Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Jahanbakhsh (2012)
Title Prevalence of transmitted HIV drug resistance in Iran between 2010 and 2011.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 47
NumPts 47
Subtype CRF35_AD, CRF01_AE, B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
KSH21 KSH21PRRT None None   E6D, K11R, V35IT, T39TK, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142IV, D177E, V179I, Q207A, L210E, R211K  
KSH22 KSH22PRRT None None   E6D, K11R, V35T, V60I, K101KR, D121Y, K122E, I135IT, R143RK, K166KR, E169EK, R172RK, D177EK, I178IV, V179I, R199RK, T200V, Q207A, R211K N54ND 
KSH24 KSH24PRRT None None   E6D, V21VI, V35IT, V60I, D121Y, K122E, I135T, Q174QH, D177EK, V179I, T200I, Q207AD, R211K  
KSH25 KSH25PRRT None None K219Q  E6D, V35T, E40A, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, G196R, R199K, T200I, Q207A, R211K, F214FL Q91QR 
KSH26 KSH26PRRT None None   E6D, K11KQ, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162C, D177E, Q197K, T200I, E203D, Q207A, R211K, F214L  
KSH28 KSH28PRRT None None   K11R, V35T, K43R, V60I, D121Y, K122E, I135KR, D177E, V179I, Q207A, R211K  
KSH29 KSH29PRRT None None   E6D, K11X, V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, K166R, D177E, T200TI, Q207A, R211K  
KSH30 KSH30PRRT None None   E6D, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135IR, V179I, Q207A, R211K  
KSH31 KSH31PRRT None None   E6D, V8I, V21VI, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135R, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207D, R211K  
SYZ27 SYZ27PRRT None None   E6A, K11R, E28ED, V35T, E40D, V60I, K122E, I142IT, D177E, V179VI, V189VI, T200I, Q207A, R211K  
SYZ32 SYZ32PRRT None None  E138A E6D, K11R, V35T, V60VI, D121Y, K122E, D123DE, I135T, K166R, D177E, T200I, Q207A, R211K, F214FL  
SYZ33 SYZ33PRRT None None   E6D, K11R, V35I, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, K166R, D177E, V179I, T200I, Q207A  
SYZ34 SYZ34PRRT None None   E6D, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
SYZ35 SYZ35PRRT None None   E6D, K11R, V35T, T39A, K49R, V60I, S68T, I135T, K166KR, D177E, I178L, V179I, T200IL, Q207A, R211K  
SYZ36 SYZ36PRRT None None   E6D, K11KR, V35T, V60I, D121H, K122EV, D123X, I135T, K173EQ, D177EG, I178IL, V179VI, T200V, E204EK, Q207A, R211K  
SYZ37 SYZ37PRRT None None   E6D, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135R, D177E, V179T, T200I, Q207A, R211K  
SYZ38 SYZ38PRRT None None   E6D, V8VI, K11R, I31L, V35IMT, T39A, I50T, V60I, D121Y, K122E, D123E, D177E, V179I, T200TI, Q207A, R211K  
SYZ40 SYZ40PRRT None None  E138A E6D, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, D123DA, I135T, T139A, D177E, I178L, V179I, T200I, Q207A, R211K, F214L  
THR01 THR01PRRT None None  E138EQ E6D, V8I, K11RS, V35T, T39IM, V60I, D121Y, K122E, I135IR, Q174N, D177E, V179VI, Q207A, R211K, F214FL  
THR02 THR02PRRT None None   E6D, V8I, K11R, V21I, V35T, E40D, V60I, K122E, I135R, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
THR03 THR03PRRT None None   E6D, V8I, K11R, V21I, V35T, V60I, K122E, I135T, S163SG, D177E, G196R, T200I, Q207A, R211K  
THR04 THR04PRRT None None   V8I, V35T, S48SL, V60I, D121H, K122E, I135R, Q174H, D177E, V179I, E204EK, L205LF, Q207A, R211K W71W* 
THR05 THR05PRRT None None   E6D, K11KR, V35T, T39IM, V60I, K122E, D123DN, I135KR, Q174H, D177E, V179I, E204EK, Q207A, R211K V8IM 
THR06 THR06PRRT None None   E6D, V8I, K11R, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135K, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
THR07 THR07PRRT None None   E6D, K11KR, V35T, V60I, D121DY, K122E, D123DE, Q174HN, D177E, V179I, T200TI, Q207A, R211Q  
THR08 THR08PRRT None None   E6D, T7TS, K11R, V35X, V60I, D121H, K122E, I135R, D177E, I178IM, V179VI, T200I, Q207A, R211K  
THR09 THR09PRRT None None   V35T, E36ED, T39TA, E42EK, V60I, D121H, K122E, I135R, D177E, V179I, T200I, I202IV, Q207AT, R211K  
THR10 THR10PRRT None None   E6D, V8I, K11R, V35T, E40D, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135R, Q174N, D177G, V179I, T200I, Q207A, R211K  
THR11 THR11PRRT None None   E6D, V8I, K11R, T27S, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135R, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
THR12 THR12PRRT None None   E6D, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, T139I, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
THR13 THR13PRRT None None   E6D, V8I, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135R, Q174N, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
THR14 THR14PRRT None None   E6D, V8I, V35T, K43R, K49R, V60I, D121H, K122E, I135K, K166R, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
THR15 THR15PRRT None None   E6D, K11R, V35T, T39L, K49R, V60I, K64KR, D121H, K122E, I135T, S162C, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K L26LS 
THR17 THR17PRRT None None   E6D, K20R, V35I, V60I, K101R, D121X, K122E, I135T, S162A, D177E, V179I, T200I, Q207D, R211K  
THR18 THR18PRRT None None   E6D, V8I, K11R, V35T, T39A, E40D, V60I, K101R, D121H, K122E, I135R, K166R, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
THR19 THR19PRRT None None   E6D, V8VI, V35T, V60I, D121H, K122E, I135KR, S162X, K166KR, Q174N, D177E, V179I, T200TA, Q207A, R211K  
THR20 THR20PRRT None None   E6D, V35T, V60I, D121HY, K122E, E169EK, D177E, V179I, E194ED, T200TI, Q207D, R211K  
THR41 THR41PRRT None None   E6D, V8I, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135R, Q174H, D177E, V179I, T200TI, Q207A, R211K  
THR42 THR42PRRT None None   E6D, V8I, V35T, T39A, E40D, V60I, K101R, D121H, K122E, I135R, Q174N, V179I, T200I, Q207A, R211K  
THR43 THR43PRRT None None   V35I, T39TS, V60I, D121Y, K122E, I135R, D177E, V179I, T200TI, Q207A, R211K  
THR44 THR44PRRT None None   E6D, V8I, V35T, T39L, V60I, D121Y, K122E, I135R, Q174HN, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
THR46 THR46PRRT None None   V35I, V90VI, K122E, D123N, I135T, R211K  
THR47 THR47PRRT None None A62AV  E6D, V8I, V35I, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135R, Q174H, D177E, V179I, Q207A, R211K  
THR48 THR48PRRT None None   E6D, K11T, V21VI, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, T139K, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q182H, Q207A, R211N, F214L  
THR49 THR49PRRT None None   E6D, V8I, K11R, V35T, V60I, K122E, I135R, A158AS, S162SC, Q174N, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
THR50 THR50PRRT None None   E6D, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135R, K166R, Q174H, D177E, V179I, T200E, Q207T, R211K  
THR51 THR51PRRT None None T215D  E6D, K11R, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, S162C, D177DE, V179I, I195L, T200I, Q207A, R211K  

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