Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Chibo (2011)
Title HIV transmissions during seroconversion contribute significantly to new infections in men who have sex with men in Australia.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 209
NumPts 209
Subtype B


  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 209 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
S1 S1 None None   V35I, D123N, I135M, I178M, V179I, T200I, R211K  
S10 S10 None None   K32R, K122E, K166KQ, F214L  
S100 S100 None None   S48SL, D123EK, S162C, E169D, T200A, Q207D, R211K, D218DN, V245M  
S11 S11 None None   K20R, V118A, K122Q, I135T, S162C, D177E, T200A  
S12 S12 None None   K11R, K20R, V35I, R83K, A98S, K122E, A158S, D177E, V245E  
S13 S13 None None T215D  V35T, E40A, V60I, R83K, D121Y, K122E, I135T, S162C, E203D, V245M  
S14 S14 None None M41L, L74I, M184V, T215Y K103N, G190S V35R, K43E, E44D, A98S, K122P, D177E, V179I, T200K, Q207E, L228H  
S15 S15 None None   A98S, R211K, V245M  
S16 S16 None None  E138A, Y188YH E6D, D123E, S162C, T200I  
S17 S17 None None K65KR, T215TI  K30KR, D67X, Q174H, G196E, T200I, I202V, R211G, V245M F61FS, I63IR, K66KQ 
S18 S18 None None   D123E, I142V, S162C, K173R, Q174K, R211K, F214L, K238R  
S19 S19 None None   A98AS, V245M  
S2 S2 None None   K11R, A98S, K122E, D123E, T200V, E203K, V245R  
S20 S20 None None   I135T, G196E, Q207H, R211K, V245M  
S21 S21 None None   V35I, R83K, E169D, R211K  
S22 S22 None None   R211K, V245K  
S23 S23 None None   R83K, K122KE, T165I, E169D, R211K  
S24 S24 None None T215L Y188L S48T, V60I, A98S, K102KR, K122E, D123S, I135T, S162H, D177E, G196E, E203D  
S25 S25 None None   R83K, E169D, R211K  
S26 S26 None None   E6D, K104R, I135T, I142V, T165I, D177E, G196E, T200A, R211G, F214L, V245E  
S27 S27 None None   V35I, S68G, T69N, D123E, I135T, S162C, E169D, I178L, R211K, V245E  
S28 S28 None None   A98S, K122E, S162A, G196E, E204N, Q207E, R211K, V245E  
S29 S29 None None   A98S, K102Q, K122E, D123N, I135V, D177E, R211K, V245M  
S3 S3 None None   I135T, I142V, S162C, G196E, T200A, R211K, V245E  
S30 S30 None None   I135T, S162C, D177E, G196E  
S31 S31 None None   E6D, D121DN, G196E, E203K, R206RK, Q207D, L210F, V245K  
S32 S32 None None  K103N V10VI, I50IT, V60I, S68G, K122P, D177E, T200A, Q242R  
S33 S33 None None T215C  V35T, E40D, K122E, I202V, Q207E, R211K, V245K  
S34 S34 None None   E6K, K20R, K104R, K122E, T200M, I202V, Q207E, R211K, V245I  
S35 S35 None None   T39A, S68G, K122P, Q197E, R211K  
S36 S36 None None   E6D, I135T, R172RK, T200I, R211K  
S37 S37 None None M41ML, T215D K103KN V35M, K122E, I135IT, S162C, E169D, I202V, V245VA W88WG, G93GV 
S38 S38 None None   S48T, I135V, S162C, T200E, Q207A, R211K, V245E  
S39 S39 None None   S162C, E169D, T200A, Q207E, R211K, V245M  
S4 S4 None None   D123E, I135T, Q174K, D177E, I202V, R211K, F214L  
S40 S40 None None   D123DG, I135T, R211K, V245VA  
S41 S41 None None   K49R, I135T, R211K  
S42 S42 None None   K20R, D123E, E169D, I202V, R211K, F214L, V245T  
S43 S43 None None   K11R, K32N, K49R, D123E, I135T, E169D, K173E, I195T, T200A, Q207E  
S44 S44 None None   I135T, S162C, D177E, G196E  
S45 S45 None None   V35I, K104R, I135M, T165I, T200I, R211K Q85QK 
S46 S46 None None   T39A, A98S, T107S, K122E, D123E, I135V, S162C, Q174K, T200E, Q207G, R211T  
S47 S47 None None   V60I, K102KE, D123E, S162C, T200TI, E203ED, R211K, V245I  
S48 S48 None None   N57ND, D123N, T165I, D177E, G196E, I202V, Q207E  
S49 S49 None None   K49R, D123E, I135T, S162C, R172RK, D177E, G196E, R211G  
S5 S5 None None   D121N, R125RK, I135T, S162C, R211K  
S50 S50 None None   K20R, R72X, K122KE, D123EK, E169D, I178M, I202V, R211K, F214L, V245T R206RG 
S51 S51 None None   A98S, D121DN, R125RK, R143RK, E169K, R172K, D177N, R199RK, W212WG, D218DN, V245M V111VG 
S52 S52 None None  E138G, V179D K20R, V60I, R78RK, K122E, D123G, I135T, Q174K, G196E, R211K, F214L  
S53 S53 None None   D123E, I135T, N137NS, D177E  
S54 S54 None None   K20R, D123E, E169D, I178L, R211K, F214L, V245T K220KT 
S55 S55 None None   K11R, K32N, K49R, D121DN, D123E, I135T, E169DN, R172RK, K173E, I195T, T200A, Q207E  
S56 S56 None None M184I  E29EK, K126Q, I135T, S162C, Q207H, R211K  
S57 S57 None None   I5V, E6D, D123E, I135T, I142V, S162Y, Q174N, G196E, T200A  
S58 S58 None None M41L, T215S  E6D, K66KE, S68G, K122P, I135K, K166R, I178L, V179I, T200I, R211K  
S59 S59 None None  K103N K11T, E79EK, V118I, D121DN, K122E, D123N, S191SF, R211S, F214L  
S6 S6 None None  E138A E6D, T139TI, I142IS, S162C, T200I  
S60 S60 None None   K11S, V35T, T39TA, E40ED, V60I, K122E, D123N, I135T, I202V, E203EG, L210F, R211K H96HP, R206RG 
S61 S61 None None   K122E, I135T, I142T, T165I, N175H, T200A, I202V, V245E  
S62 S62 None None  K103N E28EK, V35T, E40D, V60VI, K122E, V179I, T200TA, V245E  
S63 S63 None None   K11R, K49R, K64R, D123E, I135T, K166R, E169N, K173E, Q174K, D177E, I195T, T200A, Q207K  
S64 S64 None None   D123DN, I178M, T200TM, Q207E, R211RK  
S65 S65 None None   I135T, S162C, Q207H, R211K  
S66 S66 None None   V35I, K104KR, I135M, T200I, R211K, F214L  
S67 S67 None None   R78RK, V118I, A158S, K166R, F214L, V245M  
S68 S68 None None   K11KR, P14PT, M16MI, K49R, D123E, I135T, E169D, K173E, P176PT, V179I, I195T, T200A, Q207E  
S69 S69 None None   K20R, D123E, E169D, I202V, R211K, F214L, V245T  
S7 S7 None None   K20R, V60I, K122E, I135T, I142AT, S162Y, V245E S3SN 
S70 S70 None None   A98S, D123E, I135T, Q174H, I178L, Q207E, R211K  
S71 S71 None None   V35I, K102R, K122E, I135T, D177E, I178M, R211K  
S72 S72 None None  E138G, V179D K20R, V60I, K122E, D123G, R125RK, I135T, Q174K, G196E, E203D, R211K, F214L  
S73 S73 None None   K11R, A98S, D123E, T200V, V245R K122GR 
S74 S74 None None     
S75 S75 None None   K11T, E29EK, G45GE, V118I, I135T, T165I, D192DN, I202V, E203EK, Q207K, R211K, F214L  
S76 S76 None None   T27TA, K32R, I135T, S162C, G196E, R211K K220KT, H221HP 
S77 S77 None None   T27S, K43Q, K49R, V60I, K103R, K122E, I135T, I142V, S191SF, G196E, T200A, E204K, R211K, D218DN, V245E  
S78 S78 None None   K20R, R78RK, D121DN, R143RK, I178L, V179VA, I202V, R211A, F214L, V245T  
S79 S79 None None   V60I, I135V, R211K, D218DN, V245M  
S8 S8 None None   K20KR, D123DE, I135IV, S162C, K173Q, E203EQ, R211K, V245T W71WG 
S80 S80 None None  K103N V35T, V60I, K122KE, I135IV, S162SC, G196GE, Q207QE, R211RK, D218DN, V245VM L109LF 
S81 S81 None None   K11T, R78RK, A158S, F214L, V245E  
S82 S82 None None   I135T, S162C, Q207H, R211K  
S83 S83 None None   V60I, I135T, I142V, G196E, T200A, R211K, V245K  
S84 S84 None None   K11R, K20R, V35A, D123E, S162C, K166R, R172RK, D177E, V245K  
S85 S85 None None   I135IT, D192DN, R211K S191SFL 
S86 S86 None None   E36Q, V60I, K122E, S162C, G196E, Q207E  
S87 S87 None None   K20R, D123E, K166R, T200A, V245K  
S88 S88 None None   V35I, S68G, I135T, R211K  
S89 S89 None None   D123E, G141GR, S162C, R172RK, D177E, T200A, E204EK, Q207E, R211KQ, D218DN, V245Q  
S9 S9 None None   K20R, K122E, T200I, R211K, F214L  
S90 S90 None None   V35I, R83K, I135T, T165I, E169D, G196E, I202V  
S91 S91 None None   V35I, R83K, I135T, E169D, D192N, G196E, I202V  
S92 S92 None None   V60I, I135T, Q207E, V245M  
S93 S93 None None   K20R, D123E, E169D, I178V, R211K, F214L, V245T  
S94 S94 None None   D123E, I135T, S162DN, R211K, F214L  
S95 S95 None None   I135T, S162C, D177E, G196E  
S96 S96 None None   G15GR, K20R, V35I, D123E, I135R, E169D, R199RK, F214FL, V245T  
S97 S97 None None   D76DN, R78RK, D121DN, I142T, R143RK, E169EK, D177DN, E194EK, R199RK, R211K, D218DN, V245K  
S98 S98 None None  K103KN V35VI, T39A, S162C, E169ED, I202V, Q207E, R211K, V245T  
S99 S99 None None   K11KR, K20KR, V60I, A98S, K102Q, R211K, V245K