Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Hattori (2010)
Title Trends in transmitted drug-resistant HIV-1 and demographic characteristics of newly diagnosed patients: nationwide surveillance from 2003 to 2008 in Japan.
Citation Antiviral Res
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 1920
NumPts 1920
Subtype B, CRF01_AE, C, CRF02_AG, A, G, F, CRF07_BC, CRF20_BG, CRF06_cpx, CRF08_BC


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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 1920 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
A05-201027 A05-201027 None None   V21VI, T131X, I135T, F160X, T165I, T200I, R211K, V245I  
A05-201029 A05-201029 None None   E6D, K43R, V60I, S191SF, Q197K, R211K, V245Q W153W* 
A05-201031 A05-201031 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K122KE, D123X, I135M, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238KR, V245E  
A06-201045 A06-201045 None None   D123E, I135T, K173E, D177E, T200I  
A06-201047 A06-201047 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, G196E, D250DN, A272AP  
A06-201050 A06-201050 None None   E6D, V60I, I135T, Q197K, R211K, V245Q  
A07-201054 A07-201054 None None   K122E, I135T, T200I, V245I  
A07-201055 A07-201055 None None   K20R, D123E, I135T, S162SC, E169ED, I178L, I202IV, R211RK, V245M  
A07-201060 A07-201060 None None   I135RT, T200I, V245I  
A08-201076 A08-201076 None None T215TS  V35I, D123E, I135L, P150PS, S162C, S191SF, G196E, Q207X, V245M  
B07-511048 B07-511048 None None   P1L, S3SI, E6D, V10VL, D17DE, E29EK, V35I, E36EK, D123E, I135L, S162C, D177E, I178V, G196E, T200A, R211K M16MR, W24WG, Y232YF 
B08-511055 B08-511055 None None  V179VD S3SI, R72RK, V106VL, D123E, I135T, D177DE, I178IM, G196E, T200TI, I202V, R211G W71WG 
B08-511057 B08-511057 None None   S3ST, E6D, T7TP, V10VL, E28G, V35IL, T39TP, D123E, I135L, S162C, D177E, I178V, S191SF, G196E, R211K W71WG, P217PT 
B08-511058 B08-511058 None None   V60I, D123E, I135T, I178M, Q197QH, T200TA  
C04-2069017 C04-2069017 None None   D123E, I135L, S162C, P176T, G196E, V245M  
C04-2069038 C04-2069038 None None   D123E, I135V, S162C, I178M  
C05-2066252 C05-2066252 None None   E6ED, T200I, R211K, F214L  
C05-2066258 C05-2066258 None None   V8I, V35T, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, I142V, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E, A272P  
C05-2066266 C05-2066266 None None   E6D, V8I, V35VI, D123E, A272P  
C05-2066277 C05-2066277 None None   I135V, S162C, E169K, D250E, Q278E  
C05-20671792 C05-20671792 None None   P9A, K11R, I135T, R211K, V245M, A272P, K275R  
C05-2069014 C05-2069014 None None   A98S, K102Q, R211K  
C05-2069015 C05-2069015 None None   D123E, I135L, S162C, E169ED, G196E  
C05-2069020 C05-2069020 None None   D123E, I135L, S162C, Q207H, R211K  
C05-2069040 C05-2069040 None None   T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, T165I, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211K, V245E  
C05-2069043 C05-2069043 None None   K102R, D123E, I135T, S162C, I195L, G196E, E204K, Q207E, R211K, E224K  
C05-2069044 C05-2069044 None None   I135T, V245M  
C05-2069060 C05-2069060 None None   T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
C05-2069066 C05-2069066 None None   D177E, G196E, Q207E, V245M, E248D  
C05-2069078 C05-2069078 None None   K102R, I135T, T200E, I202V, E204D, R211K, V241I  
C05-2069080 C05-2069080 None None   V60I, K122E, D123N, I135T, I142V, Q207E, V245K  
C05-2069097 C05-2069097 None None   V60I, I135T, I142V, S162A Q85H, E89G 
C05-2069100 C05-2069100 None None   V35L, I135L, S162C, I178M, G196E, Q207R  
C05-2069105 C05-2069105 None None  V106I K20R, S162C, V189I, G196E, V245M  
C05-2069111 C05-2069111 None None   E6D, V8I, K20R, D123E, I135T, D177E, T200I, R211K, V245K  
C05-2069120 C05-2069120 None None   V35I, I135L, S162C, G196E  
C05-2069121 C05-2069121 None None   E6D, V8I, V60I, I135T, I142V, T200S, Q207E, L210M, R211K, F214L  
C05-505003 C05-505003 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43KE, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R  
C05-51110247 C05-51110247 None None  F227L E6D, V35I, I135R, S162C, G196R, T200I  
C05-51110259 C05-51110259 None None   K122P, I135T, D177E, I178L, I202V, E204D, L210F, R211K  
C05-51110263 C05-51110263 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
C05-51110271 C05-51110271 None None   E6D, V35I, D123E, I135L, S162C, P176S, G196E, T240S  
C05-51110278 C05-51110278 None None   I5V, V35I, V60I, S68G, K104R, K122Q, D123E, I135L, S162C, I178L, G196E  
C05-51110281 C05-51110281 None None   D123E, I135T  
C05-51110292 C05-51110292 None None   E29K, D123E, I135L, S162C, G196E, T200A  
C05-51110308 C05-51110308 None None   K22R, V35M, I135V, S162C, K173E, Q174R, R211K  
C05-51110317 C05-51110317 None None  V179E K102R, K122E, I142V, T200I  
C05-51110323 C05-51110323 None None   V35I, K122E, I135L, S162C, E194T, G196E, E224D  
C06-2066282 C06-2066282 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, R83K, K122E, D123S, T165I, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211N, K238R, V245E, A272P  
C06-2066300 C06-2066300 None None   E6ED, T39TA, D121H, K122E, R125RK, I135T, T200I, I202V, R211K, V245M, A272P  
C06-2066312 C06-2066312 None None   E6K, V118I, K122E, E203A, F214L, V245E  
C06-2066333 C06-2066333 None None   E6D, V35I, I135L, S162C, G196E, Q207H, R211K, D237N, A272P, K277R I274N 
C06-2069001 C06-2069001 None None   E6D, V35I, D123E, I135L, S162C, G196E, T200I, L210M  
C06-2069046 C06-2069046 None None   A98S, K102R, D123E, I135T, T200I, R206S, R211G  
C06-2069048 C06-2069048 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, G196E  
C06-504606 C06-504606 None None   K22R, V35I, I135L, S162C, G196E, E204A  
C06-505601 C06-505601 None None   K20R, K102R, D123E, I135T, S162C, R211K  
C06-51110328 C06-51110328 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, D177E, E204K, R211K  
C06-51110330 C06-51110330 None None D67H  V35M, K102N, I135T, S162C, R211K  
C06-51110342 C06-51110342 None None   V35I, I135V, S162C  
C06-51110344 C06-51110344 None None   E6D, P19Q, V35I, D123E, I135L, S162Y, I180V, T200I  
C06-51110350 C06-51110350 None None   V35I, I135T, S162C, T200I, Q207E, F214I  
C06-51110354 C06-51110354 None None   V35I, A98S, K101R, I135V, S162C, I178M  
C06-51110358 C06-51110358 None None   K20R, K32Q, D123E, I135R, S162C, E169D, G196E  
C06-51110373 C06-51110373 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, G196E, T200A  
C06-51110391 C06-51110391 None None   I142V, S162A, T200E, E204D, R211K  
C06-51110395 C06-51110395 None None  V179E V35I, R83K, K102R, K104R, D177G, G196E, T200S, Q207V, R211K  
C06-51110397 C06-51110397 None None   V35I, I135L, S162C, G196E  
C06-51110407 C06-51110407 None None   K122E, Y127F, I135V, I142V, S162C, R211K  
C06-51110416 C06-51110416 None None   K22R, V118I, K122E, I135T, R211K, F214L  
C06-51110435 C06-51110435 None None   I135V, S162C, T200E, R211K  
C06-51110436 C06-51110436 None None   P4S, V35I, I135L, S162C, V179A, G196E  
C06-51110442 C06-51110442 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
C06-51110450 C06-51110450 None None   Q207N, R211K  
C06-51110451 C06-51110451 None None  K103N I5V, K20R, K122E, I135V, S162C, T200A, F214L  
C06-6000C122 C06-6000C122 None None   D121Y, K122E, S162C, I178L, R211K  
C07-2066346 C07-2066346 None None   V35M, D123E, I178M, G196E, I202V, V245M, A272P, V276I  
C07-2066347 C07-2066347 None None T215D  K64R, D123E, I135T, I142T, S162C, I178L, V179I, Q207E, V245K, A272P  
C07-2066350 C07-2066350 None None  V179E K20R, D123E, I135T, D177E, G196E, R211K, V245M, A272P, K275R, V276I  
C07-2066371 C07-2066371 None None   E36EK, E53EG, V60I, I142V, K166R, K173Q, V179I, T200A, R211K, A272Q L26LV 
C07-20672254 C07-20672254 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211S, V245E, K249R  
C07-2069001 C07-2069001 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, G196E  
C07-2069004 C07-2069004 None None   M16K, D123E, I135T, D177E, G196E, R211K  
C07-2069008 C07-2069008 None None   V35I, K122E, D123N, I135L, S162C, G196E  
C07-2069011 C07-2069011 None None  E138EA E6D, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162SC, E204EQ, Q207D, R211K Y232C 
C07-2069024 C07-2069024 None None   K20R, D123E, I135T, I178L, I202V, R211K  
C07-2069031 C07-2069031 None None   I5V, K11Q, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, Q174K, E194D, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
C07-2069053 C07-2069053 None None   I135LV, S162C, F171FY, I178IV, V179I, Q207QE  
C07-2069066 C07-2069066 None None   K122P, D123E, I135T, D177E  
C07-2069067 C07-2069067 None None   I5V, K20R, A98S, D123E, I135T, D177E, R211K  
C07-2069084 C07-2069084 None None   V35I, V60I, D123DE, I135L, S162C, I178IM, G196E, T200A, R211RG  
C07-2069116 C07-2069116 None None   I135T, G196E, T200A, F214L  
C07-2069119 C07-2069119 None None   V35I, K122EQ, I135L, S162C, P170PS, G196E, R211K  
C07-2069131 C07-2069131 None None   E6D, K20R, D123E, I135T, S162AG, I178L, I202V, R211K  
C07-2069133 C07-2069133 None None   I5V, V35I, I135L, S162C, G196E, R211K  
C07-2069137 C07-2069137 None None   V35I, I135L, S162C, G196E  
C07-2069143 C07-2069143 None None  V179D V35I, A98AS, D123E, I135L, S162C, Q207N, R211K  
C07-2069151 C07-2069151 None None   E6D, V35I, S68G, I135R, T139V, G196E, R211G  
C07-20952471 C07-20952471 None None   V35I, D123E, I135IL, S162SC, P176PT, G196GE, Q207X, R211RK, W229WL, P236PL, W239WR, V245VM, A272AP, V276VI  
C07-504702 C07-504702 None None   D123E, I135T, K173E, D177E, Q207R, R211K