Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Frange (2012)
Title Recent HIV-1 infection contributes to the viral diffusion over the French territory with a recent increasing frequency.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 989
NumPts 989
Subtype B, CRF02_AG, A, G, C, CRF01_AE, F, CRF06_cpx, CRF09_cpx, CRF45_cpx, D, CRF60_BC, CRF12_BF, B + C, CRF56_cpx, CRF11_cpx, CRF27_cpx, CRF18_cpx, G + Unknown, G + H + J

 
  Page 1 of 10    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 989 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
130107EJX 130107EJX None None   E28A, V35I, R83K, D123E, I135T, D177E, I178M, G196E, Q207H, R211K  
130206KOR 130206KOR None None   V35I, I50V, R83K, A98S, E169D  
130215DHX 130215DHX None None   V35I, R83K, A158S, R211K, V245E  
130216HYS 130216HYS None None   T7A, D17E, V35T, V60I, D123E, K166R, D177E, I178M  
130220FAD 130220FAD None None M41L, M184V, L210W, T215Y A98G T39K, K43E, K102R, K122P, D123E, T131P, I132X, I135V, N137I, I142V, Y146S, D177E, T200A, E203D, R211K  
130221NVY 130221NVY None None   T39L, D123E, I135T, D177E, I178L, G196E, Q207E, R211K  
140108BWJ 140108BWJ None None   S162C, Q174K, R211K  
310104HNK 310104HNK None None   I142V, R211K  
310105EYX 310105EYX None None   K20R, V60I, G196E, Q197K, R211K  
310203FAT 310203FAT None None T215S Y188L R83K, K102Q, S162C, I178M, G196E, T200A, E203K, Q207E  
330209GDL 330209GDL None None   I135M, K166R, G196E, R211K, E224X  
330216AHZ 330216AHZ None None   V35I, K49R, S162SG, K166R, D177E, V245M  
330225QCZ 330225QCZ None None   V35I, S68N, D123E, I135R, G196E  
330236XV 330236XV None None   K122E, I135T, I142V, G196E, R211G, F214L, V245T  
330422DF 330422DF None None   D123E, I135T, R211K  
330426DHU 330426DHU None None   E40D, A98S, I135V, F171Y, Q197K, T200I, R211K  
340101DZO 340101DZO None None F77FL  K20R, D123E, I135T, I142IM, I159ILV, F160X, K166R, E169D, I178L, R211K, F214FL  
340109HHL 340109HHL None None   P1S, V35M, S48E, V60I, D123E, Q174R, I178M, G196E, T200A, Q207H  
340135GBR 340135GBR None None   K49R, I50V, I142T, K166R, Q207E, R211K  
350101TABY 350101TABY None None   T27P, S162C, Q197H, E203D, R211K, V245M  
350104XN 350104XN None None D67N, T215C, K219Q  P1S, K20R, V60I, K102Q, K103R, K122E, S162C, Q174A, T200A, Q207E, V245K  
350120KAM 350120KAM None None   Q174K, I178M, R211K  
370213CJM 370213CJM None None   A98S, Q197K, R211K, F214L  
440107EGV 440107EGV None None   A98S, R172RK, Q197K, R211K  
440109KUB 440109KUB None None   S48E, D123E, K166R, T200A, L210LF  
440111BWC 440111BWC None None   K122E, S162C, R211K  
440113RUD 440113RUD None None   A98S, R211K  
440123ASD 440123ASD None None   D123E, I135T, S162C, D177E, I178V, E194K, T200V, R211K  
440130GGX 440130GGX None None   K122E, S162C, Q197H, R211K  
440131KOM 440131KOM None None   K104A, V118I, I135T, S162H, G196E, T200A, R211G, F214L  
440135JTH 440135JTH None None   A98S, Q197K, R211K  
440138HAH 440138HAH None None   A98S, F171Y, Q197K, R211K  
440139CGD 440139CGD None None   K122E, S162C, R211K  
440145NCG 440145NCG None None   A98S, K104E, F171Y, Q197K, R211K  
440147MKV 440147MKV None None   A98S, Q197K, R211Q  
490103XR 490103XR None None   E44K, I47F, S48Q, K49R, I135T, S162C, R211X  
490105OFV 490105OFV None None   T39S, I135L, S162C, G196R, T200A, R211E  
540104TN 540104TN None None   I5M, T27A, K122E, D123E, I135T, Q174K, I178M, V179I, I202V, Q207E, R211K, V245E  
630106CTXC 630106CTXC None None   A98S, K166R, R211K, K223R  
660106DFK 660106DFK None None   P1S, D123E, S162C, D177N, T200E, R211K, V245M  
680112LYO 680112LYO None None   V35I, S48T, D123E, I135T, G196E, Q207E  
680205KTV 680205KTV None None T215E  D123E, I142V, V179I  
690204OEJE 690204OEJE None None   K122E, D123N, I135IV, R211K  
690205VZPZ 690205VZPZ None None   A98S, I135V, T139A, T200A, R211K P225R 
690212BOA 690212BOA None None   R83K, A158S, K173R, R211K  
750206ETJ 750206ETJ None None   I2T, I5M, T7A, I135T, D177E, G196E, I202V, R211S, F214L  
750210MAX 750210MAX None None   T39A, S162C  
750211FQC 750211FQC None None   T39A, S162C  
750312KDT 750312KDT None None   A98S, D123E, I135T, T139K, S162C, R172K, K173E, I178M, T200A, R211S  
750507GE 750507GE None None   K122P, T165I, E169D, D177E, I195L, I202V, R211K, V245M  
750515DLF 750515DLF None None   D121H, K122E, I135T, I142T, R211S, F214L  
750520RW 750520RW None None   Q174K, I178M, R211K  
750609KFW 750609KFW None None   D123E, S162C, R211K  
750612NAG 750612NAG None None   A98S, K122E, D123E, I135R, T139K, S162C, I178M, T200A, R211S, V241I  
750712EV 750712EV None None   K173R, Q207K, R211K  
750714GMJ 750714GMJ None None   A98S, K102Q, D123E, I135T, G196E, E204Q  
750717XOS 750717XOS None None   K122E, D123T, D177E, R211K, V245M, E248N  
750804GYR 750804GYR None None M184V, L210W, T215Y  D123E, A158S, D177E, I178M, R211K, D218X, K220KN, M230X Y56I 
750810JQD 750810JQD None None   K11N, K22N, T27P, T39P, I135T  
750911FGW 750911FGW None None   S162C, Q174R, I178M, Q207H, R211K  
750913CRM 750913CRM None None  K103N S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, I178M, G196E, T200A, R211G  
751004NTX 751004NTX None None   A98S, G196E  
751105EEJ 751105EEJ None None   D123E, I142T, I202V, R211K, F214L  
751108FFV 751108FFV None None   I135T, D177E, I178M, G196E, Q197E, F214L  
751112JNG 751112JNG None None   A98S, I135R, G196E, Q207K, R211Q  
751113BKD 751113BKD None None   K82R, K102Q, S105A, D123E, I135V, S162C, I178M, I195L, T200A  
751114HDM 751114HDM None None   T200A, Q207R, R211S, F214L  
751203EC 751203EC None None   S68N, R83K, E169D, R211K  
751205KRW 751205KRW None None   E36K, D123E, K166R, D177E, G196E, R211Q  
751308BKY 751308BKY None None   D123E, I135T, K166R, D177E, R211K, V245Q  
751406FTL 751406FTL None None   I135V, S162C, G196E  
751502GMO 751502GMO None None   K32R, I135T  
751505CXJ 751505CXJ None None   K122E, I132V, E169D, K173R, Q174K, I178M, G196E, R211K, F214L  
751626ZOFC 751626ZOFC None None   A98S, I135R, G196E, Q207G, R211K  
751636JES 751636JES None None   R83K, K122P, D177E, G196E, T200I, E204K, R211A  
751641MWF 751641MWF None None   R83K, F171Y, I178M, G196E, T200I, R211G  
751703MDK 751703MDK None None   R211K Y146YC 
751715GTE 751715GTE None None   K20R, T39P, I135T, K166R, G196E, V245M  
751905MCWD 751905MCWD None None   A98S, I135R, G196E, Q207E, R211K  
751920HMY 751920HMY None None T215E  I142V, V179I, G196R  
752010ER 752010ER None None   V35I, G196E, R211A  
752025NMA 752025NMA None None   D121H, K122E, I135T, I142T, R211S, F214L  
830110LSO 830110LSO None None   K49R, V60I, K122E, I135T, I178M, G196E, Q207E, V245M  
830112CEY 830112CEY None None M41L, T215Y  I135T, K166R, E169D, G196E, Q207E, R211A  
850102KFO 850102KFO None None   A98S, Q197K, R211E  
890101MRT 890101MRT None None   S48T, D123E, I135T, G196E, Q207E, V245E, D250E, K277R, E291D, V292I, I293V, E297K, D324E Y127YN 
910104NTW 910104NTW None None   I142V, K166R, E203D, R211K  
920220GTQ 920220GTQ None None   A98S, K102Q, D123E, I135T, G196E, E204Q  
920403JUST 920403JUST None None   A98S, G196E  
920409DJQ 920409DJQ None None   K104A, V118I, I135T, S162H, G196E, T200A, R211G, F214L  
920410AXF 920410AXF None None T215E  I142V, V179I  
920418CKQ 920418CKQ None None   K122E, I142T, S162C, R211K, V245Q  
930201EUX 930201EUX None None   G18X, K122E, I135T, I142T, S162C, G196D, T200I  
930203EBO 930203EBO None None   P1S, A158S, V179I, G196E, R211K  
940203NDW 940203NDW None None   D123E, I135T, T165I, I178L, R211K, S251X, W252WGR, T253X, V254X  
940212DMH 940212DMH None None   T39A, K64R, R83K, K122E, S162C, E204K  
940215CG 940215CG None None   I142T, K166R, D177E, Q207K, R211K  
940216CJP 940216CJP None None   K49R, K103R, K122E, I135T, Q174R, I178M, T200V, R211Q, L228F  
940223DUC 940223DUC None None   I135T, S162C, T200A, R211K  
972127GQK 972127GQK None None   S162C, Q207H, R211K  

Database

Resources

Team