Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Bussmann (2011)
Title Prevalence of transmitted HIV drug resistance in Botswana: Lessons learned from the HIVDR-threshold survey conducted among women presenting for routine antenatal care as part of the 2007 national sentinel survey.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 152
NumPts 152
Subtype C, CRF49_cpx

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 152 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
B0531 B0531 None None   K20R, V35T, T39A, S48T, K122KE, D123DN, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K, K223R, V245Q, D250N  
B0532 B0532 None None  E138A V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122E, D123GS, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245K, E248D, D250E  
B0534 B0534 None None   P4S, E6D, V35T, T39A, S48T, K122E, K173T, D177E, T200E, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
B0535 B0535 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173T, Q174R, D177E, T200Q, Q207E, R211S, V245Q  
B0536 B0536 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173I, T200A, Q207E  
B0538 B0538 None None   V35K, T39E, S48T, I135V, S162C, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, P247T, D250E  
B0540 B0540 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
B0542 B0542 None None  E138A K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, I142V, S162Y, K173L, Q174K, T200A, Q207E, F214L, V245Q, E248DN  
B0543 B0543 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
B0544 B0544 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248T  
B0545 B0545 None None   P4S, V8I, V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K173A, I178M, T200V, Q207N, R211K, K238R, V245Q, D250E  
B0546 B0546 None None   V35T, S48T, K122P, D123N, T165I, K173M, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211K, V245Q, E248D  
B0547 B0547 None None  E138A V35T, T39E, S48T, K49R, K122E, D123N, T139A, A158S, K173T, Q174K, T200A, I202V, R211K, F214L  
B0549 B0549 None None  E138A K20R, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V118I, K122E, T139A, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245M, D250E  
B0550 B0550 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, T165I, K173A, Q174K, I178L, T200A, Q207R, R211K, V245H  
B0551 B0551 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, K82R, K122E, D123DG, I135T, S162C, E169D, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211K, V245Q, E248D  
B0552 B0552 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D  
B0553 B0553 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, K122E, D123S, S162N, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, D250S  
B0554 B0554 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q197K, T200A, Q207K, R211K, V245Q  
B0555 B0555 None None   V35T, E36V, T39E, S48T, K102Q, D121DH, K122KE, K166R, K173A, Q174T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
B0557 B0557 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, I135T, S163T, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207K, R211K, I244V, V245T, D250E  
B0558 B0558 None None   V35T, T39E, S48T, K102Q, K122E, D123N, K173A, Q174R, D177E, I178L, Q197K, T200A, Q207N, R211K, P243T, V245Q, E248T  
B0559 B0559 None None  V179D, F227L K20R, T27S, V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, K173T, D177Q, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
B0560 B0560 None None   V35T, E36A, T39D, K122E, D123G, S162C, K173V, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
B0561 B0561 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K173A, Q174K, T200A, K201R, Q207K, R211K, V241I, P243S, V245N, D250E  
B0562 B0562 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
B0563 B0563 None None   E6K, K11Q, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207K, V245Q, D250E, S251N  
B0564 B0564 None None   V35T, E36A, T39E, S48E, V60I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245E, E248D  
B0565 B0565 None None  E138A V35T, E36G, T39E, S48T, K122E, D123N, I135T, S162C, K173A, Q174K, T200A, Q207E, F214L, V245Q  
B0566 B0566 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121Y, K122E, K166R, K173E, Q174R, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245R, E248T  
B0567 B0567 None None M184V, T215F K103N, Y181C, G190GA K20R, V35T, E36A, T39D, K122E, D123G, K173A, T200A, Q207E, V245Q, E248N  
B0568 B0568 None None   P4S, V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248EK  
B0569 B0569 None None  E138A V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, T139V, K173A, Q174K, G196GE, T200E, Q207E, R211RK, F214L  
B0570 B0570 None None   V35T, S48T, V60I, K122E, T139R, I142T, K173A, D177G, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
B0571 B0571 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K166R, K173A, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207D, R211K, V245Q, E248D, D250E  
B0572 B0572 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48E, D123S, E169Q, K173E, D177E, T200A, Q207K, R211K, V245Q  
B0573 B0573 None None   V35T, E36EA, T39E, S48T, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211K, F214L, V245Q, E248EK  
B0574 B0574 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121Y, K122E, S162C, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207E, V245K, D250E V90G, Q151Q* 
B0575 B0575 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K166KR, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
B0577 B0577 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121C, K122E, D123S, K173A, D177E, Q207N, R211K, V241I, V245Q, E248D  
B0578 B0578 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, I135V, T165I, K173I, Q174K, I195T, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245E  
B0579 B0579 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, I178M, T200E, Q207N, R211K, V245Q, E248EK  
B0580 B0580 None None   K20R, V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248EK, D250E  
B0581 B0581 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, I142V, S162SG, K173V, G196E, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
B0582 B0582 None None   V35T, T39EK, S48T, K122E, D123S, K173A, Q174K, T200A, Q207N, R211K, V245I, E248EK  
B0583 B0583 None None   V35T, E36AV, T39E, S48T, K102R, K122E, D123N, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245Q, E248T  
B0584 B0584 None None   V35M, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248EK  
B0679 B0679 None None  E138A V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, K173T, Q174KR, G196E, T200A, Q207E, F214L  
B0681 B0681 None None  E138A V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, K173T, Q174KR, G196E, T200A, Q207E, F214L  
B0682 B0682 None None   V35IT, E36A, T39D, E40D, S48T, K122E, D123G, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245K, D250E  
B0685 B0685 None None  E138A V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, T200A, Q207E, V245M, E248D  
B0687 B0687 None None   P4T, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, S68N, T69N, V118I, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, E204D, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
B0688 B0688 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245K, D250E  
B0690 B0690 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48E, A158S, E169K, K173E, T200A, Q207E, V245Q  
B0692 B0692 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, S162A, K173A, Q174K, D177E, Q207E, V245K, D250E  
B0693 B0693 None None   K32R, V35T, E36A, T39E, S48T, V106X, T107X, V108X, L109X, D110X, V111X, D121H, K122E, K173T, Q174K, D177E, I195V, R199K, T200E, Q207E, R211S  
B0694 B0694 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, I135V, S162C, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207D, V245Q, D250E  
B0696 B0696 None None  E138A V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K166R, K173T, Q174H, T200A, Q207E, F214L, P243T, V245T, E248D  
B0698 B0698 None None   E6K, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248EK  
B0701 B0701 None None   P4S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D  
B0703 B0703 None None   V35MT, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, S68G, K122E, D123N, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207E, V245Q  
B0705 B0705 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, V60I, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, S251SN  
B0707 B0707 None None   E6K, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207AE, R211RK, V245Q V90VIM 
B0709 B0709 None None  E138A P4S, V35T, E36T, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173T, Q174A, T200A, Q207G, V245K, E248D  
B0711 B0711 None None  K103N V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, K173T, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D  
B0713 B0713 None None   E28D, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, I135R, K173T, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245K  
B0715 B0715 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, Q207A, R211K, V245Q  
B0719 B0719 None None   P14S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245T, D250E, S251N  
B0723 B0723 None None   V35T, T39K, S48T, W88C, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, E203D, E204Q, Q207D, R211K, F214L  
B0725 B0725 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, S162C, K166R, K173T, Q174K, D177E  
B0727 B0727 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, T107S, K122E, K173V, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, V245Q  
B0728 B0728 None None  E138A V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, T139A, S162C, K173T, Q174QK, T200A, Q207N, R211K, F214L  
B0730 B0730 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, T139A, I142V, Q151*, S162A, K173T, D177E, I178M, I195M, T200A, Q207A, V245Q, D250E  
B0732 B0732 None None   V35I, T39E, S48T, K102Q, K122E, D123N, I142V, K173A, Q174R, D177E, I178L, Q197K, T200A, Q207D, R211K, P243T, V245Q, E248T  
B0734 B0734 None None   T27S, E28A, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, D177E, T200E, E204K, Q207D, V245Q  
B0736 B0736 None None   E28K, K32E, V35T, E36V, T39E, S48T, K101KQ, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211M, V245Q  
B0739 B0739 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
B0741 B0741 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K  
B0743 B0743 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, D123E, I135V, S162C, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207D, E224K, V245Q, E248EK, D250E  
B0745 B0745 None None   E6K, V35T, T39A, S48T, K101R, K122P, K173V, Q174K, D177E, V179S  
B0747 B0747 None None   V35T, E36A, T39A, S48T, K122E, D123S, S162C, K173T, D177E  
B0748 B0748 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122E, D123G, A158S, T165TI, K173A, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, D250E  
B0750 B0750 None None   E6D, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123E, K173A, D177E, T200A, Q207N, V245Q, E248T  
B0752 B0752 None None   V21I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, N175H, D177E, T200A, K201I, Q207E, R211K, V245Q  
B0754 B0754 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123DN, K173T, D177E, T200A, E204EK, Q207E, P243T, V245Q  
B0756 B0756 None None   V35T, T39M, S48T, V60I, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
B0757 B0757 None None   V35T, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, I135T, S162C, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248EK  
B0761 B0761 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, I142V, K166R, K173T, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248V, D250E  
B0763 B0763 None None   P4T, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173T, Q174E, D177E, I178V, T200A  
B0767 B0767 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123N, K173A, D177E, T200A, Q207S, R211K, V245Q, E248T  
B0768 B0768 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, A158S, K173V, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, V245Q, D250E  
B0770 B0770 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, I135T, K173A, D177E, Q197P, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
B0772 B0772 None None   V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, F87L, K122E, D123N, K173A, Q174N, D177DE, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E  
B0773 B0773 None None  E138A V35T, E36A, T39D, S48T, W88S, K122E, D123N, I142V, K166R, K173T, Q174R, T200A, Q207A, R211K, F214L, V245Q  
B0775 B0775 None None   P4T, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, V118I, K122E, D123S, E169K, F171Y, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211Q, F214L  
B0777 B0777 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211E, V245K, D250E  
B0779 B0779 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K104N, I142V, S162C, P170S, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207N, R211K, V245Q, S251N  
B0781 B0781 None None   E6K, K11N, V35T, E36A, T39E, S48E, K122E, D123G, I135T, K173A, D177E, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
B0784 B0784 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122P, K173I, I178M, T200A, R211K  
B0786 B0786 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q  

Database

Resources

Team