Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Ssemwanga (2012)
Title Transmitted antiretroviral drug resistance among drug-naive female sex workers with recent infection in Kampala, Uganda.
Citation Clin Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 40
NumPts 40
Subtype A, D, C, CRF10_CD, B


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
0322HR 0322HR None None   V35T, E40D, K49R, E53K, V60I, D121H, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207E, R211K  
0765HR 0765HR None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, V60I, K102Q, K173S, D177E, V179I, Q207A, R211S  
1204HR 1204HR None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D177E, T200I, Q207G, R211K  
1420HR 1420HR None None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, I159V, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211N, F214L  
1444HR 1444HR None None   K11R, V35T, T39I, E40D, K49R, V60I, R172K, D177E, I178M, Q207E, R211K  
2910HR 2910HR None None   K11R, K20R, V35T, V60I, K64R, D123E, I142V, S162Y, E169D, D177E, T200V, Q207E, R211K, F214L  
2917HR 2917HR None None   K20R, V21I, K32I, V35T, V60I, K122E, D123N, I135R, S162Y, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207V, R211K  
2946HR 2946HR None None   K20R, V21I, V35T, T39A, E40D, V60I, D121C, K122E, D123E, I135T, K173S, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L  
3083HR 3083HR None None   I5V, E6D, K11Q, V35T, D121Y, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, V179I, I195L, T200A, Q207E, R211K  
3112HR 3112HR None None  E138A V35T, E36I, T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
3132HR 3132HR None None   E6D, K20R, V21I, V35T, V60I, K122E, D123S, T139S, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S  
3153HR 3153HR None None   K11A, V35T, K122E, D123G, T165I, K173S, Q174K, D177E, I178M, Q197E, Q207A, R211S  
3204HR 3204HR None None  E138A V35T, E36A, T39E, S48E, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, V179I, T200Q, Q207E, R211K, F214L  
3272HR 3272HR None None   V35T, E40D, V60I, K166R, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
3445HR 3445HR None None   K11T, V35T, I50V, V118I, D123S, K173A, V179T, T200A, Q207A, R211S, F214L  
3635HR 3635HR None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, I135V, I142V, K166Q, K173V, Q174K, V179I, Q207A, R211S  
3683HR 3683HR None None   V35T, T39A, K43R, K49R, K122E, D123S, I135T, I142V, S162C, K173S, D177E, V179T, T200A, Q207A, R211S  
3981HR 3981HR None None   V8I, V35T, E36A, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, E169D, D177E, I178V, T200R, Q207D  
4183HR 4183HR None None   P4H, I5V, K11T, K20R, V21I, V35T, V60I, K101Q, D121Y, K122E, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200E, I202V, Q207A, R211S  
4372HR 4372HR None None   E6N, V8I, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207E, R211S  
4668HR 4668HR None None   K11T, K20R, K32R, V35T, T39K, K43E, D123S, I135T, K173S, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207A  
4834HR 4834HR None None   E6N, V21I, V35T, T39L, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211S  
5443HR 5443HR None None  K103N V35T, E40D, K49R, V60I, E169D, G196E, T200A, Q207E, R211K  
5675HR 5675HR None None   E6K, V35T, T39E, S48T, R83RK, K122E, I142V, A158S, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207N, R211K  
5796HR 5796HR None None   E6D, V35T, V60I, D121Y, K122E, E169EK, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
5832HR 5832HR None None   V35I, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200I, E204K, Q207E  
6291HR 6291HR None None   V8I, V35T, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, S162N, R172K, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, E224K  
6356HR 6356HR None None   E6K, K20R, V35T, E40D, V60I, K101Q, K122E, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211S  
6441HR 6441HR None None   P4T, V35T, E36A, T39D, K122E, D123G, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
6601HR 6601HR None None   V35T, V60I, K166R, D177E, I178V, V179I, T200I, Q207E, R211K, K238R  
6667HR 6667HR None None   V35A, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, I135T, S162C, K173A, T200A, I202V, Q207E, R211K  
6699HR 6699HR None None  E138A K20R, V35T, K49R, V60I, K122E, D123N, T165I, E169D, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
6891HR 6891HR None None   V21I, V35IT, T39G, K122E, D123N, I135T, I142V, T165I, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211K  
7177HR 7177HR None None   V35T, T39L, V60I, D177E, T200I, Q207E, R211K  
7475HR 7475HR None None   E6R, K11R, V35T, V60I, K122A, D123S, K166I, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
7498HR 7498HR None None   V35T, V60I, D121Y, K122E, A158S, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
7518HR 7518HR None None   E6K, K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, V60I, K122E, D123S, K173S, D177E, I202V, Q207A, R211S  
7672HR 7672HR None None   V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, T165I, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207A, R211S  
8627HR 8627HR None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, K173T, D177E, T200E, Q207E  
8651HR 8651HR None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, K223Q