Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Heipertz (2013)
Title Molecular epidemiology of early and acute HIV type 1 infections in the United States Navy and Marine Corps, 2005-2010.
Citation ARHR
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 40
NumPts 40
Subtype B, CRF01_AE

 

Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
306019_RT 306019_RT None    E35D, M36I, N37D, L63P, I93L  
306026_RT 306026_RT None    Q7R, G16E, M36I, I62V, I64V  
306029_RT 306029_RT None    M36I, L63T, I72T  
306081_RT 306081_RT None    N37D, D60E, L63P  
306129_RT 306129_RT None    L10I, L63P, C67D, K70R, I72T, V77I  
306131_RT 306131_RT None    L10I, I13V, M36I, R41K, D60E, I62V, I64V, I72T  
306142_RT 306142_RT None    L63P, E65D, K70R, V77I, N98S  
306144_RT 306144_RT None    R41K, I62V, L63P, V77I, I93L  
306159_RT 306159_RT None      
306163_RT 306163_RT None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
306196_RT 306196_RT None    I15V, L63A, H69Q, V77I  
306203_RT 306203_RT None    T12S, E35D, M36I, R41K, I64V  
306209_RT 306209_RT None    R41K, K45R, L63P, V77I, I93L  
306212_RT 306212_RT None    L10I, I15V, E35D, R41K, I62V, L63P, C67W, I93L  
306227_RT 306227_RT None    T12N, D60E, L63P, K70R, V77I  
306238_RT 306238_RT None    I15V, L63S  
306261_RT 306261_RT None    I13V, I15V, L19T, N37S, R57K, D60E, Q61E, L63P, H69Q  
306272_RT 306272_RT None    E35D, L63T  
306308_RT 306308_RT None    G16E, E35D, N37T, L63A, I64V, V77I  
306318_RT 306318_RT None    I13V, N37D, R41K, I64V  
306335_RT 306335_RT None    T12P, L19Q, K20R, L63P, I93L  
306336_RT 306336_RT None    E35D, N37D, D60E, L63P, H69Q  
306340_RT 306340_RT None  L90M  T12S, I13V, L19I, K20I, Q61H, L63P, K70E, A71V, V77I  
306344_RT 306344_RT None    L19Q, N37S, P39S, R41K, K45R, R57K, L63A, A71T, V77I, I93L  
306347_RT 306347_RT None    I15V, G16E, M36I, N37K, R41K, Q61E, I62V, L63T, E65D, I72T, V82I  
306349_RT 306349_RT None    I13V, L63P, H69Q  
306350_RT 306350_RT None    I15V, M36I, N37D, L63S, I72T  
306376_RT 306376_RT None    L19Q, N37S, R41K, K45R, R57K, I62V, L63S, A71T, V77I, I93L  
306391_RT 306391_RT None    E35D, N37S, R41K, L63T, A71V, I72T, V77I, I93L  
306397_RT 306397_RT None    E35D, N37S, R41K, I93L  
306403_RT 306403_RT None    E35D, N37E, D60E, L63T, I72V, V77I  
306410_RT 306410_RT None    I13V, R41K, I64V  
306415_RT 306415_RT None  L90M  T12S, I13V, L19I, K20I, Q61H, L63P, K70E, A71V, V77I  
306434_RT 306434_RT None    L63P, A71T, I72E, V77I, I93L  
306445_RT 306445_RT None    L10I, I13V, G16E, R41K, L63T, V77I, I93L  
306451_RT 306451_RT None    I13V, E35D, L63P, V77I  
306453_RT 306453_RT None    G16E, E35D, N37S, L63T, I72T  
306501_RT 306501_RT None    K14R, L63P, H69Q, V77I  
306512_RT 306512_RT None      
306517_RT 306517_RT None    L19Q, N37S, R41K, R57K, L63S, I64V, A71T, V77I, I93L  

Database

Resources

Team