Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author da Silveira (2012)
Title HIV type 1 molecular epidemiology in pol and gp41 genes among naive patients from Mato Grosso do Sul State, central western Brazil.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 49
NumPts 49
Subtype B, C, F, B + C, CRF60_BC


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
BRMS01 BRMS01 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121Y, K122E, A158S, K173A, D177G, T200A, Q207E, R211K  
BRMS01_10 BRMS01_10 None None  V179D I31R, V35M, T39A, D123N, I135T, G196E, I202V, R211K  
BRMS02 BRMS02 None None   V35T, T69S, K122E, K173D, Q174K, I202V, Q207A, R211K, F214L  
BRMS02_10 BRMS02_10 None None   D123E, I135T, K166R, D177DG, Q207G, R211K  
BRMS03 BRMS03 None None   V35T, E36A, T39E, S48E, D123E, I135T, V179I, G196E, Q197K, T200I, R211Q  
BRMS03_10 BRMS03_10 None None   K122E, I135T, I142IV, R211K  
BRMS04_10 BRMS04_10 None None   E6EK, R78RK, E79EK, V118I, K122Q, I135T, S162C, Q207A, R211K, F214L  
BRMS05 BRMS05 None None  V106I K122E, I135T, R211RS, F214L  
BRMS05_10 BRMS05_10 None None   V35I, R78RK, E79EK, F87FL, I135V, S162C, D177DE, V179VI, Q207K, R211RK  
BRMS09_10 BRMS09_10 None None   V8I, V35T, E36EA, T39E, E40D, K43KR, S48T, V60I, K122E, D123DN, I135L, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K  
BRMS11_10 BRMS11_10 None None T215S  K122KE, I142V, I202IV, E204K, R211K  
BRMS12 BRMS12 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D121H, K122E, I135T, S162A, K173A, T200E, Q207E, R211K  
BRMS12_10 BRMS12_10 None None   S68G, I135R, D177EG, T200E, Q207A, R211K  
BRMS13_10 BRMS13_10 None None   E28EK, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, T200TI, I202IT, R211K  
BRMS14 BRMS14 None None   S48T, D121Y, K122E, I135T, S162C, D177E, I178IM, T200A  
BRMS14_10 BRMS14_10 None None V75M  V35I, V90I, D123E, I135T, D177E, T200A, R211G  
BRMS22 BRMS22 None None   V35T, K122E, I135T, L210F, F214FL, P243T  
BRMS23 BRMS23 None None  E138A V10VA, V60I, K102Q, K122E, D123G, I135L, G196E, T200A  
BRMS25 BRMS25 None None   D121Y, K122E, S162C, Q174H, D177E, Q207P, R211K E29Q 
BRMS27 BRMS27 None None   K49R, S68G, I135T, S162C, Q174L, T200I, Q207K, R211G  
BRMS28 BRMS28 None None  V179E V21VI, D123E, I135T, E169D, K201Q, I202V, Q207P, R211K  
BRMS29 BRMS29 None None   P4PS, I135T E29Q 
BRMS30 BRMS30 None None   K20R, V35I, K122E, I135T, Q197EK, T200AE, I202IV, Q207E, R211RK  
BRMS31 BRMS31 None None   K49R, K122E, D123N, I135T, A158AS, T165I, K173N, I178M, Q197P, I202V  
BRMS33 BRMS33 None None   V35T, E40D, K49R, D123E, S162C, E169G, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211A  
BRMS34 BRMS34 None None   I178M, R211K  
BRMS36 BRMS36 None None   K49R, K122E, I135T, K166R, K173E, I195L, T200E, V245M  
BRMS37 BRMS37 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123G, I142IV, T200A, Q207E, R211K, D218G  
BRMS38 BRMS38 None None  V179D V35T, E40D, V60I, I135L, S162Y, E169D, K173A, Q174K, T200A, E203K, Q207D, R211K  
BRMS39 BRMS39 None None   V35I, R211K  
BRMS40 BRMS40 None None  V106I V118VI, S162C, R211K, E224D  
BRMS41 BRMS41 None None   V35T, V60I, I135IV, T200A, R211K  
BRMS43 BRMS43 None None   I5V, K20R, A158S, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
BRMS45 BRMS45 None None   K49R, K102R, D123E, I135T, Q174QHR, P176Q, E194G, G196E, I202V, R211K  
BRMS46 BRMS46 None None   V35T, T39A, K122A, I135T, Q207E, R211K, F214L  
BRMS47 BRMS47 None None   E6K, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, T200A, Q207K, R211Q  
BRMS48 BRMS48 None None   V35T, T39N, K49R, K104R, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178L, T200A, Q207D, R211RQ  
BRMS50 BRMS50 None None   V21I, V35T, V60I, I135T, S162C, E169D, T200A, Q207E, R211K  
BRMS51 BRMS51 None None  E138A E6D, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, D123E, N137H, T139A, S162C, K173T, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K  
BRMS52 BRMS52 None None   I135T, S162C, E169D, T200I, R211K  
BRMS53 BRMS53 None None  V179D K101KR, V118I, D121DY, D123E, I135V, R211K, F214L  
BRMS54 BRMS54 None None   S68G, K122E, D123N, I135T, K166KR, D177E, R211K  
BRMS55 BRMS55 None None   D123E, I135T, D177E, I178V, F214L  
BRMS56 BRMS56 None None   V35T, K49R, I135T, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207E, R211K  
BRMS57 BRMS57 None None   A98S, K102Q, D121H, K122E, I135T, K166R  
BRMS58 BRMS58 None None V75M  V35I, V90I, D123E, I135T, D177E, T200A, E204EG, R211G  
BRMS59 BRMS59 None None   S68G, K103Q, D123E, I135T, S162A, E169D, V179I, G196E, R211G  
BRMS60 BRMS60 None None   S68G, K122E, D123N, I135T, S162C, D177E, I178L, V179I  
BRMS61 BRMS61 None None   K20R, K102Q, K122E, I135T, K166R, I178M, V189I, I202V, E204D