Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Smolen-Dzirba (2013)
Title Transmission of drug-resistant HIV-1 variants among individuals with recent infection in southern Poland.
Citation Curr HIV Res
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 54
NumPts 54
Subtype B, A, CRF02_AG

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
AAK19 AAK19 None None   V35I, S68G, I135T, T165I, T200I, V245K  
ADE697 ADE697 None None   V35T, V60I, K122E, D123E, I135K, I178M, V179I, E204K, Q207E  
AGE658 AGE658 None None   R83K, D121H, K122E, I135T, S162H, V245E  
AJK10 AJK10 None None   V35T, E40D, V60I, D121H, I135T, S162C, D177N, I178L, V245K  
AL6279 AL6279 None None   K20R, T27S, V35T, V90I, D123K, I135V, Q174A, G196E, T200A, R211G  
APS7199 APS7199 None None   E28A, K32Q, V35I, E40D, S68G, K122P, K166R, I178L, T200E, R211K, E248Q, K249Q  
ASK39 ASK39 None None  E138K V21I, K49R, V60I, S163A, K166T, K201R, I202V, V245K  
CE6675 CE6675 None None T215D  V35I, S68G, I135T, I142T, S162C, I178M, R211K  
DPS7347 DPS7347 None None   V35I, S68G, K122Q, I135T, V189I  
DUS7121 DUS7121 None None   V118I, I135T, F171Y, I202V, Q207E, L210M, R211K, F214L, D237N, V245E, D250E  
EKK9 EKK9 None None   V35T, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, V245Q  
GBK16 GBK16 None None   R83K, S162H, Q207N  
GJK14 GJK14 None None   K122E, D123NS, A158S, K166R, R211K, V245E  
IHS7125 IHS7125 None None   K20R, E42EK, S48T, V60I, R83RK, D123EK, I135V, R172RK, D177N, I178M, R211T G93GE 
JF642 JF642 None None   A98S, K103KE, K104R, I135T, S162A, Q197K, F214L  
JJ6571 JJ6571 None None   R83K, S162H, Q207N, R211K, V245E, D250E  
JK6552 JK6552 None None   V35I, D123E, I202V, R211Q  
JK722 JK722 None None   K49R, D121H, K122E, I135T, S162C, E194Q, G196Q, Q207A, R211K, V245E, K249R  
JK723 JK723 None None   Q207A, R211K, V245I  
JKE647 JKE647 None None  K103N V35I, R83K, D123E, I135T, S162Y, V179I, V189A, T200A  
JKE649 JKE649 None None   V35T, K122E, D123E, I135T, I142V, S162F, D177E, I178M, Q207E, R211K, V245E  
JNK21 JNK21 None None   V35T, E36D, T39M, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D  
KGK6 KGK6 None None   V35I, D123E, I135R, S162C, T200A, Q207E, R211S  
KK6516 KK6516 None None   K122E, I135T, S162C, E194N, G196Q, Q207A, R211K, V245E  
KKK4 KKK4 None None   K122E, D123N, I142V, S162SN, Q207E, V245E  
KKS7051 KKS7051 None None   D121Y, K122E, I135T, S162C, E194N, G196Q, Q207A, R211K, V245E  
KN13 KN13 None None   K102G, D121Y, K122E, I135T, S162C, E194Q, G196Q, E203D, Q207A, R211K, V245E  
LC707 LC707 None None   D121H, K122E, I135T, S162C, E194N, G196Q, Q207A, R211K, V245E  
LJE610 LJE610 None None D67N E138K M16I, D17N, V35T, E40D, M41I, E42K, V60I, W71*, D76N, E79K, R83K, W88*, E89K, D121H, D123N, R143K, W153*, S162C, R172K, D177N, I178L, D186N, D192N, E194K, G196E, F214L, E224K, W229*, E233K, W239*, V245K, D250N G45K, G93E, G99S, D185N, G190K 
LZK38 LZK38 None None   K102Q, K104A, D121Y, K122E, I135T, S162A, R211E, E248D, D250E  
MB6533 MB6533 None None   I135V, V179I, R211K, E248D  
MBK5 MBK5 None None   R83K, S162H, Q207KN  
MGK17 MGK17 None None   R83K, D123E, S162Y, D177E, Q207N  
MKD22 MKD22 None None M41L, T215S  V21I, V35I, K43N, V60I, I135T, G196E, Q197K, E204K, Q207E, V245E  
MKE590 MKE590 None None   T27A, I142M, N175H, Q207E, R211K  
MLK20 MLK20 None None   K122E, I135T, S162C, R211K  
MM6354 MM6354 None None   K102Q, K104A, D121H, K122E, I135T, S162A, R211E, V245M, E248D  
MME715 MME715 None None   S68G, T69N, K122E, D123DE, I135IR, A158AS, S162C, R211K, P243T, V245E  
MNS6938 MNS6938 None None   K32Q, V35I, V60I, S68G, I135R, K166R, V179I, R211K  
MRS7272 MRS7272 None None   D123E, I135V, I178M, R211K, E248D  
PBS7120 PBS7120 None None   V118I, I135T, F171Y, I202V, Q207E, L210M, R211K, F214L, D237N, V245E, D250E  
PRD21 PRD21 None None   K122E, D123S, I142T, A158S, K166R, R211K, V245E  
RCS7015 RCS7015 None None   V35M, T39A, R83K, T200A, R211K, K249Q  
SCE667 SCE667 None None T215D  V35I, S68G, I135T, I142T, S162C, I178M, R211K K201E 
SPD19 SPD19 None None   V35I, D123E, I135T, G196E, T200A, I202V, R211Q, F214L  
SSE717 SSE717 None None   K122KQ, D123DE, V179I, K201R, I202V, Q207PT, R211K, V245E  
TRS6903 TRS6903 None None   K32Q, V35I, S68G, I135R, K166R, V179I, R211K  
UP4545 UP4545 None None   E28G, V35I, T39A, S68G, K102KQ, K122Q, I135T, R211K  
WGK35 WGK35 None None   I135L, S162Y, R211Q  
WJK11 WJK11 None None   V35T, E40D, V60I, G112GE, D121H, I135T, S162Y, D177N, I178L, V245K  
ZBK1 ZBK1 None None   D123E, I142T, Q207G, R211K, V245M  
ZKS7423 ZKS7423 None None   K20R, K122E, I135T, S162H, F171Y, T200A, R211K, V245E, E248D  
ZSK34 ZSK34 None None  K103N, K238T V35I, S68G, K104R, V118I, D123E, I135T, T165I, V179C, D192N, T200A, Q207G, R211K, F214L  
ZSS7366 ZSS7366 None None   V60I, D123E, I135T, S162C, T200A, R211S  

Database

Resources

Team