E224D L205K 

Database

Resources

Team