Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Afonso (2012)
Title HIV-1 genetic diversity and transmitted drug resistance mutations among patients from the North, Central and South regions of Angola.
Citation PLoS ONE
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 99
NumPts 99
Subtype C, CRF02_AG, F, CRF18_cpx, G, H, CRF01_AE, D, A, K, CRF45_cpx, B

 

Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
ANG1 ANG1 None    M36I, R41K, L63P, H69K, T74S, L89M, I93L  
ANG100 ANG100 None    M36I, R41K, L63S, H69K, L89M  
ANG101 ANG101 None    M36I, R41K, I66V, H69K, L89M  
ANG103 ANG103 None    M36I, H69K, L89M  
ANG104 ANG104 None    M36I, R41K, I62V, L63T, C67N, H69K, V82I, L89M  
ANG105 ANG105 None    M36I, N37S, R41K, L63T, H69K, L89M, I93L  
ANG106 ANG106 None    E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, E65D, H69N, I72T, L89M R87E 
ANG107 ANG107 None    E35D, M36I, H69K, K70R, L89M  
ANG108 ANG108 None    E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, E65D, K70R, L89M  
ANG11 ANG11 None    E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, E65D, L89M  
ANG110 ANG110 None    E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, E65D, L89M, I93L  
ANG111 ANG111 None    M36I, R41K, L63S, I72K, L89M H69A 
ANG113 ANG113 None    E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M  
ANG114 ANG114 None    M36I, R41K, H69K, L89M  
ANG12 ANG12 None    E35D, M36I, R41K, I66V, H69K, V82I, L89M  
ANG13 ANG13 None    M36I, N37S, R41K, I66V, H69K, V82I, L89M  
ANG14 ANG14 None    E35D, M36I, R57K, L63V, H69K, K70R, L89M  
ANG15 ANG15 None    M36I, P39T, R41K, D60E, I62V, L63V, I64V, H69K  
ANG16 ANG16 None    M36I, R41K, L63S, H69K, L89M  
ANG17 ANG17 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
ANG18 ANG18 None    E35D, M36I, R41K, K45R, L63V, H69K, L89M  
ANG19 ANG19 None    M36I, R41K, K45R, L63P, I93L  
ANG2 ANG2 None    M36I, L63P, H69K, I93L  
ANG20 ANG20 None    E35D, M36I, R41K, L63S, I64L, C67*, H69K, V82I, L89M  
ANG21 ANG21 None    M36I, R41K, H69K, K70R, T74S, L89M  
ANG22 ANG22 None   Q58E E35D, M36I, P39T, D60E, L63T, H69N, L89M  
ANG24 ANG24 None    M36I, R41K, I62V, L63T  
ANG25 ANG25 None    E35D, M36I, P39S, R41K, L63T, E65D, I72T, L89M  
ANG26 ANG26 None    M36I, R41K, L63P, H69K, T74S, L89M, I93L  
ANG27 ANG27 None    M36I, N37D, R41K, L63V, I64L, H69K, K70R, V82I, L89I  
ANG28 ANG28 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
ANG3 ANG3 None    T31P, E35D, M36I, R41K, R57K, I72T, L89M  
ANG30 ANG30 None    M36I, N37D, R41K, H69K, K70R, L89M  
ANG31 ANG31 None    E35D, M36I, P39S, R41K, L63T, E65D, H69Q, I72T, L89M I50F 
ANG32 ANG32 None    E35D, M36I, R41K, Q61N, L63S, I64M, H69K, I72T  
ANG33 ANG33 None    E35D, M36I, P39T, R41K, D60E, I62V, L63T, H69K, L89M  
ANG34 ANG34 None    M36I, R41K, I62V, I64L  
ANG35 ANG35 None    E34Q, E35D, M36I, R41K, H69K, V82I, L89M, I93V  
ANG36 ANG36 None    E35D, M36I, R41K, D60E, H69K, L89M  
ANG37 ANG37 None    E35D, M36I, R41K, H69K, V77I, L89M  
ANG38 ANG38 None    E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, E65D, L89M  
ANG39 ANG39 None    M36I, P39S, R41K, D60E, Q61E, I62V, L63N, H69K, L89I  
ANG4 ANG4 None    M36I, N37D, R41K, L63S, H69K, K70R, I72V, L89M  
ANG40 ANG40 None    E35K, M36I, N37D, R41K, R57K, L63T, H69K, V82I, L89M  
ANG41 ANG41 None    M36I, R41K, D60E, I62V, L63A, I64L, H69K, L89I  
ANG42 ANG42 None    E35D, M36I, N37D, R41K, L63V, H69K, T74S, L89M, I93L  
ANG43 ANG43 None    M36I, R41K, L63T, C67E, H69R, V82I, L89M  
ANG44 ANG44 None   L33F E35D, M36I, R41K, L63H, H69K, K70R, I72V, V77I, L89M  
ANG45 ANG45 None    E35N, M36I, N37E, R41K, H69K, L89M  
ANG46 ANG46 None    M36I, R41K, I62V, L63T, H69*, V77I, L89M  
ANG47 ANG47 None    M36I, N37D, R41K, L63T, H69S, L89M  
ANG48 ANG48 None    M36I, R41K, D60E, Q61E, I62V, L63H, H69K, I72V, L89I  
ANG49 ANG49 None    E35D, M36I, R41K, R57K, Q61N, I93L  
ANG5 ANG5 None    E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, V77I, L89M  
ANG50 ANG50 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
ANG51 ANG51 None    E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, E65D, L89M  
ANG52 ANG52 None    E35D, M36I, R41K, L63P, C67S, H69K, K70R, L89M  
ANG53 ANG53 None   N83D E35D, M36I, R41K, I64M, E65G, H69K, K70R, L89M  
ANG54 ANG54 None    M36I, N37S, R41K, K45R, L63A, H69K, L89M, Q92R, I93L, T96S I85S, G86R 
ANG55 ANG55 None    E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, E65D, L89M  
ANG56 ANG56 None    E35D, M36I, N37D, R41K, Q61N, L63S, C67W, I72T G86K 
ANG58 ANG58 None    M36I, N37K, R41K, D60E, I62V, L63P, L89M, I93L  
ANG59 ANG59 None    M36L, R41K, L63A, H69K, K70R, L89M, I93L  
ANG6 ANG6 None    E35D, M36I, N37K, R41N, Q61K, H69K, T74S, L89M, I93L  
ANG60 ANG60 None    M36I, R41K, L63S, I64L, C67E, H69K, V82I, L89M, Q92H  
ANG61 ANG61 None    M36I, N37K, R41K, K45R, D60E, Q61H, I62V, L63P, H69Q, L89M, I93L  
ANG62 ANG62 None    E35D, M36I, R41K, K45R, I62V, H69K, L89M  
ANG63 ANG63 None    E35D, M36I, R41K, L63V, H69K, I93L  
ANG64 ANG64 None    M36I, R41K, H69K, L89M, I93L  
ANG65 ANG65 None    E35D, M36I, H69K, V77I, L89M  
ANG66 ANG66 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
ANG67 ANG67 None    M36I, N37K, R41K, D60E, I62V, L63P, H69Q, L89M, I93L  
ANG68 ANG68 None    E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, E65D, I72T, L89M  
ANG69 ANG69 None    M36I, N37K, R41K, D60E, I62V, L63P, H69Q, L89M, I93L  
ANG7 ANG7 None    E35D, M36I, R41K, R57K, I62V, L63P, C67Y, H69Q, L89M  
ANG70 ANG70 None    M36I, N37Q, P39S, R41K, D60E, I62V, L63V, I64V, E65D, H69K, I72V  
ANG71 ANG71 None    E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, V77I, L89M  
ANG73 ANG73 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
ANG74 ANG74 None    M36I, N37D, R41K, L63P, H69K, I72V, L89M  
ANG75 ANG75 None    E35D, M36I, R41K, I64V, H69K, K70R, L89M  
ANG76 ANG76 None    M36I, R41K, E65D, C67S, H69K, V82I, L89M  
ANG77 ANG77 None    E35D, M36I, R41K, R57K, Q61H, L63T, E65D, L89M  
ANG78 ANG78 None    E35N, M36I, R41K, H69K, V77I, L89M  
ANG79 ANG79 None    M36I, R41K, L63V, H69K, T74S, L89M, I93L  
ANG8 ANG8 None    M36I, R41K, I62V, L63V, I64L, H69K, T74S, L89M, I93L  
ANG80 ANG80 None    E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, E65D, H69Q, L89M  
ANG81 ANG81 None    M36I, N37S, R41K, H69K, L89M  
ANG82 ANG82 None    M36I, R41K, L63P, H69K, I93L  
ANG83 ANG83 None    M36L, N37S, R41K, L63P, H69K, L89M, I93L  
ANG84 ANG84 None    E35Q, M36I, R41K, W42*, C67*, H69R, G78R, V82I, L89M Q61P 
ANG85 ANG85 None    E34Q, M36I, N37S, P39T, R41K, I62V, I64M, C67E, H69K, I72V, L89M  
ANG86 ANG86 None    E35D, M36I, R41K, H69K, I72V, I85V, L89M, I93L  
ANG88 ANG88 None    E35D, M36I, R41K, D60E, H69K, L89M  
ANG9 ANG9 None    E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
ANG90 ANG90 None    M36I, D60E, Q61E, I62V, L63N, H69K, L89I  
ANG91 ANG91 None    E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, L89M, C95X  
ANG93 ANG93 None    M36I, R41K, L63H, C67S, H69K, V82I, L89I, T96P N98T 
ANG94 ANG94 None    E35D, M36I, R41K, C67Y, H69K, I85V, L89M  
ANG99 ANG99 None    M36L, P39L, L63P, H69K, L89M, I93L  

Database

Resources

Team