Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Podzamczer (2002)
Title A randomized clinical trial comparing nelfinavir or nevirapine associated to zidovudine/lamivudine in HIV-infected naive patients (the Combine Study).
Citation Antivir Ther
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 102
NumPts 80
Subtype B, CRF12_BF

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 102 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1 BAA139516 None None T215TA  R83K, R211KQ, E297K, V317VA, I329L, G359S, A376T  
  BAA139852 AZT, 3TC NVP   R83K, R211KQ, E297K, V317VA, I329L, M357MV, G359GS, A376T  
10 BAA139809 None None   K49KR, R83K, K122KE, R211S, K277KR, I293IV, E297K, G335D, G359S, K366R, A376T  
11 BAA139836 None None   K43R, R83K, G196GE, P294PT, E300EK, P313PS, D324E, A360T, T369TA, A376T, K390R S3SG, I326R 
12 BAA139828 None None M41ML  E36EK, K49R, K122E, I178IV, I195M, R211RG, V245M, G262GE, A272P, K277R, E297K, G333E, G359S, Q367L  
13 BAA139523 None None   K64KR, K122E, I135T, T200AD, Q207E, R211K, I244V, E297T, M357T, K385R, K390R  
  BAA139857 AZT, 3TC NVP  Y181C V60I, K122E, I135T, T200D, Q207E, R211K, I244V, E297T, M357T, K390R  
14 BAA139255 None None   K49R, A98S, K122KE, I135V, E169ED, T200A, E203ED, I293V, E297A, K311KR, V317VA, S322T, D324DE, I326IV, G359S, T377X, S379SG  
15 BAA139849 None None   K49KR, D123E, I135T, T200TI, A272P, K281R, A288AS, V292I, E297K, K311KR, I326IV  
16 BAA139814 None None   K104N, K122X, D123DE, S162SN, D177DE, I178ILM, T200TA, R211Q, V245K, K277R, Q278E, I293V, E297K, V317A, S322T, Q334X, A376AV, T386A, K390R, K395R, E396ED  
  BAA139815 AZT, 3TC None M184V  K104N, D123E, I135IL, D177E, Q207QH, R211X, V245K, K277R, Q278E, I293V, E297K, V317A, S322T, A376AV, T386A, K390R, K395R, E396D  
17 BAA139833 None None   P4T, V35I, R83K, I135V, D177E, I178IL, R211K, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, Q334E, Y339F, A376T, Q394T  
18 BAA139024 None None   K49R, R83K, K102R, D123E, D177E, V179I, G196E, K277R, T286A, I293V, E297A, R356K, G359S, A371V, A376T, K388R, K390R  
19 BAA139844 None None   V118I, K122E, I135T, T200R, R211K, F214L, I293V, E297R, L301I, S322T, I329L, E370D, K385R  
2 BAA139850 None None   K49R, R83K, K122KR, D123DE, D177E, I178V, V245KR, T286A, G359S, K390R  
20 BAA139517 None None   K20R, V35I, I135IT, S162SC, R211RK, K277T, T286A, I293IV, E297K, I326IV, I375V, A376T, K390R, E399D  
21 BAA138673 None None   K20KR, V60VI, D121H, K122E, I142V, I178L, R211S, T377M, S379C, K390R  
22 BAA139525 None None   K122E, T200A, I202V, E204D, V317A, S322T, I329L, M357MV, A360AT, T369A, A376T, K390R  
  BAA139858 AZT, 3TC None   K122E, T200TA, I202V, E204D, Q207QK, R211X, V317A, S322T, I329L, A360AT, T369A, A376T, K390KR  
23 BAA139829 None None   E36ED, K104R, E169D, G196E, R211G, A272P, I293V, P294Q, E297K, Q334L, G359S, A360T, A371V, I375V, A376T, E399D  
24 BAA139337 None None   K49R, R83K, R211RK, T286A, E297K, I326IV, Q334X, G335D, M357MT, G359NS, A376T, T377KR, K388KR  
25 BAA139847 None None   K166R, R211K, E248D, K277R, P294T, K311R, S322T, A376T, K390R E291EG 
26 BAA139851 None None   D177E, G196E, T200TI, R211Q, F214L, Y271YF, A272P, K275KR, K277KR, P294PQ, P313T, V317A, I329V, Q334L, R356K, K366R  
27 BAA139269 None None   V35L, K122KE, I202V, R211K, T286TA, D324E, I326V, Q334E, M357T, A376T, K390R  
28 BAA139028 None None   E6EK, K49R, V60VI, R83K, D123E, A158S, S162HQ, V179VI, T200A, A272P, K277KR, K281KR, E297A, Q334R, G335D, M357T, G359S, K366KR  
29 BAA139879 None None   K102Q, K122E, I142V, S162C, E169D, E224A, A272P, K277R, S322T, I329V, P345Q, K347R, R356K, K390R  
  BAA139834 AZT, 3TC NVP  K103KN K102Q, K122E, I142V, S162C, E169D, A272P, I274IV, K277KR, S322T, I329IV, P345PQ, K390R  
  BAA139835 AZT, 3TC NVP  K103N K102Q, K122E, I142V, S162C, E169D, A272P, K277R, S322A, P345Q, K390R  
3 BAA139831 None None   V35I, K64R, R83K, I135V, K166R, E204EG, R211RK, V276I, T286A, I293V, E297I, V317A, D324E, P345PT, M357T, A360AT, A376T, T377A, T386A G152GR 
30 BAA139052 None None  V106I V35I, D123E, K166R, D177E, T200I, A272P, V276I, K277R, L283I, V292I, I293V, R356RK, A376T, K390R, E399D  
31 BAA139853 None None   I135IT, I142T, T286TA, A288AS, V292VI, I293V, E297EK, Q334H, K366R, A376T, A400AT  
32 BAA139811 None None   L34LF, V35I, R83K, K101Q, K103KR, D123DE, S162X, T165I, R211K, A272P, K277R, Q278H, T286A, A288S, E297K, K311R, I329L, Q334E, M357T, K366R, A376T  
33 BAA139820 None None   S162A, R211K, V292I, I293V, K311R, D324E, I329L, T377IV, S379SG, K390R  
34 BAA138675 None None   K49R, E53D, D177E, I178IM, V189VI, G196GE, T200TI, A272AP, I293V, P294A, K311KR, E312EQ, Q334L, T369TAS, I375IV, A376T, T377L, S379SG V381VIM 
35 BAA139335 None None   S162C, I178M, G196E, T200TI, E203EK, Q207KN, R211G, K277R, I293V, E297A, Q334Y, A360T, T369A, A376S, T377L, K390R  
36 BAA139272 None None   K49R, R83K, K122KE, E169D, D177E, G196E, R211K, V292I, I293V, E297A, L301M, K311KR, G359S, A376T, K390R  
37 BAA139822 None None   K49R, V111I, K122E, I135T, T200E, F214L, A272P, K277KR, V292I, I293V, E297A, K311KR, G335D, M357T, G359S, A376T, T386I  
  BAA139823 Unknown Unknown   K49R, V111VI, K122E, I135T, T200E, F214L, A272P, K277KR, V292I, I293V, E297A, K311R, G335D, M357T, G359S, A376T, T386I  
  BAA139824 Unknown Unknown   K49R, V111I, K122E, I135T, T200E, F214L, A272P, K277KR, V292I, I293V, E297A, K311R, G335D, M357T, G359S, A376T, T386I  
38 BAA139031 None None   V35I, R83K, K101Q, D123E, S162C, T200I, E203D, R211K, K223KR, T286AV, I293V, E297K, I329L, Q334E, M357T, A376T  
39 BAA139821 None None   E6ED, A98AS, D121Y, K122E, D177E, I178IV, V179VI, Y271H, T286TA, I293IV, G359S, I375V, K385R, K390R Q207*E 
4 BAA138672 None None   K49R, R83K, K102KR, D123E, D177E, V179I, G196E, K277R, T286A, I293V, E297A, R356K, G359S, A371V, A376T, K388R, K390R  
40 BAA139340 None None   R83K, I135IT, K166R, R211K, A272S, I293IV, I329L  
41 BAA139878 None None   I135T, Q207QK, R211K, A272P, V276I, T286A, E297K, I326IV, A327V, M357T, T377TN, K390KR, K395R  
42 BAA139859 None None   K20KR, R211RK, F214L, A272P, T286A, E297R, K311R, I326V, Q334QH, R356K, A360T, T369TA, A371AV, I375IV, A376AV, T377X  
  BAA139860 AZT, 3TC None   K20KR, E169EK, F214L, A272P, T286A, E297R, K311R, I326V, Q334QH, G335GS, R356K, M357MT, A360T, T369TA, A371AV, I375IV, A376V, T377X  
  BAA139861 AZT, 3TC None   K20KR, F214FL, A272P, T286A, E297KR, K311R, I326V, Q334QH, G335GS, T338TS, R356K, A360T, T369A, A371AV, I375V, A376AV, T377TI  
  BAA139862 AZT, 3TC, Unknown Unknown   K20KR, F214L, A272P, T286A, E297KR, K311R, I326V, Q334QH, G335GS, R356K, A360T, T369TA, A371AV, I375IV, A376AV, T377X  
43 BAA139343 None None   S48T, D123E, A158S, E169D, G196E, A272P, K277R, P294S, Q334M, M357T, A360T, T386I, E399D  
44 BAA139054 None None   K49R, R83K, I135T, T165I, K277R, V292VI, I293V, E297A, S322A, A360T, A376T, K390R  
45 BAA139863 None None   K49R, E53ED, V60VI, V90I, K122KE, I135IT, S162X, K277R, L283LI, I293V, K311R, G333E, K390R  
  BAA139864 AZT, 3TC NVP   K49R, V60VI, V90I, K102KR, K122KE, I135IT, S162SN, K277R, I293V, K311KR, G333E, R356RK, M357MI, D364DE, K390R  
46 BAA139816 None None D67N, K70KR, T215S, K219Q  S162A, R199K, T200I, E203D, R211K, K277R, K281R, E312Q, I326IM, Q334E, R356K, M357MR, A371X, T377I, K390R, E399ED  
47 BAA139053 None None   I135T, S162C, V245I, A272P, K277R, V292I, I293V, E297A, N306D, Q334L, G335S, T338S, M357T, T369A, K374R, I375V, A376T, S379C, T386I, K390R  
48 BAA139832 None None   K20R, V35M, T39A, E40D, R83K, K122E, I135T, S162Y, A272P, A288S, K311R, K350R, M357I, K390R I309IT, Q336E 
49 BAA139346 None None   K102Q, I142T, A272P, K277R, T296TS, E297EA, E298ED, V317A, Q334N, F346Y, R358K, G359S, K366R, A376T, K390R  
5 BAA138677 None None   R83K, D123E, T200I, R211K, A272P, K277R, K281KR, E297KR, M357T, T377A, K390R, K395R, E396D  
50 BAA139334 None None   K49R, R83K, K102KQ, Q207E, R211K, A272P, V292VI, P294PA, E297EA, Q334N, G359S, A376T, T377L Q336Y 
  BAA139875 AZT, 3TC None   K49R, R83K, I178IL, Q207E, R211EK, A272P, V292VI, P294PA, E297A, Q334N, G359S, A376T, T377L, E396EG Q336Y 
  BAA139876 AZT, 3TC None   K49R, R83K, K102KQ, Q207E, R211K, A272P, V292VI, P294PA, E297EA, Q334N, G359S, A376T, T377L Y181Y*, Q336Y 
51 BAA139808 None None   R83K, K122E, N175NH, R211K, V245E, A272P, K281KR, P294A, E297K, G359S, S379G, T386I, K390R  
52 BAA139874 None None  V106VI V35VL, S48ST, K49KR, K102KQ, K104KR, V118I, E169ED, H208HY, F214L, L228Q, A272P, K277R, L283LI, V317A, S322T, I329IV, G359S, T369TA, K390KR  
53 BAA139257 None None   V35T, K122E, I135V, V245K, A272P, K277R, K281KR, E297K, R358K, Q394L  
54 BAA139047 None None   K122E, I142V, G196E, A272P, K277KR, T369A, A376T, T386I, K390R  
55 BAA139025 None None   K122E, I142T, Q197E, Q207E, K277KR, A288AS, E297K, I341IV, R358RK, K390R  
56 BAA139261 None None D67G, T215S, K219Q N348IT V35I, S48E, S68G, D86DE, K102Q, I135T, I202V, Q207E, A272P, K277KR, A288S, V292I, I293V, E297A, K311KR, V317VA, D324E, A376V, T386I, K390R, E399D  
57 BAA138679 None None   V35M, T69A, R83K, D123E, I202V, R211K, A272P, K277R, E297A, I329V, G359S, A371V, A376T, E399D  
58 BAA139526 None None   V35L, R83K, W88WC, K103R, K122KE, I135T, R211RK, F214L, V245E, E248ED, I293V, A304AE, I329V, G359S, T377Q, K390R  
59 BAA139045 None None L210W, T215D  A98S, D123E, I142IT, K173E, D177E, T200K, R211K, V245LM, S251SR, A272P, A288AT, I329L, G333E, Q334H, A376C, T377AS, T386I, K390R  
6 BAA139256 None None   D123E, D177E, V179I, Q207QE, V292VI, I293V, I326IV, A376AT, K385KR  
60 BAA139524 None None   K122E, D123E, S162SC, I178IM, T200A, F214FL, V245VE, V254VI, A272P, A288AT, I293V, E297A, F346FC, A376T, K390R  
61 BAA139259 None None   K49KR, K122KE, T200AV, R211K, V245L, K281R, I293V, E297V, S322SL, Q334E, M357T, T377L, S379G, K390R  
62 BAA139051 None None D67G, T215TS, K219Q  V35I, S48E, S68G, K102Q, I135T, K166R, I202V, Q207E, A272P, K277R, A288S, V292I, I293V, E297A, V317A, N348T, A376V, T386I, K390R, E399D  
63 BAA139258 None None   I135T, R211K, V245K, K277R, I326V, I329L, T377L, S379C, T386I G196C 
  BAA139870 AZT, 3TC NVP   I135T, R211K, V245K, K277R, I326V, I329L, T377X, S379CG, T386I G196C 
64 BAA139854 None None   V35I, R83RK, D123E, I135IT, D177E, I178IMV, T200A, I202V, R211K, K277KR, V317VA, G359S, T377Q  
  BAA139855 AZT, 3TC None M184V  V35IR, R83K, D123E, I135IT, D177E, I178M, T200A, I202V, R211K, K277KR, V317A, D324E, G359S, T377Q  
  BAA139856 AZT, 3TC None M41ML, M184V  V35IRT, R83RK, D123E, I135IMT, D177E, I178IM, T200A, I202V, R211K, V317A, D324DE, G359S, T377Q  
65 BAA139519 None None   E6K, R83K, K122E, K166Q, D177E, T200A, Q207R, K238R, K277R, T286A, V292I, I293V, E297KR, G333GE, G335GC, G359S, A371V, A376T, K390R  
  BAA139830 AZT, 3TC NVP   E6K, R83K, K122E, K166Q, D177E, T200A, Q207R, R211RK, K238KR, K277R, T286A, V292I, I293V, E297KR, G333GE, G335GC, R358RK, G359S, A371V, A376T, K390R  
66 BAA139268 None None   V35L, T39TS, R83K, A98S, I135V, I202IV, K259R, M357T, A376AT  
67 BAA139050 None None   V8I, K49R, L210LF, R211RK, V245VM, S251V, I293IV, S322ST, Q334QE, R356RK, G359S, A376S, K390R, I393M  
69 BAA139837 None None   K20KR, V35IM, K49R, V60VI, R83K, I135T, D177E, T253TA, R356K, G359S, K390R  
  BAA139839 AZT, 3TC, D4T NVP M184V K103N V35I, K49R, R83K, I135T, D177E, R356K, G359S  
7 BAA139344 None None   K102Q, K122E, I135T, S162C, E169D, I202IV, R211K, A272P, V317A, S322T, I329IV, K390R  
70 BAA139826 None None   V35VI, K64R, I135T, T200I, R211E, E297A, K311R, I326V, A376T, T386I  
71 BAA139865 None None   V35I, D123E, I135M, I142V, E169D, T200I, V245M, E248N, A272P, Q334H, M357T, A376T, T386I, E399D  
72 BAA139873 None None   R83K, K122KE, K166KR, T200TA, I202IV, R211K, A272P, K277R, E297A, D324E, Q334HN, G359S, K366R, T369A, A376T  
73 BAA139807 None None   R72RG, R83K, K122E, D123DN, G196E, E204ED, L210LF, R211RK, A272P, V276VI, K281R, I293V, E297K, S322ST, G333GE, Q334QL, G335GC, G359S, A371AV, A376T, E399D  
74 BAA139336 None None   V60I, S68G, D123E, I135T, D177E, D250N, K277R, T286A, E297A, I326V, A360T, A376S, K395R  
  BAA139877 AZT, 3TC NVP   V21I, V60I, S68G, D123E, I135T, D177E, K277R, T286A, E297A, I326V, A360T, A376S, K395R  
75 BAA139846 None None   K122E, I142T, Q197E, T200TI, Q207E, R211RK, K277KR, A288AS, E297K, I341IV, R358RK, K390R  
  BAA139339 AZT, 3TC None M184V  D17E, K122E, I142T, Q197E, R211K, K277R, A288S, E297K, R358K, T369I, K390R  
76 BAA139026 AZT, 3TC NVP M41L, D67N, L210W, T215Y G190A V35L, A98S, K102Q, V118VI, I135T, R172RK, E203EK, R211D, A272S, I293V, E297K, D324DG, Q334E, G359S, A376T, T386A, K390R  
77 BAA139033 None None   A98S, D123E, I142IM, S162SC, K166KR, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214FL, A272P, K277R, I293V, E297K, G333E, Q334L, M357T, A376S, K385R, K390R  
78 BAA139273 None None  V106VI S48ST, K102KQ, K104KR, V118I, E169ED, F214L, L228Q, A272P, K277R, V317A, S322T, I329IV, G359S, T369TA, K390KR  
79 BAA139845 AZT, 3TC NVP  Y181C V35VI, V90VI, I135T, S162SN, R211K, K275R, I293V, P294Q, P313S, R356K, K366R, A376T, K385KR, T386I A129AG 
8 BAA139270 None None   K122E, D123N, E204K, Q207E, F214L, I293V, I329L, Q334E, M357T, A376T  
80 BAA139872 AZT, 3TC None   K64KR, I135T, I178IM, I202V, R211V, V245EK, I293IV, P294AT, K311R, A327V, G359S, K385R, T386I, K390R, E399D  
9 BAA139812 None None   M16ML, V35I, K122KE, I135T, K173N, D177N, I202V, T286A, P294S, R356K, K385R, K390R  

Database

Resources

Team