Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author de Medeiros (2011)
Title Co-circulation HIV-1 subtypes B, C, and CRF31_BC in a drug-naive population from Southernmost Brazil: Analysis of primary resistance mutations.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 99
NumPts 99
Subtype C, B, B + C, CRF31_BC, F, CRF12_BF

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
Pat001 RS107 None None   K122E, I135T, Q151R, K154E, T200V, R211K, Q222H I159F 
Pat002 RS017 None None   V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, K122E, D123G, I135M, S162C, K173A, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K  
Pat003 RS067 None None   V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, V118I, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K, F214L  
Pat004 RS046 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121H, K122E, A158S, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K  
Pat005 RS097 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, I135T, S162C, E194K, T200A, I202V, Q207K, R211Q  
Pat006 RS072 None None D67G  V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, K166R, D177E, T200A, Q207E, R211K  
Pat007 RS030 None None   V35I, E36A, T39E, S48T, I135L, K173T, Q174K, D177E, E194A, T200A, Q207G, R211K  
Pat008 RS140 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, I135T, I142T, A158S, K173V, T200A, Q207G, R211K  
Pat009 RS015 None None   V10L, P14A, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, D121A, K122E, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
Pat010 RS044 None None   E6N, V35I, S68G, I135T, K166T, Q197E L34S 
Pat011 RS038 None None   S48T, S68G, V90I, K102H, K122E, I135T, S162C, Q207K, R211A  
Pat012 RS034 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123N, K173A, T200A, Q207E, R211K  
Pat013 RS155 None None   E6D, S162C, Q174K, Q207A, R211K  
Pat014 RS139 None None   V35K, E36A, T39D, S48T, S162C, K173A, T200A, Q207E, R211K  
Pat015 RS120 None None   V35T, E36A, T39D, K103R, K122E, K166R, K173I, D177E, E194K, T200A, Q207E, R211K G155E 
Pat016 RS110 None None   I50V, S68G, K122A, K166R, Q174R, D177E, Q207E, R211K, F214L  
Pat017 RS111 None None   V35T, E36A, T39D, K122E, D123S, E169D, R211K  
Pat018 RS016 None None   I2V, E6R, K20R, V35A, K49R, A98S, K122E, I135T, A158S, T165I, I202V, R211K, D237N L26S 
Pat019 RS053 None None  V106I, E138A V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, S162A, I178L, V179I, E204K, Q207E, F214L  
Pat020 RS121 None None   K20R, V35I, R83K, K122E, D123S, R211K  
Pat021 RS143 None None   D121Y, K122E, H198P, R199K, Q207P, L210V H208P 
Pat022 RS066 None None   V35T, T39N, S48T, K122E, A158S, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207G, L210F  
Pat023 RS055 None None   T27S, V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, S162C, D177E, T200A, Q207E, R211K  
Pat024 RS073 None None   V35T, T39E, S48T, A158T, R172K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
Pat025 RS069 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123S, K173Q, D177N, T200A, R211K  
Pat026 RS059 None None   T7S, T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, A158S, K173A, D177A, T200A, I202V, Q207G, R211K F87M 
Pat027 RS001 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, W153R, A158S, K173A, D177G, Q197L, T200E, E203D, Q207E, R211K, E233K, D237N  
Pat028 RS138 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, D177E, T200A, R211K, D218G, K220R, H235N, W239*  
Pat029 RS101 None None   K20R, V35I, I135T, I142V, F214L  
Pat030 RS021 None None   V35T, T39K, S48T, D177E, T200A, Q207K, R211K  
Pat031 RS136 None None   K102Q, K122E, R211K  
Pat032 RS008 None None   K122P, K166R, D177E, G196E, Q207E, F214L  
Pat033 RS074 None None   V35T, T39N, S48T, D123E, S162C, D177E, I178L, Q207E, R211K  
Pat034 RS019 None None   K20R, K122E, I135T, T165I, F214L  
Pat035 RS077 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, I142V, D177E, I178L, T200A, R211K  
Pat036 RS061 None None   D121H, K122E, I135T, S162C, Q207E  
Pat037 RS052 None None   I50V, A98S, K122E, D123N, I135T, G196E, Q207E, R211K  
Pat038 RS011 None None   P4X, V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, K103R, K122E, D123G, I135T, T165I, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K, F214L I2Q 
Pat039 RS010 None None   V35T, T39D, S48T, D123S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K V108L 
Pat040 RS075 None None   E6D, S105A, I135T, K166R, D177N, T200E, I202V, R211K  
Pat041 RS118 None None   V60I, S68G, K102Q, D123E, I135T, K166R, I178M, T200A, R211K  
Pat042 RS082 None None  V179D K20R, K122E, I135T, G196E, I202V, F214L  
Pat043 RS117 None None   V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, K122E, D123G, I135T, S162C, R211K  
Pat044 RS076 None None  E138A V35T, T39D, S48T, K122E, D123S, L210F, R211K  
Pat045 RS145 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, D177E, I178V, V179I, T200A, R211K  
Pat046 RS099 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, I178M, T200A, Q207E, R211K  
Pat047 RS103 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K122E, I135T, D177N, R211K  
Pat048 RS036 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, I135T, I142V, S162C, R211K  
Pat049 RS065 None None   P1S, I2L, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122A, D123S, S162C, K173A, D177E, V189I, T200A, Q207E, R211K, W239R, V241I S3G, D237K 
Pat050 RS189 None None   E28A, V35T, T39D, S48T, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, R211K  
Pat051 RS007 None None   I5L, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123G, Q174H, T200A, R211K F61S, I63T, W71R, L74P, F77P, F87S, L92S 
Pat052 RS167 None None   V35T, E36A, T39D, K43KR, S48ST, K49KR, K122E, D123S, K166R, K173I, D177E, E194K, T200A, Q207E, R211K G155E 
Pat053 RS158 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, K104R, K122E, I178M  
Pat054 RS114 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, D123E, K173V, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K  
Pat055 RS112 None None   V35T, V60I, I135V, S162C, K173T, Q174K, Q207E, R211K, F214L V108VL 
Pat056 RS106 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, I135T, T139A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
Pat057 RS105 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K122E, N136T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
Pat058 RS095 None None  V106VM, E138EA V35T, E36A, T39D, S48T, D121DH, K122E, D123N, I135T, A158S, E169D, K173A, T200A, Q207E, R211K L193P 
Pat059 RS063 None None   V21A, K32E, V35K, E36A, T39E, K43R, S48T, A98S, K104N, K122E, D123N, I135R, T200TA, R211K H221HR 
Pat060 RS056 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122KE, D123G, A158AS, S162SN, K173AT, D177E, T200A, Q207E, R211K  
Pat061 RS039 None None   V60VI, K122E, S162X, I178IM, Q207QE, R211K, F214FL, W239WR  
Pat062 RS033 None None   V35T, E36EA, T39DE, K43R, S48T, K102Q, V118I, K122E, A158S, T165M, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207R, R211K, F214L  
Pat063 RS187 None None   V35T, E36EA, T39X, K49KR, V60VI, K122E, D123N, I135T, T200A, R211K  
Pat064 RS045 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, K122E, I135T, I142T, Q197P, T200A, R211K, P236L V108VL 
Pat065 RS171 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, K122E, D123X, I135IV, D177E, T200A, Q207E, R211K P52PL, N57NI 
Pat066 RS028 None None   V35I, R83K, D123E, I135T, G196E, T200I, I202V, R211G  
Pat067 RS025 None None   I5M, K49R, V60I, D86E, I135T, R172K, R211K  
Pat068 RS168 None None   V35M, T39A, R83K, K104R, S162A, P170S, P176Q, G196E, T200A  
Pat069 RS152 None None   W88C, I135T, I195L  
Pat070 RS109 None None   E6K, K20R, K122E, I135T, F214L, D237N  
Pat071 RS037 None None   M16L, K20R, V35T, T39A, S48T, K122E, D123S, I135T, T200A, F214L P14R 
Pat072 RS123 None None   S68G, K122E, I135T, T200A, E203D  
Pat073 RS113 None None   K32R, S162D, I178M, I195L, R211K, F214L  
Pat074 RS188 None None   K20R, V35I, K122E, D123N, I135T, D177E, I178V, E194G, G196E, F214L  
Pat075 RS151 None None   K122E, I135T, S162C, T200A, Q207E, R211K, F214L  
Pat076 RS100 None None   V35T, S48T, K122E, A158S, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207G, L210F, R211K  
Pat077 RS029 None None   E6K, A33V, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, K166R, K173A, D177E, T200V, Q207E, R211E D186G, L234V 
Pat078 RS078 None None   P14S, M16T, V21A, K22R, W24R, I31T, V35T, E36A, T39E, M41T, S48T, K122E, I135V, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207R, R211K, F214L, K238R L26S, L34P, I37T, C38R, F61S, W71R, L92S 
Pat079 RS050 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K103R, D123E, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L  
Pat080 RS027 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, K122E, K173T, T200A, E203D, Q207A, R211K  
Pat081 RS031 None None   E6K, T7A, E28G, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, I135V, S162C, K173A, D177E, V179I, T200A, E204K, Q207E, R211K  
Pat082 RS042 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, G99R, D121H, K122E, I135T, A158S, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K  
Pat083 RS147 None None   V35T, T39K, S48T, K122E, I135T, I159V, K173T, T200V, Q207E, R211K  
Pat084 RS086 None None  E138K V35I, T39A, S48T, V60I, D121H, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200A, E204K, Q207A, R211K P25L 
Pat085 RS156 None None   V35T, S48T, K122E, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E P14R 
Pat086 RS014 None None   V35T, T39D, K43R, S48T, K122E, D123S, T165I, Q174R, T200A, R211K, F214L, D237N V108L 
Pat087 RS051 None None   I2T, V8A, L12I, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, Q197K, R211K, D237N I5G, T7N, K11G, P25Q 
Pat088 RS091 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123G, K173Q, D177N, V189I, R211K  
Pat089 RS064 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K102R, Q207E, R211K  
Pat090 RS092 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K82R, D123E, D177E, E204A, R211K  
Pat091 RS126 None None  K103N, E138A V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K173I, R211K  
Pat092 RS020 None None   V35T, T39K, S48T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
Pat093 RS049 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, K101R, K122E, T200A, Q207E, R211K P150H 
Pat094 RS079 None None   P1S, P14A, V35T, T39D, S48T, K122E, D123G, I135T, S163C, E169K, T216P, D218G, K220E, K238R I37N 
Pat095 RS098 None None  Y181C V35T, E36A, T39D, S48T, K102N, K104N, L109M, D123G, T139A, S162R, S163C, E169G, Q174L, M184L, T200A, I202V, E203K, Q207E, D218G, L228F V21E, P95T, S105P, D121G, K122G, T131A, I132M, N136G, N137G, Q145R, N147D, Q161L, Q182R, D186A, D192G, H198Y, K201G, Q222L 
Pat096 RS003 None None   V35T, T39K, I135T, I142V, K173Q, D177N, R211K, D237N  
Pat097 RS012 None None D67N, K70R  I135T, I142V P1A 
Pat098 RS087 None None   P1S, D17E, V35A, D123E, I135T, A158P, S162Y, K173A, D177E, V179I, T200P, L205F, Q222R, K223E, L234P, D237E P4R, F160P, Q182L, T216S, P217L 
Pat099 RS104 None None M184V E138A K11N, V35I, K122E, I135T, I142V, K154E, K173G, D177G, I178V, I195L, K201I, E203G, E204G, R206S, Q207R, R211K, W212G, F214L, Q222P V10E, K20M, P25L, F160L, Q161R, M164V, Q182R, Y183F, D186G, L187K, D192G, L209S, T216S, K219M, H221R 

Database

Resources

Team