Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Zhao (2014)
Title Genotypes and transmitted drug resistance among treatment-naive HIV-1-infected patients in a northwestern province, China: trends from 2003 to 2013.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 357
NumPts 357
Subtype CRF01_AE, CRF07_BC, B, B + C, CRF08_BC, C, CRF06_cpx

 
  Page 1 of 4    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 357 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CNX0304 CNX0304 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162X, V245Q, E248V, K249Q  
CXA024 CXA024 None None   K102R, I135V, S162C, V179I, I195IT, T200TA, Q207H, V276VI, K277R, Q278E, L283LI  
CXA031 CXA031 None None   I135V, S162C, K173KT, T200A, R211G, K277R, Q278E, I293V  
CXA033 CXA033 None None   K20KR, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104KR, K122KE, D177DE, R211RGS, V245Q, A272P, V276IT, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
CXA053 CXA053 None None   K122KQ, D123DE, S162C, D177E, T200A, Q207E  
CXA054 CXA054 None None   V35VI, K122KE, I135V, S162C, R211RK, A272AS, Q278E, I293IV  
CXA056 CXA056 None None   K122KE, D123DE, I135V, S162C, T200A, R211G, A272S, V276X, K277KR, Q278E, I293IV  
CXA057 CXA057 None None   D123DE, S162C, T200A, I202IV, Q278E, I293V  
CXA060 CXA060 None None   P52A, K122KE, D123DE, I135V, S162C, T200A, R211K  
CXA063 CXA063 None None   E6ED, I135V, S162C, T200A, I202V, R211G  
CXA070 CXA070 None None   I135V, S162C, T200A  
CXA075 CXA075 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, Y144F, I159IV, S162SC, K173IT, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238KR, I244V, V245EK, A272P, E291D, V292I, I293V  
CXA078 CXA078 None None   I5IV, V118I, K122E, F214L, V245IL, E248EK, K249KR, S251SI, V261I, I293V  
CXA087 CXA087 None None   I135V, S162C, T200A, K277R, Q278E, K281KR, L283LI, I293IV  
CXA092 CXA092 None None  V106VI D123E, I135T, S162C, T200X, I202IV, Q207X, R211K, Q278E, I293V  
CXA096 CXA096 None None   K102KR, I135V, S162C, T200TA, Q207QE, V245VE, K277R, Q278E  
CXA100 CXA100 None None   K122KE, D123DE, I135V, S162C, E169ED, T200A, Q207E, R211RK, K277R, Q278E, L283I, E297A  
CXA101 CXA101 None None  V179VD I135V, S162C, T200A, K277R, Q278E, I293V  
CXA104 CXA104 None None   I135V, S162C, Q174QH, D177DE, T200TA, I202IV, R211G, V245E, K277R, Q278E, L283LI, I293V  
CXA106 CXA106 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123NS, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
CXA109 CXA109 None None   S162C, T200TA, I202IV, R211RG, K277KR, Q278E  
CXA112 CXA112 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248I, K249Q  
CXA119 CXA119 None None  V106VI, G190GA E6ED, V35VI, K102KQ, I135V, S162C, I178IL, E194ED, T200A, E203ED, E224ED  
CXA123 CXA123 None None   V8VI, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121HY, K122E, I135AT, S162SC, R211RS, V245Q  
CXA130 CXA130 None None   K11KN, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121HY, K122E, I142IV, K166KR, D177DE, V245Q  
CXA141 CXA141 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122KE, D123NS, S162C, K173N, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211T, K238R, V245K  
CXY0517 CXY0517 None None  G190GE E6D, K11T, V35T, E36EA, T39K, K43E, K122E, D123S, S162SA, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211T, K238R, V245E  
DJP0511 DJP0511 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200TA, V245Q, E248V, K249Q  
FCC0628 FCC0628 None None   I135IMV, I142V, S162C, I178M, T200A, E203ED, Q207QK, R211RG  
FWN0221 FWN0221 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, T69N, R83K, K122E, D123S, I135T, S162C, Q174G, D177E, I178M, Q207K, R211S, K238R, V245I  
GXJ0222 GXJ0222 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K49R, D121H, K122KE, D123S, I135T, S162C, D177E, T200TI, E203D, Q207AT, R211S, K238R, V245E  
GYM0207 GYM0207 None None   E6D, K11T, V21VI, V35T, T39K, K43E, K64KR, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245D  
HJK0624 HJK0624 None None   P4PT, E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, I135IRT, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179VI, Q207A, L210LS, R211S, K238R, V245EK, S251N  
HL0447 HL0447 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
HZQ0217 HZQ0217 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K104KR, D121DH, K122E, D123NS, K173I, Q174KN, D177E, I178IM, T200K, Q207A, R211S, K238R, V245E  
kang002a kang002a None None   E6D, V8VI, K11T, K32I, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238KR, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang003a kang003a None None  G190A K11KQ, T69N, V118I, K122E, D123N, I135M, K173E, V179I, T200TI, F214L, V245I, I257L, V261I, I293V E6*Q 
kang009a kang009a None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39DE, S48T, V60I, D121DH, K122E, I135T, E169ED, Q197QK, T200TA, R211RK, F214FL, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang010a kang010a None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, I142IV, K173M, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E, E291D, V292I, I293V  
kang012a kang012a None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200TI, I202IV, Q207A, R211S, K238KR, V245E  
kang013a kang013a None None   E6D, K11T, V35T, T39TK, K122KE, D123NS, I135T, K173RT, Q174K, D177E, I178IM, T200I, Q207A, R211NS, K238R, V245E  
kang024 kang024 None None   K11T, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, R211RK, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang025a kang025a None None   E28R, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102KR, K103KR, K104KR, D121H, K122E, I178M, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang029 kang029 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121HY, K122E, V245Q, E248EV, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang034 kang034 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, S162C, K173N, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, E291D, V292I, I293V  
kang038 kang038 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60VI, D121Y, K122E, D123E, S162C, E169EA, R211G, V245Q, E248V, K249Q, A272P, T286A, V292I, I293V  
kang039 kang039 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173R, Q174K, D177E, T200R, Q207A, L210M, R211S, F214L, K238KR, V245D, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang051 kang051 None None   E6D, K11T, V35T, T39KR, K43KE, K122E, D123N, S162C, E169ED, K173X, Q174QKR, D177E, I178IV, T200TA, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245K, A272P, K275Q, K277R, E291D, I293V  
kang056 kang056 None None   V8VI, K20KR, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104KR, K122E, I142IV, R211K, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297EA  
kang059 kang059 None None   E28K, K32E, V35IT, E36A, T39D, S48T, V60I, D121DHY, K122E, I135T, T200TA, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286TA, V292I, I293V  
kang064 kang064 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123N, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang067 kang067 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173A, Q174K, D177E, V189I, I202V, Q207A, R211S, V245E, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang072 kang072 None None   P4X, E6ED, K11T, V35T, T39K, K43E, K104KR, V118VI, D121H, K122E, D123X, I135T, S162C, K173X, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207N, R211S, K238KR, V245E, T286A, K287KR, E291D, V292I, I293V  
kang080 kang080 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102KR, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K275R, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang083 kang083 None None   E28K, K32E, V35T, E36T, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang095 kang095 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39X, S48T, V60I, D121DHY, K122E, Q207QE, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291ED, V292I, I293V, P294T  
kang097 kang097 None None   E6D, K11T, V35T, T39KR, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179A, T200TA, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, I293V  
kang109 kang109 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang121 kang121 None None   I2IV, E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K102R, D123N, I135IT, S162C, Q174N, D177G, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D, I293V  
kang125 kang125 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39A, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
kang134 kang134 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178IM, V189VI, Q207A, R211S, V245E, K275R, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang135 kang135 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, R211G, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
kang138 kang138 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39DE, S48T, V60I, A98AS, K104KR, D121DY, K122E, I135X, K166KR, I195X, T200TA, V245Q, E248EV, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang139 kang139 None None   E28R, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104R, D121H, K122E, I135IT, T139TI, T200TA, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K275KR, V276VI, K277R, T286TA, E291D, V292I, I293V  
kang143 kang143 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122A, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207A, L210M, R211S, F214L, K238R, V245D, V276I, T286AV, E291D, V292I, I293V  
kang148 kang148 None None   E6D, K11KT, V35T, T39KR, K43KE, K122KE, D123NS, S162C, K173R, Q174QK, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211ST, K238R, V245E, K277KR, T286TA, I293V  
kang156 kang156 None None   S162C, E169D, Q174E, K277R, Q278E, L283I  
kang194 kang194 None None   V21VI, E28K, K32E, V35T, E36A, T39EK, I47IL, S48T, V60I, D121DY, K122KE, V241X, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
kang203 kang203 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, K101R, D121H, K122E, D177DE, I178IM, T200TI, V245E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
kang210 kang210 None None   V8I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104KR, D121Y, K122E, I135V, K166R, V179I, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
kang251 kang251 None None   E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, K49KR, K122E, D123S, I135T, S162C, F171FY, K173X, Q174KR, D177E, I178M, T200TI, Q207A, L210LM, R211S, K238R, V245E, K281R, T286A, I293V  
kang252 kang252 None None   E6D, M16MV, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135V, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200TI, Q207A, R211S, K238R, V245K, A272P, K275KQR, T286A, E291D, I293V  
kang254 kang254 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, D121Y, K122E, D123G, I135T, S162CW, K173R, Q174K, D177E, E203D, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, T286A, I293V  
KQJ082910 KQJ082910 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, D121DY, K122KE, D123X, I135T, S162CW, K173R, Q174K, D177E, T200TA, E203D, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, T286A, I293IV  
KY0110 KY0110 None None   V21VI, E28K, K32E, V35I, E36A, T39D, S48T, V60I, K103KR, D121Y, K122E, I135M, V245Q, E248V, K249Q  
LBC0117 LBC0117 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
LBP0405 LBP0405 None None   T27TS, V35T, T39X, S48ST, V60I, D121H, K122E, I135T, I142IV, T200X, I244IV, V245Q  
LG0422 LG0422 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39DE, S48T, V60I, D113DG, D121DHY, K122E, I135IT, T139TA, S162SC, D177DE, I244IV, V245Q, E248V, K249Q P157PL 
LT0428 LT0428 None None   E6D, K11T, V35T, T39KR, K43E, K122E, D123S, S162C, I202IV, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245S  
LZH0429 LZH0429 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, T69N, K122E, D123S, I135IT, S162C, Q174R, D177E, I178M, T200TA, Q207K, R211S, K238R, V245E, S251N  
LZL0406 LZL0406 None None   I5V, E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162CW, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203ED, Q207A, R211S, K238R, V245E  
LZZ0103 LZZ0103 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
TP0114 TP0114 None None   P4PS, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S163ST, K173I, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S, F214L, I244V, V245E  
WAY0218 WAY0218 None None   E6D, K11T, K20KR, V35I, T39K, E40EQ, K43E, K102R, V118I, D121H, K122E, D123S, I135IT, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207AT, R211N, F214L, K238R, V245DE  
WF0120 WF0120 None None   E6D, K11T, V35T, T39KR, K43E, K122E, D123S, I135X, T139TA, S162C, D177E, I178IM, I202V, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245S  
WLQ0630 WLQ0630 None None   I135IV, E169D, Q174E, T200A  
XCQ0442 XCQ0442 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V75VL, K122E, D123S, S162SN, T165TI, K173IL, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
XLJ0115 XLJ0115 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, D123N, S162C, K173N, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211S, V245K  
YB0402 YB0402 None None   E6D, K11KT, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200TA, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
YGJ0219 YGJ0219 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, D123N, S162SC, K173S, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245K  
YXL111411 YXL111411 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, K49R, V118VI, K122E, D123ST, S162C, I178M, E203D, Q207A, R211S, E224D, K238R, V245E  
YYD0626 YYD0626 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I142IV, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, I202V, Q207A, R211S, F214FL, K238R, V245E  
YYM0449 YYM0449 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K103R, K122E, D123S, S162C, K173RS, Q174KN, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251N  
ZCA0301 ZCA0301 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211T, K238R, V245E  
ZHP0407 ZHP0407 None None   K122E, D123S, D177E, I178IM, V189I, T200I, R211K, V245I, E248EK  
ZJ0302 ZJ0302 None None   E6D, V35T, T39K, K43KE, V60VI, K122E, D123S, T139TA, S162C, K173IRS, Q174K, D177E, I178M, I195IL, Q207A, R211NS, K238R, V245K  
ZJR0432 ZJR0432 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121HY, K122E, I142IT, R172RK, D177DE, I178ILM, T200TI, R211G, V245Q  
ZKC0409 ZKC0409 None None   K122KE, I135V, E169D, Q174E, T200A, I202V, E204EK, R211G, I244V  
ZL0306 ZL0306 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
ZLB0211 ZLB0211 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  

Database

Resources

Team