Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ragonnet-Cronin (2012)
Title Genetic diversity as a marker for timing infection in HIV-infected patients: Evaluation of a 6-month window and comparison with BED.
Citation J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 1308
NumPts 1308
Subtype B

 
  Page 1 of 14    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 1308 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
PHAC_001 PHAC_001 None None   T69S, S162C, T200TI, R211K, A272P, K277KR, I293V, E297I  
PHAC_002 PHAC_002 None None   K49R, K122E, S162C, I178M, V179I, I202V, E204Q, Q207E, A272P, V276I, K277R, T286A  
PHAC_003 PHAC_003 None None   V35M, T39A, D86E, V118I, D123X, P176S, F214L, Q278H, T286A, A288AT, K311R  
PHAC_004 PHAC_004 None None   K20R, V60I, I135T, R211RS, A272P, V292I, I293V, P294PT, E297K  
PHAC_005 PHAC_005 None None   K49R, D123E, I135T, S162C, I178M, Q207E, A272P, V276I, T286A, I293V, E297A  
PHAC_006 PHAC_006 None None   E6D, K20R, D76DN, S162C, D192DN, Q207E, K277R, I293V E300EG 
PHAC_007 PHAC_007 None None   T69S, S162C, R211K, A272P, K277R, I293V, E297A  
PHAC_008 PHAC_008 None None   K101R, I142V, T200A, F214L, K277R, L283I, T286A, I293V, P294T, E297A  
PHAC_009 PHAC_009 None None   V35M, T39A, D86E, V118I, I135T, P176S, F214L, Q278H, T286A, A288T, K311R  
PHAC_010 PHAC_010 None None   V35I, K49R, K64KR, D121DY, K122KE, D123DN, I142IT, E169D, I178IM, V179VI, I202IV, R211RK, A272P, K277R, V292VI, I293V, P294PS, E297A  
PHAC_011 PHAC_011 None None   E6D, R83K, K102Q, D123E, S162A, R211K, V245K, A272P, K277R, I293V, E297R, L301I  
PHAC_012 PHAC_012 None None   S162SC, I178M, G196GR, R211Q, V245Q, K277R, Q278H, T286A, E291D, I293V, E297AT, E312V  
PHAC_013 PHAC_013 None None   D123E, I142V, S162C, K277R, I293V, E297P  
PHAC_014 PHAC_014 None None   V35I, V60I, R83K, D177E, I178M, T200I, Q207N, R211K, D250E, A272P, V276T  
PHAC_015 PHAC_015 None None   I135K, S162C, Q207E, A272P, K277R, T286A, P294T  
PHAC_016 PHAC_016 None None   D123E, S162C, D177E, T200TA, Q207E, R211S, A272P, I293V, E297A  
PHAC_017 PHAC_017 None None   V60I, I135T, Q174QK, G196E, Q207E, R211RK, V245KQ, E248D, D250DE, V292VI, I293V, E297K E298E* 
PHAC_018 PHAC_018 None None   K49KR, V60VI, R83K, V90VI, G196GE, R211Q, A272PS, K275KR, V276VI, T286TA, E312EA W71W* 
PHAC_019 PHAC_019 None None   V35I, V60I, R83K, D123DN, K275KR, K277KR, Q278E, K281KR, E297K, A304AE, K311R  
PHAC_020 PHAC_020 None None   K64R, K104N, I135T, S162Y, Q174E, V179I, G196E, T200I, R211G, Y271F, A272P, V276I, I293V  
PHAC_021 PHAC_021 None None   S162C, G196E, A272G, K277R, I293V, E297V  
PHAC_022 PHAC_022 None None  V108VI K20R, V60I, D123EK, I135IT, K166KR, D177DE, I178IM, V245VM, A272P, K277R, V292I, I293V, P294T P1PT 
PHAC_023 PHAC_023 None None   S162Y, Q174K, Q197E, T200A, R211K, A272P, K277R, E297K  
PHAC_024 PHAC_024 None None  K103N K20R, K122E, I135T, R211K, V276VI, K277KQ, P294Q  
PHAC_025 PHAC_025 None None   V35I, R83RK, I202V, Q207QE, A272P, K281R, I293IV  
PHAC_026 PHAC_026 None None   T69S, S162C, R211K, A272P, K277R, I293V, E297A  
PHAC_027 PHAC_027 None None   K20R, D121Y, K122E, I135T, K166R, V179I, T200I, A272P, T286A, I293V  
PHAC_028 PHAC_028 None None   E29EK, T39TA, D121HY, K122E, I135T, S162C, D177E, I178M, Q207K, R211AT, V245M, A272AP, K277R, I293V, P294T, E312EA  
PHAC_029 PHAC_029 None None   Q207E, R211K, F214L, V245VE, K249KQ, D250DN, K277R, R284K, T286A, E312T  
PHAC_030 PHAC_030 None None   K122E, T200V, R211K, V245L, A272P, K277R, I293V, P294V, E297Q, L301M  
PHAC_031 PHAC_031 None None   K64KR, D121H, K122E, I135T, S162C, D177E, G196E, E204ED, R211X, A272P, K277R, T286A, E297K  
PHAC_032 PHAC_032 None None   V60VI, D123E, I142IV, S162C, Q174QK, Q207QH, R211X, V245E, A272P, K277R, V292I, I293V, E297A, K311KR  
PHAC_033 PHAC_033 None None   S162C, R211K, A272P, K277R, I293V, E297V, E298EK  
PHAC_034 PHAC_034 None None   R83K, I135T, S162CY, I195IT, T200TA, I202V, R211K, K249KR, A272P, T286A, I293IV, P294PQ, E297EA, E300EQ  
PHAC_035 PHAC_035 None None   K11KR, K13KR, S162C, Q174K, I293V, E297A  
PHAC_036 PHAC_036 None None   E6D, E42EK, R72RK, S162Y, R172RK, D177E, R211K, I257L, G262GE, A272P, K277R, I293V  
PHAC_037 PHAC_037 None None   S68G, V90I, D123E, I135T, D177E, T200A, E204D, R211K, V245VE, T286TA  
PHAC_038 PHAC_038 None None   V35M, T39A, D86E, V118I, I135K, P176S, F214L, Q278H, T286A, A288T, K311R  
PHAC_039 PHAC_039 None None   V35T, A98S, K122E, D123S, D177E, I178L, T200A, E204Q, R211K, V245E, I293V, P294Q, K311R  
PHAC_040 PHAC_040 None None  V179D E28A, V60I, K102KR, K122E, I135T, I142T, E169D, Q207E, F214L, A272P, T286A, E297K  
PHAC_041 PHAC_041 None None   E6D, K32KN, V35I, S68G, K82KR, I135R, S163T, I178IM, K311KR, E312EQ  
PHAC_042 PHAC_042 None None   D123E, I135IV, S162C, I178ILM, D218DN, A272P, K277R, T286A, I293IV, E297A  
PHAC_043 PHAC_043 None None   E29EK, V35T, T39I, D123E, I135T, D177E, T200I, Q207E, V245K, K277R, L283I, A288T, I293V  
PHAC_044 PHAC_044 None None   K49R, D86E, I135T, S162C, E224D, K277R, I293V, T296S, E297A  
PHAC_045 PHAC_045 None None   V35I, K49R, R83K, D123E, I135T, T165I, I178M, Q207E, V245K, A272P, K277R  
PHAC_046 PHAC_046 None None   K20R, V60I, D123E, I135T, Q174QH, I178ILM, Q207QR, R211EK, V292I, K311KR  
PHAC_047 PHAC_047 None None   K11KR, R83K, V90I, S162A, D177G, V245T, D250E, A272P, K277R, T286A, E297K G93GE 
PHAC_048 PHAC_048 None None   V35I, D123E, Q174K, D177E, R211RK, A272P, K281R, I293V  
PHAC_049 PHAC_049 None None   K122I, I142IV, S162C, K173T, G196E, Q207A, E224ED, V245VE, E248D, A272P, K277R, V292VI, I293IV, E297K  
PHAC_050 PHAC_050 None None   D123E, I135T, S162CY, T200I, K277R, E297A  
PHAC_051 PHAC_051 None None   V35VI, T39TA, D123E, I135IT, I142IT, S162SC, T200I, Q207DH, R211RK, F214FL, L228LF, V245X, E248ED, K277KR, E291ED, I293IV, P294PS, E297KR  
PHAC_052 PHAC_052 None None   D121Y, K122E, I135IT, S162C, R211X, F214L, I293V, E297A  
PHAC_053 PHAC_053 None None   D123X, S162C, R211K, I293V, E297T  
PHAC_054 PHAC_054 None None   S162C, R211K, A272P, K277R, I293V, E297IV  
PHAC_055 PHAC_055 None None   V35ST, E53ED, S162X, E169D, T200TA, R211KQ, V245M, A272P  
PHAC_056 PHAC_056 None None  E138A M16T, K20R, T39E, V60I, K122R, I135V, K173Q, D177E, A272P  
PHAC_057 PHAC_057 None None   E204K, R211G, F214L, I293V, E297A  
PHAC_058 PHAC_058 None None   V35I, A158S, E194EK, V245M, T286A, E297EK, E298EK G213GE 
PHAC_059 PHAC_059 None None   V60VI, I135T, R211EK, K277R, L283I, I293V  
PHAC_060 PHAC_060 None None   K49R, K122E, S162C, I178M, V179I, I202V, E204Q, Q207E, A272P, V276I, T286A, E312K  
PHAC_061 PHAC_061 None None   I50IV, D121Y, K122E, I135T, S162C, R172RK, I178IM, R211RK, V245A, A272P, K277R, I293V, E297A  
PHAC_062 PHAC_062 None None   V35I, I135M, S162C, Q174E, I178M, T200A, R211Q, P236L, A272P, I293V, E297A  
PHAC_063 PHAC_063 None None   K102Q, K104R, S162C, V189I, K238R, K277R, I293V, E297T A272LP 
PHAC_064 PHAC_064 None None M41L, L210W, T215C K103N, Y181C V35M, T39A, K122E, I135T, E169D, T200I, Q207E, R211K, I293V  
PHAC_065 PHAC_065 None None   I142IV, G196E, T200TA, E248D, A272P, K277KR, I293V, E297A, P313PT  
PHAC_066 PHAC_066 None None   D123E, I135V, T200I, R211K, E248D, A272P, V276I, I293V  
PHAC_067 PHAC_067 None None   K20R, K101Q, K103R, D123E, I135K, E203EK, R211K, V245K, D250E, K277R, L283I, I293V, E297AV  
PHAC_068 PHAC_068 None None   E6D, R83K, K102Q, D123E, S162A, R211K, V245K, A272P, I293V, E297R, L301I  
PHAC_069 PHAC_069 None None   K20R, V35I, V60I, R83K, I135T, R211K, V245E, T286A, E297K  
PHAC_070 PHAC_070 None None   K20R, V35IM, R83K, V90I, S162X, I202IV, Q207A, R211K, A272AG, P294T  
PHAC_071 PHAC_071 None None   V35VIM, S48T, K49R, D123E, T139TS, A158S, T165TI, K166KR, R211K, E248T, A272P, K277R, I293V, E297A  
PHAC_072 PHAC_072 None None  E138EA K49KR, R83K, D123E, S162ST, I178L, E203ED, R211K, A272P, R284K, A288S, V292I, I293V, E297A  
PHAC_073 PHAC_073 None None   E28EA, D121H, K122E, I142IV, S162C, D177E, I178M, R211K, V245M, K277R, I293V, P294T, E312AT  
PHAC_074 PHAC_074 None None   A98S, I135K, R172RK, Q174R, I178M, G196E, A272P, I293V, E297V  
PHAC_075 PHAC_075 None None M41L, L210W, T215S  E6D, T39A, K101R, K122P, S162C, Q207E, R211K, V241I, A272P, T286TA, P294S  
PHAC_076 PHAC_076 None None   E28EG, I135M, S162C, H208Y, R211K, A272P, K277R, I293V, E297V  
PHAC_077 PHAC_077 None None   V60I, A98S, I135L, A158S, K173N, Q174QK, R211K, V245I, I293V W153WG 
PHAC_078 PHAC_078 None None   I142V, Q174K, Q207K, R211A, K249Q, A272P, I293V, E297K, L301M, E312V  
PHAC_079 PHAC_079 None None   K122KE, I135T, S162C, Q207E, A272P, K277R, I293V, E297A  
PHAC_080 PHAC_080 None None T215S  R83K, D121Y, K122E, I135T, S162A, D177E, R211RS, I244V, V245K, A272P, K277KR, V292VI  
PHAC_081 PHAC_081 None None   I135T, S162C, K173KE, A272P, K277R, I293V, E297A, K311R  
PHAC_082 PHAC_082 None None   D123E, S162C, K173R, D177E, T200TI, Q207AE, R211K, A272P, I293V, E297A, A304E  
PHAC_083 PHAC_083 None None   K20KR, V35I, T69TN, D123E, K166KR, R211K, V245K, D250E, K277Q, L283I, I293V, E297A  
PHAC_084 PHAC_084 None None   D121HY, K122E, I135V, S162A, E169D, D177E, T200A, I244V, K277R, T286A, E291D, I293V, E297A  
PHAC_085 PHAC_085 None None  K103KN, Y181YC, H221HY K122KE, S162SC, T200TA, R211K, F214FL, A272P, K277R, I293V, E297V  
PHAC_086 PHAC_086 None None   K122E, S162C, G196GR, Q197E, R211K, A272P, K277R, I293V, E298D  
PHAC_087 PHAC_087 None None   D123E, S162C, D177E, R211K, A272P, K277R, I293V, E297V  
PHAC_088 PHAC_088 None None   V35VI, R83K, A98S, K122KE, D123E, K166KR, A272S, K277KR, T286TA  
PHAC_089 PHAC_089 None None   K20R, K122P, D177E, G196E, Q207QH, R211G, V245K, D250E, K277R, L283I, I293V, E297A  
PHAC_090 PHAC_090 None None   R83K, K122P, I135T, K166R, D177E, Q207E, K277R, T286A, I293V  
PHAC_091 PHAC_091 None None   E6ED, K122KE, S162C, T200A, R211RK, F214L, I293V, E297A  
PHAC_092 PHAC_092 None None   K122KE, D123E, S162C, K173R, D177E, Q207A, R211K, A272P, I293V, E297A, A304E  
PHAC_093 PHAC_093 None None   T39K, V60I, S68G, T69N, K104KR, K122E, I135V, I142M, E169D, T200A, R211K, V245E, A272P, E297K  
PHAC_094 PHAC_094 None None   K20R, S162A, Q207E, R211K, K277R, I293V  
PHAC_095 PHAC_095 None None   V60VI, I142V, I178IM, Q197E, R211RG, V245E, D250DE, V292I, I293V, E297A, E312ED  
PHAC_096 PHAC_096 None None   V21I, T165I, E169D, Q197QK, T200X, I202V, R211K, A272P, V276VI, L283I, A288AS  
PHAC_097 PHAC_097 None None   V21I, D123N, S162C, T200I, E204EK, R211S, K277R, I293V, E297A, E298EK  
PHAC_098 PHAC_098 None None M41L, L210*RW, T215S  E6D, T27TA, E29EK, K122P, S162C, E169EK, E203EK, Q207EK, R211K, V241I, A272P V261VM 
PHAC_099 PHAC_099 None None   K122KE, D123E, I142T, E169D, D177E, I178IL, T200A, R211K, V245E, A272P, V276I, L283LI, E297K, K311R  
PHAC_100 PHAC_100 None None   V35M, V118VI, D123E, K166KR, E169EG, D177E, I178IV, T200A, Q207E, R211RK, F214L, V245VIM, K277R, T286A, I293IV  

Database

Resources

Team