Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Alencar (2013)
Title HIV genotypes and primary drug resistance among HIV seropositive blood donors in Brazil: Role of infected blood donors as sentinel populations for molecular surveillance of HIV.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 300
NumPts 300
Subtype B, F, C, D, CRF47_BF, CRF45_cpx

 
  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 300 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
MG2-0003 MG2-0003 None None   V21I, V35T, T39L, V60I, D123N, I135V, S162C, K173A, Q174K, T200A, Q207D, R211K  
MG2-0004 MG2-0004 None None   K20R, V35T, T39M, K122E, I135L, S162C, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L  
MG2-0005 MG2-0005 None None   K122E, I135T, I142V, R211S, F214L, V245M  
MG2-0006 MG2-0006 None None   K20R, K49R, I135V, T165I, E169D, Q207K  
MG2-0007 MG2-0007 None None   K11Q, V35I, S48T, K122E, D123N, I135V, S162C, Q174R, R211K  
MG2-0008 MG2-0008 None None   V35T, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, T200A, Q207S, R211K  
MG2-0009 MG2-0009 None None   K122V, I142V, I178L, I202V, R211S, V245M  
MG2-0010 MG2-0010 None None   E6D, V8VI, V35T, E40D, K49R, V60I, D123E, I135T, I142V, E169D, K173T, Q174K, V179T, T200A, Q207K, R211Q  
MG2-0011 MG2-0011 None None   V35T, R72RK, D123E, I135T, D177E, I178V, E194EK, Q207E, R211RK  
MG2-0012 MG2-0012 None None   K20R, I202V, E204D  
MG2-0013 MG2-0013 None None   I135T, I178IM, T200TA, R211K  
MG2-0014 MG2-0014 None None   K122E, I135T, I142V, D177DE, I202V, R211S  
MG2-0015 MG2-0015 None None   E6D, S68G, K102KQ, K122P, D177E, I178L, E224EK  
MG2-0016 MG2-0016 None None  K101E, E138G, G190S E6D, D123E, I135T, T200A, E204N, R211K  
MG2-0017 MG2-0017 None None   K20R, V21I, V35I, T39A, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214FL  
MG2-0018 MG2-0018 None None   K49R, S68G, I135T, T165I, E204Q, Q207A, R211K  
MG2-0020 MG2-0020 None None   V60I, I142V, T200V, R211K, G231V  
PE2-0001 PE2-0001 None None   V35I, R83K, D123E, I135R, I202V, R211K  
PE2-0002 PE2-0002 None None   V35T, K49R, I135V, S162C, E169D, K173I, Q174K, T200I, Q207G, R211K  
PE2-0003 PE2-0003 None None   E29EK, V60I, K122E, D123N, I135V, I142V, R211K, D250E  
PE2-0004 PE2-0004 None None   P4S, V35T, T39A, I135V, S162C, K173T, Q174R, I178M, T200A, Q207E, R211K  
PE2-0005 PE2-0005 None None  E138A D17E, K20R, T165I, Q174K, R211K, F214L  
PE2-0006 PE2-0006 None None   K20R, D123E, I135T, T165I, K173R, G196E, T200TP, E204Q, R211K, V245T, E248D  
PE2-0007 PE2-0007 None None   S68G, K122E, I135T, S162N, I195IV, Q207E, R211K  
PE2-0008 PE2-0008 None None  V106I V35T, E40D, V118I, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L  
PE2-0009 PE2-0009 None None   E6EK, V35T, K49R, E53EK, K122E, D123E, S162C, F171Y, K173A, Q174K, I178M, D192DN, E194EK, T200A, Q207A, R211T  
PE2-0010 PE2-0010 None None   E6D, D123E, I178M, T200A, E204N, R211K  
PE2-0012 PE2-0012 None None   K122E, I135T, K173N, Q174K, R211K  
PE2-0013 PE2-0013 None None   K20R, D123E, I135T, S162C, Q174H, G196E, R211G  
PE2-0014 PE2-0014 None None M41L, L210W, T215E L100I, K103N E6EK, K11KR, V35I, K43E, E44A, S68SG, W88C, V118I, K122E, T139K, S162A, D177E, V179I, Q207E, R211K, L228LH  
PE2-0015 PE2-0015 None None   K32N, I135R, G196E, Q207A, V245K  
PE2-0017 PE2-0017 None None  K103N K20R, V35VI, K64R, A98S, I135T, S162SN, K173R, G196E, R211K  
PE2-0018 PE2-0018 None None   K173E, N175H, T200A, Q207E, V245Q  
PE2-0019 PE2-0019 None None  V106I D123E, I135T, S162C, D177E, V189I, R211Q  
PE2-0020 PE2-0020 None None   K20R, I135T, I178ILM, G196E, R211K, V245T, E248D  
PE2-0021 PE2-0021 None None   I50V, K122E, I142V, S162C, E169D, D177E, I178L, G196E, Q197H, V245Q  
PE2-0022 PE2-0022 None None   K20R, K122E, I135T, S162Y, V245M  
PE2-0023 PE2-0023 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K166R, Q174QR, D177E, T200A, Q207E, R211Q  
PE2-0024 PE2-0024 None None  V179E S48T, V60I, T107TS, I135V, S162SN, Q174K, D177E, T200A, F214X  
PE2-0026 PE2-0026 None None   V35T, T39R, K49R, V60I, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207E, R211K  
PE2-0027 PE2-0027 None None   K43KR, K122E, D123N, I135V, I142T, Q197R, I202V, R211K, D250E  
PE2-0028 PE2-0028 None None   K122E, D123E, I135R, S162DN, I180V, G196E, Q207A  
PE2-0029 PE2-0029 None None  V179D D123N, I135T, K201R, I202V, R211K, F214L  
PE2-0033 PE2-0033 None None   K166KR, E169ED, Q174H, D177E, Q207E, R211K  
PE2-0038 PE2-0038 None None  K101E, E138K E6X, R83K, K122E, I142IT, S162A, I202V  
PE2-0039 PE2-0039 None None   S68G, T69N, D123DE, I135T, S162C, Q174QR, I178IM, T200A, E204ED, R211RK  
RJ2-0001 RJ2-0001 None None   K20R, D121H, I135T, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211K, K223KE, K238S  
RJ2-0002 RJ2-0002 None None   K43N, D121Y, K122E, D123E, I142V, S162C, D177E, R211K, V245E  
RJ2-0003 RJ2-0003 None None   K122E, I135T, V189I, I202V, R211K, V245T, D250E  
RJ2-0004 RJ2-0004 None None   K49R, K122E, I135T, A158S, E169D, D177E, I202V, V245H, D250E N255M 
RJ2-0005 RJ2-0005 None None   V60I, D177E, I178M, G196E, T200A, R211T, V245M  
RJ2-0006 RJ2-0006 None None  E138A G45E, K101Q, I142V, S162C, Q174R, D177E, V179I, T200A, Q207E, V245K  
RJ2-0007 RJ2-0007 None None   V35T, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, I178M, G196E, T200A, Q207G, R211K, V245Q, V254X  
RJ2-0008 RJ2-0008 None None   V35I, K43R, K122E, I135T, I142V, S162Y, I202V, R211K, E224X, P225T, E248D  
RJ2-0009 RJ2-0009 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
RJ2-0010 RJ2-0010 None None   K49R, V245M  
RJ2-0012 RJ2-0012 None None  V179D E169D, D177N, G196D, I202V, V245M, E248N E79EQ 
RJ2-0013 RJ2-0013 None None   V35T, T39I, K102R, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207T, R211K  
RJ2-0014 RJ2-0014 None None   V35T, T39I, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207N, R211K K223M 
RJ2-0015 RJ2-0015 None None   V35T, T39L, D123E, I135T, S162C, E169D, K173T, T200A, I202V, Q207K, R211S, F214X, K223X  
RJ2-0019 RJ2-0019 None None A62V  I135T, K166R, Q174H, R211N  
RJ2-0020 RJ2-0020 None None   V35I, R83K, V245K  
RJ2-0021 RJ2-0021 None None   K20R, V35E, T39A, I135V, Q174E, I178M, T200M, Q207E, R211K, V245K  
RJ2-0022 RJ2-0022 None None   K104R, K122E, I142V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200R, Q207E, R211K  
RJ2-0023 RJ2-0023 None None   V35T, K101R, D123E, A158T, S162C, E169D, K173A, Q174R, I178L, T200A, Q207N, R211K  
RJ2-0024 RJ2-0024 None None   S68G, T69N, K122KE, D123DN, I135T, S162C, T200A, E204D  
RJ2-0025 RJ2-0025 None None  E138A T39A, S68G, K122E, D123G, I135T, T200I, F214L  
RJ2-0029 RJ2-0029 None None   P14PT, K20R, K49R, A98S, K102Q, E169D, K173T, Q174K, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D  
RJ2-0030 RJ2-0030 None None   K20R, K104N, E194K, G196E, T200A, Q207R, V245T, K277R, V292I, I293V, E297A G213S 
RJ2-0031 RJ2-0031 None None   D86E, D123E, A158AP, I180V, R211K  
RJ2-0032 RJ2-0032 None None   D123E, I135T, G196E, Q197K  
RJ2-0033 RJ2-0033 None None   D123E, I135T, K173Q, I180V, I195K, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
RJ2-0034 RJ2-0034 None None   K122E, I135T, Q197L, Q207E, R211K, V245I  
RJ2-0036 RJ2-0036 None None   V35T, I135V, I142IT, S162C, E169D, Q174K, T200A, Q207E, R211RS  
RJ2-0037 RJ2-0037 None None   V35T, T39TI, V60I, K122V, I135L, S162H, K173T, Q174K, D177E, T200TA, R211K  
RJ2-0038 RJ2-0038 None None   V60I, I135V, I142V, S162A, R211K, F214X  
RJ2-0039 RJ2-0039 None None   E6D, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, I135T, K173A, D177G, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
RJ2-0050 RJ2-0050 None None   V35L, K102Q, D121H, K122E, I142L, D177E, I178M, T200A H208Q 
RJ20018 RJ20018 None None   V21I, K122E, D123N, I135T, S162C, D177E, I178L, T200S, R211K  
SP2-0002 SP2-0002 None None   K102Q, S162C, D177N, I178M  
SP2-0003 SP2-0003 None None   V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, K166KR, I178L, R211K, V245M  
SP2-0004 SP2-0004 None None T69D  K49R, S68G, I135T, S162C, D177E, R211Q  
SP2-0005 SP2-0005 None None  K103N, E138A, K238T P4T, E6A, V90I, K101Q, V118I, K122E, I135T, I142T, Q174K, T200A, I202V, R211K, F214L  
SP2-0006 SP2-0006 None None   K20R, V35T, K122E, I135T, I142L, Y144F, E169D, K173R, V245M  
SP2-0008 SP2-0008 None None   K20R, D123E, D177E, I178M, R211K, W239R, V245K  
SP2-0009 SP2-0009 None None   V60I, I135T, S162A, E169D, Q174K, F214L, V245M  
SP2-0010 SP2-0010 None None   K49R, E53D, T200M, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D  
SP2-0011 SP2-0011 None None   E28A, V35T, E40D, V60I, K102Q, K104E, D121H, K122E, I135T, S162A, E169D, Q174K, D177E, E194K, R211K, F214L  
SP2-0012 SP2-0012 None None   K122E, S162C  
SP2-0013 SP2-0013 None None   K20R, S162N, Q174L, I178M, E194G, G196E, R211K, F214L, T240S, V245K  
SP2-0015 SP2-0015 None None  K103N D123E, I135T, S162C, K173KR, I178M, T200A, Q207E, R211K  
SP2-0016 SP2-0016 None None   I135T, K166KR, K173KE, T200IV, R211K, F214L  
SP2-0017 SP2-0017 None None   V35T, S68G, V90I, K122E, D123N, I135T, T200I, D237N, V245M  
SP2-0019 SP2-0019 None None   K43R, I50V, S68G, D177G, Q207K, R211K  
SP2-0021 SP2-0021 None None   K49R, D121C, K122E, D123E, I135T, K166Q, E169D, D177E, G196E, T200A  
SP2-0022 SP2-0022 None None   I142M, G196E, V245K  
SP2-0023 SP2-0023 None None   V35T, T39E, S48T, D121DH, K122E, D123X, I135R, K173A, Q174KR, D177E, T200A, Q207E, R211K  
SP2-0024 SP2-0024 None None  K103N, V108I V90I, A98S, I135IT, R172K, K173R, Q207QR, R211K  
SP2-0025 SP2-0025 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, K173A, T200A, E204EK, Q207E, R211K, F214L  
SP2-007 SP2-007 None None   V35I, V60I, S68G, K122E, I135T, A158S, K166R, K173A, Q207E, V245E  

Database

Resources

Team