Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Descamps (2010)
Title Increasing prevalence of transmitted drug resistance mutations and non-B subtype circulation in antiretroviral-naive chronically HIV-infected patients from 2001 to 2006/2007 in France
Citation J Antimicrob Chemother
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 465
NumPts 465
Subtype B, CRF02_AG, A, C, G, F, CRF01_AE, CRF06_cpx, D, CRF18_cpx, CRF11_cpx, CRF45_cpx, CRF09_cpx, A + J, H, CRF49_cpx, CRF03_AB, CRF25_cpx, CRF31_BC, A + G


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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 465 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
100odyssee 100odyssee None None   V35T, E36D, V60I, T200I  
101odyssee 101odyssee None None   V21I, V35VI, E53ED, D123DE, S162C, R211K, A272S, T286A, K311R, Q334E  
103odyssee 103odyssee None None   V60I, D123E, S134SN, I135V, D177E, R211K, V245K  
104odyssee 104odyssee None None  V106I V35IM, V60I, S68G, D123E, I135T, I178L, T200D, Q207E, R211RK M16N 
106odyssee 106odyssee None None   V21VI, V35T, T39A, E40D, V60I, I135V, S162C, K173V, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211E  
107odyssee 107odyssee None None   V35T, I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174K, D177E, D192N, T200A, Q207E, R211A, F214L, V245Q  
108odyssee 108odyssee None None   V8VI, K20KR, T69TA, K122E, D123DN, I135T, K173E, R211K  
110odyssee 110odyssee None None   K49R, V90I, K122KE, D123DN, I142T, T165I, F214L  
111odyssee 111odyssee None None T215CY  V35T, T39N, E40D, V60I, S68G, K122E, D123NS, I135V, K173A, D177E, T200L, Q207A  
113odyssee 113odyssee None None   F87L, I135V, I142T, S162C, Q207L, R211K  
114odyssee 114odyssee None None   K122E, P133PL, I135T, S162C, I202V  
115odyssee 115odyssee None None D67N, T69D, T215AV, K219Q K103N, E138Q, Y181C V118I, K122E, P133PL, G196E, T200A, R211K, F214IL, E224D, L228H, V245M  
116odyssee 116odyssee None None   V60I, D121H, I142V, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K E40Y 
118odyssee 118odyssee None None  K238N I47N, K49R, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, F214L, H221HQ, V245P, S251R A62AD 
119odyssee 119odyssee None None   K122R, I135IV, R211K E194E*, R199RI 
11odyssee 11odyssee None None  E138A K122E, I142V, R211K  
120odyssee 120odyssee None None  K103NS, E138Q A98S, K122E, D123E, D177E, L228F  
122odyssee 122odyssee None None M41L, D67N, L74LI, T215C, K219E G190A V35VI, E40V, K43KE, T69N, K122E, D123N, I135IT, I142V, S162N, S163ST, M164MI, I178M, V179I, V189A, T200TA, I202IV, V245EK  
123odyssee 123odyssee None None   I135V, I142T, S162C, Q207L, R211K  
12odyssee 12odyssee None None M41L, L210W, T215S E138A K43E, E44A, V118I, S162C, Q174E, T200I, R211K, F214L, V245T  
13odyssee 13odyssee None None   V35T, E36D, E40D, K122P, I135V, A158S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K  
14odyssee 14odyssee None None V75I K103N, P225H V35T, T39A, V60I, I132L, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q  
15odyssee 15odyssee None None   K49R, I132V, I135A, A158S, S162Y, E169D, Q207E, R211K  
16odyssee 16odyssee None None M41L, T215S  D123E, A158S, K166R, D177E, T200A  
17odyssee 17odyssee None None   V35T, V60I, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200E, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
18odyssee 18odyssee None None   S68G, K102Q, K104R, S162A, K173Q, I178L, R211K  
1odyssee 1odyssee None None M41L, T215E  K122E, D123N, I142V, D177E, I178M  
21odyssee 21odyssee None None   V118I, S162D, T165I, P170S, I178M, T200A, R211K, F214L  
22odyssee 22odyssee None None   V35T, E36D, E40A, I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211E, F214L, V245Q  
23odyssee 23odyssee None None   D123E, I142V, K173D, Q174K, I178M, R211K, V245K, D250E  
25odyssee 25odyssee None None   V35T, E36D, T39L, D123N, I132V, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, I180V, T200A, Q207E  
26odyssee 26odyssee None None   V35T, E36D, E40D, K122P, I135V, A158S, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207A, R211K  
27odyssee 27odyssee None None   V60I, R83K, G196E, R211K  
28odyssee 28odyssee None None   V35T, E36D, T39A, K49R, V60I, I135V, I142V, S162A, R172K, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K G93A, K173P 
29odyssee 29odyssee None None   S68G, D177E, I178L, R211Q, V245T, A272P, K277R, L283I, E297A, V317A, I329L, Q334Y  
2odyssee 2odyssee None None   R83RK, D123E, R211K  
30odyssee 30odyssee None None   V35T, K122E, D123N, I135T, D177E, I202V, V245M  
31odyssee 31odyssee None None   I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
33odyssee 33odyssee None None   K122E, A158S, I202IV, R211K, V245T  
34odyssee 34odyssee None None F77FL  T39S, D86DN, K122KE, I135X, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
36odyssee 36odyssee None None   E40D, K43R, V60I, A98S, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211S, V245Q, E248D, D250E  
38odyssee 38odyssee None None  V179VE V60I, V118I, D123N, I135V, T139K, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, I178V, D192DE, T200A, Q207E, L210LI, F214L, L228LF  
39odyssee 39odyssee None None  E138A V60I, S68G, V108X, L109LMV, D121X, K122P, I135T, R211K, Y232X E89ED 
3odyssee 3odyssee None None   V35T, V60I, K122E, T200A, R211K, D218DG, T240TA, E291D, V292I, I293V, E297R, E305EK  
40odyssee 40odyssee None None   V60I, D113DE, D123E, S134SR, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, F214L, T216TP, E224EG, V245Q, L246LR, P247X W153WG 
41odyssee 41odyssee None None   V60I, S68G, D121H, K122E, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245VE, E248D, K249X  
42odyssee 42odyssee None None   P9X, V35T, T39L, S48E, D123E, I135V, A158S, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, K238X, P243S, V245Q, E248X Y183Y* 
43odyssee 43odyssee None None   R72RK, R78RK, K122E, T131TP, I135KR, I142V, R143RK, S162A, E169R, R172RK, K173T, Q174EK, D177E, V189I, T200A, Q207E, R211RK, F214L, V245Q  
44odyssee 44odyssee None None   K122E, D123N, K173S, D177E, T200TA, Q207A, R211S, V245Q, E248DN  
45odyssee 45odyssee None None M41L, L210W, T215C  E44D, V60I, S68SG, R72RK, R78RK, V118I, K122A, R125RK, I135IT, R211K H96HP, V111VG 
46odyssee 46odyssee None None D67DN  R72RK, R78RK, E79EK, T139TA, A158AS, D177DN, T200A, Q207HL, R211K  
47odyssee 47odyssee None None   K102Q, D123E, I135V, S162C, I178IM, T200A  
49odyssee 49odyssee None None   T69TP, R72RK, R78RK, E79EK, R83RK, D86DN, K122E, D123NS, R125RK, I135T, I142V, V148VG, E169ED, K173A, Q174QK, T200AE, Q207A, R211K, V245KQ  
50odyssee 50odyssee None None D67N, T215V, K219Q  E40D, V60I, T69NS, K104KR, K122E, D123N, I142IT, A158S, K173S, Q174R, S191SF, Q207A, R211X, F214FL L149LV, Y183YN 
51odyssee 51odyssee None None A62AV  K43KE, S68G, T69TP, R72RK, D76DN, R78RK, K104KR, K122KE, D123S, T131TP, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, D237A, Q242QH, V245E W71WG 
52odyssee 52odyssee None None   A98S, D121H, K122E, I135T, I142IT, K166KR, E169D, I178M, I195L, G196E, I202IV, R211G, K259KN V111VG 
53odyssee 53odyssee None None   V60I, R83K, D121FY, K122E, E169EK, R172RK, D177EK, R211K  
54odyssee 54odyssee None None   T69TN, L109LM, P119PS, D123E, S162SG, K173A, Q174K, D177E, I178IM, S191SF, T200TA, Q207E, R211RK T84TN, A114AG, T128TN, L149LV, Y183YN 
55odyssee 55odyssee None None  K238KN K102Q, S134SR, I135V, S162A, K173L, D177E, D186DE, S191SF, Q207A, R211K, E233X, W239X Y183YN, L205LV, Y232Y*, D237T 
56odyssee 56odyssee None None   R83K, K103R, K104R, V118VI, K122KE, I135T, R143RK, E169EK, R172RK, V179I, G196E, F214L  
58odyssee 58odyssee None None  V108VI K43KE, R78RK, K102Q, K104KR, D121DN, K122E, D123G, R125RK, I142V, R143RK, S162Y, E169EK, K173L, D177EK, V179I, E194EK, Q207A, R211K, V245Q  
59odyssee 59odyssee None None  L100LV P52PA, D86DE, L109LI, D113DE, P119PS, K122E, D123S, I142IV, K173S, D177E, V179I, D186DE, S191SF, T200A, Q207AG, H208HY, R211RS L80LV, T84TN, T128TN, A129AG, L149LV 
5odyssee 5odyssee None None   K11S, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K166R, E169D, F171Y, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K  
60odyssee 60odyssee None None   V60I, R78RK, D121DN, K122E, D123S, I135V, S162A, R172RK, K173T, Q174K, D177EK, T200A, Q207E  
61odyssee 61odyssee None None   D121DN, D123E, I135T, R172RK, D177EK, R211Q, F214L  
62odyssee 62odyssee None None  V106VI K49R, V60I, R78RK, D86DN, D113DN, K122KR, D123DE, I135IT, R172RK, D177EK, I178M, T200A, E204EK, Q207E, R211K, V245K, D250X H96HP 
63odyssee 63odyssee None None   K122E, D123N, D177E, I178L, G196K, Q197K, T200E, K201KR, I202V, Q207K, P243T, I244V, V245T  
66odyssee 66odyssee None None   T69TA, D123E, I142M, S162C, T200I, R211K  
67odyssee 67odyssee None None   V35M, F171Y, D177E, I178M, I202V  
69odyssee 69odyssee None None   S68G  
6odyssee 6odyssee None None   I135IV, T200AV, R211S  
70odyssee 70odyssee None None  K103N, K238T D121H, K122E, I142V, S162C, D177E, R211K, V245T  
72odyssee 72odyssee None None   S68G L26S 
73odyssee 73odyssee None None   I50V, S68G, I135X, Q207A, R211K  
74odyssee 74odyssee None None   A98S, D123E, S162A, D177E, R211K, V245K  
75odyssee 75odyssee None None   V21I, V35T, V60I, D121H, K122KE, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211S, V245Q  
76odyssee 76odyssee None None   V35T, E36D, E40ED, K43N, K49R, V90I, A98S, D121HY, K122E, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E  
77odyssee 77odyssee None None   V35T, T39K, E40EA, K43E, K122E, D123G, S162SC, K173S, Q174K, D177E, Q207AD K49KN 
78odyssee 78odyssee None None   S48E, S162C, E169ED, G196E, T200A, E204K, R211G  
79odyssee 79odyssee None None   R211K, V245K L12V 
7odyssee 7odyssee None None  V106I K122E, K166R, I202V, R211K, F214L, V245KM, A272P, K277R, I293V, S322A  
80odyssee 80odyssee None None   D123E, I142V, S162C, Q207K, R211K, T286A, I293V, I329V, G333E, Q334L L303LR 
81odyssee 81odyssee None None   D123N, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
82odyssee 82odyssee None None   D123E, I135T, I142T, K166R, D177E, G196E, R211Q, V245I  
83odyssee 83odyssee None None   V60I, R83K, K166R, T200E  
84odyssee 84odyssee None None   K13R, T39A, K49R, I50V, V60I, I142T, R211Q  
85odyssee 85odyssee None None   P19Q, V35T, V60I, A158S, T200I, Q207K, R211K  
86odyssee 86odyssee None None   L12I, P14T, K122E, D123N, K173E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
87odyssee 87odyssee None None   V35T, E36D, T39A, E40D, K102KQ, K104R, K122E, D123S, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E G155E 
89odyssee 89odyssee None None   A98S, Q197K, R211K  
90odyssee 90odyssee None None   K13R, K49R, I50V, V60I, K122E, I142T, Q207R T131I 
91odyssee 91odyssee None None   E28K, K32E, V35T, E36D, T39A, I135V, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207T, R211K  
92odyssee 92odyssee None None   D123E, I135T, S162C, D177E, I178V, T200A, R211K  
94odyssee 94odyssee None None   K122P, I178M, R211K D218A, K220Q 
95odyssee 95odyssee None None   V35T, T39L, S68G, V90I, D121Y, K122Q, I132V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
96odyssee 96odyssee None None   E36DN, G196E, Q207G, L228F  
97odyssee 97odyssee None None   V35T, T39M, V60I, K104R, D121Y, K122E, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
98odyssee 98odyssee None None   V35T, E36D, T39L, V60I, S68G, I135R, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207E  
99odyssee 99odyssee None None   D123E, I135T, S162C, D177E, I178V, T200V, R211K  
9odyssee 9odyssee None None   V35I, K49R, A98S, I135T, S162C, D177E, I178M, Q207G, R211K, E224D K223N