Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Han (2010)
Title Genetic and epidemiologic characterization of HIV-1 infection In Liaoning Province, China.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 141
NumPts 141
Subtype CRF01_AE, B, CRF07_BC, A, CRF08_BC, C, G, CRF06_cpx, B + C

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 141 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
JC06 04CNLN123 None None   K11R, S162C, T200V, R211K, A272P, K277R, Q278E, L283I I270F 
JC07 04CNLN124 None None   K11R, I135V, S162C, T200E, Q278E G213E 
JC09 04CNLN126 None None   K102Q, I135V, S162C, T200A, V245E, K277R, Q278E, L283I  
JC10 04CNLN127 None None   I135R, S162C, T200A, I202V, K277R, Q278E Q269R 
JC13 04CNLN130 None None  V106I I135V, S162C, T200E, R211G, F214L, K275R, Q278E  
JC16 04CNLN133 None None   S68G, I135R, S162C, T200A, E203D, K277R, Q278E, G285R  
JC18 04CNLN135 None None   K102Q, I135V, S162C, T200A, V245E, K277R, Q278E, L283I  
JC19 04CNLN136 None None   K101R, I135V, S162C, T200E, R211T, Q278E, L283I  
JC20 04CNLN137 None None   I135V, S162C, T200A, Q207H, R211K, Q278E  
JC23 04CNLN140 None None   K102R, I135V, S162C, Q174H, T200A, Q278E  
JC29 04CNLN146 None None   I135V, E138D, Q145H, S162C, T200E, K275R, Q278E, L282I, T286A  
JC30 04CNLN147 None None   E6D, R125G, I135L, S162C, T200A, L210M, K277R, Q278E  
LN01 00CNLN01 None None M184I  M16I, V35T, E36A, T39D, M41I, S48T, G51R, V60I, R78K, W88*, G99R, D121Y, K122E, R143K, G155R, G196R, W212*, V245Q, W266*, A272P, G273R, K277R, Q278R, R284K, G285E, T286A G112K, G231K 
LN03 00CNLN03 None None  V106I V21I, V35T, V60I, Q174E, D177E, T200V, Q207K, R211K, V245Q, E248D, A272P, K275R, V276I, K277R, T286A  
LN04 00CNLN04 None None T215S  V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I195M, V245Q, A272T, K277R, T286A  
LN05 00CNLN05 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN07 00CNLN07 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K102R, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN08 00CNLN08 None None   I135V, S162C, T200A, K277R, Q278E, L283I  
LN087 LN087 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
LN090 LN090 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
LN092 LN092 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
LN10 00CNLN10 None None   S162C, T200A, A272S, K277R, Q278E  
LN103 LN103 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I  
LN105 LN105 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
LN107 LN107 None None   E6D, V35I, I135L, S162C, G196E, L210LM, E248V, A272P  
LN109 LN109 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
LN111 LN111 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I  
LN112 LN112 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I  
LN113 LN113 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, I142V, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
LN114 LN114 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I  
LN115 LN115 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, I135T, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200R, I202V, Q207D, R211S, V245E, K277R  
LN116 LN116 None None   E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I  
LN12 00CNLN12 None None  V106I I135V, S162C, T200A, Q207H, K277R, Q278E  
LN121 LN121 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, S68G, K102R, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
LN122 LN122 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214FL, K238R, V245E, V276I  
LN123 LN123 None None   P4H, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102R, D121H, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
LN124 LN124 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245D, V276I  
LN125 LN125 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
LN126 LN126 None None   E6D, V35I, I135L, S162C, G196E, E248V, A272P  
LN128 LN128 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, T165I, K173RT, Q174K, D177E, T200I, Q207A, F214L, K238R, V245E, V276I  
LN13 00CNLN13 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, K173S, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, V245T  
LN132 LN132 None None   E6D, K11AT, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E S3SG 
LN134 LN134 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
LN136 LN136 None None   E28K, K32E, V35I, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
LN138 LN138 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K103R, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I  
LN14 00CNLN14 None None  K103N K11N, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, K173S, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245T  
LN15 01CNLN15 None None   K11N, V35T, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245T, T286A  
LN153 LN153 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, A98S, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I  
LN154 LN154 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V75VL, K122E, D123S, I135T, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E K275E 
LN16 00CNLN16 None None   K102Q, K104T, I135V, S162C, G196R, T200A, K277R, Q278E  
LN17 01CNLN17 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207E, R211K, D250E, A272P, K277R, K281R  
LN175 LN175 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I  
LN176 LN176 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K104R, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I  
LN18 01CNLN18 None None   K11S, I135V, S162C, T200E, Q278E, T286A  
LN19 01CNLN19 None None   I5V, S162C, T200A, I202V, Q207E, A272P, K277R, Q278E, L283I  
LN21 01CNLN21 None None   E6D, E44K, K122E, I135V, S162C, T200A, Q207N, R211K, D237N, Q278E  
LN23 02CNLN23 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, A272P, V276I, K277R, T286A  
LN24 02CNLN24 None None   I135V, S162C, T200A, R211K, Q278E  
LN26 02CNLN26 None None   V35I, K122E, S162C, T200E, Q207H, R211K, K277R, Q278E, L283I  
LN27 02CNLN27 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, D121H, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P  
LN30 02CNLN30 None None   E6D, D123E, I135V, S162C, D177E, T200A, K277R, Q278E  
LN32 02CNLN32 None None M41L  V35L, T39K, E40G, K43E, V60I, K122E, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207E, R211K, V245Q, E248D, L260V, A272P, K275R, T286A  
LN33 02CNLN33 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135L, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, Q207A, R211S, V245E, A272P  
LN34 02CNLN34 None None   K20R, D121H, K122E, T200I, R211K, V245K  
LN35 02CNLN35 None None   K11R, V35T, E40D, V60I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207A, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A  
LN36 02CNLN36 None None   I5V, E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, Q269H  
LN37 02CNLN37 None None  V106I I135V, S162C, T200A, Q278E, T286A  
LN38 02CNLN38 None None   K11R, V35T, E40D, V60I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207A, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A  
LN39 02CNLN39 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102R, K103Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E, K277R  
LN40 02CNLN40 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K103Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E, K277R  
LN41 02CNLN41 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN42 02CNLN42 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A  
LN43 02CNLN43 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, T200A, V245Q, A272P, K277R  
LN44 02CNLN44 None None   D123E, I135V, S162C, T200E, Q207E, Q278E  
LN45 03CNLN45 None None   V35T, E36A, T39D, V60I, V90I, D121H, K122E, D177E, L210F, V245Q, A272P, K277R  
LN46 03CNLN46 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V90I, D121Y, K122E, V179I, E204K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN47 03CNLN47 None None   E6D, T7P, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, Q207A, R211S, V245E, K281R, T286A  
LN51 03CNLN51 None None A62V  V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69N, D123E, I135V, S162C, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
LN52 03CNLN52 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A  
LN53 03CNLN53 None None   K122E, I135T, K166R, D177E, F214L, V245M, V261I, A272P, V276I  
LN54 03CNLN54 None None   K101T, I135V, S162C, E169D, T200I, V245A, K277R, Q278E  
LN58 03CNLN58 None None  V106I D123E, I135V, S162C, T200A, V276I, K277R, Q278E  
LN60 04CNLN60 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K102R, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN61 04CNLN61 None None   E6D, K11T, V35I, T39K, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, T286A  
LN62 04CNLN62 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E, I274V, T286A  
LN63 04CNLN63 None None   I135V, S162C, T200A, V245K, K277R, Q278E, K287Q  
LN64 04CNLN64 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, G45R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A  
LN65 04CNLN65 None None   I135V, S162C, V189I, T200A, Q207R, K277R, Q278E  
LN66 04CNLN66 None None   E6D, K11T, V35I, K122E, D123S, I135T, I142L, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A  
LN67 04CNLN67 None None   K102M, I135V, S162C, I178M, T200A, Q278E  
LN69 04CNLN69 None None A62V  K11T, V35I, T39K, D123N, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, V276I, T286A  
LN71 04CNLN71 None None  V179D V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102R, D121Y, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN72 04CNLN72 None None   D123E, I135V, S162C, T200A, A272P, K277R, Q278E, L283I  
LN74 04CNLN74 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K103R, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, V276I, K277R, T286A  
LN76 04CNLN76 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A  
LN77 04CNLN77 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245K, T286A  
LN78 04CNLN78 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A  
LN79 04CNLN79 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, V245Q, A272P, K277R, T286A  
LN80 04CNLN80 None None   K122E, I135T, E169D, I202V, F214L, V261I, Q278H  
LN81 04CNLN81 None None   K173E, T200A, E204D, E248D, K277R, Q278E  

Database

Resources

Team