Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Tramuto (2013)
Title Dynamics and molecular evolution of HIV-1 strains in Sicily among antiretroviral naive patients.
Citation Infect Genet Evol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 155
NumPts 155
Subtype B, CRF02_AG, C, G, F, CRF12_BF, A, CRF60_BC, CRF01_AE

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 155 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1007_87 1007_87 None None   K122KE, I135V, S162C, K173KR, Q197QH, Q207A, R211K, A272P, I293V, I326V, Q334R  
1012_88 1012_88 None None   A98S, D123E, I135T, S162A, K166R, I178L, Q197E, A272P, K277R, I293V  
1024_97 1024_97 None None   E6K, K122E, D123E, I142IV, S162C, G196E, T200A, I202V, L210LS, R211G, A272P, V276T, K277R, L283LI, P294T, E297R, G333D  
1042_113 1042_113 None None   I178V, R211K, F214L, V245EK, K281KR, T286TA, I293V, E297A, Q334E  
1045_114 1045_114 None None L210W, T215C  K20R, V35I, S48T, V60I, S68G, D121H, K122E, I135T, D177E, R211K, V245K, V276T, Q278E, P294Q, L310I  
1046_54 1046_54 None None   K32R, V35M, T69X, A98S, K102KQ, K122KE, R211K, F214L, A272P, K277KR, K281KR, L283I, I293V, E297Q, G333E, Q334C  
1054_124 1054_124 None None T215S  K20R, T27S, K32N, V35L, S48E, I135R, P176T, T200A, I202V, F214L, V276VI, K277KR, Q278E, I293V, P294Q, E298A, K311R  
1056_127 1056_127 None None   K122E, I135T, I142T, K166R, I178M, R211Q, V276VI, K277KR, L283LF, T286A, V292I, D324E  
1068_133 1068_133 None None T215S  K20R, T27S, K32N, V35L, S48E, I135R, P176T, T200A, I202V, F214L, Q278E, I293V, P294Q, E298A, K311R, Q334L  
1072_132 1072_132 None None   K49R, V60I, I135V, I142V, K166R, T200TI, I293V, K311R  
1073_130 1073_130 None None   V35I, K49R, V60I, R83K, I135R, I178M, A272AS, T286A, I329V, Q334E  
1075_2 1075_2 None None   V35R, K101R, K122E, D123DE, I135T, S162C, R211K, V245T, A272P, K277R, Q278H, T286A, T296S, E297R, I329L  
1076_3 1076_3 None None   K49R, S68T, I135T, I178L, V179I, G196E, E204K, T286A, I293V, P313T, I329L  
1080_12 1080_12 None None M41L, T215D  V35M, T39A, D121Y, K122E, D177E, T200A, H208HY, L210LF, R211K, A288S, V292I, I293V, E297A  
1088_30 1088_30 None None   E6ED, D123E, I142V, S162C, T200TI, L210LF, R211K, A272P, K277R, K281R, T286P, I293V, E297K, D324E, A327V  
1091_31 1091_31 None None   V35I, R83K, D123E, I135T, S162C, D177E, Q207QR, R211X, V245M, A272P, K277R, V317VA, I326V, Q334L  
1092_33 1092_33 None None   K11R, K104R, D123E, T139TA, I142IV, V245KT, K249Q, K277R, E297K, P313T, I329V  
1103_52 1103_52 None None   V35T, E36D, K49KR, V60I, V118VI, I135V, Q145C, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, V245Q, T286TA, E291D, V292I, I293V, P294T, E312T, S322T, I326V  
1104_53 1104_53 None None   V35T, E36D, K49R, V60I, I135V, Q145C, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312T, S322T, I326V  
1108_67 1108_67 None None   V35I, R83K, K102KQ, K122KE, D123E, I135V, K166R, T200TI, I202V, R211K, A272P, L283I, T286TA, I293V  
1112_69 1112_69 None None   V21I, V35T, T39E, K102KM, K104KR, K122E, D123X, I135T, A158S, K173A, Q174K, D177DEG, G196E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I  
1114_81 1114_81 None None   V35T, E36D, K43KR, V60I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178IV, T200A, Q207E, R211RK, L228LH, V245Q, E248D, D250E, A272G, L283I, T286V, V292I, I293V, P294T, S322T, I326IV  
1116_80 1116_80 None None  E138EAV E6D, D123E, T139TA, I142IM, T200TI, F214L, A272P, K281R, I293IV, E297KQ  
1122_87 1122_87 None None   E6D, D123E, T139TA, I142IV, S162C, R211K, A272P, K277R, K281R, T286P, I293V, E297K, D324E, A327V  
1123_89 1123_89 None None   A98S, K122KE, R211K, V245X, S251SI, I293V  
1124_90 1124_90 None None   A98S, R211K, V245K, S251I, I293V  
1129_95 1129_95 None None   K20R, K122E, K173X, Q174GR, I202V, Q207E, R211K, F214L, E248N, A272P, I293V, K311R, I326V, Q334L  
1132_97 1132_97 None None  G190A K20R, S48T, T69NS, K101A, D123E, I135R, V179A, R211K, F214L, A272P, K277KR, K281R, I293V, P294T, E297K  
1133_98 1133_98 None None  G190A K20R, S48E, T69N, K101A, D123E, K173E, V179I, R211K, F214L, A272P, K277R, K281R, I293V, P294T, E297K, I326IT  
1136_102 1136_102 None None T215S  K20R, T27S, K32N, V35IL, S48E, V60I, K122KR, D123DN, I135R, T200A, I202V, F214L, K277R, Q278E, I293V, P294Q, E298A, K311R P176G 
1137_104 1137_104 None None  K103N D123E, D177E, R211K, V245Q, K277R, I293V, I326V, Q334L  
1141_119 1141_119 None None  V106VI, E138A V35IT, V60I, W88C, K122A, I135T, I142IV, T165TI, K166KR, I178L, F214L, V245E, A272S, K277KR, A288S, V292I, I293V, I329L  
1145_130 1145_130 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, K173A, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, S251D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, I329V, Q330QP  
1147_133 1147_133 None None  A98G V35I, I50V, V60I, R83K, D123E, I135IV, I142X, Y144YF, T200IM, R211K, A272P, K281R, E297K  
1149_7 1149_7 None None   V35T, E36L, T39E, S48T, V60VI, K122KE, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311KR, I326V  
1151_11 1151_11 None None  K103N V60I, R83K, R211K, V245MT, K281R, T286TA, I293V, E297A, I329V, Q334H  
1152_3 1152_3 None None   P55PA, S162C, Q207E, R211K, E248Q, D250E, A272AP, V276VI, K277KR, E297EK, V317A, I326V, I329V, Q334L  
1156_15 1156_15 None None   K122E, D123GS, S162N, D177E, I178M, G196E, K277R, K281KR, T286A, E297K, Q334H  
1158_19 1158_19 None None   V35M, T69TA, A98AS, G196E, F214L, V245E, E248HQ, K277R, P294T, E297KR, I329L  
1161_23 1161_23 None None   V35I, K82KR, K122E, I135K, K166KR, D177DE, Q197P, T200TA, R211RK, A272AP, K277R, T286A, E297A, S322T, I329V  
1162_26 1162_26 None None   S48T, V90VI, K122P, I142IT, K166KR, I178L, Q197L, R211K, I244V, V245M, A272P, I293V, V317A, I329L, Q334D  
1165_28 1165_28 None None   K49R, V60I, R83K, I135T, S162A, R211RK, A272AP, I274IV, I293IV, V317A  
1166_41 1166_41 None None  V106VI T27S, V35T, E36AV, T39E, S48T, T69S, K122KE, D123DG, S162C, K173A, Q174QK, D177E, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, L279M, T286TA, E291D, V292VI, I293V, K311KR, D324E P59PS 
1168_31 1168_31 None None   S68SG, K122E, D123X, I135T, I178IM, R211X, P243PL, K277R, T286A, D324E  
1170_34 1170_34 None None T215S  K20R, T27S, K32N, V35L, S48E, I135A, P176A, T200A, I202V, F214L, Q278E, K281KR, I293V, P294Q, E298A, K311R  
1171_35 1171_35 None None   K102Q, D123E, Q197E, R211K, A272P, K277R, V292I, I293V, E297A  
1172_40 1172_40 None None   V35T, G45GE, K122E, I135V, S162A, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207DE, R211K, V245Q, E248D, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E312D  
1173_36 1173_36 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, E40D, V60I, K122E, D123S, I135T, I142IV, K173A, Q174K, D177E, T200TA, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1175_47 1175_47 None None   V35I, R83K, K102Q, K122R, D123E, I135RT, K166R, T200I, I202V, A272P, L283I, I293V  
1181_67 1181_67 None None K219KR M230MI V35VE, I135RT, I180IV, A272P, V276I, T286A, P294T, E297EK, R307RK, Q334H  
1182_69 1182_69 None None   V35T, E36A, T39E, K122KE, A158S, K173A, D177DE, T200A, E203D, Q207DE, R211RK, V245Q, D250DE, S251SN, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, L310I  
1183_77 1183_77 None None   V21I, I135M, K166R, R211K, A272P, K277R, I293V, L295I, E297K, K311R  
1186_78 1186_78 None None   K11KN, V35T, E36A, T39D, K43KR, S48T, K49KR, K122E, D123G, K173T, D177E, T200A, E203ED, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, I293IV D121DV 
1187_75 1187_75 None None   V35VI, K49KR, R83RK, D123DE, I135AT, S162C, Q197H, R211RK, F214FL, A272PS, V276I, L283LI, T286TA, I293V, K311KR, I329L  
1188_79 1188_79 None None   P4PS, T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K102KR, K122E, D123DN, A158S, K173A, Q174K, D177E, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245K, A272P, K277R, T286A, E291D, I293IV, V314M  
1190_82 1190_82 None None   K20KR, K102KR, K122P, K166R, D177E, V179I, R211K, V245VM, A272P, K277KR, I329L, G333E  
1192_87 1192_87 None None   V35KT, E36ED, K104KR, K122AP, Q174E, D177E, V189I, G196E, T200A, I202V, Q207N, V245HQ, E248X, D250DE, S251SN, A272S, T286A, E291D, V292I, I293V, E297D, I329V  
1193_88 1193_88 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, E40D, K43E, S68G, D121H, K122DE, D123GS, I135T, T139A, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245D, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R, E312T, I326V, I329V  
1197_94 1197_94 None None   K64KR, A98S, K102KQ, K104KR, K122E, D123N, A158AS, K166KR, R211RK, V245E, A272AP, V317A, D324DE  
1199_92 1199_92 None None  E138A V35T, E36A, T39E, E40D, K122E, D123S, I135T, T139I, S162C, K173T, T200A, Q207AD, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R  
1200_91 1200_91 None None  E138A K20KR, V60I, W88C, K122V, I135IT, I142V, K166KR, I178L, F214L, V245E, A288S, I293V, I329V E6E* 
1201_93 1201_93 None None   R83K, D123E, T165TI, I178IM, V245E, A272P, K277R, K281KR, P294A, E297K  
1202_96 1202_96 None None   I50IV, K64KR, K122P, I135T, S162C, D177EG, V179VI, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, I293IV, P294X, E297EA  
1203_97 1203_97 None None   E6A, V10A, V35VI, K43KR, K49KR, V60I, K122E, Q197P, A272P, I293V, E297A, K311R, I329V  
1206_101 1206_101 None None  K101KE V35X, V60I, R83K, Q145IV, T200X, K201KR, I202IV, R211K, V245EK, A272P, E297A, S322T  
1207_105 1207_105 None None   V35L, K49KR, I50V, R83K, F87FL, K122E, I135IT, S162A, E169ED, G196E, R211RK, V245X, E248D, D250E, A272P, K277R, L283I, E297K, E300Q, E312D, Q334E  
1209_RI 1209_RI None None   V35T, K49KR, R83K, Q145X, T165TI, T200S, R211K, V245E, A272P, E297A, S322T  
1214_102 1214_102 None None   V35T, T39S, A98AS, K122E, D123S, I135KR, K173A, Q174K, D177E, I195IT, G196GE, T200A, Q207D, R211K, V245HQ, E248DN, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V, D324E, I329IV  
1218_112 1218_112 None None   R83K, K122P, I135T, P176PS, I178L, I195L, T200A, R211K, K277KR, K281KR, A288S, V292I, I293V, E297D, Q334L  
1223_116 1223_116 None None   K32Q, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, D121Y, K122E, D123E, S163ST, V179VI, T200A, Q207K, R211Q, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, A327V  
1225_122 1225_122 None None   K20R, V35T, V60I, K102Q, K122E, I135MV, S162A, K173IT, Q174EK, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, V245X, D250DE, S251SC, K277R, T286A, E291D, V292VI, I293V, S322T  
1226_123 1226_123 None None   K11Q, V35M, T39A, K122A, D123S, I142V, K166KR, K173KR, Q174R, D177E, G196E, Q207DE, R211RK, V245Q, E248N, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, L295LM, S322A, D324E  
1227_124 1227_124 None None   V35T, V60I, S68SG, S162A, K173T, Q174QK, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, F214FL, V245E, T286TA, E291D, V292I, I293V, S322T  
1228_125 1228_125 None None   V21I, K49R, K122E, D123S, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, G196GE, Q207E, V245Q, E248N, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D, S322T S251SP 
1229_126 1229_126 None None   D123E, S162C, R211RK, F214FL, A272P, T286TA, E297K, P313PT, G333E  
1230_127 1230_127 None None  V179E V35IL, V90VI, K102R, K122KE, D123E, I135R, Q174N, D177E, Q207E, R211K, V276I, L283I, A288AS, I293V, P294PHQ, K311R, I326V, I329V  
1234_133 1234_133 None None  E138EG V35T, T39TA, V60VI, D123E, I135L, I142IS, S162Y, K173X, Q174N, I195L, T200A, Q207AT, R211KQ, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286TA, E291ED, V292I, I293V, P294T, E297A, D324DE  
1235_142 1235_142 None None   K11KR, V21I, V35T, V60I, I135V, I159IV, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, P243T, V245Q, G262GE, A272P, I274V, K275R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322T, I326V  
1238_134 1238_134 None None   K20R, V35T, E40D, V60I, K104R, V118I, K122E, D123S, I135R, T165I, K173IT, Q174K, D177E, I178IM, I195T, G196E, T200A, Q207E, F214L, L228Q, V245HQ, E248D, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294A, I329V  
1239_135 1239_135 None None   K20R, V35T, E40D, V60I, K104R, V118I, K122E, D123NS, I135IR, T165I, K173T, Q174K, D177E, I195T, G196E, T200A, R206RK, Q207E, F214L, L228Q, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294A, I329V  
1240_146 1240_146 None None   V35T, E36A, T39E, K43KR, S48T, K122E, D123G, I142IV, K173T, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, I293V  
150_12 150_12 None None   K49R, V60I, K122E, I135T, T165TI, E169ED, I202V, R211RK, F214FL, A272P, I274IV, L283LI, I293V, V317A  
542_RI 542_RI None None   K49KR, R83RK, W88WC, K104KR, D121HY, K122E, I135IT, T165I, D177E, I178IMV, K277R, L283I, I293V, L325I  
631_35 631_35 None None   V35VI, D123DE, I135L, I142IM, S162C, A272P, K277R, T286A, I329IV, Q334QL  
652_38 652_38 None None   S48T, K122P, K166R, I178M, Q197L, E204D, I244V, V245M, A272P, I293V, E298A, V317A, I329L, Q334D  
740_5 740_5 None None   S48T, D123E, I135T, T200TI, R211RK, F214L, A272P, Q278QH, T286A, V292VI, E297K, D324DA, A327AV  
767_56 767_56 None None   D123E, I135LM, T165I, D177E, G196GE, R211K, V245X, A272AT, V276VI, K281R, R284RK, A288S, I293V, P313PQ, I329V  
799_10 799_10 None None   V35VI, K49R, I50IV, R83K, I135T, T200A, R211K, A272PS, V276IT, K277KR, E297K, V317AG, I329L, G333E, Q334H  
836_96 836_96 None None  V106I V35I, K166KR, R211K, V245E, A272P, V276VI, K277R, S322A, D324E, I329V, Q334P  
846_19 846_19 None None   K49R, R83K, K122KE, K277R, I293V, E297A, Q334P Q258K 
865_77 865_77 None None M184V K103N, Y188L R83K, K102KR, K122E, R211K, E224D, A272P, I329V  
910_RI 910_RI None None   R83K, K122E, I135T, G196Q, I293V, P294A, E297A  
911_RI 911_RI None None   T27TS, R83K, K122KE, G196Q, V292VI, I293V, P294PA, E297A  
912_RI 912_RI None None   D123E, S162C, A272P, T286A, V292I, I293V, S322T, G333E  
930_93 930_93 None None   R83RK, I135T, A272P, K281R, T286A, E297K  
944_9 944_9 None None  K101E, Y181C, G190A S48T, K49R, I135T, T200A, R211K, L228H, V245E, T253S, A288S, V292I, I293V, E297A  
961_31 961_31 None None   V35M, T39A, R83K, D123E, I178M, R211K, V245E, A288S, V292I, I293V, E297A  
962_34 962_34 None None T215D K101KE K20KR, V35M, T39A, V60I, R83K, A98AS, K103KR, D121Y, K122E, I135KR, D177E, I178IM, T200A, R211K, A288S, V292I, I293V, E297AT  
964_46 964_46 None None   V60I, K122E, K166R, T200AEV, R211K, A272P, K277R, L283I, I293V, E297A, I329V, Q334E  
984_73 984_73 None None T215S  K20R, T27S, K32N, V35L, S48E, I135R, P176T, T200A, I202V, F214L, Q278E, I293V, P294Q, E298A, K311R, Q334QL  

Database

Resources

Team