Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Kao (2011)
Title Surveillance of HIV type 1 recent infection and molecular epidemiology among different risk behaviors between 2007 and 2009 after the HIV type 1 CRF07_BC outbreak in Taiwan.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 378
NumPts 378
Subtype B, CRF07_BC, CRF01_AE, A, CRF08_BC, CRF06_cpx

 
  Page 1 of 4    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 378 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
Pat279 27036 None None  V106I E6D, D123DE, I135V, K166R, D177DE, I178IL, T200TI, I202V, R211RK, A272P, K277R, I293V, E297A, I309L, I326V  
Pat280 27034 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294PT, K311KR  
Pat281 27032 None None   T107S, K166KR, V189I, G196E, I202V, A272P, K277R, I293IV, E297K, E312T, V317A, I326IV  
Pat282 27031 None None   V35M, T39A, R83K, K103R, K122E, I135M, K166R, K173N, I178M, G196E, T200A, R206RK, Q207E, F214L, A272P, V276I, I293V, E312V  
Pat283 27023 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R  
Pat284 27009 None None   I5V, V60I, R83K, K104N, S163T, L187LF, V245E, E248D, K277R, E297K, I329L Y115YD 
Pat285 27003 None None   E6D, V35T, T39E, V60I, K122E, D123S, S162A, K173AT, Q174K, T200I, Q207A, R211S, K238KR, V245E, A272P, E291D, V292I, I293V, E312T, I326V, I329V  
Pat286 26991 None None   K173E, V179I, I195LP, G196E, Q197K, T200TI, E203ED, A272S, I293V, E312K, S322L, I326V  
Pat287 26989 None None   E6D, K122E, T200I, I202V, V245K, A272G, K277R, R284K, A288S, I293V, P294Q, E297A D192DG, I274IM 
Pat288 26986 None None   E6D, K103R, K166R, I202V, Q207E, F214L, V261I, K277R, I293V, E297A, H315Y, S322T, Q334L  
Pat289 26981 None None   K11R, K103R, K122E, K173E, I178M, T200A, Q207E, F214L, K277R, Q278S, T286A, I293V, I329V, Q334L  
Pat290 26979 None None   E6D, K103R, I202V, Q207E, R211K, F214L, I293V, E297A, H315Y, S322A, Q334L  
Pat291 26977 None None   V35M, V60I, R83K, K166R, E169D, T200E, Q207E, R211K, V245E, A272S, V276I, I293V, E312V, Q334L  
Pat292 26976 None None   V8VI, V35IT, S68SG, K122E, K166R, T200I, R211K, V245E, A272S, A288S, I293V, E297A, E312EV  
Pat293 26975 None None   K102R, K122E, I178M, T200A, Q207E, V245K, R284K, I293V, E312V, I326V, Q334L  
Pat294 26974 None None   E6D, V35T, V60I, R83K, D123E, K166KR, K173KR, Q207E, R211K, V245E, A272P, K277R, I293V, E297V, S322A, Q334L  
Pat295 26973 None None   K122E, I135V, I178IM, G196E, T200A, I202IV, E204K, Q207E, R211RK, V245E, G262GE, V276I, L283I, A288T, I293V, E297A, P313T, V317A  
Pat296 26971 None None   K20KR, V35VI, K64R, I135T, T139TI, R211K, F214L, V245E, E248D, A288S, I293V, E297K, I309V, I329L  
Pat297 26969 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R  
Pat298 26967 None None   K103R, I178M, Q207E, F214L, V276I, E312V, I326V, Q334L  
Pat299 26966 None None   E6K, K20R, K103R, K122E, I159V, I178M, T200A, Q207K, R211K, F214L, Q278S, T286A, I293V, E297K, I329V, Q334L  
Pat300 26964 None None   T69TS, A98S, K102Q, K122E, I142V, T200A, V245M, T286A, E297R, V317S, I329V  
Pat301 26961 None None   E6D, V60I, K103KR, D123E, I202V, Q207K, F214L, V245E, I293V, K311R, H315Y, D324E, Q334L  
Pat302 26959 None None   V35I, I50V, V60I, R83RK, D121DY, K122E, I135L, V245E, A272P, K277R, I293V, E297A, S322A, Q334L  
Pat303 26958 None None   V35I, R83K, K102Q, K173Q, D177E, I178M, G196E, E204K, Q207E, I293V, K311R, Q334L  
Pat304 26954 None None   V35M, T39S, R83K, K103R, K122E, I135M, K166R, K173N, I178M, G196E, T200A, Q207E, F214L, A272P, V276I, E312V  
Pat305 26951 None None   V35I, K102Q, K103R, V118I, K122E, I135T, T200I, R211RT, F214L, I244V, V245T, A272P, A288S, E297A, V317A  
Pat306 26947 None None   V60I, A158S, V179I, G196E, I202V, I293V, V317A, I326V  
Pat307 26945 None None   K173E, G196E, T200A, E204K, Q207E, V245E, S251N, T286N, I293V, E312R, I326V  
Pat308 26944 None None   K20R, I135V, S162D, K166R, I178M, G196E, T200I, E204K, R211G, V276I, I293V, E297K, P313T, S322A  
Pat309 26942 None None   K103R, I135IV, E169D, I202V, Q207E, R211K, F214L, V276I, K281KR, V292I, I293V, P294PH, E297A, H315Y, S322A  
Pat310 26941 None None   K103R, I135V, K166R, E169D, I202V, Q207E, R211K, F214L, V276I, K281R, I293V, E297A, H315Y, S322A, Q334L V292KR 
Pat311 26940 None None   V35T, V60I, R83K, I142V, T200E, E204K, Q207E, R211K, V245E, I293V, D324E, Q334L  
Pat312 26939 None None   E6D, I135V, R211K, V245E, I293V, E297A, I326V, I329L  
Pat313 26936 None None   I50V, I142V, R172RK, R211K, V245I, K249R, E291D, E297K, E312T, I326V, Q334L  
Pat314 26934 None None   K11R, V35M, V60I, R83K, I135R, E169D, G196E, T200I, Q207D, A272S, K311R, E312T  
Pat315 26933 None None   V35I, K103R, D123E, S162C, T200A, Q207E, A272G, Q278E, I293V, E297T, K311S, E312V, Q334L T131A 
Pat316 26930 None None   E6D, I50V, K103R, D123E, D177E, I202V, Q207E, F214L, I244M, V276I, I293V, E297A, H315Y, Q334L  
Pat317 26927 None None   K64R, I135V, G196E, T200A, E204K, Q207E, V245A, V276I, I293V, E297T, V317A, I326V W88G 
Pat318 26926 None None   K20R, V35L, R83K, I142V, K166R, K173E, Q207E, V245K, K277R, I293V, E297A, E312V, Q334L  
Pat319 26922 None None   V35IT, E53D, I135V, Q207E, V245E, I293V, E297R, E312EA, Q334M L92LF 
Pat320 26916 None None   K43R, A98S, K102Q, K103R, K122E, I142V, T200A, V245M, T286A, E297R, V317S, I329V  
Pat321 26915 None None   E6D, I135V, R211K, F214L, V245E, D250E, K277R, I293V, E297A, I326V  
Pat322 26906 None None   I31V, E36D, K122E, I135V, N175Y, G196E, K201KR, R211RK, V245E, K249KR, I293V, I326V, Q334QL  
Pat323 26905 None None   E6D, V60I, K103R, D123E, N175NH, I202V, Q207K, R211K, F214L, V245E, I293V, E297A, H315Y, D324E, Q334L  
Pat324 26895 None None   V35M, T39A, R83K, K103R, K122E, I135M, K166R, K173N, I178M, G196E, T200A, Q207E, F214L, A272P, V276I, I293V, E312V  
Pat325 26893 None None   E6ED, V35I, R83K, K103KR, D123E, K166KR, D177E, T200A, Q207E, A272AS, V276VI, I293V, E312V, Q334L  
Pat326 26888 None None   E6D, E28A, K32E, V35VIL, S68G, K103KR, I135T, T139I, K166R, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245E, V276I, I293V, E297A, K311KR, V314I, H315Y, D324E, Q334L  
Pat327 26886 None None   V35E, K122P, I135R, T200I, Q207A, R211K, V245VE, A272AV, E312V, I326V  
Pat328 26879 None None  V179E V35M, T39A, R83K, K102R, K166R, N175H, T200E, I202V, R211K, V245E, E248D, A272P, K277R, I293V, E297K, P313S, V317A, D324E, I329L  
Pat329 26865 None None   K122E, I135T, I142V, V179A, Q207E, R211RK, V245K, K281R, R284K, T286TA, I293V, E312V, Q334QL  
Pat330 26850 None None   E6D, K20R, V35I, I135T, K166R, D177E, I178M, G196E, E204K, R211G, F214L, I293V, E297Q, P313V, I326V  
Pat331 26794 None None  V106I E6D, D123DE, I135V, K166R, D177DE, I178IL, T200TI, I202V, R211RK, A272P, K277R, I293V, E297A, I309L, I326V  
Pat332 26714 None None   V8I, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R  
Pat333 26692 None None   V8I, V35T, T200A, I202IV, E204K, Q207E, R211K, V245L, I293V, E312EA, Q334L T128TA 
Pat334 26672 None None   V35A, E36A, T39D, S48T, K49R, I50IM, V60I, D121Y, K122E, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R, I326IM  
Pat335 26665 None None  K103N, Y181C K11R, V35I, V60I, R83K, T139KR, T200E, E204K, Q207E, R211Q, V245E, E248V, I293V, D324E, Q334L  
Pat336 26645 None None   E6D, V35T, V60I, R83K, I135V, K166R, Q207E, R211K, V245E, A272P, K277R, I293V, E297V, S322A, Q334L  
Pat337 26592 None None   A98S, K102Q, K103R, K122E, I142V, T200A, V245M, T286A, E297R, V317S, I329V  
Pat338 26584 None None   E6G, V8I, K20R, E28A, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E, E291D, V292I, I293V, E312T, I326V, I329V  
Pat339 26579 None None   E6D, V35L, D123E, I202V, Q207E, F214L, K277R, I293V, E297A, H315Y, S322A, Q334L  
Pat340 26524 None None   E6D, V35M, R83K, K103KR, K166R, D177E, G196E, T200A, Q207E, A272S, V276I, I293V, E297A, E312V, Q334L L80V 
Pat341 26523 None None   A98S, K102Q, K103R, D121E, I142V, T200A, V245M, T286A, E297R, V317S, I329V V60VAE 
Pat342 26500 None None   E6D, K11R, K103R, V111VI, I135IT, G196R, T200I, I202V, Q207E, F214L, I293V, E297A, H315Y, S322A, Q334L  
Pat343 26492 None None   V8I, V35T, E36AV, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135K, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
Pat344 26460 None None   V35I, V60I, R83K, R125RK, T200E, E204KQR, Q207E, R211K, V245E, I293V, Q334L  
Pat345 26447 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286V, E291D, V292I, I293V  
Pat346 26423 None None   P4PS, K20R, I135IT, R211K, V245M, A272P, I293V, E312S, V314I, I326M, Q334D  
Pat347 26418 None None   E6D, F87FL, K103R, K166R, I202V, Q207E, F214L, V245M, E248D, I293V, E297T, H315Y, S322A, Q334L  
Pat348 26417 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, T200I, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, L303LW, K311R  
Pat349 26414 None None   E6K, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, L187LF, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V, K311R L12K, V292K 
Pat350 26413 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V N137NK 
Pat351 26390 None None   I31V, K122E, I135V, N175Y, G196E, V245E, I293V, I326V  
Pat352 26389 None None   E6D, K32E, V35VI, S68G, K103KR, I135T, T139I, K166R, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245E, V276I, I293V, E297AT, V314M, H315Y, D324E, Q334L  
Pat353 26386 None None   E6D, K43R, A98S, K122E, N175I, T200I, I202V, R211RK, V245K, K263KR, R284K, A288S, I293V, P294Q, E297T, K311Q  
Pat354 26368 None None   K11R, K43KR, K102R, S162A, I178M, Q197K, T200A, Q207E, S251I, V292I, I293V, P294PT, E312Q, Q334L K104S 
Pat355 26308 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, S251SI, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V L210LP 
Pat356 26304 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R, E312V, D320V  
Pat357 26302 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R  
Pat358 26300 None None   V35L, R83K, K103R, K122E, I142V, K166R, K173E, Q207E, R211K, V245K, A272P, K277R, I293V, E297A, Q334L  
Pat359 26298 None None   E6D, K122E, T200I, I202V, V245K, R284K, A288S, I293V, P294Q, E297T K275KE 
Pat360 26294 None None   K11R, K22KN, K64KR, K102EQ, K103R, I135V, K166R, K173T, I202V, Q207E, F214L, K277KR, I293V, E297A, H315Y, Q334L  
Pat361 26293 None None   V8I, K102KR, K173E, V179I, I195P, G196E, Q197K, S251N, A272S, I293V, E312K, S322L, I326V  
Pat362 26292 None None   V35T, K46KQ, K122E, I135IR, E169D, K173D, Q174K, R211K, A272P, T286P, K311R E44EQ 
Pat363 26290 None None   K64R, S162SN, G196E, T200A, E204K, Q207E, V245E, V276I, R284K, I293V, P313T, V317A, I326V  
Pat364 26285 None None  V179E I135V, I142V, R172K, K173E, T200I, A272S, K277R, I293V, V317A, S322T, I329V, Q334E  
Pat368 22234 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, A272P, K277R, R284K, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R  
Pat369 22207 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R  
Pat370 22174 None None   V8G, V35L, A158PS, Q207E, F214L, V245E, V276I, I293V, E312V, I329V, Q334L  
Pat371 22148 None None   P4L, I5M, E6K, K20KR, V35T, I135V, E204EK, Q207E, I293V, E312V, Q334V  
Pat372 22124 None None   K11KR, E29EK, V35I, R83K, R143RK, G196E, E203K, E204Q, Q207E, V245VE, A272P, K275R, I293V, E312V, Q334L  
Pat373 22122 None None   K20R, K122E, I135T, R211K, V245K, A272P, I293V, E312S, V314I, I326M, Q334D  
Pat374 21676 None None   E6D, K166R, K173N, G196E, T200A, I202V, E204K, Q207E, R211RK, V245E, V276I, I293V, P313T, V317A, I326V, Q334L  
Pat375 21663 None None   E6D, V35I, I135R, T200I, I202V, Q207E, R211K, I244IV, V245K, A272PS, I293V, E297K, P313T, V317A, I326V  
Pat376 21313 None None   E6D, K103R, K122E, K166KR, I202V, Q207E, R211RK, F214L, V245E, I293V, E297A, V314I, H315Y, Q334L  
Pat377 21212 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, G196R, V245Q, S251I, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
Pat378 21209 None None T215AP  V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R  
Pat379 21152 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, D121Y, K122E, D123E, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312N  
Pat380 21131 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R  
Pat381 21097 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121FY, S134SC, E169D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, Y319X, K323KQ, E328X, K331KN, Q334A K122*E, A129AG, Q145Q*, S322S*, I326IR 

Database

Resources

Team