Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Avidor (2013)
Title Transmission patterns of HIV-subtypes A/AE versus B: inferring risk-behavior trends and treatment-efficacy limitations from viral genotypic data obtained prior to and during antiretroviral therapy.
Citation PLoS ONE
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 237
NumPts 237
Subtype A, CRF01_AE, C, CRF03_AB, CRF45_cpx

 
  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 237 Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
1129 1129 Unknown    I13V, I15V, K20R, M36I, R41K, Q61E, H69K, L89M, I93L  
1135 1135 None    E35D, M36I, R41K, L63LV, H69K, L89M, I93IL  
1216_MT 1216_MT Unknown    I13IV, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
1221_MT 1221_MT Unknown    I13V, K14R, I15IV, E35D, M36I, N37D, R41K, Q61E, H69K, K70KR, L89M  
1257_MT 1257_MT None    I13V, K14R, I15V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M  
1273 1273 None    I13V, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
1274_MT 1274_MT Unknown    L10I, I13V, E35D, M36I, R41K, H69K, V77I, L89M  
1306 1306 None    L10I, I13V, I15V, K20KR, E35D, M36I, N37D, R57K, L63T, H69K, L89M  
1327 1327 None    L10I, K14R, E35DN, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M, I93L  
1365_MT 1365_MT Unknown    I13V, K14R, I15IV, G16GE, E35D, M36I, R41K, H69K, V77I, L89M, I93L  
1368 1368 None    Q7QE, L10V, I13V, K14R, G16E, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
1430 1430 None    I13V, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L G27GE 
1501 1501 None    I13V, E35D, M36I, R41RK, L63P, H69K, L89M  
1513 1513 None    K14R, G17E, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M  
1529 1529 None    K14R, E35D, M36I, R41K, R57RK, H69K, L89M  
1532 1532 None    I13V, I15IV, E35D, M36I, R41K, L63P, H69K, V77I, L89M, I93L  
1570_FT 1570_FT Unknown    I13V, K14R, L19I, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
1580 1580 None    I13V, K14KR, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, L63X, H69K, I72IT, L89M, I93L  
1600 1600 None    K14R, E35D, M36I, R41K, R57K, I62IV, H69K, T74TS, L89M  
1603 1603 None    L10I, I13V, L19I, K20KI, E35D, M36I, R57K, D60E, I62V, L63P, H69K, T74S, L89M  
1609_FT 1609_FT None   F53FL I15IM, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, I47IM, R57K, I62IT, H69K, L89M D60AE 
1612_MN 1612_MN None    T12P, I13V, E35D, M36I, R57K, I62V, L63P, H69K, T74S, L89M  
1657 1657 None   L10LF K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M  
1678 1678 None    K14KR, E35D, M36I, N37D, R41K, R57RK, H69K, L89M, I93IL  
1728 1728 None    K14KR, E35D, M36I, R41K, H69K, V77I, L89M, I93L  
1756_FN 1756_FN LPV    I13IV, E35D, M36I, N37ND, R41K, H69K, V77I, L89M  
1778 1778 None    E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M  
1785 1785 None    L10I, E35D, M36I, R41K, L63P, H69K, L89M, I93L  
1798_MT 1798_MT None    I13V, K14KR, I15V, E35D, M36I, R41K, Q61QE, I64IM, H69K, L89M, I93L  
1814 1814 None    L10I, I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, H69K, V77I, L89M  
1863_FN 1863_FN Unknown    L10I, I13V, K14KR, E35D, M36I, N37D, R41K, D60E, Q61E, L63V, H69K, L89M, I93L  
1880 1880 None    K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57RK, H69K, L89M  
1884 1884 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
1885 1885 None    I13V, K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M, I93L  
1909 1909 None    I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M, I93L  
1912 1912 None    T12TA, I13V, K14KR, I15IV, E35D, M36I, R57K, I62V, L63ST, H69K, I72V, T74S, L89M  
1913_MT 1913_MT None    I13V, E35D, M36I, R57K, I62V, L63AT, E65D, H69K, T74S, L89M  
1917_MT 1917_MT None    I13IV, K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M, I93L  
1919 1919 None    K14KR, G16GE, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
1921_MT 1921_MT None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
1923 1923 None    L10LV, I13V, K14R, I15IV, E35D, M36I, R41K, H69K, V77VI, L89M  
1926 1926 None    I13V, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
1927_MT 1927_MT Unknown    L5LF, I13V, E35D, M36I, R57K, I62V, L63P, H69K, T74S, L89M  
1935 1935 None    K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, K70KE, I72V, L89M  
1937 1937 None    I13V, I15V, E35D, M36I, N37D, R41K, L63P, H69K, L89M, I93L  
1938 1938 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
1940 1940 None    I13V, L33V, E35D, M36I, R41K, H69K, V77I, L89M, I93L  
1941_MT 1941_MT None    K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, L63PT, H69K, L89M  
1942_MT 1942_MT Unknown    G16GE, K20KR, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93IL  
1947 1947 None    K14R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
1949 1949 None    L10V, I15V, G16E, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
1950 1950 None    L10LI, I15V, K20R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89I, I93L  
1951 1951 None    T12TA, I13IV, K14R, K20KR, E35D, M36I, R41K, L63P, H69K, L89M, I93L  
1957 1957 None    K20KR, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93IL  
196 196 APV  M46I, I84V L10FI, L33F I13V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, K45R, R57K, I62IV, H69K, L89M, I93V L24LV 
1966_MT 1966_MT None    K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, K70R, L89M  
1969 1969 None    I13V, K14KR, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
1972 1972 None    I13V, K14R, E35D, M36I, N37E, R41K, H69K, L89M  
1974 1974 None    I13V, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, I72IV, L89M  
1975 1975 None    I13V, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, I72V, L89M  
1976_FT 1976_FT None    I13V, E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, I72IT, V77VI, L89M  
1978_MT 1978_MT None    I13V, K14R, I15V, E35D, M36I, R41K, H69K, V77I, L89M  
1986_FT 1986_FT None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
1990_FT 1990_FT None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
1991_MT 1991_MT None    K14R, I15V, G16E, E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, L89M, I93L  
1994 1994 None    L10V, I15IV, G16E, K20KR, E35D, M36I, R41K, L63V, H69K, L89M, I93L  
1995_MT 1995_MT None    R8Q, K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, I64IM, H69K, L89M  
1996_FT 1996_FT None    L5LF, K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M, I93L  
1997_MT 1997_MT LPV    E35D, M36I, N37D, Q61E, L63V, I64M, H69K, L89M  
1998_MT 1998_MT None    K14R, I15IV, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
1999 1999 None    K14R, G16E, E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, L89M, I93L  
200 200 IDV    P9T, I13V, G17E, E35D, M36I, R41K, R57K, D60DE, H69K, L89M R8T 
2006 2006 None    E35D, M36I, R57K, I62V, L63AT, E65D, H69K, T74S, L89M M46MT 
2007_MT 2007_MT None  M46I, V82A  K14R, G16A, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M, I93L  
2012 2012 None    I13IV, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, D60E, I62IV, H69K, L89M, I93IL  
2014 2014 None    I13IV, G16E, L19I, E35D, M36I, R41K, L63LP, H69K, V77I, L89M, I93L  
2017_MT 2017_MT None    K14R, I15V, G16E, E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, L89M, I93L  
2036 2036 None    L10LI, I13V, G16GE, E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, L89I, I93L L23R 
2070_MT 2070_MT Unknown    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, L63S, H69K, L89M, I93L  
2073 2073 None    I13V, I15V, M36I, R41K, Q61E, L63P, I64M, H69K, L89M, I93L  
2091 2091 None    I13V, E35D, M36I, R57K, I62V, E65D, H69K, T74S, L89M  
2095_MT 2095_MT Unknown    L10I, E35D, M36I, R41K, D60E, Q61E, I62IV, E65ED, C67CW, H69K, L89M, I93IL  
2112 2112 None    I13V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, V77I, L89M, L97I  
2177_FT 2177_FT Unknown    K14R, G16E, K20KR, E35D, M36I, R41K, I62V, H69K, L89M  
2179_FT 2179_FT Unknown    G16E, E35D, M36I, R41K, Q61QE, L63LP, H69K, L89M, I93L  
276 276 Unknown    L10I, E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, H69R, L89M, I93L  
37_MT 37_MT IDV    I13V, K14R, E35D, M36I, N37ND, R41K, Q61QE, H69K, L89M R8RH 
402 402 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
451 451 None    I13V, K14R, Q18K, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M  
513 513 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
563 563 None    I13V, K14KR, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
631 631 None    K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M  
730 730 None    I13V, K14KQ, K20KR, E35D, M36I, R41K, L63P, H69K, L89M, I93L  
807 807 None    G16E, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
834_MT 834_MT Unknown    K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M  
855 855 None    L10I, I13V, K14R, I15V, E35D, M36I, N37D, R41K, L63T, C67Y, H69K, K70R, L89M  
900 900 None    K14KR, K20R, E35D, M36I, P39PS, R41K, H69K, L89M A71AG 
948_FT 948_FT Unknown    I13V, E35D, M36I, R41K, L63T, H69K, V77VI, L89M, I93L  
951_FT 951_FT None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L Y59YD, D60DG 
989_MT 989_MT NFV  L90M L10LF, K20T I13V, E35D, M36I, R41K, H69K, A71AV, T74S, L89I, I93L  

Database

Resources

Team