Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Heipertz (2013)
Title Molecular epidemiology of early and acute HIV type 1 infections in the United States Navy and Marine Corps, 2005-2010.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 40
NumPts 40
Subtype B, CRF01_AE


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
306019_RT 306019_RT None None V75I, F77L, F116Y, Q151M V108I S68G, T69I, D121H, K122E, I135T, V179I, V245K, A272P, K277R, I293V, P294T, E297K, I329L, G359S, A376T  
306026_RT 306026_RT None None   R83K, K122E, K173E, I178L, T200A, R211K, V245E, A272P, I293V, E297K, R307K, D324E, G335D, R356K, M357K, T386I, K390R, A400I  
306029_RT 306029_RT None None   K122P, T139I, I142V, D177E, G196E, A272P, K277R, I293V, K311R, A360T, S379G, A400T, T403I, V435L  
306081_RT 306081_RT None None   S48SP, D123N, R211K, E248D, A272P, K277R, T286A, S322L, I326V, Q334E, M357T, A376T, A400T, T403S, E404D, V435I  
306129_RT 306129_RT None None   A98S, K122E, I178M, V245E, A272P, V276I, K277R, Q278H, I293V, Q334Y, R358K, T377M, K390R, A400T, E404D, V435E Q197S 
306131_RT 306131_RT None None   S48T, V60I, K122P, I135V, I178L, F214L, V245K, E248D, D250E, A272P, L283I, A288T, I293V, P345PL, R356K, M357T, A376S, I382V, A400T, E404D, N418H  
306142_RT 306142_RT None None   E53D, K122Q, S162C, D177E, D250E, A272S, T286A, A288S, I293V, M357T, A360T, I375V, K390R, A400T, V435A  
306144_RT 306144_RT None None   R83K, V90I, D123E, S162A, T200A, Q207E, R211K, A272P, K275Q, K277R, R284K, I293V, E298A, K311R, D324N, A360T, I393T  
306159_RT 306159_RT None None  K103N, V108I D123E, I142T, S162Y, D177E, I178M, V179I, E248D, T286A, I293V, A360V, A400T, E432D, V435A  
306163_RT 306163_RT None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V111I, D121H, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, L283I, E291D, I293V, E312T, I329V, G335D, M357K, G359S, A371V, A376V, K390R, K395R, A400T, T403M, E432D  
306196_RT 306196_RT None None   R83K, K104R, G196E, E248D, T286A, I329L, G335S, R356K, A376S, T377V, T386I, K390R, A400T, T403A  
306203_RT 306203_RT None None   S68G, D123E, I159V, D177G, G196E, T200A, E203D, R211K, E291D, I293V, E297A, A327V, I329L, A400T  
306209_RT 306209_RT None None   T27S, I178M, Q207R, R211E, S251A, E297P, K311R, V317A, D324E, I329L, Q334Y, R358K, I375V, K390R, K395R, E399D, E404D  
306212_RT 306212_RT None None   V35I, T39TI, R83K, I135T, S162C, K173R, I178L, R211K, A272P, I293V, I329L, T369A, A376S, A400T, V435E  
306227_RT 306227_RT None None  V106I, Y188L V35I, D121H, K122E, I135T, G196E, T200A, R211G, D237E, I244V, A272S, S322T, M357A, A376S, A400T, V435E  
306238_RT 306238_RT None None   A98S, K104N, K122E, I135T, S162C, Q197K, T200E, Q207E, V292T, I293V, I326V, G436E  
306261_RT 306261_RT None None   D123E, I135M, S162C, D177E, V179A, G196E, R211K, V245M, D250E, A272P, T286A, V292I, I293V, F346Y, M357T, A376S, K390R, A400S, E432D, V435A  
306272_RT 306272_RT None None   T69TI, K122E, D123N, I142V, S162A, P176T, R211S, V245M, A272P, K277R, T286A, E297K, Q334D, A355T, K366R, K390R, T403M, E413D, V435A  
306308_RT 306308_RT None None   K20R, V35L, G45E, K122E, S162C, K173Q, R211K, A272P, K281R, P294Q, S322T, G333E, G359S, K366R, E399D, A400T, E404D, E432D  
306318_RT 306318_RT None None   I135R, T165I, G196E, F214L, V241I, D250T, A272S, I293V, M357T, A376T, K390R, A400T, E432D  
306335_RT 306335_RT None None   V35L, T39A, G196E, F214L, V245M, A272P, T286P, V292I, I293V, M357V, R358K, A376T, A400S, V435A, A437V  
306336_RT 306336_RT None None  G190S K102Q, D123E, I135V, D177E, I178M, T200A, R211K, F214L, I257L, A272P, V276I, K277R, I293V, E297K, K311R, Q334L, F346Y, A371V, I375V, T377L, S379G, K388R, K390R, V435I  
306340_RT 306340_RT None None   V118I, I135T, I142V, L210S, R211S, F214L, K275R, Q278A, T286A, Q334H, M357T, K366R, K385R, K388R, A400T, T403S  
306344_RT 306344_RT None None T215C  V35I, S68G, A98S, K101Q, K122E, I135R, S162C, K201I, V245Q, E248V, A272P, K277R, T286A, I293V, G359S, K390R, E399D, A400T  
306347_RT 306347_RT None None   K122E, E203D, Q207A, R211K, V245K, V276I, A288S, P294T, A327V, T377V, K390R  
306349_RT 306349_RT None None  V108I K43N, I50V, R83K, D123E, S162A, D177E, T200A, V245E, D250E, I293V, M357V, V365I, K390R, A400T, E432D, V435P  
306350_RT 306350_RT None None   V35M, E36D, E40D, I135V, I178M, R211K, V245M, T286A, I293V, E297K, T403I  
306376_RT 306376_RT None None T215C  V35I, S68G, A98S, K101Q, K122E, I135R, S162C, K201I, V245Q, E248V, A272P, K277R, T286A, I293V, E297K, G359S, K390R, E399D, A400T  
306391_RT 306391_RT None None   K20R, D123E, K173E, V245E, K277R, T286A, E297A, M357T, K385R, K390R, A400T, T403S, V435A  
306397_RT 306397_RT None None   K11R, K20R, I135T, E194D, F214L, A272P, T286A, P294T, E297Q, K311R, I326V, F346Y, T403V  
306403_RT 306403_RT None None  K103N E6D, V35T, T39A, E40D, D123E, D177E, V179I, R211K, F214L, E233EK, V245M, K277R, R284K, I293V, P294Q, M357T, A376T, T377N, V381I, T397TA, A400T, E404D  
306410_RT 306410_RT None None   K104R, K122E, D123E, I135T, T165I, T200I, R211K, F214L, V245E, K277R, I293V, I329V, R356K, K390R, A400T, V435A  
306415_RT 306415_RT None None   K82R, V118I, I135T, I142V, T165I, R211S, F214L, V254I, A272P, K277R, Q278A, T286A, K311R, Q334H, M357I, A376V, T386A, K390R, T397I, A400T, T403S Q91QR 
306434_RT 306434_RT None None   K32Q, S162A, G196E, Q207E, A288S, I293V, K311R, S322T, D324E, T338S, M357T  
306445_RT 306445_RT None None   V35I, T39A, I135L, S162C, T200A, Q207H, R211K, V245L, A272P, K277R, T286A, I293V, E297A, I326V, Q334L, R358K, I375V, K385R, T403M  
306451_RT 306451_RT None None   V35I, R83K, D123E, I135T, S162Y, Q207E, K277R, T286A, E297A, P321Q, D324E, I329V, Q334E, M357T, R358K, T369A, E370G, V381I, K390R, K395R, E399D, A400T  
306453_RT 306453_RT None None   D123E, S162C, D177E, G196E, I202V, R211K, V241I, A272P, K277R, T286A, T296S, E297K, I326V, I329L, M357T, A360T, A400T  
306501_RT 306501_RT None None  K103N E6D, K122E, T200E, L210F, R211K, T286A, I293V, I329L, G335S, Y342F, T377V, K390R, A400T, T403A, V435A  
306512_RT 306512_RT None None  K103N D123E, I142T, S162Y, D177E, I178M, V179I, I244IV, E248D, T286A, I293V, V317G, A371T, A400T, E432D, V435A  
306517_RT 306517_RT None None T215C  V35I, S68G, A98S, K101Q, K122E, I135R, S162C, K201I, V245Q, E248V, A272P, K277R, T286A, I293V, E297K, G359S, A376S, K390R, E399D, A400T V111M