Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Castro (2010)
Title HIV-1 drug resistance transmission networks in southwest Switzerland.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 30
NumPts 30
Subtype B, CRF02_AG, F, G, A, G + J, CRF01_AE, D, CRF11_cpx

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
PHI-1 PHI-1 None None   D123G, S162A, D177E, F214L, Q242X, V245K  
PHI-10 PHI-10 None None   A98S, I135T, S162C, I178V, Q242X, V245E  
PHI-11 PHI-11 None None   E6D, V35T, T39A, E40D, K49R, I135T, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L, Q242X, V245Q, E248N, D250E  
PHI-12 PHI-12 None None   K49R, K104R, R211T, Q242X  
PHI-13 PHI-13 None None   K49R, R211K, Q242X  
PHI-14 PHI-14 None None   T27S, V35T, V60I, K122E, I135L, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211E, Q242X, V245Q  
PHI-15 PHI-15 None None M41L, M184V, T215Y K103N V35T, K49R, V60I, K122E, I135V, I142V, T165I, D177E, I178M, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E  
PHI-16 PHI-16 None None   V35T, D177E, I178M, V179I, R211K, D237N, P243A, V245K  
PHI-17 PHI-17 None None   I178M, T200A, Q207G, Q242X  
PHI-18 PHI-18 None None   K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, V245K  
PHI-19 PHI-19 None None   A98S, D123E, Q174K, V179I, R211K  
PHI-2 PHI-2 None None  K103N V35I, E40D, K49R, I63X, D123E, I135L, S162C, E169D, K173T, Q174K, D177E, I178L, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
PHI-20 PHI-20 None None   V35T, T39A, E40D, I132V, I135V, S162A, K173T, Q174R, N175H, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211K, F214L, Q242X, V245Q C38CW 
PHI-21 PHI-21 None None   V35I, A98S, K102Q, D123E, I135T, S162C, E224D  
PHI-22 PHI-22 None None  K103N V35I, E40D, K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173T, Q174K, D177E, I178L, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
PHI-23 PHI-23 None None   V21I, V35T, T39S, V60I, I135V, K173T, Q174N, D177E, G196E, T200A, I202V, P243Q, V245Q, D250E  
PHI-24 PHI-24 None None   T27S, V35T, T39A, V60I, S68G, K104R, K122E, D123N, I135T, K173T, Q174R, D177E, I178M, V189I, I195T, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D, D250E  
PHI-25 PHI-25 None None   E6D, V35T, T39A, K49R, D123E, I135T, E169D, K173AT, Q174QK, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207QK, R211K, F214L, V245Q, E248DN, D250E, Y271F, A272P, I293V, E297A, A304AE, K311KR, S322E, D324E, G335E, I341V, F346Y, R356K, M357R, R358G, G359S, K366R, T369V, A371V, I375V, A376AS, T386I, Q394R, A400V E40N 
PHI-26 PHI-26 None None   V35T, K103R, S105A, D123E, S162C, R211G, E248D, A272P, K277R, T286A, A288S, L301M, S322T, I329L, G333E, P345Q, M357T, A400T  
PHI-27 PHI-27 None None   V35T, K103R, S105A, D123E, S162C, R211G, W212WG, E248D, A272P, K277R, T286A, A288S, L301M, S322T, I329L, G333E, P345Q, M357T, A400T  
PHI-28 PHI-28 None None T215E  V35T, E36A, K122E, I135M, S162C, F171Y, Q207E, I244V, E248V, A272P, I293V, I329V, F346Y, A400T W337WG 
PHI-29 PHI-29 None None L210W, T215L K103N, E138G, K238T V35M, T39A, R83K, K101Q, I142T, T165L, T200S, I202V, Q207E, A272P, K277R, R358K, G359S, K366R, A376T, K390R, E399D, A400I  
PHI-3 PHI-3 None None  K103N V35I, E40D, K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
PHI-30 PHI-30 None None   D123E, I135IT, D177E, R211K, I293V, S322ST, I326IV, A327AV, Q334X, G359S, T377M, I382IV, T386AV, K390KR, E399D, A400L  
PHI-4 PHI-4 None None   P14T, V35T, E40D, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211S, F214L, V245Q  
PHI-5 PHI-5 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, Q242X, V245E, E248D  
PHI-6 PHI-6 None None   R83K, I178V, E204ED, R211RK, V245M, K249Q  
PHI-7 PHI-7 None None   T27S, V35T, V60I, K122E, I135L, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211E, Q242X, V245Q  
PHI-8 PHI-8 None None   D123E, S162C, V245Q  
PHI-9 PHI-9 None None   D123E, S162C, V245Q  

Database

Resources

Team