Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Chow (2013)
Title Molecular diversity of HIV-1 among people who inject drugs in Kuala Lumpur, Malaysia: massive expansion of circulating recombinant form (CRF) 33_01B and emergence of multiple unique recombinant clusters.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 112
NumPts 112
Subtype B + CRF01_AE, CRF33_01B, CRF01_AE, B, CRF58_01B, CRF74_01B, CRF54_01B

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 112 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
10MYKJ001 10MYKJ001 None None   K82R, I135L, S162C, K277R, Q278E, T286A  
10MYKJ003 10MYKJ003 None None   P4PS, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, I244V, V245E, V276I, T286A, E291D, I293V  
10MYKJ005 10MYKJ005 None None   E6EK, V35I, W88C, K122E, D123S, I135R, S162C, K173T, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245E, K275R, E291D, V292I, I293V F160FL 
10MYKJ009 10MYKJ009 None None  V179D K122E, D123S, I135R, T165I, K173A, Q174K, D177E, I178M, I202V, Q207A, R211N, K238R, V245E, A272G, T286A, I293V  
10MYKJ010 10MYKJ010 None None   V60I, K122E, D123S, I135V, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211AT, V245EK, T286A, I293V  
10MYKJ011 10MYKJ011 None None   V35VI, K49R, K122E, D123S, T165I, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211N, E233EG, K238R, V245E, E291D, V292I, I293V G45N 
10MYKJ015 10MYKJ015 None None   I135V, S162C, R211S, V245M, K277R, Q278E, T286A  
10MYKJ016 10MYKJ016 None None   V35IT, K122E, D123S, I135R, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, R211S, V245M, K277KR, T286A, E291D, V292IT, I293V, P294PS  
10MYKJ018 10MYKJ018 None None   K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211A, K238R, V245E, K249Q, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ020 10MYKJ020 None None   K32Q, V35I, K64R, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207X, R211RK, E233EG, K238R, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ021 10MYKJ021 None None   K20R, T39A, I135V, S162C, R211K, V245M, K277R, Q278E, T286A, K287R, E297K  
10MYKJ022 10MYKJ022 None None   K20R, K122E, I135V, S162C, R211G, V245K, Q278E, T286A, A288G, I293V  
10MYKJ023 10MYKJ023 None None   V35L, K82R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A  
10MYKJ025 10MYKJ025 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135L, S162C, T165I, R172K, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211RK, V245E, A272P, E291D, V292I  
10MYKJ027 10MYKJ027 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, E36EA, T39KR, K43E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245E, V276I, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ028 10MYKJ028 None None   K122E, D123S, I135R, S162C, K173I, Q174K, D177E, G196GE, Q207E, R211K, K238R, V245E, K275R, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ031 10MYKJ031 None None   V35I, E36D, K122E, I135K, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ032 10MYKJ032 None None   E6D, K122E, D123N, I135RT, S162C, K173R, Q174K, Q207A, R211N, K238R, V245E, T286A, V292I, I293V  
10MYKJ034 10MYKJ034 None None   V35I, S68G, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211N, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ035 10MYKJ035 None None   A98S, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245E, T286A, E291D  
10MYKJ036 10MYKJ036 None None   P14PQ, V60I, I135V, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245M, V254I, Q278E, T286A  
10MYKJ038 10MYKJ038 None None   V35I, K64R, K122E, D123S, I135IR, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179VI, T200TA, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, E297ED  
10MYKJ039 10MYKJ039 Unknown Unknown  K103N K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, K238R, V245E, V276I, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ041 10MYKJ041 None None   E6D, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, L210M, R211N, E233EG, K238R, V245E, A272P, K275Q, T286A, V292I, I293V  
10MYKJ042 10MYKJ042 None None   K122E, D123S, I135R, S162C, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211NS, K238R, V245E, V276I, T286A, I293V  
10MYKJ043 10MYKJ043 None None   K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, E194D, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ044 10MYKJ044 None None   D86E, K122E, D123S, K173M, Q174K, D177E, Q207A, R211K, K238R, V245E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ045 10MYKJ045 None None   E28EG, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, Q278E, T286A, V292I, I293V  
10MYKJ047 10MYKJ047 None None   E6EK, K122E, D123S, K173M, Q174K, D177E, T200I, Q207N, R211N, K238R, V245E, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V G285G* 
10MYKJ049 10MYKJ049 None None   V21I, V35I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249R, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ050 10MYKJ050 None None   V60I, K122E, D123S, S162C, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ051 10MYKJ051 None None   K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211NS, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ053 10MYKJ053 None None   V35X, K122E, T139A, K173V, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245A, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ054 10MYKJ054 None None   K32N, K122E, D123S, I135R, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, I293V  
10MYKJ055 10MYKJ055 None None   V35I, V111I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245E, A272AP, T286TA, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ056 10MYKJ056 None None   V60I, S68G, K122E, D123N, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211T, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ057 10MYKJ057 None None  K103KN A98S, K122E, I135R, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211T, K238R, V245E, T286A, E291D, I293V  
10MYKJ058 10MYKJ058 None None   V60I, K104R, K122E, D123S, I135R, K173IT, Q174K, D177E, Q207D, R211RK, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V A98PS 
10MYKJ059 10MYKJ059 None None   V8I, V60I, K122E, D123S  
10MYKJ060 10MYKJ060 None None   S68G, R72RK, K102KQ, K122E, D123S, I135T, T165I, K173A, Q174K, D177E, Q207AV, R211N, K238R, V245E, A272S, T286A, E291D, I293V  
10MYKJ061 10MYKJ061 None None   K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, V179VI, Q207A, R211K, K238R, V245E  
10MYKJ062 10MYKJ062 None None  V179D D121H, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, E233EG, K238R, V245E, A288T, V292I, I293V K30N, F61V 
10MYKJ063 10MYKJ063 None None   V35VI, A98S, D121H, K122E, I135K, T139A, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293IV, P294PQ  
10MYKJ064 10MYKJ064 None None   E6D, K103R, K122E, I135S, I142V, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, T286A, I293V  
10MYKJ065 10MYKJ065 None None   V35M, T39S, T107S, I135V, S162C, T200I, Q278E, T286A  
10MYKJ067 10MYKJ067 None None   E6D, P9S, V35T, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, L210M, R211N, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ069 10MYKJ069 None None   V35I, K122E, D123N, I142V, K173I, Q174K, D177E, D192N, Q207A, R211N, K238R, V245E, T286A, E291D, I293V  
10MYKJ070 10MYKJ070 None None   I135V, S162C, Q174H, R206RK, R211K, V245M, A272T  
10MYKJ072 10MYKJ072 None None   K122E, D123S, I135R, S162Y, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211N, K238R, V245E  
10MYKJ073 10MYKJ073 None None   K64R, K122E, D123S, K173M, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249R, T286A, E291D, I293V  
10MYKJ074 10MYKJ074 None None   E36K, T107S, K122E, D123S, S162C, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211N, K238R, V245E  
10MYKJ075 10MYKJ075 None None   V35I, V60I, T107S, K122E, D123S, S162C, K173N, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211N, K238R, V245E, V276I, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V, E297K  
10MYKJ076 10MYKJ076 None None   D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E, K249Q, T286A, I293V  
10MYKJ079 10MYKJ079 None None   V35T, T39K, K43D, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179A, Q207A, R211N, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ081 10MYKJ081 None None   K20R, V35I, K43KR, K122E, D123S, I135R, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200TA, Q207A, R211N, K238R, V245E  
10MYKJ085 10MYKJ085 None None  A98AG K32N, V35I, T107TS, K122E, D123N, I135K, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245E  
10MYKJ086 10MYKJ086 None None   K122E, D123S, I135K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
10MYKJ090 10MYKJ090 None None   K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ092 10MYKJ092 None None   E6K, S68G, W88S, K122E, D123N, I135R, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211Q, K238R, V245E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ095 10MYKJ095 None None   W88C, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, K275R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294S  
10MYKJ096 10MYKJ096 None None   K122E, D123S, I135R, K173IV, Q174K, D177E, I202V, Q207V, R211N, K238R, V245E, V292I, I293V, P294T  
10MYKJ097 10MYKJ097 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, A158AS, T165TI, K166KR, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214FL, K238R, V245E, K275Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ099 10MYKJ099 None None   V35I, S68G, T69N, K122E, K173I, Q174K, T200A, Q207A, R211K, K238R, V245Q, A272P, K275R, K277T, E291N, V292I, I293V  
10MYKJ101 10MYKJ101 None None   E40ED, V60I, T107S, K122E, D123X, I135IV, E169ED, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211N, V245E  
10MYKJ104 10MYKJ104 None None  K103N M16T, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178L, V179I, T200I, Q207A, R211N, K238R, V245E, A272V, T286A  
10MYKJ105 10MYKJ105 None None   K32R, A98S, K101Q, K122E, I135R, S162A, K173T, Q174N, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
10MYKJ108 10MYKJ108 None None   S48T, V60I, V90I, K122E, D123S, R125K, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ111 10MYKJ111 None None   K20R, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, E194EK, Q207A, R211S, K238R, V245E  
10MYKJ112 10MYKJ112 None None   K122E, D123N, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211N, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ113 10MYKJ113 None None   K20R, V35I, D86E, K122E, D123S, I135R, S162A, K173V, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ114 10MYKJ114 None None   V21I, V35I, K122E, D123S, I135T, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
10MYKJ115 10MYKJ115 None None   V35M, T39A, V111I, K122E, I135V, F214FL  
10MYKJ117 10MYKJ117 None None L210W  K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
10MYKJ118 10MYKJ118 None None   E29G, K122E, D123S, T139A, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211K, K238R, V245E, T286A, E291D, I293V  
10MYKJ119 10MYKJ119 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162SG, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, V245N, T286A, E291D, V292I, I293V  
MY1AK691 MY1AK691 Unknown Unknown   V60I, A98S, K122E, D123S, I135K, K173I, Q174K, D177E, I178M, R206K, Q207A, R211N, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
MY1AN661 MY1AN661 None None  K103N V35VI, T39TA, V60I, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, Q207A, R211S, V245E, V276I, E291D, V292I, I293V  
MY1BK591 MY1BK591 None None   K101Q, K122E, D123S, I135K, I159IV, T165TI, E169ED, K173IR, Q174K, D177E, Q207A, R211H, K238R, V245K, T286A, E291D, V292I, I293V  
MY1CY622 MY1CY622 None None   K20R, T39TA, I135V, S162C, R211K, V245VM, K277R, Q278E, T286A, E297K  
MY1IM781 MY1IM781 None None   K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V189VI, T200IM, R211M, V245N, K277R, Q278E, T286A  
MY1JJ741 MY1JJ741 None None   V35I, R83K, A98S, K122E, D123N, I135R, K173I, Q174K, D177E, R211S, V245M, K275R, T286A, E291D, V292I, I293V  
MY1KN751 MY1KN751 None None   V35I, R83K, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245E, T286A, E291D, I293V  
MY1LS562 MY1LS562 None None   K11Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, E204K, Q207A, R211N, K238R, V245E, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V  
MY1MN571 MY1MN571 None None   V35I, K122E, D123S, I135T, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
MY1MS671 MY1MS671 None None   V35I, K122E, D123S, I135K, K173I, Q174K, D177E, I178M, V189I, Q207A, R211N, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
MY1MS761 MY1MS761 None None   K122KE, D123N, I135L, S162H, K173KR, T200A, E204D, Q207E, I244V, V245M, E248D, K277R, Q278E, T286A  
MY1MS771 MY1MS771 None None   V35I, K64R, K122E, D123S, I135V, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211N, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
MY1NM641 MY1NM641 None None   V35I, D121DN, K122E, D123N, R125RK, I135KR, R143RK, E169EK, R172RK, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211N, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
MY1SA791 MY1SA791 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, M41I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, V245K, A272T, T286A, I293V  
MY1SH721 MY1SH721 None None   E6N, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, I135K, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211N, K238R, T240A, V245E, T286A, E291D, V292I  
MY1YC672 MY1YC672 None None   V60I, K122E, D123S, I135T, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, R211S, V245M, E291D, I293V I167IT 
MY1ZK731 MY1ZK731 None None   K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K277R, Q278E, T286A  
MY1ZN751 MY1ZN751 None None   V35I, K102R, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211N, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V V276VL 
MY2KA791 MY2KA791 None None   E6D, D17N, V21I, V35T, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, I135T, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, I195V, T200I, E203K, Q207A, R211N, K238R, V245K, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
MY3HA741 MY3HA741 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211K, K238R, V245K, T286A, E291D, V292I, I293V  
MYKJ007 MYKJ007 None None   E6D, K11A, V35T, A98AS, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177DE, G196GE, Q207A, R211S, V245E, K275R, T286A, E291D, V292I, I293V  
MYKJ033 MYKJ033 None None   V35I, K102KQ, K122E, D123S, A158S, S162C, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
MYKJ052 MYKJ052 None None   K11KT, K122E, D123S, I135R, I142IV, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, V189I, T200A, R211S, K238R, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V  
MYKJ107 MYKJ107 None None   K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245E  
MYKJ109 MYKJ109 None None   W88C, K122E, D123N, I135R, S162H, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245E, E248EK  

Database

Resources

Team