Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Florea (2011)
Title HIV transmitted drug resistance in Romania 2007-2010
Citation Direct Genbank Submission
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 65
NumPts 65
Subtype F

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
100_2008 100_2008 None None   T39A, E40D, D121HY, K122E, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174N, D177G, T200A, Q207K, R211K, F214L, V245Q, E248D, A272P, T286V, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A  
102_2008 102_2008 None None   T39A, E40D, D123E, S134R, I135L, S162Y, S163T, K173T, Q174K, T200A, Q207T, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, P294T, E297A Y146D, I293M 
1044_2007 1044_2007 None None  V179D V35T, D123E, I135L, I142V, S162H, K173T, Q174K, N175Y, I195L, T200A, Q207X, R211E, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, I326IT, A327V  
105_2008 105_2008 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, Q145C, S162H, K173T, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T, L325I  
106_2008 106_2008 None None  V179D V35I, D123E, I135L, A158P, S162C, K173A, Q174R, P176Q, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, A288T, E291D, V292I, E297T G152E, I293M 
108_2008 108_2008 None None   V35T, T39A, D123E, I135L, S162Y, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A  
1091_2007 1091_2007 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, V317A  
1102_2007 1102_2007 None None   V35L, D123E, I135L, S162C, K173V, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T, K311R, G333E  
1103_2007 1103_2007 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173L, Q174K, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286V, E291D, I293V, P294T, E297A, G333E  
1104_2007 1104_2007 None None   V35T, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, E203ED, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T, D324E, I329L  
110_2008 110_2008 None None   V21F, V35T, T39L, V60I, D123E, I135L, A158P, S162C, S163X, K173A, Q174K, D177N, T200A, Q207AT, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V, E297A, D320E  
1121_2007 1121_2007 None None  E138EG V35T, E40D, V60I, D123E, I135L, I142V, S162H, K173M, Q174K, I195L, T200E, Q207A, R211K, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T, L310I  
112_2008 112_2008 None None   V35T, E36D, T39L, V60I, D123E, I135L, N137I, S163I, K173KT, Q174K, D177E, I178V, I195L, T200A, I202V, Q207T, R211K, I244L, V245Q, E248D, A272P, V276I, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, L310I Y144N 
1345_2008 1345_2008 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, Q145C, S162H, K173I, Q174K, I195L, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, V276I, T286TA, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T  
1368_2008 1368_2008 None None   K20R, V35T, T39A, E40D, K122KE, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174N, D177E, I195L, T200A, Q207A, R211K, I244V, V245Q, E248N, A272P, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A  
1572_2007 1572_2007 None None  V106VI V35T, T39A, K122P, D123DE, I135LR, I142IV, S162C, E169ED, K173DE, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, V245Q, E248ED, A272P, K277R, T286TA, E291D, V292I, I293V, E297A, I329V  
1635_2007 1635_2007 None None   V35I, S68G, D123E, I135T, S162C, K173V, Q174K, I178L, I195L, T200A, Q207A, R211EK, V245Q, E248DN, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, A327AV K277V 
1636_2007 1636_2007 None None  E138G V35T, E40D, D123E, I135L, K173A, Q174K, Q207A, R211K, L228H, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294S, E297A  
1649_2007 1649_2007 None None   V35T, T39L, S105A, D123E, I135L, T139S, S162C, K173T, Q174K, E194D, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, K275R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, D324E, I329V, Q334D  
1650_2007 1650_2007 None None   V35T, E40ED, I135L, I142V, S162H, K173T, Q174R, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, P294T, E297AT, D324E, I326T  
1651_2007 1651_2007 None None   V35T, T39A, E40D, I135L, T139TS, I142IV, S162H, K173T, Q174K, T200A, Q207S, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, D324E  
1679_2007 1679_2007 None None  V179D K20R, V35T, T39A, E40ED, D123E, I135L, S162H, K166KR, K173X, Q174KR, N175Y, T200AE, Q207T, R211T, I244IMV, V245Q, E248D, A272P, T286TA, E291ED, V292VI, I293V, P294T, L295M, E297AT, V317VA, Q334H  
1682_2007 1682_2007 None None   V35T, T39L, V60I, K122KE, D123E, I135T, S162C, K173AT, Q174K, I195L, G196E, T200I, E203D, Q207AE, R211K, E224D, V245Q, E248D, A272P, T286TA, E291D, I293V, P294T, E297T, V317A  
1687_2007 1687_2007 None None  Y318F V21VI, V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, V276X, E291D, V292I, I293V, P294T, L295M, E297A  
1830_2007 1830_2007 None None  V179D E6D, K20R, V35T, T39A, E40D, K122E, D123DE, I135L, I142V, S162H, K173AT, Q174K, I195L, G196K, Q197E, T200A, E204EQ, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, V292I, I293V, E297A  
1883_2007 1883_2007 None None   V35T, T39L, V60I, D123E, I135L, S162C, K173A, Q174K, P176PQ, D177N, T200A, Q207AT, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277KR, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V, E297A, I329L  
1933_2007 1933_2007 None None   K20R, V35T, T39A, E40D, V60I, D123E, I135L, T139TS, S162H, K173AT, Q174K, D177DE, I195L, T200E, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, E291ED, V292I, I293V, P294PT, E297A, S322T  
1969_2007 1969_2007 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, I142IV, S162H, K173T, Q174K, D177E, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, E291D, V292I, I293V, P294PT, E297A, V317A, I326V, I329V, Q334H  
208_2008 208_2008 None None   V35T, T39A, D123E, I135L, S162C, K173A, Q174E, I195L, G196R, T200A, Q207E, V245Q, E248D, A272P, V276T, K277R, L279I, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A  
2142_2007 2142_2007 None None  E138A K32I, V35T, V60I, V118VI, D123E, I135T, I142IV, S162C, K173A, Q174K, D177E, V189I, I195L, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, I309L, I329V  
2360_2008 2360_2008 None None   V35T, K49KR, V60I, D123E, I135L, S162C, K173E, Q174K, T200TA, Q207A, R211K, L228Q, V245Q, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, D324E, I329L  
2368_2007 2368_2007 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200V, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, K281KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, I326T  
2516_2007 2516_2007 None None M184V K101E, K103N, G190A P4H, V35T, T39G, E53D, S105T, D123E, I135L, I142V, S162H, K173T, Q174K, D192N, I195L, T200A, Q207A, R211T, L228Q, V245Q, E248D, S251V, A272P, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, A304E, I326V E138V 
2739_2007 2739_2007 None None   V35T, T39N, D123E, S162Y, K173I, Q174K, D177DE, I178IL, V179I, Q207E, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, E298ED, A304E, V317A, Q334L  
2903_2007 2903_2007 None None  E138EG V35T, T39N, E40D, D123E, I135T, S162H, K173I, Q174K, D177X, Q207EG, R211KT, V245Q, E248N, A272P, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, A304E, V317A, Q334L  
3004_2007 3004_2007 None None   V35T, T39N, E40D, D123E, I135S, S162H, K166R, K173I, Q174K, I202V, Q207E, R211K, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, A304E, V317VA, I326V  
3005_2007 3005_2007 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173A, Q174K, I195L, Q197K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, A304E, E312A, I329V, Q334L  
3016_2007 3016_2007 None None T215S E138A K32I, V35T, V60I, D123E, S162C, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200AE, I202V, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297AP, I309L, I329V  
3160_2007 3160_2007 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200AE, Q207A, R211K, V245Q, E248DN, A272P, V276I, L283LI, T286TA, E291ED, V292I, I293V, P294T, E297A, V317A  
3163_2007 3163_2007 None None  H221HY K32KR, V35T, T39TI, E40D, K49KR, V60I, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286V, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, I329V  
317_2007 317_2007 None None   V35T, E36ED, T39A, E40D, K122KE, I135L, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178V, I195L, T200A, Q207G, R211K, V245Q, E248DN, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294PT, E297AT, I329V  
364_2007 364_2007 None None   V35T, T39A, E40D, K104R, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, E291D, V292I, I293V, P294I, L295M, E297A, I329V  
4148_2007 4148_2007 None None   V35T, T39A, E40D, V60I, D123E, I135L, S162Y, E194G, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, V276I, L283I, E291D, V292I, I293V, E297T, V317A P217T 
4171_2007 4171_2007 None None   V35T, T39L, K122E, D123E, I135X, K173AV, Q174KR, T200A, Q207E, R211K, L228H, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, A327V, Q334N  
4175_2007 4175_2007 None None   V35T, T39M, V60I, D123E, I135L, K173A, Q174R, T200A, Q207ADE, R211K, L228H, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, A327V, Q334N  
4294_2007 4294_2007 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, T139S, S162H, K166E, F171Y, K173T, Q174K, V179I, I195L, T200A, I202V, Q207K, R211K, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T, I329V  
4477_2007 4477_2007 None None   V35T, T39A, E40D, I135L, I142T, S162A, E169D, F171L, K173A, Q174K, I195L, T200A, Q207E, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, A288AT, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A R172E 
4635_2008 4635_2008 None None   V35T, V60I, S68G, K101R, D123E, I135T, I142V, S162H, S163I, K166X, K173V, Q174K, D177E, E194D, I195L, G196E, T200A, Q207A, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, A304E L295P 
4636_2008 4636_2008 None None   P25A, V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, R143K, S162Y, K173Q, Q174K, V179I, Q207A, R211I, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V, E297A, A304E  
4638_2008 4638_2008 None None   V35T, T39A, E40D, E53D, D123E, I135L, S162D, K173T, Q174K, D177DE, T200E, Q207E, I244V, V245Q, E248D, A272P, T286TA, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T  
4639_2007 4639_2007 None None   K22R, V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162Y, K173T, Q174K, T200A, Q207A, R211Q, V245Q, E248D, A272P, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A  
4642_2007 4642_2007 None None  E138G T7S, V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, F171Y, K173T, Q174K, T200E, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, V276I, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V, E297A, A304E R143RG 
4643_2007 4643_2007 None None   V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162C, F171Y, K173T, Q174K, G196R, T200E, E203ED, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, V276I, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V, E297A, A304E  
4644_2007 4644_2007 None None   V35T, V60I, S68G, D123E, I135T, I142V, S162H, K173V, Q174K, D177E, E194D, I195L, G196E, T200A, Q207A, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, A304E  
4645_2007 4645_2007 None None   V35T, T39A, E40D, V60I, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195IL, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286A, I293V, P294T, E297A, I329V  
4646_2007 4646_2007 None None   V35I, T39A, E40D, D123E, T139K, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, K331N N137K, P140S, Y146K, L149I 
4647_2007 4647_2007 None None   I2N, V35T, T39L, T69N, K82R, S105A, D123E, P140X, G141X, I142X, R143X, Y144X, Q145X, Y146X, N147X, V148X, L149X, P150X, Q151X, G152X, W153X, K154X, G155X, S156X, P157X, A158X, I159X, F160X, Q161X, S162X, S163X, M164X, T165X, K166X, I167X, K173T, Q174K, E194D, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, E297A, V317A  
4648_2007 4648_2007 None None  V179D E40D, D123E, I135L, S162Y, K173A, Q174K, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, A272P, K275R, V276I, T286A, E291D, I293V, P294T, E297A, K311R, V317A, K331N  
4650_2007 4650_2007 None None   V35T, E40D, I135L, S162H, K173T, Q174K, T200EK, Q207A, R211K, V245Q, A272P, I293V, P294T, E297A, Q330P  
4700_2007 4700_2007 None None   V35T, E40D, E44X, D123E, I135L, S162H, E169EG, K173T, Q174K, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, V292I, P294T, E297A  
4711_2008 4711_2008 None None  V179D V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162C, K173E, Q174K, I195L, T200A, Q207E, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294A, E297A  
4730_2007 4730_2007 None None   K22KR, V35T, T39A, E40D, V60VI, D123E, I135L, I142V, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, Q207AE, R211T, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T, V317A  
4765_2007 4765_2007 None None  V179D V35T, T39A, E40D, D123E, I135L, S162C, K173E, Q174K, I195L, T200A, Q207E, V245Q, E248DN, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294A, E297A, E300EK  
4887_2007 4887_2007 None None   V35T, T39A, D123E, I135L, S162H, F171L, K173T, Q174K, D177G, T200A, Q207E, R211K, V245Q, P247T, E248D, A272P, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A T7TNS 
502_2007 502_2007 None None   V35I, T39A, V60VI, D123E, I135L, K173A, Q174K, I195L, T200I, Q207D, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, R284K, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, I326V, I329L  

Database

Resources

Team