Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Yebra (2009)
Title Clinical differences and viral diversity between newly HIV type 1-diagnosed African and non-African patients in Spain (2005-2007).
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 59
NumPts 59
Subtype CRF02_AG, A, G, C, CRF11_cpx, CRF06_cpx, F, B, A + J, H, C + D, D

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
SP10-320351 SP10-320351 None None   V35T, T39M, V60I, T107S, D121Y, K122E, D123DG, S162Y, T200A, Q207A, V245T, E248DN, A272P, I274V, Q278H, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V K11IMV 
SP106-287543 SP106-287543 None None   T39A, I135L, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, V245Q, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294I, L295M, E297EK, S322T, I326V  
SP107-377820 SP107-377820 None None   V35I, S162C, R211K, V245E, K249KR, T286A, A288S, E297K, I326V  
SP11-322971 SP11-322971 None None   K11T, T27S, V35T, T39K, K43E, K49R, D123S, I135M, S162A, K173S, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245Q, E248D, A272S, K281R, E291D, V292I, I293V, K311KR, E312X, D324DE, K331N  
SP111-374995 SP111-374995 None None  V179E V21I, K32I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135K, S162C, K166KR, K173R, Q174E, P176KT, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
SP12-331966 SP12-331966 None None   E40D, V60I, D123N, I135V, S162A, K173S, D177E, V179I, G196GE, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
SP122-30612 SP122-30612 None None   E28K, K32KE, V35T, E36D, K104R, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, R211K, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322A, I326V  
SP13-323939 SP13-323939 None None   T39E, D121H, K122E, D123DG, A158S, K166R, K173X, Q174KR, D177E, T200A, Q207G, V245Q I180IM 
SP131-285421 SP131-285421 None None   V10X, K11X, L12X, K13X, P14X, G15X, M16X, D17X, G18X, P19X, K20X, V21X, K22X, Q23X, W24X, P25X, L26X, T27X, E28X, E29K, I31L, V35AT, E36A, T39E, E40ED, S48T, K49R, D123E, K173AT, P176K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277KR, E291D, V292I, I293V  
SP132-287163 SP132-287163 None None   V35T, V60I, K104KR, V118I, K122E, D123S, T165I, K173T, Q174K, D177E, G196GE, T200A, Q207E, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272P, L279I, T286A, E291D, V292I, I293V, K311KR, D324E, I329V W88W*C 
SP15-339625 SP15-339625 None None   V35T, E36D, E40D, K43R, K49R, K122E, S162A, E169ED, K173A, Q174EK, D177E, V179I, I195T, T200A, Q207N, R211T, V245Q, E248D, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
SP16-320310 SP16-320310 None None   V35T, V60I, S105A, K122E, D123S, I135T, S162T, D177E, T200A, Q207E, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V, K323R  
SP18-320770 SP18-320770 None None   V35T, I50V, V60I, K104R, D121Y, K122E, I135M, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178L, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297R, K311R, I329V  
SP2-290207 SP2-290207 None None  V106I K11T, V35T, E36X, T39K, K43E, D123N, S162Y, K173X, D177E, I178V, V179I, Q207A, R211K, F214L, V245Q, E248D, T286A, E291D, I293V, P294AT, E312D, I326V  
SP22-339826 SP22-339826 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D123E, I135V, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
SP22-353742 SP22-353742 None None   V21I, E28A, V35Q, T39A, V60I, K122E, I135T, I142IT, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, R211K, V245Q, E248D, K277R, T286A, A288AT, V292I, I293IV, E297A, I326V, I329L  
SP25-353037 SP25-353037 None None M184MLV  I5V, V35T, K49R, K122E, D123N, I135T, I142V, K173T, D177E, E194ED, T200X, I202V, Q207K, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, L283I, E291D, V292I, I293V, I329V I257IM 
SP26-346921 SP26-346921 None None M184I  K49R, V60I, V118I, K122A, T139A, T165I, E169D, Q174E, D177E, I178L, V179I P170G, P176G, I180M, Q182EG 
SP28-350582 SP28-350582 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, D123E, I135T, Q145C, K173T, P176K, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K281KR, E291D, V292I, I293V  
SP3-260414 SP3-260414 None None   K32KR, V35T, E36D, T39K, K43E, S68G, R83RK, V90I, S162A, K173T, Q174KR, D177E, T200A, Q207K, R211X, V245Q, T286A, E291D, V292IT, I293V, P294A, E297K, E312D, S322T, I326V  
SP33-299504 SP33-299504 None None  K103N I5V, E6D, E28K, K32E, V35T, T39K, V118I, K122V, I135S, S162H, T200E, I202V, R211K, F214L, V245Q  
SP37-369601 SP37-369601 None None  E138A V35T, E36D, T39L, S68T, V90I, K122A, I135V, S162A, K173M, Q174EK, D177E, I178V, T200A, Q207D, R211RK, V245Q, V276I, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, L310I, S322A, I326V  
SP39-248661 SP39-248661 None None   V35T, V60I, D121Y, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200A, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, I329V  
SP39-367857 SP39-367857 None None   V35T, E36D, V90I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322T  
SP40-371782 SP40-371782 None None   I5V, E6D, V35IT, K122X, D123X, I142V, D177E, I195L, T200E, I202V, Q207N, R211K, V245Q, E248D, D250E, S251C, A272P, K277KR, L283I, E291D, I293V, P294T, E297A, L325I, I326V, I329V  
SP42-378740 SP42-378740 None None   K11KE, V35T, K122KE, D123N, S162A, Q174N, D177E, G196R, T200A, Q207E, R211RK, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, S322A, I326V  
SP43-341239 SP43-341239 None None   K22R, K32R, V35T, E36D, S68G, D121H, K122E, D123E, I135V, S162A, E169A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, V245E, E248D, D250E, S251SN, Y271H, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, R307K, S322A  
SP43-364046 SP43-364046 None None   V90VI, K102Q, I135V, S162A, K173T, Q174KR, D177E, I178IM, T200A, Q207E, R211A, P243T, V245K  
SP44-315292 SP44-315292 None None   K49R, I50V, V60I, D121Y, K122E, I135M, S162C, K173T, Q174K, D177DE, I178L, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
SP44-372125 SP44-372125 None None   T39L, V60I, I135V, S162A, F171Y, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
SP45-371139 SP45-371139 None None L74LIV, M184V K101E, V106I, Y181YC, G190S T39A, E40D, S162A, K173T, Q174R, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
SP46-350907 SP46-350907 None None   I5V, V35T, K43Q, K49R, K122KE, D123N, I135T, T165I, K173T, D177E, T200E, I202V, Q207K, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, L283I, E291D, V292I, I293V, I329V  
SP49-258702 SP49-258702 None None   K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, I142V, S162Y, K173S, D177E, I178L, V179I, Q207A, V245Q, K281KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294PT, S322T  
SP5-283421 SP5-283421 None None   T39L, K122KE, I135T, S162A, K173T, Q174K, N175X, D177E, G196E, T200X, Q207G, R211K, F214L, V245Q K49~ 
SP51-238269 SP51-238269 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, E36D, K64R, K122P, D123N, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243H, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, S322T  
SP52-240679 SP52-240679 None None M184V  V35R, E36D, V60I, S68G, K102KR, I135IV, E138D, Q145IM, S162A, K173T, Q174X, D177E, I178M, I195IM, T200A, Q207G, V245Q, D250E, A272P, T286A, A288G, E291D, V292I, I293V, P294T, L295M, E297K, E298ED, K311R, S322T  
SP52-367860 SP52-367860 None None   V35T, E36D, V90I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
SP55-329660 SP55-329660 None None   K20R, V35T, T39K, E40D, V60I, D121H, K122E, D123S, S162Y, K173S, Q174E, D177E, V179I, Q207A, F214FL, V245Q, E248N, D250E, A272P, K281R, T286V, E291D, I293V, P294T, E312D, I326V  
SP57-270305 SP57-270305 None None   K64R, K122P, D123N, Q145C, S162A, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E  
SP6-310227 SP6-310227 None None   E36X, I37X, C38X, T39X, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207G, V245K K49X_XXXXXXXXXX 
SP63-378672 SP63-378672 None None   K20R, E28D, V35T, T39E, V60I, D121H, K122E, I135T, S162H, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A, I293V, P294T, E297K, E312D, D324E  
SP68-384383 SP68-384383 None None   V35T, K43Q, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P321S, S322T, I326V  
SP69-267096 SP69-267096 None None   K20R, V35T, T39N, E40D, V60I, I135V, T139TA, S162A, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207G, R211E, V245KQ, D250DE, A272G, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322T, I326V  
SP7-311317 SP7-311317 None None  V106VI V35T, K64R, D123E, I142IV, K166R, K173A, D177E, I178L, Q207X, R211K, P243T, V245Q, E248ED, A272P, K275R, K277R, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, V314I  
SP70-397684 SP70-397684 None None   T39S, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q  
SP71-372939 SP71-372939 None None   V60I, K122P, I142V, K173S, D177E, V189I, T200A, Q207E, R211K, P243S, V245H  
SP72-400288 SP72-400288 None None   S3R, V35T, T39L, V90I, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245T, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, K311R, S322A  
SP75-392005 SP75-392005 None None   E40D, K49R, V60I, V118I, K122E, T165I, I178L, V179I, T200A, E204K, Q207E, F214L  
SP78-400723 SP78-400723 None None   V21I, V35T, E40D, V60I, K122P, I135V, S162A, K173E, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, A288T, E291D, I293V, P294L, E297A, A327T  
SP79-377614 SP79-377614 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, D121Y, K122E, D123G, K173S, Q174K, D177E, T200K, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V, E312N, I326V  
SP8-315669 SP8-315669 None None   K122E, D123S, S162C, K173A, T200E, I202V, Q207EK, R211K, V245Q  
SP81-385167 SP81-385167 None None   T39L, K122E, D123N, S162A, K173E, Q174D, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  
SP83-381367 SP83-381367 None None   V35T, T39A, I135V, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245Q, D250E, T286A, E291D, V292VI, I293V, P294T, S322T, I326V  
SP88-250101 SP88-250101 None None   V35T, E36D, T39A, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
SP9-329233 SP9-329233 None None   V35T, K104R, K122E, D123GS, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, Q197P, T200A, Q207E, R211K, V245Q, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322A, I326V  
SP90-387599 SP90-387599 None None   V35T, D123E, I135V, S162C, K173A, Q174K, Q207E, R211RK, P243T, V245Q, D250T, A272P, K275R, Q278Y, T286A, E291D, I293V, E297A, P321S, D324E, K331N  
SP92-260758 SP92-260758 None None   T39K, E40D, V60I, K173IT, Q174K, D177DE, V189I, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
SP98-382581 SP98-382581 None None   K20R, V35T, E36A, T39TK, K43E, V60I, K122E, I135T, K173Q, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, D250E, S251E, A272P, Q278H, T286A, K287KR, V292I, I293V, E297A, L301M, V317A, I329V  
SP99-396546 SP99-396546 None None   K11T, K20R, V21I, K32R, V35I, T39N, V60I, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177G, V179I, I202V, Q207D, R211K, V245Q, E248N, V276I, T286A, E291D, I293V, P294T, E312D  

Database

Resources

Team