Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author McColl (2010)
Title Strand transfer inhibitors of HIV-1 integrase: Bringing IN a new era of antiretroviral therapy.
Citation Antiviral Res
SelectedGene IN
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Lab
NumIsolates 32
Lab Parent Strain HXB2, NL43

 

Lab IN Isolates : Susceptibility Data


IsolateINIMajorDRMsINIMinorDRMsMethodDrugFold Res.
138K E138K  PhenoSense EVG 0.7 
     PhenoSense RAL 0.9 
138K,147G+1 E138K, S147G, Q148R D232N PhenoSense EVG 154 
      PhenoSense RAL 34 
138K-147G+1 E138K, S147G, Q148R  PhenoSense EVG 175 
     PhenoSense RAL 34 
140S G140S  PhenoSense EVG 5.0 
     PhenoSense RAL 2.0 
140S,148H G140S, Q148H D232N PhenoSense EVG >1,000 
      PhenoSense RAL >1,000 
140S-148H G140S, Q148H  PhenoSense EVG >1,000 
     PhenoSense RAL >1,000 
147G S147G  PhenoSense EVG 8.0 
     PhenoSense RAL 1.0 
148H Q148H  PhenoSense EVG 6.4 
     PhenoSense RAL 20 
148K Q148K  PhenoSense EVG 67 
     PhenoSense RAL 34 
148R Q148R  PhenoSense EVG 118 
     PhenoSense RAL 30 
148R,155H Q148R, N155H D232N PhenoSense EVG 229 
      PhenoSense RAL 102 
155H N155H  PhenoSense EVG 38 
     PhenoSense RAL 23 
66I T66I  PhenoSense EVG 15 
     PhenoSense RAL 1.4 
66I-147G T66I, S147G  PhenoSense EVG 46 
     PhenoSense RAL 2.5 
66I-92Q T66I, E92Q  PhenoSense EVG 145 
     PhenoSense RAL 33 
92Q-155H E92Q, N155H  PhenoSense EVG 166 
     PhenoSense RAL 135 
E138K E138K D232N PhenoSense EVG 0.6 
      PhenoSense RAL 0.9 
E92Q E92Q D232N PhenoSense EVG 40 
      PhenoSense RAL 6.0 
E92Q,N155H E92Q, N155H D232N PhenoSense EVG 125 
      PhenoSense RAL 105 
G140S G140S D232N PhenoSense EVG 4.0 
      PhenoSense RAL 1.6 
IE92Q E92Q  PhenoSense EVG 33 
     PhenoSense RAL 6.0 
L68I  D232N PhenoSense EVG 0.9 
     PhenoSense RAL 0.9 
L68I,E92Q E92Q D232N PhenoSense EVG 43 
      PhenoSense RAL 7.6 
L68V  D232N PhenoSense EVG 1.6 
     PhenoSense RAL 1.0 
L68V,E92Q E92Q D232N PhenoSense EVG 67 
      PhenoSense RAL 14 
L68V,N155H N155H D232N PhenoSense EVG 51 
      PhenoSense RAL 24 
L68V,Q148R Q148R D232N PhenoSense EVG 139 
      PhenoSense RAL 53 
N155H N155H D232N PhenoSense EVG 36 
      PhenoSense RAL 21 
Q148H Q148H D232N PhenoSense EVG 5.3 
      PhenoSense RAL 18 
Q148K Q148K D232N PhenoSense EVG 50 
      PhenoSense RAL 27 
Q148R Q148R D232N PhenoSense EVG 109 
      PhenoSense RAL 35 
S147G S147G D232N PhenoSense EVG 9.4 
      PhenoSense RAL 1.0