Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Telan (2013)
Title Possible HIV transmission modes among at-risk groups at an early epidemic stage in the Philippines.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 174
NumPts 174
Subtype B, CRF01_AE, C, CRF02_AG, A, G, B + CRF02_AG

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 174 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1001070 1001070 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1001078 1001078 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
100108 100108 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
100109 100109 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
100110 100110 None None  V106I V21I, V60I, K104R, I135T, L193F, T200I, V245M, K249Q, A272P, K277R  
100116 100116 None None  V106I I178M, L193F, T200I  
100117 100117 None None  V106I I178M, L193F, T200I  
100123 100123 None None  V106I I178M, L193F, T200I  
100136 100136 None None  V106I G45R, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
100137 100137 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
100148 100148 None None  V106I T107P, D123G, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P L109Q, D110E, V111K 
100149 100149 None None  V106I I178M, L193F, T200I  
100150 100150 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P Y115H 
100152 100152 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, D121H, K122E, D123S, I135R, K173L, Q174K, D177E, I180V, T200E, E203D, Q207A, R211S, V245E, V276I  
100155 100155 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245I, A272P  
1002128 1002128 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1002136 1002136 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1002390 1002390 None None  V106I I178M, L193F, T200I, D237N, V245M, A272P  
1002461 1002461 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1002762 1002762 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1002764 1002764 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, D121H, K122E, D123S, I135R, K173L, Q174K, D177E, I180V, T200E, E203D, Q207A, R211S, V245E, V276I  
10031110 10031110 None None   E6D, V35I, A98S, K122E, D123E, I135T, K173I, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272G  
10041522 10041522 None None   K11R, V35T, T39E, S48T, K122E, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207D, V245Q, A272P, K277R  
10041651 10041651 None None   V35T, T39L, S48T, V60I, K122E, D123N, I135V, S162A, T165I, K173A, Q174N, D177E, I178M, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
1008604 1008604 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008619 1008619 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008624 1008624 None None  V106I K122N, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P V111G, V118L, A129S, N136S, G141W, Y146C, N147A 
1008625 1008625 None None  V106I K104R, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008634 1008634 None None  V106I V21I, V60I, I135T, I178M, V245M, K249Q, A272P, K277R  
1008642 1008642 None None  V106I P9T, K104R, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008643 1008643 None None  V106I G15E, I178M, L193F, T200I, F214L, V245M, A272P  
1008645 1008645 None None  V106I V21I, V60I, I135T, I178M, V245M, K249Q, A272P, K277R  
1008647 1008647 None None  V106I T27P, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008648 1008648 None None  V106I I178M, L193F, T200I, F214L, V245M, A272P  
1008649 1008649 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008652 1008652 None None  V106I I178M, L193F, T200I, R211G, V245M, A272P  
1008654 1008654 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008657 1008657 None None  V106I D123N, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008660 1008660 None None  V106I, V108I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008663 1008663 None None  V106I E6D, K11T, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P, V276I  
1008675 1008675 None None  V106I, V108I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008676 1008676 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008677 1008677 None None  V106I D121Y, R125K, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008678 1008678 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, D121H, K122E, D123S, I135R, K173L, Q174K, D177E, T200E, E203D, Q207A, R211S, V245E, V276I  
1008681 1008681 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008685 1008685 None None  V106I T27A, I178M, L193F, T200I, F214L, V245M, A272P  
1008689 1008689 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008692 1008692 None None  V106I D177N, I178M, L193F, R199K, T200I, D218N, V245M, A272P  
1008698 1008698 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008701 1008701 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008702 1008702 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008706 1008706 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008709 1008709 None None  V106I K166T, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1008710 1008710 None None  V106I I178M, L193F, T200I, R211K, V245M, A272P  
1008713 1008713 None None  V106I I135R, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
1101275 1101275 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200V, Q207A, R211S, D237N, K238R, V245E, K249R  
11022040 11022040 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
11022573 11022573 None None  V106I K11R, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
11022730 11022730 None None  V106I I178M, L193F, T200I, R211K, V245M, A272P  
11023131 11023131 None None   E6D, V8I, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, E204Q, Q207A, R211S, K238R, V245E  
1102435 1102435 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K173L, Q174K, D177E, I180V, T200E, E203D, Q207A, R211S, V245E, V276I  
1102437 1102437 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
11024645 11024645 None None  V106I I135T, I178M, L193F, T200I, I244V, V245M, A272P  
11028757 11028757 None None   S68G, W88C, S162A, T200I, V245Q, I257L, A272P, K277R  
110313474 110313474 None None  V106I K166I, I178M, L193F, T200I, V245M, A272P I270N 
110313500 110313500 None None  V106I V21I, V60I, I135T, I178M, V245M, K249Q, A272P, K277R  
11031525 11031525 None None  V106I E6D, V8I, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K104R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, E204Q, Q207A, R211S, K238R, V245E  
110318367 110318367 None None   E6D, V35T, T39R, V60I, S68G, D121H, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E, K281R  
110318565 110318565 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200V, Q207A, R211S, K238R, V245E K20M 
110318696 110318696 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
110318824 110318824 None None   E6D, V8I, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, E204Q, Q207A, R211S, K238R, V245E  
11042550 11042550 None None   V35T, T39A, V111I, I135T, I142V, Q174H, R211K, F214L, V245Q, E248D, A272P  
11042829 11042829 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I195L, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248D  
11042838 11042838 None None  E138G E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, R83K, K122E, D123N, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200V, Q207A, R211N, K238R, V245E  
11042857 11042857 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135T, I142V, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200V, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249R  
11052748 11052748 None None   E6D, V35I, E36A, T39K, K43E, V111I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E  
11052838 11052838 None None  E138G E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, R83K, K122E, D123N, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200V, Q207A, R211N, K238R, V245E  
11052918 11052918 None None   P4T, E6A, V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200V, Q207N, R211K, K238R, V245E  
11052990 11052990 None None   V35T, E36D, T39M, K122E, D123S, I135T, S162A, K173S, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, L283I  
11053016 11053016 None None   E6D, K11T, V35T, D123N, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
11053021 11053021 None None   K20R, K122E, I135T, S162C, Q174N, T200E, Q207N, R211K, A272P, K277R  
11063493 11063493 None None   V35T, K102Q, K122E, D123N, I132V, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
11063580 11063580 None None   E6D, P9S, V35T, T39K, K43E, K49R, V60I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200V, Q207A, R211S, K238R, V245E  
11063626 11063626 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135T, R172K, K173I, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272G, K277R  
11063707 11063707 None None   K102R, V179I, I195L, G196E, Q197K, Q207R, R211G, S251N, A272S  
11063743 11063743 None None   V35T, T39E, S48T, A98S, K122E, D123N, I135R, K173A, D177G, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K275Q  
11063809 11063809 None None   E6D, V35I, A98S, K122E, D123E, I135T, K173I, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272G  
11074623 11074623 None None   V35I, E36K, I178M, V179I, G196E, Q197K, T200A, Q207A, K238R, V245E  
11084622 11084622 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P  
11084717 11084717 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, I135T, I159V, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, E204Q, Q207A, R211S, V245E  
11084721 11084721 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200V, Q207A, R211S, K238R, V245E  
11084876 11084876 None None   E6D, K11S, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, K275Q  
11117952 11117952 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K102R, K122E, D123S, S162C, E169K, K173I, Q174K, D177E, V179I, E194D, I195L, T200A, E203D, Q207A, R211S, V245E  
12053270 12053270 None None M184V, T215Y K101E, V106I, G190A E6D, E28A, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173T, Q174K, N175Y, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, V245K  
801357 801357 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173G, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
801359 801359 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
801361 801361 None None   S162C, D177E, R211K, V245M, K277R, Q278E  
9095779 9095779 None None   V35I, V179I, I195L, G196E, Q197K, I202V, S251N, A272S, V276I  
9098062 9098062 None None  V106I I178M, L193F, T200I, V245M, A272P  
9098567 9098567 None None   E6D, V35T, T39R, V60I, S68G, D121H, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E, K281R  

Database

Resources

Team