Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Gulick (2004)
Title Triple-nucleoside regimens versus efavirenz-containing regimens for the initial treatment of HIV-1 infection.
Citation N Engl J Med
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 937
NumPts 513
Subtype B, C, A, CRF06_cpx, F, CRF12_BF, G

 
  Page 1 of 10    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 937 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
RG1 RG1w0 None None   R83K, T165TI, Q174K  
  RG1w38 ABC, AZT, 3TC None M184V  R83K, Q174K  
RG10 RG10w1 None None   K49R, V60I, K122E, I135T, Q207E  
  RG10w30 ABC, AZT, 3TC EFV, NVP  Y181YC, G190GS K49R, V60I, K122E, I135T, Q207E, R211RK, L228LR  
RG100 RG100w0 None None   K64KR, K122KE, I142IV, S162C, R211S, V245M  
  RG100w56 AZT, 3TC EFV   K64KR, K122KE, I142IV, S162CG, R211S, E233EK, V245M  
RG101 RG101w0 None None   K122P, S162C, Q174L, D177E, I178IV, Q207E, R211K L246LQ 
  RG101w129 ABC, AZT, 3TC EFV  K103N K122P, S162C, Q174L, D177E, Q207E, R211K  
RG102 RG102w0 None None   T39E, S48T, K122E, S162C, K173A, D177E, I178IL, T200A, E204EK, Q207E, R211K, V245Q  
RG103 RG103w0 None None   K122KE, D123E, R211K, V245K  
  RG103w28 ABC, AZT, 3TC None   K122KE, D123E, D177DE, D192DN, E194EK, R206RK, R211K, P243PL, V245K, L246LV  
RG104 RG104w0 None None   I195L, G196E, I202V  
RG105 RG105w0 None None   K122KE, I142V, E169D, T200A, R211K  
RG106 RG106w0 None None   I37X, G196E, R211S, F214L, V245E  
  RG106w28 ABC, AZT, 3TC None M184V  I37X, G196E, R211S, F214L, V245E  
  RG106w131 ABC, AZT, 3TC None   D17DE, K20R, D123DE, S134X, N137NH, R143RK, Y144YF, G196E, R211S, F214L, V245E, E291D, V292I Y127YD, F130IV, T131TRS, V148VA, P157PT, I159IM, F160FL 
RG107 RG107w0 None None   I178L, G196E, V245VM  
  RG107w20 AZT, 3TC EFV  K103N I178L, G196E, V245M  
RG108 RG108w0 None None M41L, L210LW, T215C  K43N, V60I, R83K, V118I, G196E, E204EK, R211T, F214L, L228H  
  RG108w106 ABC, AZT, 3TC EFV M41L, L210W, T215C Y188L K43N, V60I, R83K, V118I, G196E, E204K, R211T, F214L, L228H  
  RG108w124 ABC, AZT, 3TC EFV M41L, M184MV, L210W, T215C Y188L K43N, V60I, R83K, V118I, I135IL, G196E, E204K, R211T, F214L, L228H  
RG109 RG109w0 None None   I37X, A98S, K101Q, K102Q, K104R, S162C, K173R, Q174K, Q207E, R211M, Q242QH, P243X, V245E  
  RG109w18 ABC, AZT, 3TC None   I37X, A98S, K101Q, K102Q, K104R, S162C, K173R, Q174K, Q207E, R211M, Q242QH, P243X, V245E K223KI 
RG11 RG11w0 None None   D123E, K166R, D177E, I202IV, R211K D192DH 
  RG11w20 ABC, AZT, 3TC None M184V  R72RK, D113DN, D123E, R143K, K166R, D177E, I202IV, R211K, E233EK  
RG110 RG110w0 None None   I37X, D123E, I135T, G196E, F214L, V245E  
  RG110w19 AZT, 3TC EFV, NVP M184V K103N I37X, D123E, I135T, G196E, I202IV, F214L, V245VE  
RG111 RG111w0 None None   D123E, R211K, V245E  
  RG111w62 ABC, AZT, 3TC None Y115F, M184V  D123E, R211K, T215X, V245E  
RG112 RG112w0 None None   S162C, G196E, Q207E, F227Y  
RG113 RG113w0 None None  K103N V60I, K126KR, K173N, I178M, Q207QK, R211K, E233EK, V245Q H96HN, I132IK 
  RG113w20 AZT, 3TC EFV, NVP M184V K103N V60I, K173N, I178M, Q207QK, R211K, V245Q H96HN, I132IK 
  RG113w31 AZT, 3TC EFV, NVP M184V K103N V60I, K102KR, K173N, I178M, Q207QK, R211K, V245Q  
RG114 RG114w0 None None   K103KR, I135IT, P140PT, T200TA, Q207E, R211K, V245K  
  RG114w136 AZT, 3TC EFV M184V V106VI, H221Y, M230L I135T, P140PT, T200A, Q207E, R211K, V245K K103G 
RG115 RG115w0 None None   K122E, I135R, E204D, Q207A, R211K  
RG116 RG116w0 None None   V60I, R83K, I135T, T200TA, I202V, Q207L, R211K, V245EK L168LRW 
RG117 RG117w0 None None   I135V, T200AE, Q207DE, R211RK, V245E Q145Q* 
RG118 RG118w0 None None   V60I, R83K, I135T, S162A, Q207E, R211K  
RG119 RG119w0 None None  E138A V118I, K122E, I135V, I142IT, S162CG, R172K, K173T, Q174K, V179I, T200A, Q207E, R211RK, F214L  
  RG119w43 ABC, AZT, 3TC EFV M184V K103N, E138A, Y188L V118I, K122E, I135V, S162C, R172K, K173T, Q174K, I178IM, V179I, T200A, Q207E, F214L  
RG12 RG12w0 None None   D123E, T165I, D177E, R211Q  
  RG12w140 ABC, AZT, 3TC, TDF None D67N, K70R, V75T, M184V V108I K30R, D123E, I142V, T165L, D177E, R211Q, K277R, K281R, T286A  
RG120 RG120w0 None None   E53D, T200TA, Q207E, R211K, V245E  
  RG120w18 AZT, 3TC, D4T EFV M184V  E53D, E169ED, T200TA, Q207E, R211K, V245E  
RG121 RG121w0 None None   S68G, D123DN, I135T, S162A, R211K, V245R  
RG122 RG122w0 None None   S162C, F171Y, T200E  
RG123 RG123w0 None None   R83RK, Q174R, Q207E, R211RK, V245E  
RG124 RG124w0 None None   V60I, K122E, I142V, R211K  
  RG124w46 ABC, AZT, 3TC None D67N, M184V  V60I, K122E, I142V, D192N, R211K  
  RG124w77 ABC, AZT, 3TC, DDI EFV D67N, K70R, L74V, M184V, K219E G190S V60I, K101KT, K122E, I142V, V189VI, R211K  
RG125 RG125w0 None None M41L  I37X, T39A, K104KR, K122E, S162C, E169D, I178IL, Q197EK, R211S, E224D  
  RG125w38 ABC, AZT, 3TC EFV M41L  I37X, T39A, K104KR, K122E, S162C, E169D, I178L, Q197EK, R211S, E224D  
RG126 RG126w0 None None   I37X, D110DN, D113DN, K122E, I135M, D177N, I178IM, Q207E, R211RK, V245T  
  RG126w16 ABC, AZT, 3TC None   I37X, D113DN, K122E, I135M, D177N, I178IM, Q207E, R211RK, V245T  
RG127 RG127w0 None None  V106I K122E, A158S, I178M, T200A, R211G, V245L  
  RG127w20 ABC, AZT, 3TC None M184V V106I K122KE, A158S, I178M, T200A, R211G, V245L  
  RG127w31 ABC, AZT, 3TC None M184V V106I K122E, F130FL, T131X, I132X, P133X, S134X, I135X, N136X, N137X, E138X, T139X, P140X, G141X, I142X, R143X, Y144X, Q145X, Y146X, N147X, V148X, L149X, P150X, Q151X, G152X, W153X, K154X, G155R, P157PA, A158S, I178M, T200A, R211G, V245L L120LF, S156ST 
RG128 RG128w0 None None   R83K, D121HY, K122KE, I135T, G196E, T200A, R211G  
RG129 RG129w0 None None   K122KE, I135IT, I142T, K166KR, R211K  
  RG129w20 AZT, 3TC EFV   I135X, I142T, K166R, R211K  
RG13 RG13w0 None None  K103KN K122E, I135T, S162C, I178M, T200A, E204Q, R211RG  
  RG13w75 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215I, K219Q  V90I, K122E, D123N, I135T, S162Y, I178M, V189I, T200A, E204Q  
RG130 RG130w0 None None   A98AS, K166KR, K173KQ, I178IM, V245X  
RG131 RG131w0 None None   I50V, I135K, T200I, Q207E, R211K, V245E  
  RG131w117 ABC, AZT, 3TC EFV, NVP   I50V, I135K, T200I, Q207E, R211K, V245E  
RG132 RG132w0 None None   T39E, K101KR, K122E, D123S, K173A, D177E, G196K, T200E, I202V, E204EK, Q207E, R211X, P243T, V245K  
RG133 RG133w0 None None   T39D, K49KR, V60VI, A98S, K122E, D123G, I135IT, A158S, K173A, Q174QK, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  
  RG133w127 ABC, AZT, 3TC EFV   K11N, V35T, E36A, T39D, K49KR, V60I, A98S, K122E, D123G, I135T, A158S, K173A, Q174K, T200A, Q207E, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V, P294T  
RG134 RG134w0 None None   K64R, S162C, Q207K, R211RK  
RG135 RG135w0 None None   K122R, D123E, G196E, T200I, I202V  
  RG135w72 ABC, AZT, 3TC, D4T EFV   V60VI, K122R, D123E, I135IL, G196E, T200I, I202V  
RG136 RG136w0 None None   I37X, T39A, R83K, K122P, D123DE, I135T, I142V, V245VIM  
  RG136w32 AZT, 3TC EFV M184V  I37X, T39A, R83K, K122P, D123DE, I135T, I142V, R211RK, V245IMT  
RG137 RG137w0 None None   K49R, E53D, V60I, R83K, K122E, S162H, E169ED, Q207K, R211EK, V245VE  
  RG137w18 ABC, AZT, 3TC None M184V  K49R, E53D, V60I, R83K, K122E, D123S, S162H, K173R, E203G, Q207K, R211E  
  RG137w27 ABC, AZT, 3TC None D67DH, K70KR, M184V  K49R, E53D, V60I, R83K, K122E, D123S, S162H, K173R, E203G, Q207K, R211E  
RG138 RG138w0 None None   K101R, S162C, T200A, Q207H, R211K, V245K  
RG139 RG139w0 None None   A98S, S162A, K173Q, D177DE, Q207E, V245VM I132IK 
  RG139w43 ABC, AZT, 3TC None M184MV  A98S, D123DE, S162A, K173Q, D177E, Q207E, V245VM  
  RG139w64 ABC, AZT, 3TC None M184MV  A98S, D123DE, I135IV, S162A, K173Q, D177DE, Q207E  
RG14 RG14w0 None None   S68G, D123DE, R211RK  
  RG14w64 ABC, AZT, 3TC None K65R, M184V  S68G  
RG140 RG140w0 None None D67N, T69D K103N V60I, K101KR, K122E, D123N, S134SG, I135T, S162HY, T200TI, E204V  
  RG140w12 ABC, AZT, 3TC EFV D67N, T69D K103N I37X, V60I, K101KR, K122E, D123N, I135T, S162Y, E204EV  
  RG140w20 ABC, AZT, 3TC EFV D67N, T69D K103N I37X, V60I, K101KR, K122E, D123N, I135T, S162Y, E204V  
  RG140w40 ABC, AZT, 3TC EFV D67N, T69D K103N V60I, K101KR, K122E, D123N, S134SG, I135T, S162HY, T200X, E204EV  
  RG140w58 ABC, AZT, 3TC EFV D67N, T69D K103N V60I, W88WC, K101KR, K122E, D123N, I135T, P157PA, S162HY, T200TA, E204V  
RG141 RG141w0 None None   T39L, T69S, K122E, Q207D, R211K  
  RG141w24 AZT, 3TC EFV   T39X, T69S, K122E, Q207D, R211K  
RG142 RG142w0 None None   K122E, D123E, I202V, P243T, V245E  
  RG142w24 ABC, AZT, 3TC None M184V  K122E, D123E, P243T, V245K  
  RG142w54 ABC, AZT, 3TC, DDI EFV M184V K103N K122E, D123E, T139K, P243T, V245K  
RG143 RG143w0 None None   V60I, I135L, S162Y, V179I, G196E, R211K, V241I, V245K  
RG144 RG144w1 None None   A98S, S162CG, R211K, V245E  
RG145 RG145w0 None None   T69X, K122E, D123S, I135T, K173KE, I202V, Q207K, R211G  
  RG145w139 ABC, AZT, 3TC, D4T, DDI EFV A62V, V75T, M184V, K219N K103N T69TPS, K102R, K122E, D123S, I135T, V189I, I202V, Q207K, Y232YH  
RG146 RG146w0 None None   K166KR, R211RK  
  RG146w25 ABC, AZT, 3TC None   K104KR, K166KR, R211RK  
RG147 RG147w0 None None   I135V, S162C, V179I, V245X  

Database

Resources

Team